More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_1567 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008532  STER_1567  hypothetical protein  100 
 
 
393 aa  803    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1752  hypothetical protein  79.07 
 
 
390 aa  619  1e-176  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00572064  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0262  flavoprotein  47.95 
 
 
424 aa  343  2e-93  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000227955  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4843  conserved hypothetical protein TIGR00275  45.17 
 
 
423 aa  317  2e-85  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000266049  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0672  HI0933 family protein  44.71 
 
 
436 aa  317  3e-85  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4604  hypothetical protein  45.01 
 
 
423 aa  317  3e-85  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00629914  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4440  NAD(FAD)-utilizing dehydrogenase  45.01 
 
 
423 aa  317  3e-85  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0621454  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4458  NAD(FAD)-utilizing dehydrogenase  45.01 
 
 
423 aa  317  3e-85  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00549646  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4960  hypothetical protein  45.01 
 
 
423 aa  317  3e-85  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.979568  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4825  conserved hypothetical protein TIGR00275  45.01 
 
 
423 aa  317  3e-85  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4850  hypothetical protein  45.01 
 
 
423 aa  316  4e-85  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.473198  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4820  conserved hypothetical protein TIGR00275  44.77 
 
 
423 aa  315  6e-85  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0848463  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0416  hypothetical protein TIGR00275  45.01 
 
 
423 aa  315  8e-85  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0139426  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3371  hypothetical protein  44.69 
 
 
426 aa  312  4.999999999999999e-84  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000385799  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4539  hypothetical protein  44.53 
 
 
423 aa  312  6.999999999999999e-84  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2761  HI0933 family protein  43.48 
 
 
427 aa  311  1e-83  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1315  hypothetical protein  44.74 
 
 
420 aa  301  1e-80  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.476308  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1810  hypothetical protein  44.15 
 
 
422 aa  299  4e-80  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.261505  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1845  hypothetical protein  44.15 
 
 
422 aa  299  4e-80  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0908  HI0933 family protein  41.36 
 
 
426 aa  284  2.0000000000000002e-75  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2209  hypothetical protein  39.36 
 
 
430 aa  283  4.0000000000000003e-75  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000224827  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1025  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  37.69 
 
 
403 aa  263  4e-69  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0617168  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1197  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  37.94 
 
 
403 aa  261  1e-68  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00144707  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0708  FAD dependent oxidoreductase  38.18 
 
 
409 aa  260  3e-68  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1733  HI0933 family protein  38.27 
 
 
408 aa  255  8e-67  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1601  hypothetical protein  37.91 
 
 
406 aa  249  4e-65  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1339  hypothetical protein  38.07 
 
 
406 aa  246  6e-64  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0646456  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1150  YhiN family flavoprotein  37.83 
 
 
406 aa  244  1.9999999999999999e-63  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.823305  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0927  HI0933 family protein  36.18 
 
 
408 aa  238  1e-61  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.1016 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1022  HI0933 family protein  36.29 
 
 
403 aa  236  5.0000000000000005e-61  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0861  HI0933 family protein  38.29 
 
 
412 aa  235  1.0000000000000001e-60  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000883164  normal  0.741633 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2378  HI0933 family protein  39.07 
 
 
412 aa  229  8e-59  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.270996  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1378  hypothetical protein  36.41 
 
 
415 aa  226  6e-58  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.275116 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0030  HI0933 family protein  37.01 
 
 
412 aa  223  6e-57  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2949  putative FAD dependent oxidoreductase  34.26 
 
 
401 aa  219  6e-56  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3399  HI0933 family protein  35.68 
 
 
419 aa  217  2e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000862547  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2451  hypothetical protein  35.78 
 
 
446 aa  215  9.999999999999999e-55  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000138411  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4017  hypothetical protein  31.73 
 
 
393 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2135  hypothetical protein  33.94 
 
 
415 aa  214  1.9999999999999998e-54  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00468248  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2387  hypothetical protein  34.99 
 
 
410 aa  214  2.9999999999999995e-54  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4118  HI0933 family protein  33.25 
 
 
394 aa  211  1e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3858  hypothetical protein  31.73 
 
 
398 aa  211  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00469108  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3802  hypothetical protein  31.65 
 
 
394 aa  211  2e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1282  hypothetical protein  33.99 
 
 
403 aa  211  2e-53  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.488791  normal  0.628895 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1899  HI0933 family protein  31.5 
 
 
409 aa  209  5e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.279809  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1926  HI0933-like protein  33.66 
 
 
414 aa  209  5e-53  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3962  hypothetical protein  31.82 
 
 
398 aa  209  6e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.327369  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001943  NAD(FAD)-utilizing dehydrogenase  32.58 
 
 
397 aa  209  7e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3901  hypothetical protein  31.81 
 
 
398 aa  209  9e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.150346  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3791  hypothetical protein  31.81 
 
 
398 aa  209  9e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0047  hypothetical protein  31.47 
 
 
394 aa  208  1e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0051  hypothetical protein  31.73 
 
 
394 aa  208  1e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  unclonable  0.0000135975 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3781  hypothetical protein  31.55 
 
 
398 aa  208  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0145  hypothetical protein  33.67 
 
 
394 aa  207  3e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0187  HI0933 family protein  35.56 
 
 
433 aa  206  4e-52  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0044  hypothetical protein  31.47 
 
 
394 aa  206  4e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4873  hypothetical protein  31.98 
 
 
394 aa  206  5e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4328  hypothetical protein  31.47 
 
 
394 aa  206  5e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0049  hypothetical protein  31.47 
 
 
394 aa  206  5e-52  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000378391 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0047  hypothetical protein  31.47 
 
 
394 aa  206  6e-52  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00322221 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0064  hypothetical protein  33.59 
 
 
397 aa  206  7e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4688  hypothetical protein  32.9 
 
 
413 aa  206  7e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0055  hypothetical protein  31.22 
 
 
394 aa  205  1e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000153695 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3274  hypothetical protein  33.08 
 
 
396 aa  205  1e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.142928  normal  0.877884 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0051  HI0933 family protein  31.22 
 
 
394 aa  205  1e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.71818 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2316  hypothetical protein  36.6 
 
 
410 aa  205  1e-51  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1621  HI0933 family protein  33.42 
 
 
394 aa  204  2e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0160754  normal  0.370908 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28030  HI0933-like protein  33.33 
 
 
411 aa  204  2e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1561  hypothetical protein  32.18 
 
 
455 aa  204  2e-51  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4466  hypothetical protein  30.96 
 
 
394 aa  204  3e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.119173 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1437  hypothetical protein  32.65 
 
 
413 aa  203  4e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0413  HI0933-like protein  33.17 
 
 
392 aa  203  5e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0650019  normal  0.0294705 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1282  HI0933 family protein  34.01 
 
 
457 aa  202  7e-51  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.138775  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1007  hypothetical protein  31.19 
 
 
389 aa  202  9e-51  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.775195  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1798  hypothetical protein  32.66 
 
 
392 aa  202  9.999999999999999e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00536  oxidoreductase  32.08 
 
 
397 aa  202  9.999999999999999e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4838  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  33.5 
 
 
400 aa  201  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4032  hypothetical protein  31.49 
 
 
398 aa  201  1.9999999999999998e-50  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2547  hypothetical protein  32.49 
 
 
394 aa  201  1.9999999999999998e-50  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.374165  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0054  hypothetical protein  31.22 
 
 
396 aa  201  3e-50  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0476  hypothetical protein  33.76 
 
 
394 aa  200  3e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.900431  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3906  hypothetical protein  31.95 
 
 
397 aa  200  3e-50  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0599  HI0933 family protein  32.99 
 
 
392 aa  199  5e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.623073 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4826  hypothetical protein  33.16 
 
 
393 aa  199  7.999999999999999e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.270305  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4204  HI0933 family protein  30.6 
 
 
399 aa  199  7.999999999999999e-50  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0123  hypothetical protein  31.23 
 
 
460 aa  199  7.999999999999999e-50  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.291133  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2434  hypothetical protein  32.4 
 
 
398 aa  199  7.999999999999999e-50  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4094  hypothetical protein  31.23 
 
 
460 aa  198  1.0000000000000001e-49  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0662  hypothetical protein  31.06 
 
 
392 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0741866  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3800  hypothetical protein  33.85 
 
 
391 aa  199  1.0000000000000001e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.225042  normal  0.0906126 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07280  hypothetical protein  31.06 
 
 
392 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0195  hypothetical protein  31.2 
 
 
435 aa  198  2.0000000000000003e-49  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0437859  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3691  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  33.25 
 
 
400 aa  197  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3974  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  33.25 
 
 
400 aa  197  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3830  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  33.25 
 
 
400 aa  198  2.0000000000000003e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4030  HI0933 family protein  32.47 
 
 
414 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3781  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  33.25 
 
 
400 aa  197  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03294  hypothetical protein  33.25 
 
 
400 aa  197  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.555868  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1349  hypothetical protein  32.49 
 
 
393 aa  197  2.0000000000000003e-49  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3931  HI0933 family protein  32.75 
 
 
397 aa  198  2.0000000000000003e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>