More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_5845 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_5845  HI0933 family protein  100 
 
 		 408 aa  849    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.599184  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0791  HI0933 family protein  51.36 
 
 		 408 aa  441  9.999999999999999e-123  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.371857 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5032  HI0933 family protein  48.63 
 
 		 404 aa  427  1e-118  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3520  HI0933 family protein  47.33 
 
 		 408 aa  378  1e-103  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1282  hypothetical protein  46.87 
 
 		 403 aa  377  1e-103  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.488791  normal  0.628895 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1396  hypothetical protein  45.32 
 
 		 402 aa  365  1e-100  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2502  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein-like  44.62 
 
 		 413 aa  353  4e-96  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.472711  normal  0.7121 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1597  HI0933 family protein  42.35 
 
 		 409 aa  341  1e-92  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.168995 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1574  HI0933 family protein  42.09 
 
 		 409 aa  341  1e-92  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2067  hypothetical protein  43.04 
 
 		 415 aa  337  1.9999999999999998e-91  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04960  hypothetical protein  43.39 
 
 		 406 aa  335  1e-90  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07621  hypothetical protein  41.04 
 
 		 407 aa  331  2e-89  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.0179283 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1503  hypothetical protein  43.49 
 
 		 433 aa  328  8e-89  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0130  hypothetical protein  41.04 
 
 		 405 aa  328  9e-89  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.700212  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3929  HI0933-like protein  43.68 
 
 		 413 aa  324  2e-87  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00246834 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2316  hypothetical protein  41.75 
 
 		 410 aa  322  5e-87  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00161  hypothetical protein  43.72 
 
 		 440 aa  322  7e-87  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15361  flavoprotein  41.87 
 
 		 411 aa  321  9.999999999999999e-87  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0647863  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15581  flavoprotein  42.12 
 
 		 414 aa  319  6e-86  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.379962  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15731  flavoprotein  41.87 
 
 		 410 aa  317  2e-85  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0345  HI0933 family protein  40.59 
 
 		 409 aa  313  3.9999999999999997e-84  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1467  hypothetical protein  40.89 
 
 		 415 aa  310  2.9999999999999997e-83  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.196184  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0017  hypothetical protein  38.37 
 
 		 422 aa  299  5e-80  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0017  hypothetical protein  40.05 
 
 		 405 aa  285  1.0000000000000001e-75  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_14937  predicted protein  38.04 
 
 		 436 aa  243  6e-63  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.723308  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0708  FAD dependent oxidoreductase  33.98 
 
 		 409 aa  214  2.9999999999999995e-54  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4440  NAD(FAD)-utilizing dehydrogenase  32.17 
 
 		 423 aa  206  8e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0621454  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4458  NAD(FAD)-utilizing dehydrogenase  32.17 
 
 		 423 aa  206  8e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00549646  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4850  hypothetical protein  32.17 
 
 		 423 aa  205  9e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.473198  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4825  conserved hypothetical protein TIGR00275  32.17 
 
 		 423 aa  206  9e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4604  hypothetical protein  32.17 
 
 		 423 aa  206  9e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00629914  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4960  hypothetical protein  32.17 
 
 		 423 aa  206  9e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.979568  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4820  conserved hypothetical protein TIGR00275  32.17 
 
 		 423 aa  204  2e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0848463  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4843  conserved hypothetical protein TIGR00275  31.93 
 
 		 423 aa  204  3e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000266049  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4539  hypothetical protein  31.7 
 
 		 423 aa  202  8e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0416  hypothetical protein TIGR00275  31.93 
 
 		 423 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0139426  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0861  HI0933 family protein  31.88 
 
 		 412 aa  202  9.999999999999999e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000883164  normal  0.741633 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0030  HI0933 family protein  31.81 
 
 		 412 aa  202  9.999999999999999e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1339  hypothetical protein  33.97 
 
 		 406 aa  200  5e-50  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0646456  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1150  YhiN family flavoprotein  33.97 
 
 		 406 aa  199  6e-50  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.823305  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2761  HI0933 family protein  32.93 
 
 		 427 aa  199  1.0000000000000001e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1845  hypothetical protein  33.17 
 
 		 422 aa  196  6e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1810  hypothetical protein  33.17 
 
 		 422 aa  196  6e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.261505  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0291  hypothetical protein  33.41 
 
 		 408 aa  196  9e-49  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1601  hypothetical protein  34.11 
 
 		 406 aa  194  2e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0908  HI0933 family protein  31.37 
 
 		 426 aa  193  5e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1378  hypothetical protein  32.04 
 
 		 415 aa  192  1e-47  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.275116 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1733  HI0933 family protein  32.13 
 
 		 408 aa  189  9e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0672  HI0933 family protein  29.76 
 
 		 436 aa  187  2e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0927  HI0933 family protein  31.58 
 
 		 408 aa  187  4e-46  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.1016 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1926  HI0933-like protein  29.2 
 
 		 414 aa  186  4e-46  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2209  hypothetical protein  31.88 
 
 		 430 aa  186  5e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000224827  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3371  hypothetical protein  30.4 
 
 		 426 aa  184  3e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000385799  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1567  hypothetical protein  31.49 
 
 		 393 aa  183  6e-45  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3858  hypothetical protein  33.65 
 
 		 398 aa  182  8.000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00469108  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2135  hypothetical protein  29.79 
 
 		 415 aa  182  8.000000000000001e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00468248  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3901  hypothetical protein  33.65 
 
 		 398 aa  182  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.150346  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3791  hypothetical protein  33.65 
 
 		 398 aa  182  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3962  hypothetical protein  33.65 
 
 		 398 aa  181  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.327369  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3781  hypothetical protein  33.41 
 
 		 398 aa  181  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1561  hypothetical protein  27.54 
 
 		 455 aa  181  2e-44  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1349  hypothetical protein  30.88 
 
 		 393 aa  181  2.9999999999999997e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2451  hypothetical protein  31.49 
 
 		 446 aa  179  7e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000138411  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4030  HI0933 family protein  29.9 
 
 		 414 aa  179  9e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4204  HI0933 family protein  32.2 
 
 		 399 aa  178  2e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1315  hypothetical protein  31.07 
 
 		 420 aa  177  3e-43  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.476308  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1752  hypothetical protein  30.05 
 
 		 390 aa  177  3e-43  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00572064  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1437  hypothetical protein  29.95 
 
 		 413 aa  177  4e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3399  HI0933 family protein  31.88 
 
 		 419 aa  175  9.999999999999999e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000862547  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0262  flavoprotein  30.12 
 
 		 424 aa  175  9.999999999999999e-43  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000227955  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1392  hypothetical protein  30.81 
 
 		 393 aa  174  1.9999999999999998e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.574952  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2378  HI0933 family protein  30.87 
 
 		 412 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.270996  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2949  putative FAD dependent oxidoreductase  30.24 
 
 		 401 aa  172  6.999999999999999e-42  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1798  hypothetical protein  31.22 
 
 		 392 aa  172  7.999999999999999e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1052  hypothetical protein  27.48 
 
 		 442 aa  171  3e-41  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.843089  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2605  hypothetical protein  28.33 
 
 		 407 aa  170  5e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00291222  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1430  HI0933 family protein  26.52 
 
 		 452 aa  168  1e-40  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.223271  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1476  HI0933 family protein  28.57 
 
 		 413 aa  168  1e-40  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0627  HI0933 family protein  27.67 
 
 		 404 aa  167  2.9999999999999998e-40  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000930463  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4118  HI0933 family protein  31.87 
 
 		 394 aa  167  4e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1025  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  25.3 
 
 		 403 aa  167  4e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0617168  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1197  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  25.3 
 
 		 403 aa  166  5e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00144707  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2387  hypothetical protein  28.93 
 
 		 410 aa  166  5.9999999999999996e-40  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0187  HI0933 family protein  30.55 
 
 		 433 aa  166  6.9999999999999995e-40  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0754  HI0933-like protein  29.06 
 
 		 396 aa  166  8e-40  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.961432  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1282  HI0933 family protein  27.11 
 
 		 457 aa  162  7e-39  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.138775  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3274  hypothetical protein  31.48 
 
 		 396 aa  162  1e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.142928  normal  0.877884 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4688  hypothetical protein  31.53 
 
 		 413 aa  162  1e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2623  hypothetical protein  29.58 
 
 		 393 aa  161  1e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1122  hypothetical protein  25.93 
 
 		 443 aa  161  2e-38  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.138213  normal  0.379331 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4487  HI0933 family protein  31.39 
 
 		 399 aa  161  2e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1899  HI0933 family protein  27.95 
 
 		 409 aa  160  3e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.279809  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0123  hypothetical protein  30.29 
 
 		 460 aa  160  6e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.291133  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4032  hypothetical protein  29.88 
 
 		 398 aa  159  7e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0825  HI0933 family protein  28.24 
 
 		 414 aa  159  1e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.689631 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3945  hypothetical protein  30.47 
 
 		 405 aa  158  1e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4094  hypothetical protein  30.53 
 
 		 460 aa  158  1e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0303  hypothetical protein  28.36 
 
 		 394 aa  157  2e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.918662  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2952  hypothetical protein  26.13 
 
 		 415 aa  158  2e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00592847  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1022  HI0933 family protein  26.54 
 
 		 403 aa  157  3e-37  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>