More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_1396 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_1396  hypothetical protein  100 
 
 
402 aa  823    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04960  hypothetical protein  62.66 
 
 
406 aa  512  1e-144  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0345  HI0933 family protein  51.84 
 
 
409 aa  447  1.0000000000000001e-124  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0791  HI0933 family protein  49.01 
 
 
408 aa  412  1e-114  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.371857 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2502  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein-like  49.47 
 
 
413 aa  406  1.0000000000000001e-112  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.472711  normal  0.7121 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3520  HI0933 family protein  46.89 
 
 
408 aa  400  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1597  HI0933 family protein  46.9 
 
 
409 aa  385  1e-106  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.168995 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1574  HI0933 family protein  46.65 
 
 
409 aa  385  1e-106  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3929  HI0933-like protein  47.26 
 
 
413 aa  383  1e-105  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00246834 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5032  HI0933 family protein  46.5 
 
 
404 aa  374  1e-102  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2067  hypothetical protein  45.93 
 
 
415 aa  369  1e-101  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1503  hypothetical protein  47.64 
 
 
433 aa  369  1e-101  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2316  hypothetical protein  45.45 
 
 
410 aa  367  1e-100  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5845  HI0933 family protein  45.32 
 
 
408 aa  365  1e-100  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.599184  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1282  hypothetical protein  49 
 
 
403 aa  367  1e-100  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.488791  normal  0.628895 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07621  hypothetical protein  46.02 
 
 
407 aa  362  4e-99  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.0179283 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0130  hypothetical protein  45.77 
 
 
405 aa  362  7.0000000000000005e-99  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.700212  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15581  flavoprotein  43.36 
 
 
414 aa  335  1e-90  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.379962  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1467  hypothetical protein  42.86 
 
 
415 aa  333  3e-90  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.196184  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15731  flavoprotein  42.36 
 
 
410 aa  328  1.0000000000000001e-88  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15361  flavoprotein  41.09 
 
 
411 aa  326  4.0000000000000003e-88  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0647863  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0017  hypothetical protein  39.6 
 
 
422 aa  325  8.000000000000001e-88  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00161  hypothetical protein  40.45 
 
 
440 aa  319  7e-86  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0017  hypothetical protein  39.85 
 
 
405 aa  310  4e-83  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_14937  predicted protein  37.92 
 
 
436 aa  263  4e-69  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.723308  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0908  HI0933 family protein  31.45 
 
 
426 aa  194  2e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0927  HI0933 family protein  31.78 
 
 
408 aa  192  6e-48  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.1016 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1197  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  29.85 
 
 
403 aa  190  2.9999999999999997e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00144707  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1025  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  29.98 
 
 
403 aa  190  2.9999999999999997e-47  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0617168  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1022  HI0933 family protein  29.28 
 
 
403 aa  187  2e-46  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1567  hypothetical protein  33.17 
 
 
393 aa  187  2e-46  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1601  hypothetical protein  32.05 
 
 
406 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0291  hypothetical protein  30.68 
 
 
408 aa  184  3e-45  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2209  hypothetical protein  29.43 
 
 
430 aa  183  4.0000000000000006e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000224827  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0672  HI0933 family protein  30.33 
 
 
436 aa  183  6e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2135  hypothetical protein  29.69 
 
 
415 aa  182  9.000000000000001e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00468248  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1752  hypothetical protein  32.35 
 
 
390 aa  181  2e-44  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00572064  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0861  HI0933 family protein  30.34 
 
 
412 aa  181  2e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000883164  normal  0.741633 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0030  HI0933 family protein  29.9 
 
 
412 aa  180  4e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0262  flavoprotein  30.48 
 
 
424 aa  180  4e-44  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000227955  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1810  hypothetical protein  30.41 
 
 
422 aa  179  8e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.261505  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1845  hypothetical protein  30.41 
 
 
422 aa  179  8e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0708  FAD dependent oxidoreductase  30.88 
 
 
409 aa  178  1e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1437  hypothetical protein  30.41 
 
 
413 aa  177  3e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3274  hypothetical protein  29.68 
 
 
396 aa  176  7e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.142928  normal  0.877884 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2761  HI0933 family protein  28.3 
 
 
427 aa  176  8e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4850  hypothetical protein  31.48 
 
 
423 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.473198  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3802  hypothetical protein  30.05 
 
 
394 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1476  HI0933 family protein  29.64 
 
 
413 aa  175  1.9999999999999998e-42  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4539  hypothetical protein  30.99 
 
 
423 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4843  conserved hypothetical protein TIGR00275  31.23 
 
 
423 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000266049  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4820  conserved hypothetical protein TIGR00275  31.03 
 
 
423 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0848463  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0416  hypothetical protein TIGR00275  30.79 
 
 
423 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0139426  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1339  hypothetical protein  30.66 
 
 
406 aa  174  2.9999999999999996e-42  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0646456  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1150  YhiN family flavoprotein  30.66 
 
 
406 aa  173  5e-42  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.823305  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4604  hypothetical protein  30.99 
 
 
423 aa  172  5.999999999999999e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00629914  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4960  hypothetical protein  30.99 
 
 
423 aa  172  5.999999999999999e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.979568  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4825  conserved hypothetical protein TIGR00275  30.99 
 
 
423 aa  172  5.999999999999999e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4440  NAD(FAD)-utilizing dehydrogenase  30.99 
 
 
423 aa  172  6.999999999999999e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0621454  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4458  NAD(FAD)-utilizing dehydrogenase  30.99 
 
 
423 aa  172  6.999999999999999e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00549646  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1341  hypothetical protein  28.26 
 
 
393 aa  171  2e-41  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4466  hypothetical protein  30.19 
 
 
394 aa  171  3e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.119173 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3371  hypothetical protein  30.27 
 
 
426 aa  170  3e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000385799  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1315  hypothetical protein  31.16 
 
 
420 aa  170  4e-41  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.476308  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00166  predicted flavoprotein  28.95 
 
 
393 aa  169  7e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1561  hypothetical protein  27 
 
 
455 aa  169  9e-41  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4017  hypothetical protein  29.38 
 
 
393 aa  169  1e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1707  HI0933-like protein  29.02 
 
 
399 aa  166  5.9999999999999996e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.105129 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4873  hypothetical protein  30.19 
 
 
394 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1209  HI0933 family protein  27.98 
 
 
443 aa  164  3e-39  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00892484 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3931  HI0933 family protein  29.06 
 
 
397 aa  164  3e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3399  HI0933 family protein  30.65 
 
 
419 aa  164  3e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000862547  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0825  HI0933 family protein  29.95 
 
 
414 aa  163  4.0000000000000004e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.689631 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2183  hypothetical protein  28.78 
 
 
396 aa  163  5.0000000000000005e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.286863 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2364  hypothetical protein  27.82 
 
 
406 aa  162  7e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.709721  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2952  hypothetical protein  29.57 
 
 
415 aa  162  7e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00592847  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4030  HI0933 family protein  29.12 
 
 
414 aa  160  4e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2949  putative FAD dependent oxidoreductase  28.16 
 
 
401 aa  160  4e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3858  hypothetical protein  26.63 
 
 
398 aa  160  5e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00469108  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2635  YhiN family flavoprotein  29.09 
 
 
414 aa  159  6e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.457541  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3791  hypothetical protein  26.63 
 
 
398 aa  159  9e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0627  HI0933 family protein  27.09 
 
 
404 aa  159  9e-38  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000930463  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3901  hypothetical protein  26.63 
 
 
398 aa  159  9e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.150346  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3781  hypothetical protein  26.63 
 
 
398 aa  158  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3962  hypothetical protein  26.63 
 
 
398 aa  158  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.327369  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2378  HI0933 family protein  28.81 
 
 
412 aa  158  1e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.270996  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0271  hypothetical protein  30.75 
 
 
401 aa  159  1e-37  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1831  HI0933-like protein  27.63 
 
 
402 aa  158  2e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  decreased coverage  0.000611752  normal  0.363311 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2552  hypothetical protein  28.71 
 
 
393 aa  157  3e-37  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1926  HI0933-like protein  26.65 
 
 
414 aa  157  3e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0051  hypothetical protein  29.81 
 
 
394 aa  157  3e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  unclonable  0.0000135975 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1733  HI0933 family protein  28.78 
 
 
408 aa  156  6e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4328  hypothetical protein  29.57 
 
 
394 aa  155  9e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0303  hypothetical protein  25.55 
 
 
394 aa  155  1e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.918662  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3906  hypothetical protein  27.07 
 
 
397 aa  155  1e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1237  HI0933-like protein  27.79 
 
 
412 aa  155  1e-36  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1378  hypothetical protein  27.58 
 
 
415 aa  155  1e-36  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.275116 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0413  HI0933-like protein  29.02 
 
 
392 aa  155  1e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0650019  normal  0.0294705 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1798  hypothetical protein  26.83 
 
 
392 aa  154  2e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0754  HI0933-like protein  29.93 
 
 
396 aa  154  2e-36  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.961432  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>