More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcDH1_0223 on replicon CP001637
Organism: Escherichia coli DH1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_03341  predicted oxidoreductase with FAD/NAD(P)-binding domain  99.75 
 
 		 400 aa  824    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.542782  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0223  HI0933 family protein  100 
 
 		 400 aa  826    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3858  hypothetical protein  88.19 
 
 		 398 aa  735    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00469108  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3830  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  99.75 
 
 		 400 aa  823    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4118  HI0933 family protein  77.92 
 
 		 394 aa  645    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3931  HI0933 family protein  75.13 
 
 		 397 aa  634    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3906  hypothetical protein  84.21 
 
 		 397 aa  680    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4094  hypothetical protein  78.39 
 
 		 460 aa  666    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3962  hypothetical protein  87.94 
 
 		 398 aa  732    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.327369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3974  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  99.5 
 
 		 400 aa  822    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0224  hypothetical protein  99.5 
 
 		 400 aa  822    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3781  hypothetical protein  87.69 
 
 		 398 aa  732    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3691  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  99.5 
 
 		 400 aa  822    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03294  hypothetical protein  99.75 
 
 		 400 aa  824    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.555868  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0123  hypothetical protein  78.39 
 
 		 460 aa  669    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.291133  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4032  hypothetical protein  78.64 
 
 		 398 aa  668    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4204  HI0933 family protein  76.19 
 
 		 399 aa  640    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3901  hypothetical protein  87.94 
 
 		 398 aa  733    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.150346  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4838  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  99.25 
 
 		 400 aa  818    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3791  hypothetical protein  87.94 
 
 		 398 aa  733    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4688  hypothetical protein  80.31 
 
 		 413 aa  660    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3781  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  99.5 
 
 		 400 aa  822    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4487  HI0933 family protein  75.44 
 
 		 399 aa  627  1e-178  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2949  putative FAD dependent oxidoreductase  61.6 
 
 		 401 aa  511  1e-144  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00166  predicted flavoprotein  61.68 
 
 		 393 aa  508  9.999999999999999e-143  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001943  NAD(FAD)-utilizing dehydrogenase  61.83 
 
 		 397 aa  505  9.999999999999999e-143  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0064  hypothetical protein  61.38 
 
 		 397 aa  499  1e-140  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00536  oxidoreductase  59.8 
 
 		 397 aa  498  1e-140  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2434  hypothetical protein  61.86 
 
 		 398 aa  498  1e-139  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3802  hypothetical protein  60.81 
 
 		 394 aa  492  9.999999999999999e-139  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0051  HI0933 family protein  60.56 
 
 		 394 aa  484  1e-136  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.71818 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0051  hypothetical protein  61.07 
 
 		 394 aa  487  1e-136  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000135975 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0047  hypothetical protein  60.56 
 
 		 394 aa  485  1e-136  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4017  hypothetical protein  61.54 
 
 		 393 aa  488  1e-136  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0044  hypothetical protein  60.81 
 
 		 394 aa  487  1e-136  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0054  hypothetical protein  60.31 
 
 		 396 aa  482  1e-135  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4328  hypothetical protein  60.56 
 
 		 394 aa  483  1e-135  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0049  hypothetical protein  60.56 
 
 		 394 aa  483  1e-135  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000378391 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0047  hypothetical protein  60.31 
 
 		 394 aa  482  1e-135  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00322221 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0055  hypothetical protein  60.56 
 
 		 394 aa  484  1e-135  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000153695 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0145  hypothetical protein  59.02 
 
 		 394 aa  481  1e-134  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0375  HI0933-like protein  57.4 
 
 		 393 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4873  hypothetical protein  58.78 
 
 		 394 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2680  hypothetical protein  56.2 
 
 		 393 aa  462  1e-129  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3694  HI0933-like protein  58.69 
 
 		 398 aa  464  1e-129  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4466  hypothetical protein  58.78 
 
 		 394 aa  462  1e-129  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.119173 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2552  hypothetical protein  55.7 
 
 		 393 aa  459  9.999999999999999e-129  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28030  HI0933-like protein  58.14 
 
 		 411 aa  458  9.999999999999999e-129  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3274  hypothetical protein  57.58 
 
 		 396 aa  459  9.999999999999999e-129  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.142928  normal  0.877884 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0476  hypothetical protein  57.25 
 
 		 394 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.900431  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0662  hypothetical protein  55.1 
 
 		 392 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0741866  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0271  hypothetical protein  54.98 
 
 		 401 aa  446  1.0000000000000001e-124  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07280  hypothetical protein  54.85 
 
 		 392 aa  445  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1349  hypothetical protein  54.57 
 
 		 393 aa  442  1e-123  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0599  HI0933 family protein  56.19 
 
 		 392 aa  442  1e-123  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.623073 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5249  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein-like  54.85 
 
 		 392 aa  443  1e-123  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5002  hypothetical protein  56.54 
 
 		 393 aa  443  1e-123  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.32275  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4953  hypothetical protein  55.76 
 
 		 393 aa  441  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.683781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4826  hypothetical protein  55.76 
 
 		 393 aa  438  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.270305  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0515  hypothetical protein  54.59 
 
 		 392 aa  438  9.999999999999999e-123  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1798  hypothetical protein  54.8 
 
 		 392 aa  441  9.999999999999999e-123  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2547  hypothetical protein  54.82 
 
 		 394 aa  438  9.999999999999999e-123  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.374165  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4212  hypothetical protein  59.03 
 
 		 394 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1392  hypothetical protein  54.31 
 
 		 393 aa  436  1e-121  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.574952  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5008  conserved hypothetical protein TIGR00275  54.47 
 
 		 392 aa  435  1e-121  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0512  hypothetical protein  55.82 
 
 		 410 aa  435  1e-121  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.246775  normal  0.372207 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0623  hypothetical protein  51.01 
 
 		 428 aa  430  1e-119  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.228803 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00402  hypothetical protein  54.78 
 
 		 393 aa  428  1e-119  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.96178  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1707  HI0933-like protein  54.71 
 
 		 399 aa  425  1e-118  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.105129 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1463  hypothetical protein  54.08 
 
 		 392 aa  423  1e-117  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.261664  normal  0.428497 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2832  flavoprotein  54.08 
 
 		 392 aa  424  1e-117  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.838235  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1621  HI0933 family protein  54.78 
 
 		 394 aa  422  1e-117  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0160754  normal  0.370908 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1513  hypothetical protein  53.32 
 
 		 392 aa  422  1e-117  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.86402  normal  0.0796345 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2183  hypothetical protein  52.61 
 
 		 396 aa  420  1e-116  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.286863 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2623  hypothetical protein  53.15 
 
 		 393 aa  421  1e-116  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0303  hypothetical protein  51.27 
 
 		 394 aa  416  9.999999999999999e-116  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.918662  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3115  FAD-dependent oxidoreductase of HI0933-like family protein  52.25 
 
 		 400 aa  417  9.999999999999999e-116  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1635  hypothetical protein  50.12 
 
 		 405 aa  416  9.999999999999999e-116  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2099  hypothetical protein  52.05 
 
 		 396 aa  412  1e-114  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0156  hypothetical protein  53.05 
 
 		 392 aa  414  1e-114  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1725  hypothetical protein  54.73 
 
 		 397 aa  414  1e-114  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.685186 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0202  HI0933-like protein  49.53 
 
 		 433 aa  410  1e-113  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.309698  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0680  HI0933-like protein  56.06 
 
 		 394 aa  407  1.0000000000000001e-112  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.192167 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0398  HI0933 family protein  53.3 
 
 		 406 aa  404  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00801709 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0183  hypothetical protein  47.54 
 
 		 438 aa  401  9.999999999999999e-111  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.18446 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1238  hypothetical protein  52.58 
 
 		 414 aa  401  9.999999999999999e-111  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0801  hypothetical protein  51.16 
 
 		 395 aa  397  1e-109  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0366  HI0933 family protein  52.03 
 
 		 406 aa  396  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.128737 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1441  HI0933-like protein  50.9 
 
 		 394 aa  397  1e-109  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3945  hypothetical protein  51.64 
 
 		 405 aa  397  1e-109  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2555  hypothetical protein  49.35 
 
 		 396 aa  387  1e-106  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00730633  hitchhiker  0.0000156467 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1831  HI0933-like protein  52.54 
 
 		 402 aa  388  1e-106  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  decreased coverage  0.000611752  normal  0.363311 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1634  HI0933-like protein  51.63 
 
 		 392 aa  382  1e-105  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0131276  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1400  hypothetical protein  48.31 
 
 		 415 aa  382  1e-105  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.615162  normal  0.401096 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0691  HI0933 family protein  51.81 
 
 		 414 aa  384  1e-105  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1341  hypothetical protein  50.13 
 
 		 393 aa  380  1e-104  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3283  HI0933-like protein  48.43 
 
 		 416 aa  379  1e-104  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2824  HI0933-like protein  51.39 
 
 		 405 aa  379  1e-104  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1787  hypothetical protein  52.51 
 
 		 406 aa  379  1e-104  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000418833 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2884  HI0933-like protein  47.83 
 
 		 414 aa  372  1e-102  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>