More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_0017 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_0017  hypothetical protein  100 
 
 
422 aa  852    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0017  hypothetical protein  76.35 
 
 
405 aa  612  9.999999999999999e-175  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00161  hypothetical protein  61.15 
 
 
440 aa  491  1e-137  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0130  hypothetical protein  46.4 
 
 
405 aa  414  1e-114  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.700212  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1467  hypothetical protein  46.42 
 
 
415 aa  411  1e-114  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.196184  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07621  hypothetical protein  45.79 
 
 
407 aa  413  1e-114  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.0179283 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15731  flavoprotein  45.57 
 
 
410 aa  408  1e-113  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15581  flavoprotein  45.57 
 
 
414 aa  405  1.0000000000000001e-112  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.379962  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15361  flavoprotein  43.32 
 
 
411 aa  390  1e-107  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0647863  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1574  HI0933 family protein  44.83 
 
 
409 aa  355  1e-96  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1597  HI0933 family protein  44.83 
 
 
409 aa  354  2e-96  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.168995 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2067  hypothetical protein  47.88 
 
 
415 aa  341  1e-92  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3520  HI0933 family protein  44.01 
 
 
408 aa  339  7e-92  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3929  HI0933-like protein  44.62 
 
 
413 aa  338  9.999999999999999e-92  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00246834 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0791  HI0933 family protein  42.16 
 
 
408 aa  328  2.0000000000000001e-88  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.371857 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1396  hypothetical protein  39.6 
 
 
402 aa  325  9e-88  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0345  HI0933 family protein  41.12 
 
 
409 aa  323  3e-87  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2316  hypothetical protein  42.67 
 
 
410 aa  323  4e-87  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2502  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein-like  42.74 
 
 
413 aa  316  6e-85  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.472711  normal  0.7121 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1282  hypothetical protein  39.75 
 
 
403 aa  304  2.0000000000000002e-81  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.488791  normal  0.628895 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5845  HI0933 family protein  38.37 
 
 
408 aa  299  5e-80  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.599184  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5032  HI0933 family protein  39.16 
 
 
404 aa  300  5e-80  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1503  hypothetical protein  43.69 
 
 
433 aa  295  1e-78  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04960  hypothetical protein  36.59 
 
 
406 aa  289  7e-77  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_14937  predicted protein  36.73 
 
 
436 aa  253  3e-66  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.723308  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0708  FAD dependent oxidoreductase  33.25 
 
 
409 aa  208  1e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1733  HI0933 family protein  33.17 
 
 
408 aa  197  4.0000000000000005e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1926  HI0933-like protein  33.01 
 
 
414 aa  195  1e-48  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2209  hypothetical protein  33.57 
 
 
430 aa  195  1e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000224827  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0927  HI0933 family protein  33.74 
 
 
408 aa  193  5e-48  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.1016 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1561  hypothetical protein  31.83 
 
 
455 aa  189  8e-47  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1567  hypothetical protein  32.69 
 
 
393 aa  187  2e-46  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0861  HI0933 family protein  30.81 
 
 
412 aa  187  3e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000883164  normal  0.741633 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0030  HI0933 family protein  36.17 
 
 
412 aa  187  4e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1437  hypothetical protein  32.61 
 
 
413 aa  186  5e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0672  HI0933 family protein  33.41 
 
 
436 aa  186  6e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1601  hypothetical protein  31.73 
 
 
406 aa  186  6e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1752  hypothetical protein  32.36 
 
 
390 aa  185  1.0000000000000001e-45  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00572064  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1339  hypothetical protein  29.85 
 
 
406 aa  182  7e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0646456  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3399  HI0933 family protein  32.47 
 
 
419 aa  182  1e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000862547  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2050  hypothetical protein  33.76 
 
 
419 aa  182  1e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000118961  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1150  YhiN family flavoprotein  29.61 
 
 
406 aa  180  4.999999999999999e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.823305  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0262  flavoprotein  30.8 
 
 
424 aa  178  2e-43  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000227955  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1810  hypothetical protein  29.85 
 
 
422 aa  176  7e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.261505  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1845  hypothetical protein  29.85 
 
 
422 aa  176  7e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1197  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  28.47 
 
 
403 aa  174  1.9999999999999998e-42  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00144707  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2547  hypothetical protein  32.85 
 
 
394 aa  174  3.9999999999999995e-42  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.374165  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1122  hypothetical protein  33.73 
 
 
443 aa  173  5e-42  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.138213  normal  0.379331 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1378  hypothetical protein  31.35 
 
 
415 aa  173  6.999999999999999e-42  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.275116 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1315  hypothetical protein  30.46 
 
 
420 aa  172  7.999999999999999e-42  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.476308  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1025  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  28.47 
 
 
403 aa  172  7.999999999999999e-42  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0617168  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0908  HI0933 family protein  32.93 
 
 
426 aa  172  1e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2761  HI0933 family protein  31.84 
 
 
427 aa  171  2e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1707  HI0933-like protein  33.33 
 
 
399 aa  171  3e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.105129 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2552  hypothetical protein  29.93 
 
 
393 aa  169  8e-41  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4850  hypothetical protein  31.48 
 
 
423 aa  169  9e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.473198  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4843  conserved hypothetical protein TIGR00275  31.48 
 
 
423 aa  169  9e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000266049  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4820  conserved hypothetical protein TIGR00275  31.23 
 
 
423 aa  169  1e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0848463  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2949  putative FAD dependent oxidoreductase  30.86 
 
 
401 aa  169  1e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0416  hypothetical protein TIGR00275  30.99 
 
 
423 aa  168  2e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0139426  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4440  NAD(FAD)-utilizing dehydrogenase  31.23 
 
 
423 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0621454  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4458  NAD(FAD)-utilizing dehydrogenase  31.23 
 
 
423 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00549646  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0187  HI0933 family protein  34.19 
 
 
433 aa  167  2.9999999999999998e-40  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2680  hypothetical protein  30 
 
 
393 aa  167  2.9999999999999998e-40  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2451  hypothetical protein  27.29 
 
 
446 aa  167  4e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000138411  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4604  hypothetical protein  31.23 
 
 
423 aa  167  4e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00629914  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4960  hypothetical protein  31.23 
 
 
423 aa  167  4e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.979568  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4539  hypothetical protein  30.62 
 
 
423 aa  167  4e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4825  conserved hypothetical protein TIGR00275  31.23 
 
 
423 aa  167  4e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3371  hypothetical protein  30.75 
 
 
426 aa  166  1.0000000000000001e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000385799  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1022  HI0933 family protein  26.1 
 
 
403 aa  164  2.0000000000000002e-39  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1476  HI0933 family protein  33.33 
 
 
413 aa  164  2.0000000000000002e-39  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2135  hypothetical protein  31.02 
 
 
415 aa  164  2.0000000000000002e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00468248  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3274  hypothetical protein  32.13 
 
 
396 aa  164  3e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.142928  normal  0.877884 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0599  HI0933 family protein  31.04 
 
 
392 aa  164  3e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.623073 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0156  hypothetical protein  31.81 
 
 
392 aa  163  6e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1209  HI0933 family protein  32.65 
 
 
443 aa  162  7e-39  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00892484 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1798  hypothetical protein  30.58 
 
 
392 aa  161  2e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3945  hypothetical protein  31.03 
 
 
405 aa  160  4e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1052  hypothetical protein  30.83 
 
 
442 aa  160  5e-38  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.843089  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4030  HI0933 family protein  31.79 
 
 
414 aa  159  6e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0303  hypothetical protein  30.98 
 
 
394 aa  159  1e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.918662  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_183  hypothetical protein  31.08 
 
 
435 aa  158  1e-37  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.277985  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2183  hypothetical protein  31.98 
 
 
396 aa  158  2e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.286863 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2387  hypothetical protein  30.48 
 
 
410 aa  157  3e-37  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1621  HI0933 family protein  31.33 
 
 
394 aa  157  3e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0160754  normal  0.370908 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2623  hypothetical protein  30.99 
 
 
393 aa  157  3e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0195  hypothetical protein  30.84 
 
 
435 aa  157  4e-37  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0437859  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0158  hypothetical protein  29.78 
 
 
435 aa  156  5.0000000000000005e-37  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1349  hypothetical protein  30.83 
 
 
393 aa  156  5.0000000000000005e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28030  HI0933-like protein  31.52 
 
 
411 aa  156  7e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1430  HI0933 family protein  31.62 
 
 
452 aa  155  9e-37  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.223271  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2378  HI0933 family protein  29.85 
 
 
412 aa  155  1e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.270996  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1341  hypothetical protein  31.31 
 
 
393 aa  155  1e-36  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2635  YhiN family flavoprotein  28.74 
 
 
414 aa  155  1e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.457541  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1282  HI0933 family protein  31.64 
 
 
457 aa  154  4e-36  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.138775  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0291  hypothetical protein  31.72 
 
 
408 aa  153  4e-36  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0825  HI0933 family protein  28.5 
 
 
414 aa  154  4e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.689631 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3858  hypothetical protein  29.15 
 
 
398 aa  153  5e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00469108  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2952  hypothetical protein  28.92 
 
 
415 aa  153  5e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00592847  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>