More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_1899 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_1899  HI0933 family protein  100 
 
 		 409 aa  844    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.279809  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0303  hypothetical protein  43.58 
 
 		 394 aa  342  1e-92  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.918662  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0413  HI0933-like protein  43.78 
 
 		 392 aa  336  3.9999999999999995e-91  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0650019  normal  0.0294705 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00166  predicted flavoprotein  44.72 
 
 		 393 aa  336  3.9999999999999995e-91  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0375  HI0933-like protein  43.88 
 
 		 393 aa  335  1e-90  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1349  hypothetical protein  43.22 
 
 		 393 aa  326  6e-88  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0145  hypothetical protein  42.82 
 
 		 394 aa  325  1e-87  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001943  NAD(FAD)-utilizing dehydrogenase  42.68 
 
 		 397 aa  325  1e-87  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5249  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein-like  43.04 
 
 		 392 aa  325  1e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3931  HI0933 family protein  43.35 
 
 		 397 aa  325  1e-87  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1798  hypothetical protein  43.48 
 
 		 392 aa  325  1e-87  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2949  putative FAD dependent oxidoreductase  43.37 
 
 		 401 aa  324  1e-87  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1831  HI0933-like protein  45.09 
 
 		 402 aa  323  2e-87  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  decreased coverage  0.000611752  normal  0.363311 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07280  hypothetical protein  42.03 
 
 		 392 aa  324  2e-87  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0662  hypothetical protein  42.03 
 
 		 392 aa  323  3e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0741866  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4204  HI0933 family protein  44.95 
 
 		 399 aa  322  5e-87  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1513  hypothetical protein  41.98 
 
 		 392 aa  322  9.000000000000001e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.86402  normal  0.0796345 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3791  hypothetical protein  42.68 
 
 		 398 aa  321  9.999999999999999e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3858  hypothetical protein  42.78 
 
 		 398 aa  322  9.999999999999999e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00469108  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3901  hypothetical protein  42.68 
 
 		 398 aa  321  9.999999999999999e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.150346  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1392  hypothetical protein  42.97 
 
 		 393 aa  320  1.9999999999999998e-86  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.574952  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0064  hypothetical protein  46.11 
 
 		 397 aa  321  1.9999999999999998e-86  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3781  hypothetical protein  42.68 
 
 		 398 aa  320  1.9999999999999998e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3962  hypothetical protein  42.78 
 
 		 398 aa  319  5e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.327369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00536  oxidoreductase  42.42 
 
 		 397 aa  318  7.999999999999999e-86  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2623  hypothetical protein  42.2 
 
 		 393 aa  318  7.999999999999999e-86  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1725  hypothetical protein  43 
 
 		 397 aa  317  2e-85  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.685186 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4118  HI0933 family protein  45.71 
 
 		 394 aa  317  3e-85  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0499  HI0933 family protein  44.95 
 
 		 398 aa  316  4e-85  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0205832 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2099  hypothetical protein  44.3 
 
 		 396 aa  316  6e-85  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0051  hypothetical protein  43.77 
 
 		 394 aa  316  6e-85  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000135975 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2552  hypothetical protein  43.18 
 
 		 393 aa  315  7e-85  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0047  hypothetical protein  43.77 
 
 		 394 aa  315  8e-85  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28030  HI0933-like protein  42.72 
 
 		 411 aa  315  9.999999999999999e-85  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4328  hypothetical protein  43.51 
 
 		 394 aa  315  9.999999999999999e-85  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0051  HI0933 family protein  43.77 
 
 		 394 aa  314  1.9999999999999998e-84  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.71818 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0156  hypothetical protein  42.2 
 
 		 392 aa  314  1.9999999999999998e-84  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2680  hypothetical protein  42.68 
 
 		 393 aa  313  2.9999999999999996e-84  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3800  hypothetical protein  45.38 
 
 		 391 aa  313  3.9999999999999997e-84  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.225042  normal  0.0906126 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5008  conserved hypothetical protein TIGR00275  43.54 
 
 		 392 aa  313  4.999999999999999e-84  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2434  hypothetical protein  41.73 
 
 		 398 aa  313  4.999999999999999e-84  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0623  hypothetical protein  43.4 
 
 		 428 aa  312  7.999999999999999e-84  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.228803 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0055  hypothetical protein  43.51 
 
 		 394 aa  311  1e-83  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000153695 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1635  hypothetical protein  40.89 
 
 		 405 aa  311  1e-83  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0047  hypothetical protein  43.56 
 
 		 394 aa  311  1e-83  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00322221 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0515  hypothetical protein  42.89 
 
 		 392 aa  311  2e-83  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0044  hypothetical protein  42.75 
 
 		 394 aa  310  2e-83  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4487  HI0933 family protein  44.7 
 
 		 399 aa  310  2.9999999999999997e-83  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0476  hypothetical protein  44.08 
 
 		 394 aa  310  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.900431  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1463  hypothetical protein  40.97 
 
 		 392 aa  310  2.9999999999999997e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.261664  normal  0.428497 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0123  hypothetical protein  41.99 
 
 		 460 aa  310  4e-83  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.291133  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0054  hypothetical protein  43.81 
 
 		 396 aa  310  4e-83  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2832  flavoprotein  40.97 
 
 		 392 aa  310  4e-83  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.838235  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4032  hypothetical protein  42.93 
 
 		 398 aa  309  5e-83  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4094  hypothetical protein  41.99 
 
 		 460 aa  309  5e-83  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0599  HI0933 family protein  42.46 
 
 		 392 aa  309  5e-83  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.623073 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0049  hypothetical protein  43.56 
 
 		 394 aa  309  5e-83  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000378391 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2364  hypothetical protein  42.64 
 
 		 406 aa  309  5.9999999999999995e-83  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.709721  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0366  HI0933 family protein  43.37 
 
 		 406 aa  309  6.999999999999999e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.128737 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3945  hypothetical protein  42.21 
 
 		 405 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0680  HI0933-like protein  44.14 
 
 		 394 aa  306  3e-82  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.192167 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4017  hypothetical protein  42.38 
 
 		 393 aa  306  3e-82  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2547  hypothetical protein  43.03 
 
 		 394 aa  306  4.0000000000000004e-82  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.374165  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1400  hypothetical protein  42.22 
 
 		 415 aa  305  6e-82  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.615162  normal  0.401096 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0137  hypothetical protein  41.81 
 
 		 405 aa  305  7e-82  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0398  HI0933 family protein  42.86 
 
 		 406 aa  305  9.000000000000001e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00801709 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4688  hypothetical protein  42.05 
 
 		 413 aa  305  9.000000000000001e-82  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4466  hypothetical protein  42.6 
 
 		 394 aa  305  1.0000000000000001e-81  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.119173 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3694  HI0933-like protein  43.26 
 
 		 398 aa  304  1.0000000000000001e-81  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1634  HI0933-like protein  43.51 
 
 		 392 aa  304  2.0000000000000002e-81  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0131276  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3274  hypothetical protein  42.64 
 
 		 396 aa  303  3.0000000000000004e-81  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.142928  normal  0.877884 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0801  hypothetical protein  43.52 
 
 		 395 aa  303  4.0000000000000003e-81  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4953  hypothetical protein  43.12 
 
 		 393 aa  303  5.000000000000001e-81  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.683781  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1707  HI0933-like protein  42.49 
 
 		 399 aa  303  5.000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.105129 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2183  hypothetical protein  40.3 
 
 		 396 aa  302  6.000000000000001e-81  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.286863 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3802  hypothetical protein  41.22 
 
 		 394 aa  302  7.000000000000001e-81  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4873  hypothetical protein  42.49 
 
 		 394 aa  301  1e-80  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4826  hypothetical protein  42.86 
 
 		 393 aa  301  1e-80  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.270305  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0512  hypothetical protein  43.04 
 
 		 410 aa  301  1e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.246775  normal  0.372207 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00402  hypothetical protein  40.1 
 
 		 393 aa  301  1e-80  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.96178  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2846  hypothetical protein  42.72 
 
 		 413 aa  300  3e-80  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5002  hypothetical protein  42.86 
 
 		 393 aa  299  6e-80  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.32275  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2335  HI0933 family protein  44.01 
 
 		 413 aa  299  7e-80  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00707215  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2097  hypothetical protein  41.4 
 
 		 419 aa  297  2e-79  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.234168  normal  0.897923 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1621  HI0933 family protein  40.62 
 
 		 394 aa  296  4e-79  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0160754  normal  0.370908 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0202  HI0933-like protein  40 
 
 		 433 aa  296  6e-79  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.309698  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2824  HI0933-like protein  43.19 
 
 		 405 aa  295  7e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3906  hypothetical protein  42.26 
 
 		 397 aa  295  1e-78  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1341  hypothetical protein  39.95 
 
 		 393 aa  293  5e-78  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1860  HI0933-like protein  42.11 
 
 		 381 aa  291  1e-77  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.479593  normal  0.0118098 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0183  hypothetical protein  38.68 
 
 		 438 aa  290  2e-77  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.18446 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0617  hypothetical protein  43.24 
 
 		 407 aa  290  2e-77  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1787  hypothetical protein  42.56 
 
 		 406 aa  291  2e-77  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000418833 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1238  hypothetical protein  44.14 
 
 		 414 aa  290  3e-77  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0335  hypothetical protein  42.97 
 
 		 407 aa  290  4e-77  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2388  FAD-dependent oxidoreductase  42.97 
 
 		 407 aa  290  4e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.396449  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0368  FAD-dependent oxidoreductase  42.97 
 
 		 407 aa  290  4e-77  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1709  hypothetical protein  42.97 
 
 		 407 aa  290  4e-77  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2530  FAD-dependent oxidoreductase  42.97 
 
 		 407 aa  290  4e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1516  hypothetical protein  42.97 
 
 		 407 aa  290  4e-77  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.631373  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>