59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_1057 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_1057  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase domain protein  100 
 
 		 426 aa  882    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1058  HI0933 family protein  53.65 
 
 		 425 aa  498  1e-140  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0939  FAD dependent oxidoreductase  23.87 
 
 		 385 aa  75.1  0.000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0379493  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0631  geranylgeranyl reductase  22.11 
 
 		 402 aa  57.8  0.0000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1375  geranylgeranyl reductase  20.37 
 
 		 390 aa  57.4  0.0000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.545102  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0369  geranylgeranyl reductase  22.72 
 
 		 408 aa  57  0.0000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0683691  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2774  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  25.26 
 
 		 430 aa  56.2  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.372841  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3422  geranylgeranyl reductase  22.15 
 
 		 407 aa  55.5  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.351163 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_677  hypothetical protein  23.64 
 
 		 379 aa  55.5  0.000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.545095  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0714  geranylgeranyl reductase  20.63 
 
 		 386 aa  55.8  0.000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1308  geranylgeranyl reductase  22.07 
 
 		 406 aa  55.5  0.000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0697  FAD dependent oxidoreductase  23.62 
 
 		 393 aa  54.7  0.000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0771  hypothetical protein  24.32 
 
 		 379 aa  54.3  0.000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1250  geranylgeranyl reductase  20.79 
 
 		 390 aa  53.5  0.000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.375977  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1496  geranylgeranyl reductase  20.95 
 
 		 361 aa  51.6  0.00003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.963353  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0864  geranylgeranyl reductase  22.01 
 
 		 396 aa  50.8  0.00004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000799674  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1441  HI0933-like protein  27.54 
 
 		 394 aa  50.4  0.00006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0590  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  30.65 
 
 		 407 aa  50.4  0.00006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  decreased coverage  0.00186747  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0539  geranylgeranyl reductase  24.94 
 
 		 391 aa  50.1  0.00007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0718  geranylgeranyl reductase  20.58 
 
 		 387 aa  49.7  0.00009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2099  hypothetical protein  26 
 
 		 396 aa  49.7  0.00009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1341  hypothetical protein  28.06 
 
 		 393 aa  48.5  0.0002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4050  FAD-dependent oxidoreductase  20.95 
 
 		 570 aa  48.1  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000538899  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0599  HI0933 family protein  30.99 
 
 		 392 aa  48.1  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.623073 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1090  bacteriochlorophyll synthase 43 kDa subunit  21.13 
 
 		 385 aa  48.1  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0206  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  34.31 
 
 		 488 aa  47.4  0.0004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.324134  normal  0.930793 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0172  bacteriochlorophyll synthase  22.54 
 
 		 396 aa  47.8  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.935683 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2980  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  67.74 
 
 		 309 aa  47  0.0007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1395  FAD-dependent oxidoreductase  22.42 
 
 		 553 aa  46.2  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1307  geranylgeranyl reductase  20.22 
 
 		 391 aa  46.2  0.001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.398981  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1304  FAD-dependent oxidoreductase  19.91 
 
 		 535 aa  45.8  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.26478  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3898  tryptophan halogenase  24.53 
 
 		 429 aa  46.2  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4218  FAD-dependent oxidoreductase  22.08 
 
 		 579 aa  46.6  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43800  predicted protein  37.84 
 
 		 528 aa  45.4  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28030  HI0933-like protein  28.66 
 
 		 411 aa  45.4  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0227  monooxygenase FAD-binding  21.43 
 
 		 596 aa  45.4  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0262  flavoprotein  54.29 
 
 		 424 aa  45.4  0.002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000227955  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4466  hypothetical protein  23.55 
 
 		 394 aa  44.7  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.119173 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0522  geranylgeranyl reductase  20.74 
 
 		 390 aa  44.3  0.004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3800  hypothetical protein  42.62 
 
 		 391 aa  43.9  0.005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.225042  normal  0.0906126 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5008  conserved hypothetical protein TIGR00275  28.47 
 
 		 392 aa  44.3  0.005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0017  hypothetical protein  65.62 
 
 		 422 aa  44.3  0.005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0002  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  64.52 
 
 		 307 aa  43.9  0.006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.512704 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1264  dihydrolipoamide dehydrogenase  52.94 
 
 		 472 aa  43.9  0.006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.71337  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1543  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.55 
 
 		 470 aa  43.9  0.006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.593732  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4409  monooxygenase, FAD-binding  23.41 
 
 		 405 aa  43.9  0.006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0826  acetoin/pyruvate dehydrogenase complex E3 component  43.75 
 
 		 496 aa  43.5  0.007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2209  hypothetical protein  54.84 
 
 		 430 aa  43.1  0.008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000224827  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2718  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  58.06 
 
 		 308 aa  43.5  0.008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3204  HI0933-like protein  23.61 
 
 		 410 aa  43.5  0.008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0672  HI0933 family protein  27.43 
 
 		 436 aa  43.5  0.008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5000  glucose-inhibited division protein A  26.53 
 
 		 535 aa  43.5  0.008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.001009  normal  0.292881 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0515  hypothetical protein  27.03 
 
 		 392 aa  43.5  0.008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7215  FAD-dependent oxidoreductase  21.38 
 
 		 569 aa  43.1  0.009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2742  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  70.97 
 
 		 493 aa  43.1  0.009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0723541  normal  0.340256 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1386  geranylgeranyl reductase  20.42 
 
 		 390 aa  43.1  0.01  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0623  monooxygenase FAD-binding  23.63 
 
 		 533 aa  43.1  0.01  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0800  hypothetical protein  52.27 
 
 		 519 aa  43.1  0.01  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1910  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  53.85 
 
 		 329 aa  43.1  0.01  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00000326035  hitchhiker  0.0000549651 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>