More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_00166 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_00166  predicted flavoprotein  100 
 
 		 393 aa  818    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0375  HI0933-like protein  68.96 
 
 		 393 aa  585  1e-166  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3901  hypothetical protein  61.68 
 
 		 398 aa  509  1e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.150346  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3781  hypothetical protein  61.68 
 
 		 398 aa  508  1e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3791  hypothetical protein  61.68 
 
 		 398 aa  509  1e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4032  hypothetical protein  62.24 
 
 		 398 aa  507  9.999999999999999e-143  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4094  hypothetical protein  62.63 
 
 		 460 aa  506  9.999999999999999e-143  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3858  hypothetical protein  61.68 
 
 		 398 aa  508  9.999999999999999e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00469108  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001943  NAD(FAD)-utilizing dehydrogenase  62.44 
 
 		 397 aa  506  9.999999999999999e-143  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00536  oxidoreductase  61.42 
 
 		 397 aa  505  9.999999999999999e-143  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0123  hypothetical protein  62.63 
 
 		 460 aa  508  9.999999999999999e-143  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.291133  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3962  hypothetical protein  61.42 
 
 		 398 aa  506  9.999999999999999e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.327369  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5249  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein-like  60.91 
 
 		 392 aa  503  1e-141  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3931  HI0933 family protein  60.41 
 
 		 397 aa  498  1e-140  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0662  hypothetical protein  59.85 
 
 		 392 aa  498  1e-140  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0741866  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4204  HI0933 family protein  60.51 
 
 		 399 aa  495  1e-139  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4487  HI0933 family protein  61.52 
 
 		 399 aa  496  1e-139  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4118  HI0933 family protein  60.91 
 
 		 394 aa  497  1e-139  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2949  putative FAD dependent oxidoreductase  60.91 
 
 		 401 aa  498  1e-139  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07280  hypothetical protein  59.85 
 
 		 392 aa  498  1e-139  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4688  hypothetical protein  62.3 
 
 		 413 aa  496  1e-139  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2434  hypothetical protein  60.61 
 
 		 398 aa  492  9.999999999999999e-139  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0223  HI0933 family protein  61.48 
 
 		 400 aa  488  1e-137  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3802  hypothetical protein  60.76 
 
 		 394 aa  488  1e-137  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0064  hypothetical protein  60.1 
 
 		 397 aa  489  1e-137  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3830  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  61.48 
 
 		 400 aa  489  1e-137  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4838  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  61.21 
 
 		 400 aa  488  1e-137  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0051  hypothetical protein  62.28 
 
 		 394 aa  489  1e-137  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000135975 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03341  predicted oxidoreductase with FAD/NAD(P)-binding domain  61.21 
 
 		 400 aa  487  1e-136  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.542782  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3691  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  61.21 
 
 		 400 aa  487  1e-136  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0145  hypothetical protein  59.64 
 
 		 394 aa  487  1e-136  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0515  hypothetical protein  60.26 
 
 		 392 aa  488  1e-136  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0051  HI0933 family protein  61.52 
 
 		 394 aa  485  1e-136  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.71818 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3781  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  61.21 
 
 		 400 aa  487  1e-136  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3974  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  61.21 
 
 		 400 aa  487  1e-136  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0055  hypothetical protein  61.77 
 
 		 394 aa  485  1e-136  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000153695 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03294  hypothetical protein  61.21 
 
 		 400 aa  487  1e-136  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.555868  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0224  hypothetical protein  61.21 
 
 		 400 aa  487  1e-136  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0047  hypothetical protein  61.52 
 
 		 394 aa  485  1e-136  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0054  hypothetical protein  62.24 
 
 		 396 aa  483  1e-135  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5008  conserved hypothetical protein TIGR00275  60.42 
 
 		 392 aa  483  1e-135  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0044  hypothetical protein  61.27 
 
 		 394 aa  483  1e-135  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4328  hypothetical protein  61.52 
 
 		 394 aa  484  1e-135  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0049  hypothetical protein  61.52 
 
 		 394 aa  482  1e-135  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000378391 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4017  hypothetical protein  60.41 
 
 		 393 aa  482  1e-135  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4826  hypothetical protein  61.52 
 
 		 393 aa  478  1e-134  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.270305  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5002  hypothetical protein  61.52 
 
 		 393 aa  478  1e-134  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.32275  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2680  hypothetical protein  59.19 
 
 		 393 aa  480  1e-134  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2552  hypothetical protein  59.45 
 
 		 393 aa  481  1e-134  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3906  hypothetical protein  60.53 
 
 		 397 aa  481  1e-134  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4466  hypothetical protein  60.76 
 
 		 394 aa  479  1e-134  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.119173 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0047  hypothetical protein  61.27 
 
 		 394 aa  481  1e-134  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00322221 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4953  hypothetical protein  61.26 
 
 		 393 aa  475  1e-133  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.683781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0476  hypothetical protein  61.62 
 
 		 394 aa  476  1e-133  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.900431  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0512  hypothetical protein  61.64 
 
 		 410 aa  476  1e-133  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.246775  normal  0.372207 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4873  hypothetical protein  61.01 
 
 		 394 aa  477  1e-133  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0599  HI0933 family protein  59.13 
 
 		 392 aa  474  1e-132  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.623073 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28030  HI0933-like protein  58.99 
 
 		 411 aa  473  1e-132  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1621  HI0933 family protein  58.1 
 
 		 394 aa  469  1.0000000000000001e-131  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0160754  normal  0.370908 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3694  HI0933-like protein  60.4 
 
 		 398 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2099  hypothetical protein  58.76 
 
 		 396 aa  465  9.999999999999999e-131  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3115  FAD-dependent oxidoreductase of HI0933-like family protein  56.28 
 
 		 400 aa  462  1e-129  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3274  hypothetical protein  57.62 
 
 		 396 aa  463  1e-129  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.142928  normal  0.877884 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0623  hypothetical protein  55.16 
 
 		 428 aa  462  1e-129  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.228803 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1635  hypothetical protein  55.31 
 
 		 405 aa  460  9.999999999999999e-129  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1349  hypothetical protein  55.93 
 
 		 393 aa  456  1e-127  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00402  hypothetical protein  56.15 
 
 		 393 aa  452  1.0000000000000001e-126  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.96178  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1798  hypothetical protein  55.04 
 
 		 392 aa  453  1.0000000000000001e-126  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1707  HI0933-like protein  57.33 
 
 		 399 aa  454  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.105129 
 
 
-
 
NC_004310  BR1392  hypothetical protein  55.67 
 
 		 393 aa  451  1e-125  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.574952  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4212  hypothetical protein  60.81 
 
 		 394 aa  451  1e-125  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0156  hypothetical protein  54.76 
 
 		 392 aa  447  1.0000000000000001e-124  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0801  hypothetical protein  58.03 
 
 		 395 aa  446  1.0000000000000001e-124  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0303  hypothetical protein  53.2 
 
 		 394 aa  444  1e-123  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.918662  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2183  hypothetical protein  55.92 
 
 		 396 aa  444  1e-123  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.286863 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1725  hypothetical protein  56.92 
 
 		 397 aa  442  1e-123  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.685186 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2547  hypothetical protein  53.79 
 
 		 394 aa  441  9.999999999999999e-123  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.374165  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0413  HI0933-like protein  54.08 
 
 		 392 aa  437  1e-121  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0650019  normal  0.0294705 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1441  HI0933-like protein  55.01 
 
 		 394 aa  432  1e-120  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0398  HI0933 family protein  56.46 
 
 		 406 aa  431  1e-119  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00801709 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0183  hypothetical protein  49.88 
 
 		 438 aa  426  1e-118  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.18446 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0202  HI0933-like protein  50.12 
 
 		 433 aa  427  1e-118  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.309698  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1513  hypothetical protein  50.64 
 
 		 392 aa  422  1e-117  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.86402  normal  0.0796345 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2623  hypothetical protein  54.18 
 
 		 393 aa  422  1e-117  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2555  hypothetical protein  52.86 
 
 		 396 aa  420  1e-116  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00730633  hitchhiker  0.0000156467 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0271  hypothetical protein  53.09 
 
 		 401 aa  420  1e-116  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0366  HI0933 family protein  54.45 
 
 		 406 aa  419  1e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.128737 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2832  flavoprotein  51.15 
 
 		 392 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.838235  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1463  hypothetical protein  50.89 
 
 		 392 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.261664  normal  0.428497 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0691  HI0933 family protein  51.32 
 
 		 414 aa  407  1.0000000000000001e-112  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1831  HI0933-like protein  53.47 
 
 		 402 aa  407  1.0000000000000001e-112  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  decreased coverage  0.000611752  normal  0.363311 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1341  hypothetical protein  50.64 
 
 		 393 aa  404  1e-111  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1400  hypothetical protein  50.25 
 
 		 415 aa  395  1e-109  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.615162  normal  0.401096 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3945  hypothetical protein  49.87 
 
 		 405 aa  395  1e-109  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3800  hypothetical protein  52.69 
 
 		 391 aa  392  1e-108  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.225042  normal  0.0906126 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2413  hypothetical protein  51.28 
 
 		 390 aa  385  1e-106  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0499  HI0933 family protein  50.64 
 
 		 398 aa  385  1e-106  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0205832 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2364  hypothetical protein  50.38 
 
 		 406 aa  387  1e-106  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.709721  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0680  HI0933-like protein  51.5 
 
 		 394 aa  382  1e-105  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.192167 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2710  hypothetical protein  52.96 
 
 		 401 aa  384  1e-105  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>