More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_2050 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_2050  hypothetical protein  100 
 
 		 419 aa  835    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000118961  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0187  HI0933 family protein  54.29 
 
 		 433 aa  427  1e-118  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0030  HI0933 family protein  50.25 
 
 		 412 aa  391  1e-107  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0708  FAD dependent oxidoreductase  46.29 
 
 		 409 aa  361  1e-98  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3399  HI0933 family protein  45.67 
 
 		 419 aa  345  7e-94  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000862547  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2135  hypothetical protein  47.95 
 
 		 415 aa  341  1e-92  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00468248  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0195  hypothetical protein  44.98 
 
 		 435 aa  328  1.0000000000000001e-88  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0437859  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_183  hypothetical protein  44.52 
 
 		 435 aa  327  3e-88  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.277985  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0158  hypothetical protein  43.61 
 
 		 435 aa  322  8e-87  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1733  HI0933 family protein  44.58 
 
 		 408 aa  321  1.9999999999999998e-86  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1601  hypothetical protein  41.23 
 
 		 406 aa  308  1.0000000000000001e-82  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1150  YhiN family flavoprotein  40.83 
 
 		 406 aa  308  1.0000000000000001e-82  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.823305  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1339  hypothetical protein  40.59 
 
 		 406 aa  307  3e-82  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0646456  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2378  HI0933 family protein  42.2 
 
 		 412 aa  306  7e-82  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.270996  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2209  hypothetical protein  40.24 
 
 		 430 aa  301  1e-80  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000224827  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2451  hypothetical protein  35.99 
 
 		 446 aa  279  5e-74  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000138411  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2761  HI0933 family protein  37.23 
 
 		 427 aa  268  8.999999999999999e-71  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3371  hypothetical protein  37.38 
 
 		 426 aa  267  2.9999999999999995e-70  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000385799  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0416  hypothetical protein TIGR00275  37.65 
 
 		 423 aa  265  1e-69  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0139426  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4850  hypothetical protein  37.65 
 
 		 423 aa  265  2e-69  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.473198  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4820  conserved hypothetical protein TIGR00275  37.41 
 
 		 423 aa  264  2e-69  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0848463  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4843  conserved hypothetical protein TIGR00275  37.65 
 
 		 423 aa  265  2e-69  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000266049  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4440  NAD(FAD)-utilizing dehydrogenase  37.41 
 
 		 423 aa  263  3e-69  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0621454  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4458  NAD(FAD)-utilizing dehydrogenase  37.41 
 
 		 423 aa  263  3e-69  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00549646  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4604  hypothetical protein  37.41 
 
 		 423 aa  263  4e-69  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00629914  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4960  hypothetical protein  37.41 
 
 		 423 aa  263  4e-69  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.979568  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4825  conserved hypothetical protein TIGR00275  37.41 
 
 		 423 aa  263  4e-69  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4539  hypothetical protein  36.64 
 
 		 423 aa  262  1e-68  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1437  hypothetical protein  38.35 
 
 		 413 aa  257  3e-67  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1378  hypothetical protein  38.14 
 
 		 415 aa  256  5e-67  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.275116 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0672  HI0933 family protein  37.05 
 
 		 436 aa  256  7e-67  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1926  HI0933-like protein  37.9 
 
 		 414 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0908  HI0933 family protein  37.83 
 
 		 426 aa  248  1e-64  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0861  HI0933 family protein  34.98 
 
 		 412 aa  247  2e-64  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000883164  normal  0.741633 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0825  HI0933 family protein  37.09 
 
 		 414 aa  247  3e-64  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.689631 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2387  hypothetical protein  39.59 
 
 		 410 aa  247  3e-64  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0262  flavoprotein  34.21 
 
 		 424 aa  239  5.999999999999999e-62  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000227955  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1025  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  34.56 
 
 		 403 aa  239  6.999999999999999e-62  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0617168  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1810  hypothetical protein  34.06 
 
 		 422 aa  238  1e-61  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.261505  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1845  hypothetical protein  34.06 
 
 		 422 aa  238  1e-61  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1197  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  34.8 
 
 		 403 aa  238  2e-61  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00144707  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1237  HI0933-like protein  34.89 
 
 		 412 aa  236  5.0000000000000005e-61  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0291  hypothetical protein  36.19 
 
 		 408 aa  235  1.0000000000000001e-60  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0927  HI0933 family protein  38.63 
 
 		 408 aa  234  3e-60  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.1016 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1315  hypothetical protein  34.55 
 
 		 420 aa  233  7.000000000000001e-60  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.476308  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4030  HI0933 family protein  35.34 
 
 		 414 aa  231  2e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1561  hypothetical protein  35.24 
 
 		 455 aa  226  5.0000000000000005e-58  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1022  HI0933 family protein  33.25 
 
 		 403 aa  225  1e-57  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2952  hypothetical protein  32.77 
 
 		 415 aa  221  1.9999999999999999e-56  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00592847  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0128  hypothetical protein  35.52 
 
 		 394 aa  219  7e-56  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0603016  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2635  YhiN family flavoprotein  32.52 
 
 		 414 aa  216  7e-55  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.457541  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1752  hypothetical protein  33.66 
 
 		 390 aa  215  9.999999999999999e-55  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00572064  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1052  hypothetical protein  35.4 
 
 		 442 aa  214  1.9999999999999998e-54  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.843089  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2605  hypothetical protein  34.65 
 
 		 407 aa  214  1.9999999999999998e-54  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00291222  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1567  hypothetical protein  33.66 
 
 		 393 aa  213  3.9999999999999995e-54  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0627  HI0933 family protein  31.92 
 
 		 404 aa  212  1e-53  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000930463  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_202  hypothetical protein  38.01 
 
 		 394 aa  211  2e-53  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1476  HI0933 family protein  36.29 
 
 		 413 aa  209  1e-52  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1430  HI0933 family protein  33.41 
 
 		 452 aa  208  1e-52  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.223271  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1282  HI0933 family protein  34.46 
 
 		 457 aa  207  3e-52  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.138775  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1076  HI0933 family protein  32.82 
 
 		 407 aa  205  1e-51  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0249257  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0226  hypothetical protein  35.93 
 
 		 379 aa  204  3e-51  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0017  hypothetical protein  35.42 
 
 		 422 aa  203  6e-51  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1467  hypothetical protein  32.62 
 
 		 415 aa  194  3e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.196184  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1122  hypothetical protein  32.43 
 
 		 443 aa  192  9e-48  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.138213  normal  0.379331 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15361  flavoprotein  31.15 
 
 		 411 aa  190  2.9999999999999997e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0647863  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15731  flavoprotein  31.09 
 
 		 410 aa  187  2e-46  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07621  hypothetical protein  31.48 
 
 		 407 aa  188  2e-46  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.0179283 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1209  HI0933 family protein  31.59 
 
 		 443 aa  186  1.0000000000000001e-45  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00892484 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0130  hypothetical protein  30.7 
 
 		 405 aa  184  3e-45  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.700212  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0754  HI0933-like protein  29.51 
 
 		 396 aa  184  3e-45  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.961432  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2949  putative FAD dependent oxidoreductase  30.51 
 
 		 401 aa  181  2e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1018  HI0933 family protein  29.7 
 
 		 404 aa  180  4e-44  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1349  hypothetical protein  31.74 
 
 		 393 aa  180  4e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1798  hypothetical protein  31.6 
 
 		 392 aa  180  4e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001943  NAD(FAD)-utilizing dehydrogenase  32.86 
 
 		 397 aa  180  4.999999999999999e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15581  flavoprotein  30.73 
 
 		 414 aa  178  2e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.379962  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4688  hypothetical protein  31.84 
 
 		 413 aa  177  3e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28030  HI0933-like protein  32.27 
 
 		 411 aa  177  4e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4032  hypothetical protein  30.99 
 
 		 398 aa  176  5e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0044  hypothetical protein  31.72 
 
 		 394 aa  175  9.999999999999999e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00536  oxidoreductase  32.13 
 
 		 397 aa  175  9.999999999999999e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3520  HI0933 family protein  28.97 
 
 		 408 aa  175  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1707  HI0933-like protein  32.67 
 
 		 399 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.105129 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4328  hypothetical protein  31.72 
 
 		 394 aa  175  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1392  hypothetical protein  31.5 
 
 		 393 aa  175  1.9999999999999998e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.574952  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1899  HI0933 family protein  29.95 
 
 		 409 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.279809  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2316  hypothetical protein  30.59 
 
 		 410 aa  174  1.9999999999999998e-42  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0047  hypothetical protein  31.96 
 
 		 394 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4094  hypothetical protein  30.99 
 
 		 460 aa  174  1.9999999999999998e-42  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0123  hypothetical protein  30.75 
 
 		 460 aa  174  1.9999999999999998e-42  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.291133  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0051  HI0933 family protein  31.96 
 
 		 394 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.71818 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4118  HI0933 family protein  31.36 
 
 		 394 aa  174  2.9999999999999996e-42  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2555  hypothetical protein  31.28 
 
 		 396 aa  174  2.9999999999999996e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00730633  hitchhiker  0.0000156467 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3858  hypothetical protein  29.7 
 
 		 398 aa  174  2.9999999999999996e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00469108  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2502  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein-like  30.59 
 
 		 413 aa  173  3.9999999999999995e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.472711  normal  0.7121 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3791  hypothetical protein  29.7 
 
 		 398 aa  173  5e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3962  hypothetical protein  29.7 
 
 		 398 aa  173  5e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.327369  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3901  hypothetical protein  29.7 
 
 		 398 aa  173  5e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.150346  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3781  hypothetical protein  29.7 
 
 		 398 aa  172  9e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>