299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_0137 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007520  Tcr_0137  hypothetical protein  100 
 
 
405 aa  843    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4873  hypothetical protein  53.27 
 
 
394 aa  421  1e-116  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0044  hypothetical protein  52.76 
 
 
394 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3802  hypothetical protein  52.26 
 
 
394 aa  418  9.999999999999999e-116  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4466  hypothetical protein  52.51 
 
 
394 aa  418  9.999999999999999e-116  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.119173 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0055  hypothetical protein  52.26 
 
 
394 aa  413  1e-114  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000153695 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0049  hypothetical protein  52.26 
 
 
394 aa  412  1e-114  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000378391 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0047  hypothetical protein  52.51 
 
 
394 aa  414  1e-114  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00322221 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4017  hypothetical protein  52.01 
 
 
393 aa  412  1e-114  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0047  hypothetical protein  52.01 
 
 
394 aa  411  1e-114  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0051  HI0933 family protein  52.01 
 
 
394 aa  410  1e-113  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.71818 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0051  hypothetical protein  51.76 
 
 
394 aa  410  1e-113  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  unclonable  0.0000135975 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0054  hypothetical protein  51.63 
 
 
396 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0064  hypothetical protein  50.5 
 
 
397 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1635  hypothetical protein  50.98 
 
 
405 aa  407  1.0000000000000001e-112  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3694  HI0933-like protein  52.01 
 
 
398 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4328  hypothetical protein  51.51 
 
 
394 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2099  hypothetical protein  48 
 
 
396 aa  399  9.999999999999999e-111  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0145  hypothetical protein  49.63 
 
 
394 aa  398  1e-109  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5249  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein-like  49.25 
 
 
392 aa  395  1e-109  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0623  hypothetical protein  52.11 
 
 
428 aa  394  1e-108  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.228803 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2547  hypothetical protein  48.76 
 
 
394 aa  394  1e-108  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.374165  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0662  hypothetical protein  50 
 
 
392 aa  392  1e-108  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0741866  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07280  hypothetical protein  50 
 
 
392 aa  393  1e-108  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28030  HI0933-like protein  50.37 
 
 
411 aa  391  1e-107  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001943  NAD(FAD)-utilizing dehydrogenase  49.38 
 
 
397 aa  386  1e-106  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4212  hypothetical protein  53.4 
 
 
394 aa  387  1e-106  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1441  HI0933-like protein  48.01 
 
 
394 aa  386  1e-106  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0375  HI0933-like protein  49.5 
 
 
393 aa  387  1e-106  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0476  hypothetical protein  51.38 
 
 
394 aa  382  1e-105  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.900431  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00536  oxidoreductase  48.89 
 
 
397 aa  384  1e-105  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00166  predicted flavoprotein  49.25 
 
 
393 aa  380  1e-104  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2555  hypothetical protein  48.87 
 
 
396 aa  375  1e-103  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00730633  hitchhiker  0.0000156467 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3945  hypothetical protein  46.63 
 
 
405 aa  378  1e-103  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2434  hypothetical protein  49.13 
 
 
398 aa  375  1e-103  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0303  hypothetical protein  46.12 
 
 
394 aa  376  1e-103  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.918662  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2949  putative FAD dependent oxidoreductase  48 
 
 
401 aa  378  1e-103  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3274  hypothetical protein  47.47 
 
 
396 aa  375  1e-103  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.142928  normal  0.877884 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1725  hypothetical protein  47.99 
 
 
397 aa  375  1e-103  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.685186 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2680  hypothetical protein  46.62 
 
 
393 aa  372  1e-102  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2552  hypothetical protein  47.37 
 
 
393 aa  374  1e-102  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0599  HI0933 family protein  49.37 
 
 
392 aa  372  1e-102  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.623073 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1349  hypothetical protein  46.98 
 
 
393 aa  369  1e-101  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0515  hypothetical protein  48.05 
 
 
392 aa  370  1e-101  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1798  hypothetical protein  47.12 
 
 
392 aa  371  1e-101  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1400  hypothetical protein  46.94 
 
 
415 aa  369  1e-101  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.615162  normal  0.401096 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1621  HI0933 family protein  50 
 
 
394 aa  371  1e-101  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0160754  normal  0.370908 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5002  hypothetical protein  49.36 
 
 
393 aa  370  1e-101  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.32275  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2364  hypothetical protein  46.1 
 
 
406 aa  365  1e-100  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.709721  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5008  conserved hypothetical protein TIGR00275  48.31 
 
 
392 aa  367  1e-100  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00402  hypothetical protein  48.61 
 
 
393 aa  367  1e-100  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.96178  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0512  hypothetical protein  49.36 
 
 
410 aa  367  1e-100  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.246775  normal  0.372207 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2884  HI0933-like protein  46.27 
 
 
414 aa  365  1e-100  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2824  HI0933-like protein  48.5 
 
 
405 aa  365  1e-100  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4826  hypothetical protein  48.59 
 
 
393 aa  364  1e-99  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.270305  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2846  hypothetical protein  46.94 
 
 
413 aa  364  1e-99  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2388  FAD-dependent oxidoreductase  46.85 
 
 
407 aa  363  2e-99  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.396449  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1709  hypothetical protein  46.85 
 
 
407 aa  363  2e-99  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0335  hypothetical protein  46.85 
 
 
407 aa  363  2e-99  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0368  FAD-dependent oxidoreductase  46.85 
 
 
407 aa  363  2e-99  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2530  FAD-dependent oxidoreductase  46.85 
 
 
407 aa  364  2e-99  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0837  hypothetical protein  46.85 
 
 
407 aa  363  2e-99  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1516  hypothetical protein  46.85 
 
 
407 aa  363  2e-99  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.631373  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2335  HI0933 family protein  46.7 
 
 
413 aa  363  4e-99  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00707215  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4953  hypothetical protein  48.33 
 
 
393 aa  362  5.0000000000000005e-99  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.683781  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1392  hypothetical protein  46.48 
 
 
393 aa  362  5.0000000000000005e-99  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.574952  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0156  hypothetical protein  46.98 
 
 
392 aa  362  7.0000000000000005e-99  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2208  hypothetical protein  46.88 
 
 
406 aa  362  7.0000000000000005e-99  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1341  hypothetical protein  46.02 
 
 
393 aa  362  1e-98  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2183  hypothetical protein  47.74 
 
 
396 aa  360  2e-98  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.286863 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2097  hypothetical protein  45.99 
 
 
419 aa  359  4e-98  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.234168  normal  0.897923 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1707  HI0933-like protein  46.06 
 
 
399 aa  359  5e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.105129 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0691  HI0933 family protein  48.92 
 
 
414 aa  359  5e-98  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0398  HI0933 family protein  48.49 
 
 
406 aa  358  9.999999999999999e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00801709 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3858  hypothetical protein  47.25 
 
 
398 aa  358  9.999999999999999e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00469108  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0366  HI0933 family protein  48.48 
 
 
406 aa  357  2.9999999999999997e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.128737 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0413  HI0933-like protein  46.27 
 
 
392 aa  356  3.9999999999999996e-97  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0650019  normal  0.0294705 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3791  hypothetical protein  47 
 
 
398 aa  355  6.999999999999999e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3901  hypothetical protein  47 
 
 
398 aa  355  6.999999999999999e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.150346  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3781  hypothetical protein  47 
 
 
398 aa  355  1e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3962  hypothetical protein  47 
 
 
398 aa  354  1e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.327369  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1238  hypothetical protein  46.12 
 
 
414 aa  355  1e-96  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3645  hypothetical protein  46.21 
 
 
406 aa  353  2e-96  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4483  HI0933-like protein  46.21 
 
 
406 aa  353  2e-96  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3882  hypothetical protein  46.21 
 
 
406 aa  353  2e-96  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.151985 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2623  hypothetical protein  46.35 
 
 
393 aa  353  2.9999999999999997e-96  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6778  HI0933 family protein  46.7 
 
 
390 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00763254 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0801  hypothetical protein  47.47 
 
 
395 aa  353  4e-96  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0617  hypothetical protein  45.92 
 
 
407 aa  352  7e-96  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3253  hypothetical protein  46.46 
 
 
405 aa  352  7e-96  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0198176 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3779  hypothetical protein  46.46 
 
 
405 aa  352  8e-96  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.28946  normal  0.0295291 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3931  HI0933 family protein  47.5 
 
 
397 aa  351  1e-95  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3283  HI0933-like protein  44.99 
 
 
416 aa  351  1e-95  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4817  hypothetical protein  45.59 
 
 
406 aa  349  4e-95  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.571028  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0123  hypothetical protein  45.73 
 
 
460 aa  348  9e-95  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.291133  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4118  HI0933 family protein  45.75 
 
 
394 aa  348  9e-95  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4688  hypothetical protein  46.31 
 
 
413 aa  348  1e-94  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4032  hypothetical protein  45.73 
 
 
398 aa  348  1e-94  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0271  hypothetical protein  45.93 
 
 
401 aa  347  3e-94  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4094  hypothetical protein  45.48 
 
 
460 aa  345  6e-94  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>