More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_5000 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_4872  putative fumarate/succinate reductase flavoprotein subunit  63.62 
 
 
542 aa  660    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.498075  normal  0.251586 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5000  glucose-inhibited division protein A  100 
 
 
535 aa  1104    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.001009  normal  0.292881 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4335  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein-like protein  65.18 
 
 
549 aa  649    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0548  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  62.74 
 
 
536 aa  679    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1895  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  62.77 
 
 
540 aa  593  1e-168  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3480  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  57.31 
 
 
540 aa  547  1e-154  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3157  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  48.48 
 
 
532 aa  449  1e-125  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.532251  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5007  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein-like  50.76 
 
 
563 aa  451  1e-125  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0471341  normal  0.841595 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1387  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  48.07 
 
 
522 aa  438  1e-121  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.185112  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2620  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  47.41 
 
 
532 aa  427  1e-118  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2581  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein-like protein  47.13 
 
 
532 aa  423  1e-117  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2626  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  47.13 
 
 
532 aa  423  1e-117  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.110087  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21930  oxidoreductase flavoprotein, asfA  45.98 
 
 
545 aa  421  1e-116  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3287  putative oxidoreductase (AsfA-like), putative L-aspartate oxidase  44.98 
 
 
532 aa  390  1e-107  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.928272  normal  0.259956 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3085  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  44.51 
 
 
526 aa  361  2e-98  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0528361 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2093  Succinate dehydrogenase  25.77 
 
 
576 aa  100  5e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4205  putative oxidoreductase  23.43 
 
 
574 aa  100  9e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4093  putative oxidoreductase  23.43 
 
 
574 aa  100  9e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.668775  normal  0.807912 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0669  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  24.73 
 
 
568 aa  92.8  1e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1608  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  24.73 
 
 
590 aa  93.2  1e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.325786  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1079  L-aspartate oxidase  25.69 
 
 
534 aa  92.8  1e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.574449  hitchhiker  0.00000212842 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0571  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  24.73 
 
 
590 aa  93.2  1e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.75977  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1635  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein-like protein  24.73 
 
 
590 aa  93.2  1e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0484  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  24.73 
 
 
590 aa  93.2  1e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.131154  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2241  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  24.73 
 
 
590 aa  93.2  1e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0198056  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2057  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  25.62 
 
 
556 aa  90.5  6e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5622  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  24.35 
 
 
591 aa  89.7  1e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.427862  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1661  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  24.35 
 
 
591 aa  89.7  1e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.729694  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2021  L-aspartate oxidase  24.34 
 
 
525 aa  88.6  2e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00800394  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0271  putative oxidoreductase  27.13 
 
 
573 aa  89.4  2e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.144882 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0677  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  23.32 
 
 
566 aa  88.2  3e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0486405  hitchhiker  0.0000605931 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2224  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  25.17 
 
 
610 aa  88.2  4e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.559161 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0430  succinate dehydrogenase subunit A  23.83 
 
 
568 aa  87.4  6e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0445  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  23.57 
 
 
589 aa  87  7e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0470195  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3053  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  24.16 
 
 
540 aa  86.7  9e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02468  L-aspartate oxidase  22.45 
 
 
540 aa  85.5  0.000000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.757112  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0170  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  23.43 
 
 
566 aa  85.5  0.000000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3163  putative oxidoreductase  22.7 
 
 
576 aa  85.9  0.000000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.410228  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02432  hypothetical protein  22.45 
 
 
540 aa  85.5  0.000000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.874408  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3061  L-aspartate oxidase  23.11 
 
 
539 aa  85.5  0.000000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000289617 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3278  fumarate reductase flavoprotein subunit  23.13 
 
 
603 aa  85.5  0.000000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1094  L-aspartate oxidase  22.63 
 
 
540 aa  85.1  0.000000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.527185  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2862  L-aspartate oxidase  22.99 
 
 
540 aa  84.7  0.000000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0820367  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2730  L-aspartate oxidase  22.45 
 
 
540 aa  84.7  0.000000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.624821  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1061  L-aspartate oxidase  23.27 
 
 
534 aa  84.3  0.000000000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00092764  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0678  putative oxidoreductase  22.87 
 
 
578 aa  84  0.000000000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.434606 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2728  L-aspartate oxidase  22.63 
 
 
540 aa  84  0.000000000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.100043  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002237  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  21.66 
 
 
599 aa  83.6  0.000000000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1103  L-aspartate oxidase  22.47 
 
 
540 aa  83.6  0.000000000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.369167  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2251  L-aspartate oxidase  22.84 
 
 
535 aa  82.8  0.00000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00695711 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2230  fumarate reductase flavoprotein subunit  21.84 
 
 
602 aa  83.2  0.00000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1965  L-aspartate oxidase  22.83 
 
 
623 aa  83.2  0.00000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1159  L-aspartate oxidase  22.02 
 
 
531 aa  82.8  0.00000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3453  succinate dehydrogenase  23.38 
 
 
576 aa  82.8  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5013  putative oxidoreductase  22.16 
 
 
574 aa  82.8  0.00000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00131  fumarate reductase flavoprotein subunit  22.4 
 
 
606 aa  83.2  0.00000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1213  L-aspartate oxidase  23.44 
 
 
538 aa  82.4  0.00000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0621913  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3084  L-aspartate oxidase  26.27 
 
 
535 aa  82.4  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.169021 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3067  L-aspartate oxidase  26.13 
 
 
548 aa  82  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.117293  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0811  L-aspartate oxidase  22.71 
 
 
531 aa  82.4  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00614841  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3127  L-aspartate oxidase  26.13 
 
 
548 aa  82  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.513503 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4884  putative oxidoreductase  22.9 
 
 
578 aa  81.6  0.00000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.245713  normal  0.346185 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1197  L-aspartate oxidase  22.32 
 
 
533 aa  82  0.00000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00025723  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4551  L-aspartate oxidase  26.39 
 
 
533 aa  81.6  0.00000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.673913  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34900  putative oxidoreductase  23.23 
 
 
574 aa  81.6  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000183064  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2856  L-aspartate oxidase  22.91 
 
 
540 aa  81.6  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.151453  normal  0.187887 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3812  L-aspartate oxidase  22.12 
 
 
530 aa  81.3  0.00000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0403112  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3078  L-aspartate oxidase  22.32 
 
 
533 aa  81.3  0.00000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0341132  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2467  L-aspartate oxidase  22.85 
 
 
539 aa  80.5  0.00000000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.997427  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2852  L-aspartate oxidase  22.72 
 
 
540 aa  80.1  0.00000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.184893  normal  0.278605 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1298  putative oxidoreductase  22.22 
 
 
579 aa  80.1  0.00000000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.10343 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0258  succinate dehydrogenase or fumarate reductase flavoprotein subunit  23.69 
 
 
570 aa  80.1  0.00000000000009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.408248 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2968  L-aspartate oxidase  22.85 
 
 
540 aa  79.7  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0245  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  21.46 
 
 
552 aa  79.3  0.0000000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2788  fumarate reductase flavoprotein subunit  21.12 
 
 
617 aa  79.7  0.0000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2751  L-aspartate oxidase  22.53 
 
 
539 aa  79.7  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.53736  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2792  L-aspartate oxidase  22.32 
 
 
539 aa  79  0.0000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.016617  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2834  L-aspartate oxidase  22.72 
 
 
540 aa  79.3  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.100997  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1360  L-aspartate oxidase  23.43 
 
 
538 aa  78.6  0.0000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.648102  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2773  L-aspartate oxidase  22.86 
 
 
537 aa  78.6  0.0000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3156  L-aspartate oxidase  22.22 
 
 
534 aa  78.2  0.0000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00307505  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9157  Aspartate oxidase-like protein  25.09 
 
 
863 aa  78.2  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.15159  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1152  L-aspartate oxidase  22.97 
 
 
537 aa  78.6  0.0000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.172404  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2801  putative oxidoreductase  22.87 
 
 
578 aa  78.2  0.0000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.312547  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1114  succinate dehydrogenase subunit A  23.92 
 
 
573 aa  77.8  0.0000000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.358332  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1164  aspartate oxidase  23.25 
 
 
515 aa  77.8  0.0000000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000105405  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4485  L-aspartate oxidase  25.74 
 
 
545 aa  77.8  0.0000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3687  L-aspartate oxidase  24.09 
 
 
535 aa  77.8  0.0000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26940  succinate dehydrogenase subunit A  22.93 
 
 
572 aa  77.8  0.0000000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.898505  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3566  L-aspartate oxidase  24.49 
 
 
535 aa  77.4  0.0000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3351  putative oxidoreductase  22.48 
 
 
582 aa  77  0.0000000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.583827  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6149  putative oxidoreductase  24.69 
 
 
583 aa  77  0.0000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03007  L-aspartate oxidase  21.6 
 
 
561 aa  77  0.0000000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00568671  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1490  L-aspartate oxidase  22.47 
 
 
541 aa  76.6  0.0000000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000326406  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3959  L-aspartate oxidase  22.86 
 
 
538 aa  76.6  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0145012  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0855  L-aspartate oxidase  23.79 
 
 
538 aa  76.3  0.000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000253959  normal  0.0344943 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0999  L-aspartate oxidase  23.79 
 
 
538 aa  76.3  0.000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000540636  normal  0.1199 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4191  putative oxidoreductase  22.02 
 
 
580 aa  76.6  0.000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.991116  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0064  L-aspartate oxidase  21.24 
 
 
543 aa  76.6  0.000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.351527  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2487  L-aspartate oxidase  23.08 
 
 
531 aa  76.6  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000814089  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>