More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_3770 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_3770  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  100 
 
 		 387 aa  740    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.107297  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0779  thioredoxin reductase  30.85 
 
 		 310 aa  143  5e-33  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0559  thioredoxin reductase  35.86 
 
 		 304 aa  139  1e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0135  thioredoxin reductase (NADPH)  33.45 
 
 		 309 aa  135  9.999999999999999e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000136193  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1869  thioredoxin reductase  31.8 
 
 		 314 aa  134  3.9999999999999996e-30  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0723907  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2972  thioredoxin reductase  30.77 
 
 		 315 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000488903  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl064  thioredoxin reductase NADPH  30.17 
 
 		 311 aa  131  2.0000000000000002e-29  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0114  thioredoxin reductase  34.41 
 
 		 308 aa  131  3e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000498339  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1325  thioredoxin reductase  32.89 
 
 		 311 aa  130  3e-29  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000005061  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0182  thioredoxin-disulfide reductase  32.06 
 
 		 312 aa  129  7.000000000000001e-29  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.68776  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3844  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  33.33 
 
 		 303 aa  128  2.0000000000000002e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.672623  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0058  thioredoxin reductase  32.44 
 
 		 317 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0360012  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0142  thioredoxin-disulfide reductase  31.75 
 
 		 312 aa  127  3e-28  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0058  thioredoxin reductase  32.09 
 
 		 317 aa  127  3e-28  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00992397  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3149  thioredoxin reductase  32.12 
 
 		 318 aa  127  3e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0229  thioredoxin reductase  36.72 
 
 		 332 aa  127  3e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0214  thioredoxin-disulfide reductase  29.35 
 
 		 312 aa  127  3e-28  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.136255  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4061  thioredoxin reductase  37.41 
 
 		 314 aa  127  3e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0161  thioredoxin-disulfide reductase  32.06 
 
 		 312 aa  127  3e-28  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4637  thioredoxin reductase  33.68 
 
 		 456 aa  127  4.0000000000000003e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000231293  normal  0.140967 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1411  thioredoxin reductase  32.03 
 
 		 313 aa  126  5e-28  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0376  thioredoxin reductase  33.23 
 
 		 310 aa  126  5e-28  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000265637  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1512  thioredoxin reductase  31.13 
 
 		 309 aa  126  6e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000715153  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1140  thioredoxin-disulfide reductase  32.18 
 
 		 312 aa  126  7e-28  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4094  thioredoxin reductase  37.05 
 
 		 314 aa  125  9e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00339774  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0838  thioredoxin-disulfide reductase  34.75 
 
 		 312 aa  125  1e-27  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4960  thioredoxin reductase  37.11 
 
 		 319 aa  125  1e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1013  thioredoxin reductase  30.9 
 
 		 308 aa  125  1e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3686  thioredoxin reductase  32.99 
 
 		 316 aa  125  2e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000489943  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1919  thioredoxin reductase  32.89 
 
 		 306 aa  124  2e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4061  thioredoxin reductase  33.68 
 
 		 453 aa  124  2e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_3988  thioredoxin reductase  36.8 
 
 		 325 aa  124  3e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.717161 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1892  thioredoxin reductase  37 
 
 		 324 aa  124  3e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0767369  hitchhiker  0.00000000000000724203 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20410  thioredoxin reductase  31.33 
 
 		 311 aa  124  4e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0805  thioredoxin reductase  29.9 
 
 		 311 aa  123  4e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0788  thioredoxin reductase  29.9 
 
 		 311 aa  123  4e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3781  thioredoxin reductase  32.99 
 
 		 316 aa  123  4e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0054  thioredoxin-disulfide reductase  34.01 
 
 		 313 aa  123  6e-27  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1709  thioredoxin reductase  32.56 
 
 		 311 aa  123  6e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00135866  normal  0.877489 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1226  thioredoxin reductase  33.23 
 
 		 325 aa  122  9e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0172  thioredoxin reductase  29.7 
 
 		 310 aa  122  9e-27  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.454317  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0432  thioredoxin-disulfide reductase  29.57 
 
 		 310 aa  122  9.999999999999999e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0924  thioredoxin reductase  31.19 
 
 		 304 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2420  thioredoxin reductase  33.44 
 
 		 304 aa  122  9.999999999999999e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000290803  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0622  thioredoxin reductase  30.13 
 
 		 312 aa  121  1.9999999999999998e-26  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00106042  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2601  thioredoxin reductase  35.23 
 
 		 321 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4032  thioredoxin reductase  33 
 
 		 316 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000634849  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0672  thioredoxin reductase  30.88 
 
 		 334 aa  121  1.9999999999999998e-26  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23380  thioredoxin-disulfide reductase  35.08 
 
 		 333 aa  121  1.9999999999999998e-26  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0296  thioredoxin-disulfide reductase  35.44 
 
 		 314 aa  121  1.9999999999999998e-26  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1780  thioredoxin reductase  33.33 
 
 		 323 aa  120  3e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.720835 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0294  thioredoxin reductase  31.65 
 
 		 304 aa  119  9.999999999999999e-26  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1560  thioredoxin-disulfide reductase  33.97 
 
 		 320 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.212237  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0626  thioredoxin-disulfide reductase  31.29 
 
 		 320 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5401  thioredoxin reductase  37.45 
 
 		 361 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0542  thioredoxin-disulfide reductase  28.95 
 
 		 306 aa  117  3e-25  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1762  thioredoxin reductase  33.97 
 
 		 317 aa  117  3e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.422622  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3812  thioredoxin reductase  30.9 
 
 		 460 aa  117  3e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1713  thioredoxin reductase  33.7 
 
 		 317 aa  117  3e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000742143  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4859  thioredoxin reductase  36.77 
 
 		 310 aa  117  3e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.143952  normal  0.0952253 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0015  thioredoxin reductase  34.15 
 
 		 315 aa  117  3.9999999999999997e-25  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0097  thioredoxin reductase  33.67 
 
 		 320 aa  117  3.9999999999999997e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.653318  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2424  thioredoxin reductase  33.59 
 
 		 320 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3951  thioredoxin reductase  37.18 
 
 		 314 aa  117  5e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2441  thioredoxin reductase  37.13 
 
 		 345 aa  117  5e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0877885  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0684  thioredoxin reductase  34.81 
 
 		 317 aa  117  5e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00860267  normal  0.703249 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0086  thioredoxin reductase  33.92 
 
 		 320 aa  117  5e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.585746 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5007  thioredoxin reductase  29.9 
 
 		 321 aa  116  6e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.548386  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4836  thioredoxin-disulfide reductase (thioredoxin reductase (NADPH))  29.9 
 
 		 321 aa  116  6e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4851  thioredoxin-disulfide reductase (thioredoxin reductase (NADPH))  29.9 
 
 		 321 aa  116  6e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.881258  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5319  thioredoxin-disulfide reductase  29.9 
 
 		 318 aa  116  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0786  thioredoxin reductase  32.23 
 
 		 320 aa  116  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.148183  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5262  thioredoxin reductase  29.9 
 
 		 318 aa  116  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5243  thioredoxin-disulfide reductase  29.9 
 
 		 318 aa  116  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5387  thioredoxin reductase  29.9 
 
 		 318 aa  116  6.9999999999999995e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0809  thioredoxin reductase  32.23 
 
 		 320 aa  116  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00543895  normal  0.0268826 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4408  thioredoxin reductase  32.23 
 
 		 320 aa  116  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.460867  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0978  thioredoxin reductase  35.22 
 
 		 315 aa  116  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.993828  normal  0.0140705 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0820  thioredoxin reductase  32.23 
 
 		 320 aa  116  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0181  thioredoxin reductase  35.93 
 
 		 334 aa  116  7.999999999999999e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4232  thioredoxin reductase  34.03 
 
 		 318 aa  116  7.999999999999999e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.7622  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5277  thioredoxin-disulfide reductase  29.9 
 
 		 318 aa  116  7.999999999999999e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.450322  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2123  thioredoxin-disulfide reductase  33.21 
 
 		 320 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.165856  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_483  thioredoxin reductase  28.62 
 
 		 306 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3108  thioredoxin reductase  35.05 
 
 		 310 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.264051  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3078  thioredoxin-disulfide reductase  33.21 
 
 		 320 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2991  thioredoxin-disulfide reductase  33.21 
 
 		 320 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.520991  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3701  thioredoxin reductase  29.57 
 
 		 318 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.600246  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1991  thioredoxin-disulfide reductase  33.21 
 
 		 320 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0789  thioredoxin-disulfide reductase  33.21 
 
 		 320 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.133485  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2621  thioredoxin-disulfide reductase  33.21 
 
 		 320 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.105399  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3045  thioredoxin-disulfide reductase  33.21 
 
 		 320 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.403048  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0477  alkyl hydroperoxide reductase F subunit  31.7 
 
 		 555 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000501172  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1324  thioredoxin reductase  31.77 
 
 		 307 aa  115  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0459981  hitchhiker  0.00423787 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0518  thioredoxin reductase  29.22 
 
 		 306 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0030  thioredoxin reductase  37.38 
 
 		 320 aa  114  2.0000000000000002e-24  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0723  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  30.42 
 
 		 321 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4212  thioredoxin reductase  36 
 
 		 344 aa  114  2.0000000000000002e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.740781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5778  thioredoxin reductase  34.6 
 
 		 333 aa  114  3e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0605147  normal  0.600469 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1119  thioredoxin reductase  34.59 
 
 		 316 aa  114  3e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.202817  normal  0.295957 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>