288 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_2846 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_2335  HI0933 family protein  99.03 
 
 
413 aa  834    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00707215  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2097  hypothetical protein  85.37 
 
 
419 aa  714    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.234168  normal  0.897923 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2846  hypothetical protein  100 
 
 
413 aa  841    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2364  hypothetical protein  81.22 
 
 
406 aa  679    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.709721  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2884  HI0933-like protein  72.37 
 
 
414 aa  607  9.999999999999999e-173  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3539  HI0933 family protein  74.63 
 
 
402 aa  598  1e-170  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.110532  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1400  hypothetical protein  70.39 
 
 
415 aa  568  1e-161  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.615162  normal  0.401096 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3283  HI0933-like protein  70.46 
 
 
416 aa  565  1e-160  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1238  hypothetical protein  65.5 
 
 
414 aa  516  1.0000000000000001e-145  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1787  hypothetical protein  63.79 
 
 
406 aa  491  1e-137  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000418833 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0885  hypothetical protein  59.65 
 
 
416 aa  448  1.0000000000000001e-124  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3945  hypothetical protein  55.56 
 
 
405 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2824  HI0933-like protein  56.65 
 
 
405 aa  432  1e-120  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2610  hypothetical protein  58.38 
 
 
378 aa  424  1e-117  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.624584  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6778  HI0933 family protein  55.21 
 
 
390 aa  424  1e-117  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00763254 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2218  putative transmembrane protein  55.64 
 
 
412 aa  416  9.999999999999999e-116  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2423  HI0933 family protein  55.84 
 
 
407 aa  415  9.999999999999999e-116  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4817  hypothetical protein  56.14 
 
 
406 aa  412  1e-114  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.571028  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0335  hypothetical protein  54.32 
 
 
407 aa  412  1e-114  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2388  FAD-dependent oxidoreductase  54.32 
 
 
407 aa  412  1e-114  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.396449  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0837  hypothetical protein  54.32 
 
 
407 aa  412  1e-114  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1709  hypothetical protein  54.32 
 
 
407 aa  412  1e-114  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2530  FAD-dependent oxidoreductase  54.32 
 
 
407 aa  412  1e-114  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0368  FAD-dependent oxidoreductase  54.32 
 
 
407 aa  412  1e-114  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1516  hypothetical protein  54.32 
 
 
407 aa  412  1e-114  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.631373  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2030  HI0933 family protein  55.32 
 
 
407 aa  414  1e-114  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2547  hypothetical protein  51.72 
 
 
394 aa  406  1.0000000000000001e-112  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.374165  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3779  hypothetical protein  55.14 
 
 
405 aa  402  1e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.28946  normal  0.0295291 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2208  hypothetical protein  53.69 
 
 
406 aa  402  1e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3645  hypothetical protein  55.39 
 
 
406 aa  404  1e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0617  hypothetical protein  54.02 
 
 
407 aa  404  1e-111  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4483  HI0933-like protein  55.39 
 
 
406 aa  404  1e-111  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3253  hypothetical protein  55.14 
 
 
405 aa  403  1e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0198176 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3882  hypothetical protein  55.39 
 
 
406 aa  404  1e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.151985 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0691  HI0933 family protein  50.71 
 
 
414 aa  393  1e-108  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2183  hypothetical protein  51.23 
 
 
396 aa  394  1e-108  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.286863 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2434  hypothetical protein  49.75 
 
 
398 aa  390  1e-107  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0303  hypothetical protein  50.62 
 
 
394 aa  389  1e-107  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.918662  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1707  HI0933-like protein  52.46 
 
 
399 aa  391  1e-107  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.105129 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4118  HI0933 family protein  50.74 
 
 
394 aa  390  1e-107  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0375  HI0933-like protein  48.89 
 
 
393 aa  389  1e-107  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3931  HI0933 family protein  51.23 
 
 
397 aa  388  1e-107  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3274  hypothetical protein  51.09 
 
 
396 aa  386  1e-106  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.142928  normal  0.877884 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2949  putative FAD dependent oxidoreductase  48 
 
 
401 aa  387  1e-106  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1798  hypothetical protein  50.99 
 
 
392 aa  382  1e-105  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0623  hypothetical protein  47.43 
 
 
428 aa  383  1e-105  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.228803 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00536  oxidoreductase  47.04 
 
 
397 aa  384  1e-105  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001943  NAD(FAD)-utilizing dehydrogenase  48.28 
 
 
397 aa  378  1e-104  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1349  hypothetical protein  50.62 
 
 
393 aa  379  1e-104  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1635  hypothetical protein  48.54 
 
 
405 aa  380  1e-104  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28030  HI0933-like protein  49.88 
 
 
411 aa  377  1e-103  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4204  HI0933 family protein  49.76 
 
 
399 aa  375  1e-103  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0156  hypothetical protein  49.51 
 
 
392 aa  375  1e-103  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0599  HI0933 family protein  48.91 
 
 
392 aa  375  1e-103  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.623073 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00166  predicted flavoprotein  48.52 
 
 
393 aa  377  1e-103  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1725  hypothetical protein  49.75 
 
 
397 aa  376  1e-103  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.685186 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3858  hypothetical protein  50.61 
 
 
398 aa  372  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00469108  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1392  hypothetical protein  50.12 
 
 
393 aa  372  1e-102  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.574952  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1513  hypothetical protein  49.88 
 
 
392 aa  372  1e-102  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.86402  normal  0.0796345 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5249  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein-like  47.67 
 
 
392 aa  374  1e-102  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1831  HI0933-like protein  52.09 
 
 
402 aa  372  1e-102  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  decreased coverage  0.000611752  normal  0.363311 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00402  hypothetical protein  49.75 
 
 
393 aa  373  1e-102  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.96178  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4873  hypothetical protein  47.41 
 
 
394 aa  373  1e-102  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0123  hypothetical protein  49.26 
 
 
460 aa  372  1e-102  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.291133  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4032  hypothetical protein  49.26 
 
 
398 aa  372  1e-102  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4466  hypothetical protein  48.15 
 
 
394 aa  374  1e-102  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.119173 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3901  hypothetical protein  50.37 
 
 
398 aa  369  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.150346  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0398  HI0933 family protein  51.22 
 
 
406 aa  371  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00801709 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3962  hypothetical protein  50.37 
 
 
398 aa  368  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.327369  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4094  hypothetical protein  49.02 
 
 
460 aa  369  1e-101  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0592  HI0933 family protein  47.46 
 
 
405 aa  371  1e-101  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0064  hypothetical protein  48.64 
 
 
397 aa  369  1e-101  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3781  hypothetical protein  50.61 
 
 
398 aa  369  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3791  hypothetical protein  50.37 
 
 
398 aa  369  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0145  hypothetical protein  46.67 
 
 
394 aa  368  1e-100  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0054  hypothetical protein  46.47 
 
 
396 aa  368  1e-100  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2832  flavoprotein  50.62 
 
 
392 aa  366  1e-100  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.838235  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4487  HI0933 family protein  49.51 
 
 
399 aa  367  1e-100  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0413  HI0933-like protein  47.54 
 
 
392 aa  365  1e-100  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0650019  normal  0.0294705 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0137  hypothetical protein  46.94 
 
 
405 aa  364  1e-99  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0801  hypothetical protein  50 
 
 
395 aa  364  2e-99  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0044  hypothetical protein  46.8 
 
 
394 aa  364  2e-99  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4688  hypothetical protein  48.99 
 
 
413 aa  364  2e-99  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0055  hypothetical protein  47.04 
 
 
394 aa  362  5.0000000000000005e-99  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000153695 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5008  conserved hypothetical protein TIGR00275  47.47 
 
 
392 aa  362  6e-99  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0515  hypothetical protein  47.36 
 
 
392 aa  362  7.0000000000000005e-99  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1463  hypothetical protein  50.37 
 
 
392 aa  362  7.0000000000000005e-99  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.261664  normal  0.428497 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1341  hypothetical protein  47.92 
 
 
393 aa  362  7.0000000000000005e-99  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4017  hypothetical protein  46.42 
 
 
393 aa  362  7.0000000000000005e-99  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0047  hypothetical protein  46.8 
 
 
394 aa  362  8e-99  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00322221 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1621  HI0933 family protein  48.03 
 
 
394 aa  362  9e-99  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0160754  normal  0.370908 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3802  hypothetical protein  45.93 
 
 
394 aa  361  1e-98  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4328  hypothetical protein  46.8 
 
 
394 aa  360  2e-98  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0366  HI0933 family protein  49.75 
 
 
406 aa  360  2e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.128737 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0049  hypothetical protein  46.8 
 
 
394 aa  360  3e-98  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000378391 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2099  hypothetical protein  46.91 
 
 
396 aa  359  5e-98  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0680  HI0933-like protein  51.81 
 
 
394 aa  359  6e-98  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.192167 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0047  hypothetical protein  46.55 
 
 
394 aa  358  8e-98  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0183  hypothetical protein  44.95 
 
 
438 aa  358  8e-98  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.18446 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0051  HI0933 family protein  46.55 
 
 
394 aa  358  9.999999999999999e-98  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.71818 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>