More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_1530 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_1530  hypothetical protein  100 
 
 		 391 aa  803    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1007  hypothetical protein  56.33 
 
 		 389 aa  417  9.999999999999999e-116  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.775195  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0830  HI0933 family protein  52.8 
 
 		 419 aa  405  1.0000000000000001e-112  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0203262 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5249  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein-like  43.81 
 
 		 392 aa  342  7e-93  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0375  HI0933-like protein  42.49 
 
 		 393 aa  339  4e-92  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2434  hypothetical protein  43.91 
 
 		 398 aa  335  5.999999999999999e-91  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0662  hypothetical protein  43.7 
 
 		 392 aa  335  7.999999999999999e-91  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0741866  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07280  hypothetical protein  43.7 
 
 		 392 aa  334  2e-90  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28030  HI0933-like protein  44.62 
 
 		 411 aa  333  4e-90  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00166  predicted flavoprotein  43.08 
 
 		 393 aa  332  8e-90  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001943  NAD(FAD)-utilizing dehydrogenase  43.5 
 
 		 397 aa  329  6e-89  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2949  putative FAD dependent oxidoreductase  41.43 
 
 		 401 aa  328  7e-89  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0156  hypothetical protein  45.8 
 
 		 392 aa  327  2.0000000000000001e-88  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4466  hypothetical protein  43.59 
 
 		 394 aa  327  3e-88  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.119173 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3802  hypothetical protein  43.59 
 
 		 394 aa  326  3e-88  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0145  hypothetical protein  44.16 
 
 		 394 aa  326  4.0000000000000003e-88  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0476  hypothetical protein  44.36 
 
 		 394 aa  326  5e-88  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.900431  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4873  hypothetical protein  42.82 
 
 		 394 aa  325  9e-88  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0515  hypothetical protein  43.27 
 
 		 392 aa  324  1e-87  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0051  HI0933 family protein  43.65 
 
 		 394 aa  324  1e-87  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.71818 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00402  hypothetical protein  43.78 
 
 		 393 aa  324  1e-87  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.96178  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4118  HI0933 family protein  45.32 
 
 		 394 aa  323  2e-87  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3931  HI0933 family protein  44.67 
 
 		 397 aa  323  4e-87  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00536  oxidoreductase  42.89 
 
 		 397 aa  321  1.9999999999999998e-86  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0051  hypothetical protein  43.08 
 
 		 394 aa  321  1.9999999999999998e-86  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000135975 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0047  hypothetical protein  43.4 
 
 		 394 aa  321  1.9999999999999998e-86  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1308  HI0933 family protein  44.96 
 
 		 426 aa  321  1.9999999999999998e-86  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0313133  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0054  hypothetical protein  43.59 
 
 		 396 aa  320  3e-86  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5008  conserved hypothetical protein TIGR00275  43.12 
 
 		 392 aa  320  3e-86  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0599  HI0933 family protein  42.78 
 
 		 392 aa  320  3.9999999999999996e-86  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.623073 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0044  hypothetical protein  43.33 
 
 		 394 aa  320  3.9999999999999996e-86  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1621  HI0933 family protein  43.56 
 
 		 394 aa  320  3.9999999999999996e-86  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0160754  normal  0.370908 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0055  hypothetical protein  43.91 
 
 		 394 aa  319  6e-86  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000153695 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1635  hypothetical protein  42.14 
 
 		 405 aa  318  9e-86  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0047  hypothetical protein  44.25 
 
 		 394 aa  318  9e-86  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00322221 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0049  hypothetical protein  44.25 
 
 		 394 aa  318  1e-85  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000378391 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4017  hypothetical protein  42.67 
 
 		 393 aa  318  1e-85  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4328  hypothetical protein  43.15 
 
 		 394 aa  317  3e-85  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0064  hypothetical protein  43.08 
 
 		 397 aa  316  5e-85  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1707  HI0933-like protein  43.85 
 
 		 399 aa  316  6e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.105129 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0137  hypothetical protein  43.47 
 
 		 405 aa  313  3.9999999999999997e-84  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0123  hypothetical protein  43.43 
 
 		 460 aa  313  3.9999999999999997e-84  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.291133  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0413  HI0933-like protein  42.19 
 
 		 392 aa  313  4.999999999999999e-84  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0650019  normal  0.0294705 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4032  hypothetical protein  43.25 
 
 		 398 aa  312  4.999999999999999e-84  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4094  hypothetical protein  43.43 
 
 		 460 aa  312  5.999999999999999e-84  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0512  hypothetical protein  44.13 
 
 		 410 aa  312  6.999999999999999e-84  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.246775  normal  0.372207 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0271  hypothetical protein  40.65 
 
 		 401 aa  311  9e-84  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3962  hypothetical protein  43.36 
 
 		 398 aa  311  1e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.327369  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3791  hypothetical protein  43.36 
 
 		 398 aa  311  1e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3858  hypothetical protein  43.36 
 
 		 398 aa  311  1e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00469108  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3901  hypothetical protein  43.36 
 
 		 398 aa  311  1e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.150346  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3781  hypothetical protein  43.11 
 
 		 398 aa  310  2e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3274  hypothetical protein  42.6 
 
 		 396 aa  311  2e-83  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.142928  normal  0.877884 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3694  HI0933-like protein  42.89 
 
 		 398 aa  310  2.9999999999999997e-83  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1238  hypothetical protein  44.16 
 
 		 414 aa  309  5e-83  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5002  hypothetical protein  43.38 
 
 		 393 aa  308  6.999999999999999e-83  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.32275  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4953  hypothetical protein  43.12 
 
 		 393 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.683781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4212  hypothetical protein  43.7 
 
 		 394 aa  308  1.0000000000000001e-82  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4204  HI0933 family protein  43.56 
 
 		 399 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4826  hypothetical protein  43.12 
 
 		 393 aa  306  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.270305  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2364  hypothetical protein  43.11 
 
 		 406 aa  305  8.000000000000001e-82  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.709721  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2552  hypothetical protein  39.95 
 
 		 393 aa  305  1.0000000000000001e-81  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2547  hypothetical protein  42.13 
 
 		 394 aa  305  1.0000000000000001e-81  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.374165  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4487  HI0933 family protein  43.56 
 
 		 399 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2439  hypothetical protein  44.99 
 
 		 397 aa  304  2.0000000000000002e-81  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4688  hypothetical protein  42.93 
 
 		 413 aa  303  2.0000000000000002e-81  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0623  hypothetical protein  40.6 
 
 		 428 aa  303  3.0000000000000004e-81  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.228803 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2099  hypothetical protein  41.71 
 
 		 396 aa  301  9e-81  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2680  hypothetical protein  39.69 
 
 		 393 aa  301  1e-80  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1341  hypothetical protein  42.78 
 
 		 393 aa  301  1e-80  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3945  hypothetical protein  43.39 
 
 		 405 aa  301  2e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1400  hypothetical protein  41.89 
 
 		 415 aa  301  2e-80  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.615162  normal  0.401096 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1798  hypothetical protein  41.18 
 
 		 392 aa  300  3e-80  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1831  HI0933-like protein  43.3 
 
 		 402 aa  298  1e-79  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  decreased coverage  0.000611752  normal  0.363311 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1349  hypothetical protein  41.58 
 
 		 393 aa  298  1e-79  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1860  HI0933-like protein  44.47 
 
 		 381 aa  297  2e-79  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.479593  normal  0.0118098 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2183  hypothetical protein  40.91 
 
 		 396 aa  296  4e-79  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.286863 
 
 
-
 
NC_004310  BR1392  hypothetical protein  41.33 
 
 		 393 aa  295  7e-79  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.574952  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1463  hypothetical protein  41.58 
 
 		 392 aa  295  8e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.261664  normal  0.428497 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1513  hypothetical protein  41.58 
 
 		 392 aa  295  1e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.86402  normal  0.0796345 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0303  hypothetical protein  40.16 
 
 		 394 aa  294  2e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.918662  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2832  flavoprotein  41.58 
 
 		 392 aa  293  3e-78  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.838235  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2846  hypothetical protein  41.09 
 
 		 413 aa  293  4e-78  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2824  HI0933-like protein  45.02 
 
 		 405 aa  293  4e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2335  HI0933 family protein  40.84 
 
 		 413 aa  290  3e-77  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00707215  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2623  hypothetical protein  41.94 
 
 		 393 aa  290  4e-77  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2030  HI0933 family protein  43.4 
 
 		 407 aa  289  7e-77  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3283  HI0933-like protein  40.73 
 
 		 416 aa  289  7e-77  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1725  hypothetical protein  41.56 
 
 		 397 aa  288  1e-76  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.685186 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2218  putative transmembrane protein  42.86 
 
 		 412 aa  287  2e-76  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2555  hypothetical protein  42.11 
 
 		 396 aa  287  2e-76  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00730633  hitchhiker  0.0000156467 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2097  hypothetical protein  42.51 
 
 		 419 aa  288  2e-76  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.234168  normal  0.897923 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0499  HI0933 family protein  41.78 
 
 		 398 aa  287  2e-76  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0205832 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0885  hypothetical protein  43.94 
 
 		 416 aa  286  2.9999999999999996e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0202  HI0933-like protein  38.37 
 
 		 433 aa  287  2.9999999999999996e-76  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.309698  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2884  HI0933-like protein  40.44 
 
 		 414 aa  286  4e-76  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4838  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  41.13 
 
 		 400 aa  286  5e-76  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0680  HI0933-like protein  42.86 
 
 		 394 aa  286  5.999999999999999e-76  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.192167 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0183  hypothetical protein  38.15 
 
 		 438 aa  285  1.0000000000000001e-75  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.18446 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3906  hypothetical protein  42.46 
 
 		 397 aa  284  1.0000000000000001e-75  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>