More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_1733 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_1733  HI0933 family protein  100 
 
 		 408 aa  828    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0708  FAD dependent oxidoreductase  69.7 
 
 		 409 aa  594  1e-168  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2378  HI0933 family protein  55.99 
 
 		 412 aa  427  1e-118  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.270996  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1339  hypothetical protein  54.43 
 
 		 406 aa  427  1e-118  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0646456  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1150  YhiN family flavoprotein  54.68 
 
 		 406 aa  426  1e-118  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.823305  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1601  hypothetical protein  56.72 
 
 		 406 aa  424  1e-117  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3399  HI0933 family protein  55.84 
 
 		 419 aa  420  1e-116  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000862547  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2135  hypothetical protein  52.84 
 
 		 415 aa  414  1e-114  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00468248  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2451  hypothetical protein  50.36 
 
 		 446 aa  400  9.999999999999999e-111  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000138411  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2209  hypothetical protein  46.08 
 
 		 430 aa  372  1e-102  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000224827  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0861  HI0933 family protein  45.76 
 
 		 412 aa  355  5.999999999999999e-97  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000883164  normal  0.741633 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0030  HI0933 family protein  48.04 
 
 		 412 aa  353  2.9999999999999997e-96  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_183  hypothetical protein  43.49 
 
 		 435 aa  334  2e-90  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.277985  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0672  HI0933 family protein  41.71 
 
 		 436 aa  331  1e-89  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0195  hypothetical protein  43 
 
 		 435 aa  330  3e-89  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0437859  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0187  HI0933 family protein  45.97 
 
 		 433 aa  330  3e-89  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2761  HI0933 family protein  42.09 
 
 		 427 aa  329  7e-89  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0158  hypothetical protein  42.51 
 
 		 435 aa  327  3e-88  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1197  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  42.08 
 
 		 403 aa  319  5e-86  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00144707  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0908  HI0933 family protein  40.05 
 
 		 426 aa  317  2e-85  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4539  hypothetical protein  42.16 
 
 		 423 aa  315  8e-85  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4604  hypothetical protein  41.91 
 
 		 423 aa  314  9.999999999999999e-85  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00629914  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4825  conserved hypothetical protein TIGR00275  41.91 
 
 		 423 aa  314  9.999999999999999e-85  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4960  hypothetical protein  41.91 
 
 		 423 aa  314  9.999999999999999e-85  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.979568  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1025  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  41.83 
 
 		 403 aa  315  9.999999999999999e-85  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0617168  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4440  NAD(FAD)-utilizing dehydrogenase  41.91 
 
 		 423 aa  314  1.9999999999999998e-84  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0621454  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4458  NAD(FAD)-utilizing dehydrogenase  41.91 
 
 		 423 aa  314  1.9999999999999998e-84  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00549646  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3371  hypothetical protein  40.15 
 
 		 426 aa  314  1.9999999999999998e-84  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000385799  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4850  hypothetical protein  41.91 
 
 		 423 aa  313  2.9999999999999996e-84  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.473198  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4843  conserved hypothetical protein TIGR00275  41.91 
 
 		 423 aa  313  3.9999999999999997e-84  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000266049  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4820  conserved hypothetical protein TIGR00275  41.42 
 
 		 423 aa  312  5.999999999999999e-84  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0848463  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0416  hypothetical protein TIGR00275  41.42 
 
 		 423 aa  311  1e-83  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0139426  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2050  hypothetical protein  42.75 
 
 		 419 aa  311  2e-83  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000118961  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1315  hypothetical protein  41.02 
 
 		 420 aa  304  2.0000000000000002e-81  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.476308  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0262  flavoprotein  39.8 
 
 		 424 aa  303  4.0000000000000003e-81  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000227955  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1845  hypothetical protein  39.81 
 
 		 422 aa  297  3e-79  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1810  hypothetical protein  39.81 
 
 		 422 aa  297  3e-79  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.261505  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1752  hypothetical protein  40.05 
 
 		 390 aa  270  2.9999999999999997e-71  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00572064  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1567  hypothetical protein  38.27 
 
 		 393 aa  268  2e-70  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0927  HI0933 family protein  37.62 
 
 		 408 aa  262  6.999999999999999e-69  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.1016 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1022  HI0933 family protein  36.12 
 
 		 403 aa  248  2e-64  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1237  HI0933-like protein  36.88 
 
 		 412 aa  246  4e-64  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1926  HI0933-like protein  37.06 
 
 		 414 aa  246  4.9999999999999997e-64  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1561  hypothetical protein  33.49 
 
 		 455 aa  239  8e-62  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0291  hypothetical protein  38.46 
 
 		 408 aa  238  1e-61  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2952  hypothetical protein  34.15 
 
 		 415 aa  234  1.0000000000000001e-60  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00592847  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1378  hypothetical protein  34.16 
 
 		 415 aa  234  2.0000000000000002e-60  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.275116 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2635  YhiN family flavoprotein  33.5 
 
 		 414 aa  233  4.0000000000000004e-60  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.457541  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2387  hypothetical protein  35.53 
 
 		 410 aa  233  5e-60  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1437  hypothetical protein  37.32 
 
 		 413 aa  233  6e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4030  HI0933 family protein  37.12 
 
 		 414 aa  226  6e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0825  HI0933 family protein  34.44 
 
 		 414 aa  224  2e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.689631 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1467  hypothetical protein  35.29 
 
 		 415 aa  219  5e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.196184  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00402  hypothetical protein  34.22 
 
 		 393 aa  219  6e-56  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.96178  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15581  flavoprotein  34.56 
 
 		 414 aa  218  2e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.379962  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15361  flavoprotein  33.74 
 
 		 411 aa  216  5.9999999999999996e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0647863  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15731  flavoprotein  34.96 
 
 		 410 aa  216  7e-55  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2605  hypothetical protein  31.93 
 
 		 407 aa  214  1.9999999999999998e-54  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00291222  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1430  HI0933 family protein  32.44 
 
 		 452 aa  213  7e-54  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.223271  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1282  HI0933 family protein  32.27 
 
 		 457 aa  209  7e-53  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.138775  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0017  hypothetical protein  33.17 
 
 		 422 aa  209  9e-53  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0156  hypothetical protein  33.91 
 
 		 392 aa  208  1e-52  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2949  putative FAD dependent oxidoreductase  32.02 
 
 		 401 aa  208  2e-52  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4017  hypothetical protein  32.84 
 
 		 393 aa  206  8e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1621  HI0933 family protein  33.82 
 
 		 394 aa  205  1e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0160754  normal  0.370908 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0128  hypothetical protein  34.46 
 
 		 394 aa  204  2e-51  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0603016  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0064  hypothetical protein  33.5 
 
 		 397 aa  204  2e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0662  hypothetical protein  33.5 
 
 		 392 aa  204  3e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0741866  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07621  hypothetical protein  34.31 
 
 		 407 aa  204  3e-51  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.0179283 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1122  hypothetical protein  32.51 
 
 		 443 aa  202  6e-51  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.138213  normal  0.379331 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0051  hypothetical protein  31.59 
 
 		 394 aa  202  7e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000135975 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0047  hypothetical protein  31.34 
 
 		 394 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0130  hypothetical protein  34.31 
 
 		 405 aa  202  9.999999999999999e-51  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.700212  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3802  hypothetical protein  30.2 
 
 		 394 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5002  hypothetical protein  32.34 
 
 		 393 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.32275  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28030  HI0933-like protein  33.17 
 
 		 411 aa  202  9.999999999999999e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001943  NAD(FAD)-utilizing dehydrogenase  31.11 
 
 		 397 aa  202  9.999999999999999e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0627  HI0933 family protein  29.9 
 
 		 404 aa  201  1.9999999999999998e-50  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000930463  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1282  hypothetical protein  32.29 
 
 		 403 aa  201  1.9999999999999998e-50  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.488791  normal  0.628895 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07280  hypothetical protein  33.25 
 
 		 392 aa  201  3e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0055  hypothetical protein  31.02 
 
 		 394 aa  200  3.9999999999999996e-50  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000153695 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3520  HI0933 family protein  32.38 
 
 		 408 aa  200  3.9999999999999996e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1476  HI0933 family protein  33.59 
 
 		 413 aa  200  3.9999999999999996e-50  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0049  hypothetical protein  31.02 
 
 		 394 aa  199  6e-50  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000378391 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00536  oxidoreductase  30.37 
 
 		 397 aa  199  7.999999999999999e-50  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0051  HI0933 family protein  31.09 
 
 		 394 aa  199  7.999999999999999e-50  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.71818 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1209  HI0933 family protein  32.81 
 
 		 443 aa  199  1.0000000000000001e-49  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00892484 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0054  hypothetical protein  31.02 
 
 		 396 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5845  HI0933 family protein  33.01 
 
 		 408 aa  198  1.0000000000000001e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.599184  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4118  HI0933 family protein  30 
 
 		 394 aa  198  1.0000000000000001e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0047  hypothetical protein  31.02 
 
 		 394 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00322221 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5249  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein-like  32.61 
 
 		 392 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4826  hypothetical protein  32.26 
 
 		 393 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.270305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2434  hypothetical protein  30.77 
 
 		 398 aa  197  2.0000000000000003e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4328  hypothetical protein  31.09 
 
 		 394 aa  197  3e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2555  hypothetical protein  31.42 
 
 		 396 aa  197  3e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00730633  hitchhiker  0.0000156467 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4688  hypothetical protein  32.25 
 
 		 413 aa  196  4.0000000000000005e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3858  hypothetical protein  29.18 
 
 		 398 aa  196  5.000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00469108  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4953  hypothetical protein  32.01 
 
 		 393 aa  196  5.000000000000001e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.683781  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1899  HI0933 family protein  31.01 
 
 		 409 aa  196  7e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.279809  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>