More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_1007 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_1007  hypothetical protein  100 
 
 		 389 aa  782    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.775195  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0830  HI0933 family protein  59.56 
 
 		 419 aa  487  1e-136  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0203262 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1530  hypothetical protein  56.33 
 
 		 391 aa  417  9.999999999999999e-116  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0623  hypothetical protein  42.14 
 
 		 428 aa  351  1e-95  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.228803 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1308  HI0933 family protein  46.79 
 
 		 426 aa  346  5e-94  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0313133  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0156  hypothetical protein  44.33 
 
 		 392 aa  343  2.9999999999999997e-93  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28030  HI0933-like protein  44.78 
 
 		 411 aa  337  1.9999999999999998e-91  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5249  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein-like  40.77 
 
 		 392 aa  335  9e-91  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0599  HI0933 family protein  43.56 
 
 		 392 aa  334  1e-90  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.623073 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0515  hypothetical protein  42.29 
 
 		 392 aa  331  1e-89  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0662  hypothetical protein  42.53 
 
 		 392 aa  330  2e-89  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0741866  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2547  hypothetical protein  42.24 
 
 		 394 aa  330  4e-89  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.374165  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1725  hypothetical protein  44.33 
 
 		 397 aa  329  4e-89  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.685186 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0476  hypothetical protein  43 
 
 		 394 aa  328  8e-89  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.900431  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5008  conserved hypothetical protein TIGR00275  42.4 
 
 		 392 aa  328  9e-89  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3274  hypothetical protein  43.64 
 
 		 396 aa  327  2.0000000000000001e-88  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.142928  normal  0.877884 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07280  hypothetical protein  42.27 
 
 		 392 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0512  hypothetical protein  43.16 
 
 		 410 aa  326  4.0000000000000003e-88  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.246775  normal  0.372207 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1238  hypothetical protein  47.94 
 
 		 414 aa  326  4.0000000000000003e-88  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1341  hypothetical protein  46.08 
 
 		 393 aa  325  6e-88  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5002  hypothetical protein  43.16 
 
 		 393 aa  325  8.000000000000001e-88  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.32275  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2949  putative FAD dependent oxidoreductase  40.46 
 
 		 401 aa  324  1e-87  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3945  hypothetical protein  43.94 
 
 		 405 aa  323  3e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4953  hypothetical protein  42.89 
 
 		 393 aa  322  9.999999999999999e-87  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.683781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4826  hypothetical protein  42.89 
 
 		 393 aa  321  9.999999999999999e-87  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.270305  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00402  hypothetical protein  43.85 
 
 		 393 aa  320  3.9999999999999996e-86  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.96178  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3802  hypothetical protein  42.42 
 
 		 394 aa  318  7.999999999999999e-86  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1621  HI0933 family protein  43.81 
 
 		 394 aa  318  7.999999999999999e-86  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0160754  normal  0.370908 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0055  hypothetical protein  42.03 
 
 		 394 aa  318  1e-85  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000153695 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0413  HI0933-like protein  43.81 
 
 		 392 aa  317  2e-85  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0650019  normal  0.0294705 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0064  hypothetical protein  42.64 
 
 		 397 aa  317  2e-85  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0047  hypothetical protein  41.77 
 
 		 394 aa  317  2e-85  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00322221 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0044  hypothetical protein  41.77 
 
 		 394 aa  317  3e-85  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1707  HI0933-like protein  44.73 
 
 		 399 aa  317  3e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.105129 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3858  hypothetical protein  42.89 
 
 		 398 aa  317  3e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00469108  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0051  hypothetical protein  41.52 
 
 		 394 aa  316  4e-85  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000135975 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0047  hypothetical protein  41.27 
 
 		 394 aa  316  4e-85  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0054  hypothetical protein  42.05 
 
 		 396 aa  315  7e-85  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0051  HI0933 family protein  41.27 
 
 		 394 aa  315  9e-85  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.71818 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3694  HI0933-like protein  42.11 
 
 		 398 aa  315  9.999999999999999e-85  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3962  hypothetical protein  42.89 
 
 		 398 aa  315  9.999999999999999e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.327369  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0049  hypothetical protein  41.77 
 
 		 394 aa  315  9.999999999999999e-85  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000378391 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3781  hypothetical protein  43.15 
 
 		 398 aa  315  9.999999999999999e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2439  hypothetical protein  44.87 
 
 		 397 aa  313  1.9999999999999998e-84  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3901  hypothetical protein  42.64 
 
 		 398 aa  313  1.9999999999999998e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.150346  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3791  hypothetical protein  42.64 
 
 		 398 aa  313  1.9999999999999998e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4328  hypothetical protein  41.01 
 
 		 394 aa  313  3.9999999999999997e-84  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0303  hypothetical protein  39.85 
 
 		 394 aa  312  5.999999999999999e-84  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.918662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4466  hypothetical protein  41.77 
 
 		 394 aa  312  5.999999999999999e-84  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.119173 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3931  HI0933 family protein  42.68 
 
 		 397 aa  311  1e-83  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4873  hypothetical protein  40.51 
 
 		 394 aa  310  2e-83  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00166  predicted flavoprotein  39.29 
 
 		 393 aa  310  2e-83  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4094  hypothetical protein  41.54 
 
 		 460 aa  309  5e-83  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0123  hypothetical protein  41.28 
 
 		 460 aa  309  5.9999999999999995e-83  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.291133  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03341  predicted oxidoreductase with FAD/NAD(P)-binding domain  42.3 
 
 		 400 aa  308  1.0000000000000001e-82  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.542782  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0223  HI0933 family protein  42.3 
 
 		 400 aa  308  1.0000000000000001e-82  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3974  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  42.04 
 
 		 400 aa  308  1.0000000000000001e-82  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0224  hypothetical protein  42.04 
 
 		 400 aa  308  1.0000000000000001e-82  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3691  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  42.04 
 
 		 400 aa  308  1.0000000000000001e-82  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03294  hypothetical protein  42.3 
 
 		 400 aa  308  1.0000000000000001e-82  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.555868  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4032  hypothetical protein  41.28 
 
 		 398 aa  308  1.0000000000000001e-82  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2552  hypothetical protein  38.52 
 
 		 393 aa  307  2.0000000000000002e-82  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2434  hypothetical protein  40.45 
 
 		 398 aa  307  2.0000000000000002e-82  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0202  HI0933-like protein  40.24 
 
 		 433 aa  307  3e-82  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.309698  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3830  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  42.04 
 
 		 400 aa  306  4.0000000000000004e-82  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2680  hypothetical protein  38.52 
 
 		 393 aa  306  4.0000000000000004e-82  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3781  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  42.04 
 
 		 400 aa  306  4.0000000000000004e-82  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1463  hypothetical protein  43.94 
 
 		 392 aa  306  6e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.261664  normal  0.428497 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0137  hypothetical protein  40.15 
 
 		 405 aa  305  9.000000000000001e-82  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4688  hypothetical protein  41.9 
 
 		 413 aa  305  1.0000000000000001e-81  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2099  hypothetical protein  42.86 
 
 		 396 aa  305  1.0000000000000001e-81  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0183  hypothetical protein  39.29 
 
 		 438 aa  304  2.0000000000000002e-81  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.18446 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2832  flavoprotein  43.43 
 
 		 392 aa  304  2.0000000000000002e-81  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.838235  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2183  hypothetical protein  40.4 
 
 		 396 aa  303  4.0000000000000003e-81  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.286863 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4838  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  41.78 
 
 		 400 aa  303  4.0000000000000003e-81  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1516  hypothetical protein  44.53 
 
 		 407 aa  302  6.000000000000001e-81  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.631373  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0335  hypothetical protein  44.53 
 
 		 407 aa  302  6.000000000000001e-81  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0368  FAD-dependent oxidoreductase  44.53 
 
 		 407 aa  302  6.000000000000001e-81  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0837  hypothetical protein  44.53 
 
 		 407 aa  302  6.000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2388  FAD-dependent oxidoreductase  44.53 
 
 		 407 aa  302  6.000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.396449  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1709  hypothetical protein  44.53 
 
 		 407 aa  302  6.000000000000001e-81  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2530  FAD-dependent oxidoreductase  44.53 
 
 		 407 aa  302  7.000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2846  hypothetical protein  42.33 
 
 		 413 aa  301  1e-80  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3906  hypothetical protein  41.84 
 
 		 397 aa  301  1e-80  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1349  hypothetical protein  40.92 
 
 		 393 aa  301  1e-80  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2824  HI0933-like protein  43.94 
 
 		 405 aa  301  2e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2335  HI0933 family protein  42.2 
 
 		 413 aa  300  2e-80  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00707215  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1513  hypothetical protein  41.92 
 
 		 392 aa  300  3e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.86402  normal  0.0796345 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4017  hypothetical protein  39.34 
 
 		 393 aa  300  3e-80  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1634  HI0933-like protein  46.8 
 
 		 392 aa  299  6e-80  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0131276  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1798  hypothetical protein  40.66 
 
 		 392 aa  299  7e-80  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0145  hypothetical protein  39.9 
 
 		 394 aa  298  7e-80  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4118  HI0933 family protein  40.61 
 
 		 394 aa  298  8e-80  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2884  HI0933-like protein  40.2 
 
 		 414 aa  297  2e-79  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4212  hypothetical protein  42.32 
 
 		 394 aa  297  3e-79  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1400  hypothetical protein  41.18 
 
 		 415 aa  296  3e-79  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.615162  normal  0.401096 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1441  HI0933-like protein  41.37 
 
 		 394 aa  296  4e-79  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001943  NAD(FAD)-utilizing dehydrogenase  38.61 
 
 		 397 aa  296  6e-79  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1392  hypothetical protein  40.66 
 
 		 393 aa  295  7e-79  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.574952  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2208  hypothetical protein  43.07 
 
 		 406 aa  294  2e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>