More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_2439 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_2439  hypothetical protein  100 
 
 		 397 aa  809    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3274  hypothetical protein  53.59 
 
 		 396 aa  425  1e-118  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.142928  normal  0.877884 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1463  hypothetical protein  53.35 
 
 		 392 aa  409  1e-113  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.261664  normal  0.428497 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2832  flavoprotein  53.61 
 
 		 392 aa  410  1e-113  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.838235  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1513  hypothetical protein  53.09 
 
 		 392 aa  404  1e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.86402  normal  0.0796345 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2183  hypothetical protein  52.42 
 
 		 396 aa  399  9.999999999999999e-111  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.286863 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1798  hypothetical protein  51.81 
 
 		 392 aa  397  1e-109  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2099  hypothetical protein  51.41 
 
 		 396 aa  394  1e-108  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1349  hypothetical protein  52.45 
 
 		 393 aa  390  1e-107  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1392  hypothetical protein  52.2 
 
 		 393 aa  385  1e-106  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.574952  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0303  hypothetical protein  49.61 
 
 		 394 aa  383  1e-105  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.918662  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0801  hypothetical protein  54.29 
 
 		 395 aa  382  1e-105  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1441  HI0933-like protein  51.79 
 
 		 394 aa  384  1e-105  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1707  HI0933-like protein  50.13 
 
 		 399 aa  379  1e-104  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.105129 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3945  hypothetical protein  51.27 
 
 		 405 aa  377  1e-103  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4017  hypothetical protein  50.39 
 
 		 393 aa  375  1e-103  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0398  HI0933 family protein  51.55 
 
 		 406 aa  372  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00801709 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0599  HI0933 family protein  48.45 
 
 		 392 aa  374  1e-102  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.623073 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00166  predicted flavoprotein  48.07 
 
 		 393 aa  373  1e-102  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2623  hypothetical protein  49.23 
 
 		 393 aa  373  1e-102  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00536  oxidoreductase  47.33 
 
 		 397 aa  369  1e-101  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0183  hypothetical protein  45.31 
 
 		 438 aa  370  1e-101  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.18446 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1341  hypothetical protein  50.52 
 
 		 393 aa  370  1e-101  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0156  hypothetical protein  49.61 
 
 		 392 aa  370  1e-101  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1238  hypothetical protein  52.94 
 
 		 414 aa  371  1e-101  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4204  HI0933 family protein  48.86 
 
 		 399 aa  370  1e-101  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0202  HI0933-like protein  45.86 
 
 		 433 aa  369  1e-101  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.309698  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0413  HI0933-like protein  49.61 
 
 		 392 aa  369  1e-101  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0650019  normal  0.0294705 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001943  NAD(FAD)-utilizing dehydrogenase  46.82 
 
 		 397 aa  365  1e-100  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2364  hypothetical protein  49.87 
 
 		 406 aa  366  1e-100  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.709721  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2434  hypothetical protein  47.95 
 
 		 398 aa  363  2e-99  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0366  HI0933 family protein  50.65 
 
 		 406 aa  363  3e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.128737 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2824  HI0933-like protein  52.28 
 
 		 405 aa  363  3e-99  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1621  HI0933 family protein  51.17 
 
 		 394 aa  363  4e-99  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0160754  normal  0.370908 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3115  FAD-dependent oxidoreductase of HI0933-like family protein  47.87 
 
 		 400 aa  362  5.0000000000000005e-99  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4487  HI0933 family protein  48.35 
 
 		 399 aa  362  7.0000000000000005e-99  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0499  HI0933 family protein  50.68 
 
 		 398 aa  362  8e-99  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0205832 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3779  hypothetical protein  51.03 
 
 		 405 aa  361  1e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.28946  normal  0.0295291 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4466  hypothetical protein  48.34 
 
 		 394 aa  361  1e-98  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.119173 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0145  hypothetical protein  47.18 
 
 		 394 aa  360  2e-98  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1725  hypothetical protein  48.76 
 
 		 397 aa  361  2e-98  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.685186 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3253  hypothetical protein  50.77 
 
 		 405 aa  360  2e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0198176 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1516  hypothetical protein  51.27 
 
 		 407 aa  359  4e-98  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.631373  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0335  hypothetical protein  51.27 
 
 		 407 aa  359  4e-98  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0885  hypothetical protein  51.16 
 
 		 416 aa  359  4e-98  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2388  FAD-dependent oxidoreductase  51.27 
 
 		 407 aa  359  4e-98  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.396449  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0837  hypothetical protein  51.27 
 
 		 407 aa  359  4e-98  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0368  FAD-dependent oxidoreductase  51.27 
 
 		 407 aa  359  4e-98  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2530  FAD-dependent oxidoreductase  51.27 
 
 		 407 aa  359  4e-98  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1709  hypothetical protein  51.27 
 
 		 407 aa  359  4e-98  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00402  hypothetical protein  50.65 
 
 		 393 aa  358  9e-98  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.96178  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3802  hypothetical protein  48.34 
 
 		 394 aa  358  9e-98  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0064  hypothetical protein  48.59 
 
 		 397 aa  358  9.999999999999999e-98  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2208  hypothetical protein  50.38 
 
 		 406 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0662  hypothetical protein  47.55 
 
 		 392 aa  358  9.999999999999999e-98  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0741866  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07280  hypothetical protein  47.29 
 
 		 392 aa  358  9.999999999999999e-98  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4873  hypothetical protein  47.97 
 
 		 394 aa  357  1.9999999999999998e-97  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2552  hypothetical protein  45.9 
 
 		 393 aa  357  1.9999999999999998e-97  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3931  HI0933 family protein  49.87 
 
 		 397 aa  357  1.9999999999999998e-97  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2884  HI0933-like protein  49.01 
 
 		 414 aa  356  2.9999999999999997e-97  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28030  HI0933-like protein  48.58 
 
 		 411 aa  356  5e-97  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2547  hypothetical protein  47.58 
 
 		 394 aa  356  5e-97  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.374165  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2710  hypothetical protein  52.17 
 
 		 401 aa  355  6.999999999999999e-97  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4094  hypothetical protein  48.35 
 
 		 460 aa  355  7.999999999999999e-97  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0623  hypothetical protein  44.7 
 
 		 428 aa  355  8.999999999999999e-97  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.228803 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1831  HI0933-like protein  50.13 
 
 		 402 aa  355  8.999999999999999e-97  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  decreased coverage  0.000611752  normal  0.363311 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2218  putative transmembrane protein  50.25 
 
 		 412 aa  354  1e-96  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2680  hypothetical protein  45.64 
 
 		 393 aa  355  1e-96  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4118  HI0933 family protein  48.48 
 
 		 394 aa  353  2e-96  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1400  hypothetical protein  48.39 
 
 		 415 aa  354  2e-96  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.615162  normal  0.401096 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5249  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein-like  45.36 
 
 		 392 aa  353  2.9999999999999997e-96  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0123  hypothetical protein  48.1 
 
 		 460 aa  353  2.9999999999999997e-96  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.291133  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0375  HI0933-like protein  46.79 
 
 		 393 aa  353  2.9999999999999997e-96  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6778  HI0933 family protein  50 
 
 		 390 aa  353  4e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00763254 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4032  hypothetical protein  48.1 
 
 		 398 aa  352  4e-96  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2030  HI0933 family protein  50.64 
 
 		 407 aa  352  7e-96  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0680  HI0933-like protein  52.59 
 
 		 394 aa  352  1e-95  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.192167 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2846  hypothetical protein  48.38 
 
 		 413 aa  350  2e-95  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3645  hypothetical protein  50.64 
 
 		 406 aa  350  2e-95  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0617  hypothetical protein  50.77 
 
 		 407 aa  350  2e-95  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3882  hypothetical protein  50.64 
 
 		 406 aa  350  2e-95  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.151985 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2423  HI0933 family protein  50.64 
 
 		 407 aa  350  2e-95  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4483  HI0933-like protein  50.64 
 
 		 406 aa  350  2e-95  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0049  hypothetical protein  48.08 
 
 		 394 aa  350  3e-95  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000378391 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0044  hypothetical protein  47.83 
 
 		 394 aa  349  5e-95  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4817  hypothetical protein  50.26 
 
 		 406 aa  348  7e-95  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.571028  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2335  HI0933 family protein  48.13 
 
 		 413 aa  348  8e-95  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00707215  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4328  hypothetical protein  47.06 
 
 		 394 aa  348  1e-94  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2949  putative FAD dependent oxidoreductase  45.74 
 
 		 401 aa  348  1e-94  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0047  hypothetical protein  47.83 
 
 		 394 aa  348  1e-94  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00322221 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0054  hypothetical protein  47.83 
 
 		 396 aa  347  2e-94  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0055  hypothetical protein  47.57 
 
 		 394 aa  347  2e-94  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000153695 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0047  hypothetical protein  46.8 
 
 		 394 aa  347  3e-94  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0051  hypothetical protein  46.8 
 
 		 394 aa  346  5e-94  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000135975 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4688  hypothetical protein  47.68 
 
 		 413 aa  346  5e-94  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2610  hypothetical protein  50.56 
 
 		 378 aa  345  6e-94  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.624584  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0051  HI0933 family protein  46.55 
 
 		 394 aa  344  1e-93  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.71818 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2097  hypothetical protein  48.39 
 
 		 419 aa  344  2e-93  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.234168  normal  0.897923 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4212  hypothetical protein  49.1 
 
 		 394 aa  340  2e-92  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1635  hypothetical protein  45.27 
 
 		 405 aa  340  2.9999999999999998e-92  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>