More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_0262 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008527  LACR_0262  flavoprotein  100 
 
 		 424 aa  862    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000227955  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2761  HI0933 family protein  51.44 
 
 		 427 aa  447  1.0000000000000001e-124  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4843  conserved hypothetical protein TIGR00275  53.83 
 
 		 423 aa  422  1e-117  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000266049  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4850  hypothetical protein  53.83 
 
 		 423 aa  423  1e-117  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.473198  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4604  hypothetical protein  53.59 
 
 		 423 aa  422  1e-117  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00629914  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4440  NAD(FAD)-utilizing dehydrogenase  53.83 
 
 		 423 aa  423  1e-117  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0621454  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4458  NAD(FAD)-utilizing dehydrogenase  53.83 
 
 		 423 aa  423  1e-117  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00549646  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4960  hypothetical protein  53.59 
 
 		 423 aa  422  1e-117  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.979568  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0416  hypothetical protein TIGR00275  53.7 
 
 		 423 aa  423  1e-117  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0139426  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4820  conserved hypothetical protein TIGR00275  53.83 
 
 		 423 aa  422  1e-117  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0848463  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4825  conserved hypothetical protein TIGR00275  53.59 
 
 		 423 aa  422  1e-117  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4539  hypothetical protein  53.11 
 
 		 423 aa  419  1e-116  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0672  HI0933 family protein  49.4 
 
 		 436 aa  419  1e-116  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1810  hypothetical protein  50.72 
 
 		 422 aa  414  1e-114  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.261505  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3371  hypothetical protein  51.32 
 
 		 426 aa  412  1e-114  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000385799  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1845  hypothetical protein  50.72 
 
 		 422 aa  414  1e-114  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1315  hypothetical protein  50 
 
 		 420 aa  407  1.0000000000000001e-112  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.476308  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1752  hypothetical protein  49.51 
 
 		 390 aa  352  5.9999999999999994e-96  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00572064  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1567  hypothetical protein  47.95 
 
 		 393 aa  343  2.9999999999999997e-93  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2209  hypothetical protein  40.24 
 
 		 430 aa  338  9.999999999999999e-92  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000224827  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0908  HI0933 family protein  42.82 
 
 		 426 aa  335  1e-90  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0708  FAD dependent oxidoreductase  40.54 
 
 		 409 aa  314  1.9999999999999998e-84  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1601  hypothetical protein  40.73 
 
 		 406 aa  298  2e-79  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1733  HI0933 family protein  39.8 
 
 		 408 aa  289  8e-77  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2135  hypothetical protein  38.17 
 
 		 415 aa  280  3e-74  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00468248  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1339  hypothetical protein  39.47 
 
 		 406 aa  269  5.9999999999999995e-71  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0646456  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1150  YhiN family flavoprotein  39.47 
 
 		 406 aa  269  8e-71  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.823305  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1197  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  36.52 
 
 		 403 aa  266  5.999999999999999e-70  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00144707  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1025  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  36.27 
 
 		 403 aa  265  1e-69  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0617168  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0861  HI0933 family protein  37.35 
 
 		 412 aa  264  2e-69  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000883164  normal  0.741633 
 
 
-
 
NC_002936  DET0195  hypothetical protein  36.14 
 
 		 435 aa  262  1e-68  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0437859  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3399  HI0933 family protein  34.68 
 
 		 419 aa  260  4e-68  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000862547  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_183  hypothetical protein  36.39 
 
 		 435 aa  259  7e-68  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.277985  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0158  hypothetical protein  35.18 
 
 		 435 aa  255  1.0000000000000001e-66  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2378  HI0933 family protein  37.44 
 
 		 412 aa  252  7e-66  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.270996  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0927  HI0933 family protein  36.67 
 
 		 408 aa  244  3e-63  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.1016 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2451  hypothetical protein  32.62 
 
 		 446 aa  226  5.0000000000000005e-58  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000138411  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1022  HI0933 family protein  33.33 
 
 		 403 aa  222  9e-57  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1437  hypothetical protein  33.57 
 
 		 413 aa  219  8.999999999999998e-56  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2050  hypothetical protein  34.21 
 
 		 419 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000118961  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1237  HI0933-like protein  33.74 
 
 		 412 aa  217  2.9999999999999998e-55  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1378  hypothetical protein  33.9 
 
 		 415 aa  216  5.9999999999999996e-55  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.275116 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0030  HI0933 family protein  34.47 
 
 		 412 aa  214  1.9999999999999998e-54  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1926  HI0933-like protein  32.19 
 
 		 414 aa  213  3.9999999999999995e-54  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0291  hypothetical protein  35.51 
 
 		 408 aa  213  3.9999999999999995e-54  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2605  hypothetical protein  32.7 
 
 		 407 aa  211  2e-53  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00291222  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2949  putative FAD dependent oxidoreductase  34.38 
 
 		 401 aa  211  2e-53  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0187  HI0933 family protein  34.3 
 
 		 433 aa  207  3e-52  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1282  HI0933 family protein  32.53 
 
 		 457 aa  204  2e-51  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.138775  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4030  HI0933 family protein  31.16 
 
 		 414 aa  204  2e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2434  hypothetical protein  33.97 
 
 		 398 aa  204  3e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0627  HI0933 family protein  30.64 
 
 		 404 aa  201  1.9999999999999998e-50  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000930463  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0825  HI0933 family protein  30.98 
 
 		 414 aa  200  3.9999999999999996e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.689631 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2387  hypothetical protein  32.58 
 
 		 410 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2067  hypothetical protein  32.52 
 
 		 415 aa  198  1.0000000000000001e-49  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15731  flavoprotein  33.89 
 
 		 410 aa  197  3e-49  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3802  hypothetical protein  31.48 
 
 		 394 aa  196  6e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15581  flavoprotein  33.01 
 
 		 414 aa  196  7e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.379962  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1076  HI0933 family protein  31.83 
 
 		 407 aa  195  1e-48  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0249257  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2316  hypothetical protein  32.06 
 
 		 410 aa  195  1e-48  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0130  hypothetical protein  34.47 
 
 		 405 aa  194  2e-48  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.700212  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1467  hypothetical protein  31.87 
 
 		 415 aa  194  2e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.196184  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4466  hypothetical protein  31.57 
 
 		 394 aa  193  6e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.119173 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3520  HI0933 family protein  33.16 
 
 		 408 aa  192  7e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1561  hypothetical protein  29.09 
 
 		 455 aa  192  8e-48  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1430  HI0933 family protein  32.43 
 
 		 452 aa  191  2e-47  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.223271  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0599  HI0933 family protein  31.46 
 
 		 392 aa  191  2e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.623073 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4328  hypothetical protein  32.13 
 
 		 394 aa  191  2e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07621  hypothetical protein  33.5 
 
 		 407 aa  191  2.9999999999999997e-47  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.0179283 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0375  HI0933-like protein  33.25 
 
 		 393 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0049  hypothetical protein  32.37 
 
 		 394 aa  190  4e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000378391 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1122  hypothetical protein  31.31 
 
 		 443 aa  189  5.999999999999999e-47  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.138213  normal  0.379331 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3858  hypothetical protein  31.9 
 
 		 398 aa  189  7e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00469108  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0051  hypothetical protein  31.88 
 
 		 394 aa  189  9e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000135975 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28030  HI0933-like protein  31.73 
 
 		 411 aa  189  9e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0055  hypothetical protein  32.13 
 
 		 394 aa  189  9e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000153695 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0054  hypothetical protein  32.21 
 
 		 396 aa  189  1e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2502  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein-like  32.57 
 
 		 413 aa  188  1e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.472711  normal  0.7121 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0051  HI0933 family protein  31.88 
 
 		 394 aa  189  1e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.71818 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0345  HI0933 family protein  30.36 
 
 		 409 aa  187  2e-46  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001943  NAD(FAD)-utilizing dehydrogenase  31.67 
 
 		 397 aa  187  2e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00536  oxidoreductase  31.12 
 
 		 397 aa  188  2e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0047  hypothetical protein  32.13 
 
 		 394 aa  187  2e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00322221 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3791  hypothetical protein  31.67 
 
 		 398 aa  187  3e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3781  hypothetical protein  31.67 
 
 		 398 aa  187  3e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3962  hypothetical protein  31.9 
 
 		 398 aa  187  3e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.327369  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3901  hypothetical protein  31.67 
 
 		 398 aa  187  3e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.150346  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2952  hypothetical protein  32.22 
 
 		 415 aa  187  3e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00592847  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0047  hypothetical protein  31.64 
 
 		 394 aa  187  4e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4873  hypothetical protein  32.15 
 
 		 394 aa  186  6e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0791  HI0933 family protein  32.06 
 
 		 408 aa  186  6e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.371857 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0145  hypothetical protein  33.49 
 
 		 394 aa  186  7e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4688  hypothetical protein  32.68 
 
 		 413 aa  186  7e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1007  hypothetical protein  30.9 
 
 		 389 aa  186  8e-46  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.775195  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2635  YhiN family flavoprotein  32.46 
 
 		 414 aa  185  1.0000000000000001e-45  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.457541  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15361  flavoprotein  31.85 
 
 		 411 aa  185  1.0000000000000001e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0647863  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1018  HI0933 family protein  30.17 
 
 		 404 aa  184  2.0000000000000003e-45  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1052  hypothetical protein  31.05 
 
 		 442 aa  184  2.0000000000000003e-45  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.843089  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5249  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein-like  30.29 
 
 		 392 aa  184  3e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00166  predicted flavoprotein  31.7 
 
 		 393 aa  184  3e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>