More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A1238 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A1238  hypothetical protein  100 
 
 		 414 aa  832    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2884  HI0933-like protein  68.87 
 
 		 414 aa  573  1.0000000000000001e-162  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1787  hypothetical protein  71.39 
 
 		 406 aa  543  1e-153  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000418833 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1400  hypothetical protein  66.58 
 
 		 415 aa  535  1e-151  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.615162  normal  0.401096 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2097  hypothetical protein  66.35 
 
 		 419 aa  532  1e-150  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.234168  normal  0.897923 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2335  HI0933 family protein  65.76 
 
 		 413 aa  528  1e-149  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00707215  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2846  hypothetical protein  66.01 
 
 		 413 aa  530  1e-149  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2364  hypothetical protein  64.71 
 
 		 406 aa  521  1e-147  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.709721  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3283  HI0933-like protein  64.86 
 
 		 416 aa  523  1e-147  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3945  hypothetical protein  63.48 
 
 		 405 aa  520  1e-146  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0885  hypothetical protein  68.03 
 
 		 416 aa  513  1e-144  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3539  HI0933 family protein  65.1 
 
 		 402 aa  512  1e-144  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.110532  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2388  FAD-dependent oxidoreductase  65.17 
 
 		 407 aa  501  1e-141  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.396449  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1516  hypothetical protein  65.17 
 
 		 407 aa  501  1e-141  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.631373  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0335  hypothetical protein  65.17 
 
 		 407 aa  501  1e-141  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1709  hypothetical protein  65.17 
 
 		 407 aa  501  1e-141  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0837  hypothetical protein  65.17 
 
 		 407 aa  501  1e-141  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0368  FAD-dependent oxidoreductase  65.17 
 
 		 407 aa  501  1e-141  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2530  FAD-dependent oxidoreductase  65.58 
 
 		 407 aa  501  1e-140  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0617  hypothetical protein  65.55 
 
 		 407 aa  496  1e-139  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2824  HI0933-like protein  63.98 
 
 		 405 aa  497  1e-139  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4817  hypothetical protein  64.96 
 
 		 406 aa  497  1e-139  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.571028  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2208  hypothetical protein  61.94 
 
 		 406 aa  490  1e-137  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3645  hypothetical protein  64.1 
 
 		 406 aa  488  1e-136  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3779  hypothetical protein  64.1 
 
 		 405 aa  484  1e-136  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.28946  normal  0.0295291 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4483  HI0933-like protein  64.1 
 
 		 406 aa  488  1e-136  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3882  hypothetical protein  64.1 
 
 		 406 aa  488  1e-136  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.151985 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3253  hypothetical protein  64.1 
 
 		 405 aa  486  1e-136  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0198176 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2610  hypothetical protein  65.46 
 
 		 378 aa  480  1e-134  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.624584  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6778  HI0933 family protein  62.2 
 
 		 390 aa  479  1e-134  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00763254 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2218  putative transmembrane protein  63.38 
 
 		 412 aa  477  1e-133  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2423  HI0933 family protein  63.43 
 
 		 407 aa  476  1e-133  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2030  HI0933 family protein  63.17 
 
 		 407 aa  476  1e-133  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2547  hypothetical protein  58.84 
 
 		 394 aa  447  1.0000000000000001e-124  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.374165  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1707  HI0933-like protein  57.75 
 
 		 399 aa  434  1e-120  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.105129 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3931  HI0933 family protein  57.68 
 
 		 397 aa  429  1e-119  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3274  hypothetical protein  57.29 
 
 		 396 aa  425  1e-118  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.142928  normal  0.877884 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4118  HI0933 family protein  54.66 
 
 		 394 aa  425  1e-118  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4032  hypothetical protein  55.78 
 
 		 398 aa  422  1e-117  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0123  hypothetical protein  55.22 
 
 		 460 aa  424  1e-117  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.291133  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0413  HI0933-like protein  55.67 
 
 		 392 aa  421  1e-116  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0650019  normal  0.0294705 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4094  hypothetical protein  54.98 
 
 		 460 aa  420  1e-116  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3781  hypothetical protein  54.52 
 
 		 398 aa  417  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0303  hypothetical protein  54.91 
 
 		 394 aa  417  9.999999999999999e-116  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.918662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4688  hypothetical protein  55.67 
 
 		 413 aa  415  9.999999999999999e-116  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1798  hypothetical protein  54.29 
 
 		 392 aa  415  9.999999999999999e-116  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3901  hypothetical protein  54.27 
 
 		 398 aa  416  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.150346  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3791  hypothetical protein  54.27 
 
 		 398 aa  416  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3858  hypothetical protein  54.02 
 
 		 398 aa  414  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00469108  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3962  hypothetical protein  53.77 
 
 		 398 aa  411  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.327369  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2183  hypothetical protein  53.25 
 
 		 396 aa  406  1.0000000000000001e-112  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.286863 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1349  hypothetical protein  54.91 
 
 		 393 aa  402  1e-111  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0156  hypothetical protein  53.03 
 
 		 392 aa  403  1e-111  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00402  hypothetical protein  53.85 
 
 		 393 aa  402  1e-111  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.96178  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1441  HI0933-like protein  54.64 
 
 		 394 aa  404  1e-111  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03341  predicted oxidoreductase with FAD/NAD(P)-binding domain  53.13 
 
 		 400 aa  398  9.999999999999999e-111  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.542782  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1621  HI0933 family protein  54.31 
 
 		 394 aa  400  9.999999999999999e-111  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0160754  normal  0.370908 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4204  HI0933 family protein  52.64 
 
 		 399 aa  400  9.999999999999999e-111  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0691  HI0933 family protein  53.06 
 
 		 414 aa  398  9.999999999999999e-111  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0801  hypothetical protein  53.87 
 
 		 395 aa  400  9.999999999999999e-111  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03294  hypothetical protein  53.13 
 
 		 400 aa  398  9.999999999999999e-111  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.555868  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0223  HI0933 family protein  53.13 
 
 		 400 aa  398  1e-109  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1392  hypothetical protein  54.41 
 
 		 393 aa  397  1e-109  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.574952  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5249  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein-like  49.87 
 
 		 392 aa  397  1e-109  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0599  HI0933 family protein  51.64 
 
 		 392 aa  395  1e-109  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.623073 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0064  hypothetical protein  51 
 
 		 397 aa  397  1e-109  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4838  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  52.88 
 
 		 400 aa  395  1e-109  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3781  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  52.88 
 
 		 400 aa  396  1e-109  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0375  HI0933-like protein  50.38 
 
 		 393 aa  395  1e-109  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28030  HI0933-like protein  53 
 
 		 411 aa  397  1e-109  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0662  hypothetical protein  52.25 
 
 		 392 aa  397  1e-109  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0741866  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07280  hypothetical protein  52.5 
 
 		 392 aa  396  1e-109  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3830  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  52.88 
 
 		 400 aa  396  1e-109  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0499  HI0933 family protein  56.37 
 
 		 398 aa  392  1e-108  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0205832 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0592  HI0933 family protein  51.97 
 
 		 405 aa  394  1e-108  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0224  hypothetical protein  52.88 
 
 		 400 aa  394  1e-108  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0623  hypothetical protein  47.54 
 
 		 428 aa  393  1e-108  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.228803 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4487  HI0933 family protein  53.15 
 
 		 399 aa  395  1e-108  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3691  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  52.88 
 
 		 400 aa  394  1e-108  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3974  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  52.88 
 
 		 400 aa  394  1e-108  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2680  hypothetical protein  47.47 
 
 		 393 aa  388  1e-107  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2552  hypothetical protein  47.73 
 
 		 393 aa  391  1e-107  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3018  hypothetical protein  55 
 
 		 404 aa  389  1e-107  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0943538  normal  0.733965 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0051  hypothetical protein  50.38 
 
 		 394 aa  389  1e-107  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000135975 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4328  hypothetical protein  50.38 
 
 		 394 aa  390  1e-107  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1635  hypothetical protein  47.77 
 
 		 405 aa  389  1e-107  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0047  hypothetical protein  50.38 
 
 		 394 aa  389  1e-107  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3906  hypothetical protein  52.88 
 
 		 397 aa  386  1e-106  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00166  predicted flavoprotein  48.86 
 
 		 393 aa  388  1e-106  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0476  hypothetical protein  52.76 
 
 		 394 aa  385  1e-106  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.900431  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0398  HI0933 family protein  54.14 
 
 		 406 aa  385  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00801709 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2949  putative FAD dependent oxidoreductase  48.72 
 
 		 401 aa  385  1e-106  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0055  hypothetical protein  50.13 
 
 		 394 aa  385  1e-106  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000153695 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0044  hypothetical protein  49.87 
 
 		 394 aa  387  1e-106  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0051  HI0933 family protein  50.13 
 
 		 394 aa  387  1e-106  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.71818 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0047  hypothetical protein  50.77 
 
 		 394 aa  385  1e-106  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00322221 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0054  hypothetical protein  49.87 
 
 		 396 aa  384  1e-105  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0515  hypothetical protein  49.22 
 
 		 392 aa  383  1e-105  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1357  hypothetical protein  53.45 
 
 		 409 aa  382  1e-105  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.999189  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1725  hypothetical protein  53.4 
 
 		 397 aa  382  1e-105  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.685186 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>