121 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_2718 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013158  Huta_2718  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  100 
 
 
308 aa  623  1e-177  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1462  thiazole biosynthesis enzyme  81.94 
 
 
310 aa  491  9.999999999999999e-139  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0002  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  82.14 
 
 
307 aa  492  9.999999999999999e-139  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.512704 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2419  thiazole biosynthesis enzyme  81.88 
 
 
309 aa  488  1e-137  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2980  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  74.76 
 
 
309 aa  443  1e-123  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0678  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  49.12 
 
 
272 aa  249  3e-65  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2100  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  39.15 
 
 
260 aa  177  1e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2109  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  37.28 
 
 
258 aa  166  4e-40  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1121  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  36.81 
 
 
286 aa  165  9e-40  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2251  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  37.01 
 
 
254 aa  165  9e-40  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1609  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  35.87 
 
 
268 aa  161  1e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000241948  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1411  thiazole biosynthesis enzyme  36.92 
 
 
267 aa  160  2e-38  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0421  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  36.33 
 
 
271 aa  160  2e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000154841  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1052  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  36.75 
 
 
259 aa  154  2e-36  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.273545  normal  0.78871 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1998  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  36.75 
 
 
273 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.310517  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1498  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  36.59 
 
 
275 aa  153  4e-36  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.16629  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2221  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  35.69 
 
 
271 aa  151  1e-35  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000384751 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2426  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  33.92 
 
 
258 aa  150  2e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00205999  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1420  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  33.22 
 
 
263 aa  151  2e-35  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.043335 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0277  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  34.91 
 
 
255 aa  150  3e-35  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.720039 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_50942  predicted protein  33.11 
 
 
351 aa  147  1.0000000000000001e-34  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.920544 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0859  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  35.46 
 
 
259 aa  148  1.0000000000000001e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.841302  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1555  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  35.34 
 
 
261 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1935  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  33.81 
 
 
254 aa  145  1e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0663  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  34.17 
 
 
261 aa  141  9.999999999999999e-33  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.397509  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0963  thiazole biosynthesis enzyme  32.73 
 
 
254 aa  140  1.9999999999999998e-32  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1358  thiazole biosynthesis enzyme  34.91 
 
 
264 aa  140  3e-32  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000774298  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0142  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  35.27 
 
 
248 aa  140  3.9999999999999997e-32  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0140  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  34.91 
 
 
248 aa  139  6e-32  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0798  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  34.71 
 
 
263 aa  138  1e-31  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0725876  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1007  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  33.09 
 
 
256 aa  131  1.0000000000000001e-29  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03928  Putative thiazole synthaseTHI4_ASPOR Thiazole biosynthetic enzyme, mitochondrial ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q76B84]  31.42 
 
 
331 aa  130  3e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.514294 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0226  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  33.81 
 
 
261 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0597  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  34.53 
 
 
262 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.469921  normal  0.642946 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1321  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  33.09 
 
 
261 aa  124  1e-27  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1422  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  31.27 
 
 
277 aa  118  9.999999999999999e-26  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1590  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  31.54 
 
 
258 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00059443  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1086  dihydrolipoyl dehydrogenase (dihydrolipoamide dehydrogenase)  33.64 
 
 
464 aa  50.4  0.00003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.912162  normal  0.114778 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2761  HI0933 family protein  40.98 
 
 
427 aa  50.8  0.00003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0671  dihydrolipoamide dehydrogenase  25.67 
 
 
468 aa  48.1  0.0002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13570  3-ketosteroid-delta-1-dehydrogenase  27.13 
 
 
563 aa  47.4  0.0003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000282742 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12463  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.63 
 
 
462 aa  47  0.0004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.931129  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2151  amine oxidase  57.89 
 
 
508 aa  47  0.0004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0672  HI0933 family protein  44.26 
 
 
436 aa  46.6  0.0005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1888  carotenoid isomerase, putative  55.26 
 
 
505 aa  45.8  0.0008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2641  FAD dependent oxidoreductase  28 
 
 
542 aa  46.2  0.0008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3360  dihydrolipoyl dehydrogenanse  30.69 
 
 
466 aa  45.8  0.0009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0306833 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3185  hypothetical protein  48.72 
 
 
245 aa  45.4  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.29229  hitchhiker  0.00171019 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2493  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.29 
 
 
472 aa  45.4  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.43654  normal  0.597636 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03043  hypothetical protein  31.82 
 
 
670 aa  45.1  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6263  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.65 
 
 
468 aa  45.8  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.202471 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2268  amine oxidase  42.86 
 
 
431 aa  45.1  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.284727 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0541  hypothetical protein  52.5 
 
 
558 aa  45.8  0.001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.9586 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0040  amine oxidase  46.34 
 
 
463 aa  45.1  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3436  FAD dependent oxidoreductase  32.5 
 
 
464 aa  45.8  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2807  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.29 
 
 
473 aa  44.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.831058 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0848  fumarate reductase, flavoprotein subunit  27.33 
 
 
457 aa  44.7  0.002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000988882  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3440  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  43.9 
 
 
605 aa  44.3  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.845304  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002914  2,4-dienoyl-CoA reductase [NADPH]  31.82 
 
 
670 aa  44.3  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0255137  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2125  hypothetical protein  50 
 
 
406 aa  45.1  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0766  amine oxidase  40.3 
 
 
522 aa  44.7  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1474  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  50 
 
 
784 aa  44.7  0.002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.293744  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3205  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.29 
 
 
473 aa  45.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.169727  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2774  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  44.9 
 
 
430 aa  44.7  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.372841  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2101  monooxygenase FAD-binding protein  37.84 
 
 
368 aa  44.3  0.003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1959  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  40.58 
 
 
647 aa  44.3  0.003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3262  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  46.15 
 
 
687 aa  44.3  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0139  radical SAM domain-containing protein  33.33 
 
 
511 aa  44.3  0.003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4482  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  34.85 
 
 
490 aa  43.9  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2085  putative FAD-binding dehydrogenase  41.89 
 
 
558 aa  44.3  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.376668  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4387  tryptophan halogenase  26.55 
 
 
409 aa  43.9  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000478087  normal  0.336171 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1402  UDP-galactopyranose mutase  45.95 
 
 
396 aa  43.5  0.004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0026  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.29 
 
 
563 aa  43.9  0.004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000184744  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0279  FAD dependent oxidoreductase  27.72 
 
 
519 aa  43.5  0.004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3769  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.29 
 
 
562 aa  43.9  0.004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10320  monoamine oxidase  45.24 
 
 
510 aa  43.5  0.004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3271  Fe-S oxidoreductase  33.78 
 
 
763 aa  43.1  0.005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2766  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.62 
 
 
473 aa  43.1  0.005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1545  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  43.33 
 
 
365 aa  43.1  0.005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0160439 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1260  FAD dependent oxidoreductase  47.83 
 
 
438 aa  43.1  0.005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0419  glucose-methanol-choline oxidoreductase  54.55 
 
 
563 aa  43.1  0.005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4861  dihydrolipoamide dehydrogenase CglE  50 
 
 
454 aa  43.1  0.005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.371121  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1701  amine oxidase  54.05 
 
 
503 aa  43.5  0.005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00066646 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1057  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase domain protein  58.06 
 
 
426 aa  43.1  0.005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL05910  amine oxidase, putative  44.19 
 
 
537 aa  43.1  0.006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0298175  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2209  hypothetical protein  40.48 
 
 
430 aa  43.1  0.006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000224827  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1984  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  56.76 
 
 
576 aa  43.1  0.006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4935  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  33.02 
 
 
605 aa  43.1  0.006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0760  FAD dependent oxidoreductase  56.76 
 
 
503 aa  43.1  0.006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.522072 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0703  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.93 
 
 
454 aa  43.1  0.006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08162  amine oxidase, flavin-containing superfamily (AFU_orthologue; AFUA_5G01210)  48.78 
 
 
473 aa  42.7  0.007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0766104 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1752  hypothetical protein  57.14 
 
 
390 aa  42.7  0.007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00572064  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3164  glucose-methanol-choline oxidoreductase  58.82 
 
 
563 aa  43.1  0.007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.115784  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02311  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  48.78 
 
 
318 aa  42.7  0.007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.352426  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3139  hypothetical protein  35.48 
 
 
402 aa  42.7  0.007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  decreased coverage  0.0000634596  decreased coverage  0.0000000576575 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0008  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  31.91 
 
 
622 aa  42.7  0.007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2074  amine oxidase  43.18 
 
 
479 aa  42.7  0.007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2672  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  35.29 
 
 
653 aa  42.7  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2712  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  35.29 
 
 
653 aa  42.7  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1080  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  51.35 
 
 
352 aa  42.7  0.007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.175928  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>