More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_0754 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007575  Suden_0754  HI0933-like protein  100 
 
 		 396 aa  808    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.961432  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0627  HI0933 family protein  38.12 
 
 		 404 aa  278  2e-73  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000930463  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4030  HI0933 family protein  34.2 
 
 		 414 aa  248  1e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1437  hypothetical protein  34.72 
 
 		 413 aa  244  9.999999999999999e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0825  HI0933 family protein  32.99 
 
 		 414 aa  224  2e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.689631 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2605  hypothetical protein  32.75 
 
 		 407 aa  221  9.999999999999999e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00291222  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1076  HI0933 family protein  33.51 
 
 		 407 aa  215  9.999999999999999e-55  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0249257  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0128  hypothetical protein  33 
 
 		 394 aa  211  3e-53  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0603016  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0491  hypothetical protein  33.77 
 
 		 411 aa  208  1e-52  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0156  hypothetical protein  32.52 
 
 		 392 aa  206  7e-52  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2952  hypothetical protein  32.84 
 
 		 415 aa  203  4e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00592847  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2635  YhiN family flavoprotein  32.84 
 
 		 414 aa  202  7e-51  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.457541  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1018  HI0933 family protein  31.11 
 
 		 404 aa  202  9e-51  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28030  HI0933-like protein  33.82 
 
 		 411 aa  202  9.999999999999999e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5249  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein-like  33.83 
 
 		 392 aa  200  3e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0599  HI0933 family protein  33.99 
 
 		 392 aa  197  4.0000000000000005e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.623073 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1505  HI0933 family protein  32.67 
 
 		 402 aa  196  5.000000000000001e-49  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000535325  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0145  hypothetical protein  32.92 
 
 		 394 aa  194  2e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_202  hypothetical protein  31.77 
 
 		 394 aa  189  8e-47  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1621  HI0933 family protein  31.77 
 
 		 394 aa  189  8e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0160754  normal  0.370908 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3802  hypothetical protein  31.6 
 
 		 394 aa  188  1e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2949  putative FAD dependent oxidoreductase  30.79 
 
 		 401 aa  187  3e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0708  FAD dependent oxidoreductase  31.77 
 
 		 409 aa  186  4e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4118  HI0933 family protein  31.02 
 
 		 394 aa  186  7e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0054  hypothetical protein  31.22 
 
 		 396 aa  185  1.0000000000000001e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0044  hypothetical protein  31.53 
 
 		 394 aa  185  1.0000000000000001e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0055  hypothetical protein  31.22 
 
 		 394 aa  185  1.0000000000000001e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000153695 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0662  hypothetical protein  31.7 
 
 		 392 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0741866  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4873  hypothetical protein  32.1 
 
 		 394 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0049  hypothetical protein  30.98 
 
 		 394 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000378391 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07280  hypothetical protein  31.7 
 
 		 392 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0226  hypothetical protein  31.71 
 
 		 379 aa  184  3e-45  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2761  HI0933 family protein  30.53 
 
 		 427 aa  184  3e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0047  hypothetical protein  30.79 
 
 		 394 aa  184  3e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00322221 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0623  hypothetical protein  32.12 
 
 		 428 aa  182  9.000000000000001e-45  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.228803 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0051  hypothetical protein  30.79 
 
 		 394 aa  182  1e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000135975 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4466  hypothetical protein  30.86 
 
 		 394 aa  182  1e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.119173 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2099  hypothetical protein  32.5 
 
 		 396 aa  182  1e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0908  HI0933 family protein  28.43 
 
 		 426 aa  181  2e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0271  hypothetical protein  32.6 
 
 		 401 aa  181  2e-44  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0051  HI0933 family protein  30.3 
 
 		 394 aa  181  2.9999999999999997e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.71818 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0047  hypothetical protein  30.3 
 
 		 394 aa  181  2.9999999999999997e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1707  HI0933-like protein  32.02 
 
 		 399 aa  181  2.9999999999999997e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.105129 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001943  NAD(FAD)-utilizing dehydrogenase  30.12 
 
 		 397 aa  180  4e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1601  hypothetical protein  31.37 
 
 		 406 aa  180  4e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1007  hypothetical protein  30.56 
 
 		 389 aa  179  7e-44  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.775195  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2547  hypothetical protein  31.01 
 
 		 394 aa  179  9e-44  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.374165  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0123  hypothetical protein  31.19 
 
 		 460 aa  178  1e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.291133  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0064  hypothetical protein  30.12 
 
 		 397 aa  178  1e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5008  conserved hypothetical protein TIGR00275  32.23 
 
 		 392 aa  179  1e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0515  hypothetical protein  32.23 
 
 		 392 aa  179  1e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4328  hypothetical protein  30.3 
 
 		 394 aa  178  1e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4032  hypothetical protein  31.19 
 
 		 398 aa  178  1e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00166  predicted flavoprotein  30.99 
 
 		 393 aa  179  1e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3931  HI0933 family protein  30.42 
 
 		 397 aa  177  2e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4094  hypothetical protein  31.19 
 
 		 460 aa  177  2e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0476  hypothetical protein  33.58 
 
 		 394 aa  178  2e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.900431  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2552  hypothetical protein  31.87 
 
 		 393 aa  177  3e-43  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1238  hypothetical protein  31.28 
 
 		 414 aa  177  3e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0672  HI0933 family protein  31.05 
 
 		 436 aa  176  4e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0137  hypothetical protein  31.72 
 
 		 405 aa  176  5e-43  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2434  hypothetical protein  29.88 
 
 		 398 aa  176  6e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2680  hypothetical protein  31.87 
 
 		 393 aa  176  8e-43  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3399  HI0933 family protein  30.73 
 
 		 419 aa  176  9e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000862547  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1530  hypothetical protein  31.36 
 
 		 391 aa  176  9e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2183  hypothetical protein  29.51 
 
 		 396 aa  175  9.999999999999999e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.286863 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1845  hypothetical protein  29.93 
 
 		 422 aa  174  1.9999999999999998e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00536  oxidoreductase  30.05 
 
 		 397 aa  174  1.9999999999999998e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1810  hypothetical protein  29.93 
 
 		 422 aa  174  1.9999999999999998e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.261505  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2451  hypothetical protein  29.25 
 
 		 446 aa  174  2.9999999999999996e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000138411  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4204  HI0933 family protein  30.27 
 
 		 399 aa  172  6.999999999999999e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0416  hypothetical protein TIGR00275  30.86 
 
 		 423 aa  172  1e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0139426  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4604  hypothetical protein  30.6 
 
 		 423 aa  172  1e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00629914  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4440  NAD(FAD)-utilizing dehydrogenase  30.6 
 
 		 423 aa  172  1e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0621454  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4458  NAD(FAD)-utilizing dehydrogenase  30.6 
 
 		 423 aa  172  1e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00549646  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4825  conserved hypothetical protein TIGR00275  30.6 
 
 		 423 aa  172  1e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4960  hypothetical protein  30.6 
 
 		 423 aa  172  1e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.979568  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3858  hypothetical protein  28.14 
 
 		 398 aa  171  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00469108  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4850  hypothetical protein  30.6 
 
 		 423 aa  171  2e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.473198  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4843  conserved hypothetical protein TIGR00275  30.6 
 
 		 423 aa  171  2e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000266049  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3694  HI0933-like protein  30.32 
 
 		 398 aa  171  2e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1441  HI0933-like protein  29.8 
 
 		 394 aa  171  2e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2050  hypothetical protein  29.09 
 
 		 419 aa  170  3e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000118961  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3791  hypothetical protein  28.14 
 
 		 398 aa  170  3e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4688  hypothetical protein  29.55 
 
 		 413 aa  170  3e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3901  hypothetical protein  28.14 
 
 		 398 aa  170  3e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.150346  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2555  hypothetical protein  31.68 
 
 		 396 aa  171  3e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00730633  hitchhiker  0.0000156467 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4820  conserved hypothetical protein TIGR00275  30.38 
 
 		 423 aa  171  3e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0848463  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4017  hypothetical protein  29.46 
 
 		 393 aa  171  3e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3781  hypothetical protein  28.14 
 
 		 398 aa  170  4e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3371  hypothetical protein  30.07 
 
 		 426 aa  170  5e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000385799  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3962  hypothetical protein  28.14 
 
 		 398 aa  170  5e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.327369  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0030  HI0933 family protein  29.6 
 
 		 412 aa  170  5e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2623  hypothetical protein  28.95 
 
 		 393 aa  169  6e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1197  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  29.88 
 
 		 403 aa  169  7e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00144707  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0512  hypothetical protein  32.23 
 
 		 410 aa  169  8e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.246775  normal  0.372207 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0698  hypothetical protein  28.98 
 
 		 409 aa  169  8e-41  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2209  hypothetical protein  26.57 
 
 		 430 aa  169  8e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000224827  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1341  hypothetical protein  28.22 
 
 		 393 aa  169  8e-41  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4539  hypothetical protein  30.12 
 
 		 423 aa  169  8e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>