More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_202 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002936  DET0226  hypothetical protein  93.93 
 
 		 379 aa  733    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0128  hypothetical protein  86.55 
 
 		 394 aa  706    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0603016  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_202  hypothetical protein  100 
 
 		 394 aa  802    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4030  HI0933 family protein  40.36 
 
 		 414 aa  276  5e-73  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1437  hypothetical protein  39.41 
 
 		 413 aa  272  7e-72  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0825  HI0933 family protein  40.36 
 
 		 414 aa  262  6.999999999999999e-69  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.689631 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2605  hypothetical protein  36.75 
 
 		 407 aa  251  2e-65  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00291222  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0627  HI0933 family protein  35.41 
 
 		 404 aa  245  8e-64  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000930463  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1076  HI0933 family protein  35.11 
 
 		 407 aa  235  1.0000000000000001e-60  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0249257  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2635  YhiN family flavoprotein  37.59 
 
 		 414 aa  234  1.0000000000000001e-60  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.457541  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2952  hypothetical protein  37.59 
 
 		 415 aa  234  2.0000000000000002e-60  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00592847  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0708  FAD dependent oxidoreductase  35.97 
 
 		 409 aa  216  5.9999999999999996e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1018  HI0933 family protein  31.84 
 
 		 404 aa  211  1e-53  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2050  hypothetical protein  38.01 
 
 		 419 aa  208  1e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000118961  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1150  YhiN family flavoprotein  34.29 
 
 		 406 aa  206  4e-52  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.823305  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0754  HI0933-like protein  32.84 
 
 		 396 aa  206  6e-52  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.961432  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1339  hypothetical protein  34.29 
 
 		 406 aa  206  9e-52  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0646456  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2209  hypothetical protein  33.82 
 
 		 430 aa  204  2e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000224827  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1733  HI0933 family protein  35.44 
 
 		 408 aa  202  8e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2378  HI0933 family protein  34.77 
 
 		 412 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.270996  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1601  hypothetical protein  33.74 
 
 		 406 aa  197  3e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00402  hypothetical protein  31.27 
 
 		 393 aa  194  2e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.96178  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0476  hypothetical protein  33.25 
 
 		 394 aa  194  2e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.900431  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2135  hypothetical protein  35.37 
 
 		 415 aa  194  2e-48  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00468248  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0030  HI0933 family protein  33.17 
 
 		 412 aa  194  2e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4328  hypothetical protein  33.33 
 
 		 394 aa  194  3e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0908  HI0933 family protein  32.85 
 
 		 426 aa  193  4e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1567  hypothetical protein  33 
 
 		 393 aa  193  4e-48  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0156  hypothetical protein  32.27 
 
 		 392 aa  193  5e-48  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0698  hypothetical protein  32.07 
 
 		 409 aa  192  6e-48  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4017  hypothetical protein  32.35 
 
 		 393 aa  192  6e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0051  HI0933 family protein  33.09 
 
 		 394 aa  191  1e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.71818 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0051  hypothetical protein  33.09 
 
 		 394 aa  191  2e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000135975 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0047  hypothetical protein  32.84 
 
 		 394 aa  191  2e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0044  hypothetical protein  32.59 
 
 		 394 aa  191  2e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2949  putative FAD dependent oxidoreductase  30.62 
 
 		 401 aa  190  2.9999999999999997e-47  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1752  hypothetical protein  32.27 
 
 		 390 aa  190  2.9999999999999997e-47  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00572064  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28030  HI0933-like protein  31.54 
 
 		 411 aa  190  2.9999999999999997e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3802  hypothetical protein  32.84 
 
 		 394 aa  190  2.9999999999999997e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0049  hypothetical protein  32.84 
 
 		 394 aa  189  5.999999999999999e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000378391 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0064  hypothetical protein  33.25 
 
 		 397 aa  189  9e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0047  hypothetical protein  32.84 
 
 		 394 aa  189  9e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00322221 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0055  hypothetical protein  32.6 
 
 		 394 aa  188  1e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000153695 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07280  hypothetical protein  31.93 
 
 		 392 aa  188  1e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1349  hypothetical protein  31.02 
 
 		 393 aa  187  2e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2451  hypothetical protein  32.58 
 
 		 446 aa  187  2e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000138411  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0662  hypothetical protein  31.93 
 
 		 392 aa  188  2e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0741866  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0271  hypothetical protein  32.03 
 
 		 401 aa  187  2e-46  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00536  oxidoreductase  32.59 
 
 		 397 aa  187  2e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5249  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein-like  31.27 
 
 		 392 aa  186  6e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2761  HI0933 family protein  30.68 
 
 		 427 aa  185  1.0000000000000001e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4873  hypothetical protein  32.08 
 
 		 394 aa  185  1.0000000000000001e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0054  hypothetical protein  33.75 
 
 		 396 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0623  hypothetical protein  30.81 
 
 		 428 aa  184  3e-45  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.228803 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0599  HI0933 family protein  31.03 
 
 		 392 aa  183  4.0000000000000006e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.623073 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0672  HI0933 family protein  32.37 
 
 		 436 aa  183  4.0000000000000006e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2434  hypothetical protein  30.52 
 
 		 398 aa  183  5.0000000000000004e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4466  hypothetical protein  32.18 
 
 		 394 aa  183  5.0000000000000004e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.119173 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001943  NAD(FAD)-utilizing dehydrogenase  31.67 
 
 		 397 aa  182  6e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1392  hypothetical protein  30.77 
 
 		 393 aa  182  9.000000000000001e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.574952  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4604  hypothetical protein  32.69 
 
 		 423 aa  182  9.000000000000001e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00629914  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4440  NAD(FAD)-utilizing dehydrogenase  32.69 
 
 		 423 aa  182  9.000000000000001e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0621454  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4458  NAD(FAD)-utilizing dehydrogenase  32.69 
 
 		 423 aa  182  9.000000000000001e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00549646  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4825  conserved hypothetical protein TIGR00275  32.69 
 
 		 423 aa  182  9.000000000000001e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4960  hypothetical protein  32.69 
 
 		 423 aa  182  9.000000000000001e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.979568  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4843  conserved hypothetical protein TIGR00275  32.69 
 
 		 423 aa  182  1e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000266049  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4820  conserved hypothetical protein TIGR00275  32.44 
 
 		 423 aa  181  2e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0848463  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4850  hypothetical protein  32.2 
 
 		 423 aa  181  2e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.473198  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0861  HI0933 family protein  30.58 
 
 		 412 aa  181  2e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000883164  normal  0.741633 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4539  hypothetical protein  32.2 
 
 		 423 aa  181  2e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1025  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  29.93 
 
 		 403 aa  181  2e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0617168  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0416  hypothetical protein TIGR00275  32.2 
 
 		 423 aa  181  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0139426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3371  hypothetical protein  31.87 
 
 		 426 aa  181  2.9999999999999997e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000385799  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1197  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  29.93 
 
 		 403 aa  180  4e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00144707  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3694  HI0933-like protein  32.27 
 
 		 398 aa  179  5.999999999999999e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0375  HI0933-like protein  30.34 
 
 		 393 aa  179  7e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0195  hypothetical protein  33.49 
 
 		 435 aa  179  8e-44  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0437859  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3962  hypothetical protein  31.49 
 
 		 398 aa  179  9e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.327369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1798  hypothetical protein  30.79 
 
 		 392 aa  178  1e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3791  hypothetical protein  31.23 
 
 		 398 aa  177  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1845  hypothetical protein  31.49 
 
 		 422 aa  178  2e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3901  hypothetical protein  31.23 
 
 		 398 aa  177  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.150346  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1237  HI0933-like protein  28.35 
 
 		 412 aa  178  2e-43  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_183  hypothetical protein  32.86 
 
 		 435 aa  177  2e-43  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.277985  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1810  hypothetical protein  31.49 
 
 		 422 aa  178  2e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.261505  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3858  hypothetical protein  31.23 
 
 		 398 aa  177  3e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00469108  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00166  predicted flavoprotein  29.85 
 
 		 393 aa  177  3e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3781  hypothetical protein  31.23 
 
 		 398 aa  177  3e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4826  hypothetical protein  31.06 
 
 		 393 aa  176  6e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.270305  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3931  HI0933 family protein  31.58 
 
 		 397 aa  176  8e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1621  HI0933 family protein  30.42 
 
 		 394 aa  176  8e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0160754  normal  0.370908 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1707  HI0933-like protein  32.01 
 
 		 399 aa  176  8e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.105129 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3399  HI0933 family protein  34.06 
 
 		 419 aa  176  9e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000862547  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0158  hypothetical protein  32.07 
 
 		 435 aa  175  9.999999999999999e-43  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0491  hypothetical protein  30.65 
 
 		 411 aa  175  9.999999999999999e-43  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4688  hypothetical protein  31.47 
 
 		 413 aa  175  9.999999999999999e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0145  hypothetical protein  30.2 
 
 		 394 aa  174  1.9999999999999998e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5002  hypothetical protein  31.06 
 
 		 393 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.32275  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4032  hypothetical protein  30.27 
 
 		 398 aa  175  1.9999999999999998e-42  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0187  HI0933 family protein  32.85 
 
 		 433 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>