More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_0927 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_0927  HI0933 family protein  100 
 
 
408 aa  825    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.1016 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2387  hypothetical protein  60.31 
 
 
410 aa  464  1e-129  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1926  HI0933-like protein  52.13 
 
 
414 aa  418  1e-116  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1378  hypothetical protein  52.58 
 
 
415 aa  419  1e-116  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.275116 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0291  hypothetical protein  49.12 
 
 
408 aa  363  3e-99  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0708  FAD dependent oxidoreductase  37.38 
 
 
409 aa  277  3e-73  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0030  HI0933 family protein  41.79 
 
 
412 aa  275  7e-73  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2135  hypothetical protein  41.58 
 
 
415 aa  264  2e-69  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00468248  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1733  HI0933 family protein  37.62 
 
 
408 aa  264  2e-69  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2209  hypothetical protein  35.94 
 
 
430 aa  264  3e-69  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000224827  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0187  HI0933 family protein  39.46 
 
 
433 aa  262  8.999999999999999e-69  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1601  hypothetical protein  39.46 
 
 
406 aa  261  2e-68  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3399  HI0933 family protein  38.08 
 
 
419 aa  251  2e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000862547  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0262  flavoprotein  36.67 
 
 
424 aa  248  1e-64  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000227955  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1197  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  36.05 
 
 
403 aa  246  4.9999999999999997e-64  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00144707  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1339  hypothetical protein  34.07 
 
 
406 aa  243  3.9999999999999997e-63  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0646456  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1025  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  35.87 
 
 
403 aa  243  5e-63  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0617168  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1567  hypothetical protein  36.18 
 
 
393 aa  242  7e-63  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1150  YhiN family flavoprotein  34.31 
 
 
406 aa  242  7e-63  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.823305  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3371  hypothetical protein  36.6 
 
 
426 aa  241  2e-62  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000385799  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1022  HI0933 family protein  34.33 
 
 
403 aa  240  4e-62  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1315  hypothetical protein  35.21 
 
 
420 aa  239  8e-62  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.476308  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0672  HI0933 family protein  37.41 
 
 
436 aa  239  9e-62  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0908  HI0933 family protein  37.59 
 
 
426 aa  238  1e-61  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2761  HI0933 family protein  36.34 
 
 
427 aa  236  5.0000000000000005e-61  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4440  NAD(FAD)-utilizing dehydrogenase  35.7 
 
 
423 aa  235  1.0000000000000001e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0621454  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4458  NAD(FAD)-utilizing dehydrogenase  35.7 
 
 
423 aa  235  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00549646  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1209  HI0933 family protein  39.53 
 
 
443 aa  235  1.0000000000000001e-60  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00892484 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4843  conserved hypothetical protein TIGR00275  35.7 
 
 
423 aa  234  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000266049  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4850  hypothetical protein  35.7 
 
 
423 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.473198  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4604  hypothetical protein  35.7 
 
 
423 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00629914  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1122  hypothetical protein  38.37 
 
 
443 aa  234  2.0000000000000002e-60  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.138213  normal  0.379331 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4960  hypothetical protein  35.7 
 
 
423 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.979568  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1282  HI0933 family protein  37.62 
 
 
457 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.138775  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4825  conserved hypothetical protein TIGR00275  35.7 
 
 
423 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0861  HI0933 family protein  34.64 
 
 
412 aa  234  2.0000000000000002e-60  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000883164  normal  0.741633 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2605  hypothetical protein  35.31 
 
 
407 aa  234  3e-60  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00291222  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0416  hypothetical protein TIGR00275  35.45 
 
 
423 aa  234  3e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0139426  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4820  conserved hypothetical protein TIGR00275  35.21 
 
 
423 aa  234  3e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0848463  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1752  hypothetical protein  35.01 
 
 
390 aa  233  4.0000000000000004e-60  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00572064  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1561  hypothetical protein  35.1 
 
 
455 aa  233  6e-60  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1430  HI0933 family protein  37.75 
 
 
452 aa  233  6e-60  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.223271  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0195  hypothetical protein  34.79 
 
 
435 aa  232  8.000000000000001e-60  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0437859  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1810  hypothetical protein  34.79 
 
 
422 aa  231  1e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.261505  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1845  hypothetical protein  34.79 
 
 
422 aa  231  1e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1437  hypothetical protein  35.78 
 
 
413 aa  232  1e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_183  hypothetical protein  34.54 
 
 
435 aa  229  6e-59  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.277985  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4539  hypothetical protein  35.21 
 
 
423 aa  229  6e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1007  hypothetical protein  36.67 
 
 
389 aa  228  1e-58  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.775195  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0627  HI0933 family protein  33.08 
 
 
404 aa  226  5.0000000000000005e-58  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000930463  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2050  hypothetical protein  38.3 
 
 
419 aa  226  6e-58  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000118961  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2378  HI0933 family protein  35.05 
 
 
412 aa  225  1e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.270996  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0158  hypothetical protein  33.5 
 
 
435 aa  225  1e-57  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28030  HI0933-like protein  33.74 
 
 
411 aa  224  3e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1052  hypothetical protein  35.89 
 
 
442 aa  222  9.999999999999999e-57  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.843089  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0599  HI0933 family protein  35.16 
 
 
392 aa  221  3e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.623073 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1237  HI0933-like protein  32.64 
 
 
412 aa  219  7e-56  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1476  HI0933 family protein  37.82 
 
 
413 aa  219  8.999999999999998e-56  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4030  HI0933 family protein  35.81 
 
 
414 aa  218  1e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0623  hypothetical protein  33.75 
 
 
428 aa  218  1e-55  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.228803 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2635  YhiN family flavoprotein  33.99 
 
 
414 aa  218  1e-55  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.457541  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2952  hypothetical protein  33.25 
 
 
415 aa  217  2.9999999999999998e-55  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00592847  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07280  hypothetical protein  33.98 
 
 
392 aa  215  9e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1621  HI0933 family protein  35.87 
 
 
394 aa  215  9.999999999999999e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0160754  normal  0.370908 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3962  hypothetical protein  32.5 
 
 
398 aa  215  9.999999999999999e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.327369  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2949  putative FAD dependent oxidoreductase  33.17 
 
 
401 aa  214  1.9999999999999998e-54  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0662  hypothetical protein  33.49 
 
 
392 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0741866  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3858  hypothetical protein  32.5 
 
 
398 aa  213  2.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00469108  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3901  hypothetical protein  32.5 
 
 
398 aa  213  3.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.150346  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3791  hypothetical protein  32.5 
 
 
398 aa  213  3.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3945  hypothetical protein  34.23 
 
 
405 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3781  hypothetical protein  32.5 
 
 
398 aa  213  3.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4953  hypothetical protein  35.52 
 
 
393 aa  213  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.683781  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0512  hypothetical protein  35.35 
 
 
410 aa  213  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.246775  normal  0.372207 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4826  hypothetical protein  35.52 
 
 
393 aa  213  5.999999999999999e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.270305  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3520  HI0933 family protein  33.85 
 
 
408 aa  213  5.999999999999999e-54  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5249  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein-like  33.33 
 
 
392 aa  212  7.999999999999999e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5002  hypothetical protein  35.1 
 
 
393 aa  211  1e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.32275  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3906  hypothetical protein  33.76 
 
 
397 aa  211  2e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0515  hypothetical protein  33.68 
 
 
392 aa  211  2e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0825  HI0933 family protein  34.68 
 
 
414 aa  210  4e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.689631 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00402  hypothetical protein  33.42 
 
 
393 aa  209  9e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.96178  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2680  hypothetical protein  32.51 
 
 
393 aa  209  1e-52  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2552  hypothetical protein  32.67 
 
 
393 aa  208  1e-52  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4032  hypothetical protein  33.5 
 
 
398 aa  208  1e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0123  hypothetical protein  33.5 
 
 
460 aa  207  2e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.291133  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4094  hypothetical protein  33.5 
 
 
460 aa  207  4e-52  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1341  hypothetical protein  35.45 
 
 
393 aa  206  4e-52  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4838  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  32.91 
 
 
400 aa  206  6e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3931  HI0933 family protein  33.75 
 
 
397 aa  206  6e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3781  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  32.66 
 
 
400 aa  206  8e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3274  hypothetical protein  35.09 
 
 
396 aa  206  8e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.142928  normal  0.877884 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3830  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  32.66 
 
 
400 aa  205  9e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0223  HI0933 family protein  32.66 
 
 
400 aa  205  1e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0476  hypothetical protein  34.8 
 
 
394 aa  205  1e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.900431  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3974  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  32.66 
 
 
400 aa  204  2e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3802  hypothetical protein  32.19 
 
 
394 aa  204  2e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3691  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  32.66 
 
 
400 aa  204  2e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2451  hypothetical protein  29.98 
 
 
446 aa  204  2e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000138411  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2316  hypothetical protein  34.39 
 
 
410 aa  204  2e-51  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>