163 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_0002 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013202  Hmuk_0002  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  100 
 
 		 307 aa  625  1e-178  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.512704 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1462  thiazole biosynthesis enzyme  89.68 
 
 		 310 aa  545  1e-154  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2419  thiazole biosynthesis enzyme  88.39 
 
 		 309 aa  531  1e-150  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2718  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  82.14 
 
 		 308 aa  491  9.999999999999999e-139  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2980  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  71.94 
 
 		 309 aa  429  1e-119  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0678  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  49.82 
 
 		 272 aa  253  3e-66  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2100  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  39.5 
 
 		 260 aa  172  7.999999999999999e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1121  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  38.97 
 
 		 286 aa  171  2e-41  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1609  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  38.55 
 
 		 268 aa  169  5e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000241948  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2251  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  37.28 
 
 		 254 aa  165  6.9999999999999995e-40  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2426  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  36.65 
 
 		 258 aa  165  9e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00205999  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1998  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  40.22 
 
 		 273 aa  163  3e-39  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.310517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1498  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  38.81 
 
 		 275 aa  160  2e-38  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.16629  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1555  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  38.3 
 
 		 261 aa  160  3e-38  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1411  thiazole biosynthesis enzyme  36.3 
 
 		 267 aa  160  4e-38  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0421  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  37.28 
 
 		 271 aa  159  4e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000154841  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2109  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  35.74 
 
 		 258 aa  159  5e-38  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1052  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  39.13 
 
 		 259 aa  158  1e-37  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.273545  normal  0.78871 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1420  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  34.27 
 
 		 263 aa  156  5.0000000000000005e-37  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.043335 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0963  thiazole biosynthesis enzyme  34.3 
 
 		 254 aa  154  2.9999999999999998e-36  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0277  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  36.59 
 
 		 255 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.720039 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1358  thiazole biosynthesis enzyme  37.27 
 
 		 264 aa  151  2e-35  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000774298  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1935  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  34.66 
 
 		 254 aa  149  4e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_50942  predicted protein  32.89 
 
 		 351 aa  150  4e-35  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.920544 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2221  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  34.36 
 
 		 271 aa  149  5e-35  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000384751 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0859  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  35.94 
 
 		 259 aa  143  4e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.841302  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0663  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  35.74 
 
 		 261 aa  139  4.999999999999999e-32  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.397509  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0798  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  35.97 
 
 		 263 aa  139  8.999999999999999e-32  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0725876  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0142  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  35.64 
 
 		 248 aa  138  1e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0140  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  35.64 
 
 		 248 aa  138  1e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03928  Putative thiazole synthaseTHI4_ASPOR Thiazole biosynthetic enzyme, mitochondrial ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q76B84]  31.86 
 
 		 331 aa  135  7.000000000000001e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.514294 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1007  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  34.17 
 
 		 256 aa  131  1.0000000000000001e-29  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1422  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  33.7 
 
 		 277 aa  127  2.0000000000000002e-28  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0226  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  35.61 
 
 		 261 aa  125  1e-27  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0597  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  35.61 
 
 		 262 aa  125  1e-27  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.469921  normal  0.642946 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1321  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  34.89 
 
 		 261 aa  122  7e-27  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1590  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  34.77 
 
 		 258 aa  122  8e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00059443  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3436  FAD dependent oxidoreductase  42.31 
 
 		 464 aa  49.3  0.00008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0040  amine oxidase  51.16 
 
 		 463 aa  49.3  0.00008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1447  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  38.46 
 
 		 1012 aa  48.9  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2761  HI0933 family protein  39.34 
 
 		 427 aa  48.9  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2085  putative FAD-binding dehydrogenase  40.45 
 
 		 558 aa  48.1  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.376668  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0040  putrescine oxidase  51.22 
 
 		 462 aa  48.1  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2807  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  36.92 
 
 		 1012 aa  47.4  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3262  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  57.14 
 
 		 687 aa  47.8  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002914  2,4-dienoyl-CoA reductase [NADPH]  34.18 
 
 		 670 aa  47.4  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0255137  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4935  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  35.85 
 
 		 605 aa  47  0.0004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03043  hypothetical protein  31.25 
 
 		 670 aa  47  0.0004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2101  monooxygenase FAD-binding protein  40 
 
 		 368 aa  46.6  0.0005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2167  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  40.28 
 
 		 914 aa  46.6  0.0005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1888  carotenoid isomerase, putative  56.76 
 
 		 505 aa  46.6  0.0005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5080  amine oxidase  67.65 
 
 		 506 aa  46.6  0.0005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.984429  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5168  amine oxidase  67.65 
 
 		 506 aa  46.6  0.0005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5459  amine oxidase  67.65 
 
 		 506 aa  46.6  0.0005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.723961  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0638  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  52.5 
 
 		 414 aa  46.6  0.0005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1884  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  56.41 
 
 		 419 aa  46.6  0.0005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.254068  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4482  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  45.1 
 
 		 490 aa  46.6  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1311  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  52.38 
 
 		 776 aa  46.6  0.0006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.98211  hitchhiker  0.000275945 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2151  amine oxidase  55.26 
 
 		 508 aa  46.6  0.0006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1564  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  32.32 
 
 		 891 aa  46.2  0.0006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1287  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  63.89 
 
 		 420 aa  46.2  0.0007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1545  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  43.33 
 
 		 365 aa  45.8  0.0009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0160439 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07214  NADPH-dependent FMN reductase Lot6, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G06600)  34.52 
 
 		 463 aa  45.4  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1584  heterodisulfide reductase, subunit A  62.86 
 
 		 412 aa  45.8  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00494789  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1867  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  39.62 
 
 		 472 aa  45.4  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.00543949  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1831  protoporphyrinogen oxidase  36.78 
 
 		 447 aa  45.1  0.001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3482  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  53.66 
 
 		 683 aa  45.8  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2209  hypothetical protein  36.51 
 
 		 430 aa  45.4  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000224827  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3271  Fe-S oxidoreductase  36.49 
 
 		 763 aa  45.1  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1260  FAD dependent oxidoreductase  50 
 
 		 438 aa  45.4  0.001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0237  putative selenate reductase subunit YgfK  51.28 
 
 		 997 aa  45.4  0.001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0479  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  28.8 
 
 		 425 aa  45.1  0.001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000230935  decreased coverage  0.000263259 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4456  nopaline dehydrogenase, putative  51.28 
 
 		 464 aa  44.7  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.733359  hitchhiker  0.00000723906 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1043  putative FAD-binding dehydrogenase  39.56 
 
 		 558 aa  45.1  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00140  fumarate reductase (NADH), putative  52.5 
 
 		 635 aa  44.7  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0434389  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2849  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  56.41 
 
 		 677 aa  44.7  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6399  twin-arginine translocation pathway signal  29.88 
 
 		 482 aa  44.3  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1647  heterodisulfide reductase, subunit A  40.32 
 
 		 752 aa  44.3  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0109393  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0541  hypothetical protein  44.44 
 
 		 558 aa  45.1  0.002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.9586 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1188  phytoene desaturase  50 
 
 		 461 aa  44.7  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.045363  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5205  amine oxidase  58.33 
 
 		 565 aa  44.3  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0766  amine oxidase  54.05 
 
 		 522 aa  44.3  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2135  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  55.26 
 
 		 412 aa  44.3  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0760  FAD dependent oxidoreductase  57.14 
 
 		 503 aa  44.3  0.002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.522072 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0902  hypothetical protein  48.72 
 
 		 465 aa  44.3  0.002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.787196  normal  0.0359011 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0137  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  55.26 
 
 		 1010 aa  44.7  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0143  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  40 
 
 		 1010 aa  44.7  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0544  amine oxidase  54.05 
 
 		 525 aa  45.1  0.002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00189501  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1111  heterodisulfide reductase, putative  56.76 
 
 		 412 aa  44.3  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0204216  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2373  phytoene desaturase  58.97 
 
 		 519 aa  43.9  0.003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.145608  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10800  putative FAD-binding dehydrogenase  36.05 
 
 		 566 aa  44.3  0.003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0008  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  34.33 
 
 		 622 aa  44.3  0.003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2774  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  44.9 
 
 		 430 aa  44.3  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.372841  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1285  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  38.6 
 
 		 697 aa  44.3  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.565277 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1934  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  36.84 
 
 		 691 aa  43.9  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.230248  hitchhiker  0.00000161131 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2074  amine oxidase  47.73 
 
 		 479 aa  44.3  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1701  amine oxidase  55.26 
 
 		 503 aa  43.9  0.003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00066646 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3145  FAD dependent oxidoreductase  44.19 
 
 		 769 aa  43.9  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0790  methyl-viologen-reducing hydrogenase, delta subunit  57.14 
 
 		 700 aa  43.9  0.003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4135  carotene 7,8-desaturase  51.22 
 
 		 451 aa  43.9  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.190171  normal  0.792405 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>