More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_0698 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010003  Pmob_0698  hypothetical protein  100 
 
 
409 aa  823    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0825  HI0933 family protein  37.24 
 
 
414 aa  282  9e-75  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.689631 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4030  HI0933 family protein  36.22 
 
 
414 aa  277  2e-73  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1437  hypothetical protein  35.88 
 
 
413 aa  265  1e-69  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1076  HI0933 family protein  32.66 
 
 
407 aa  225  1e-57  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0249257  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2605  hypothetical protein  32.76 
 
 
407 aa  224  2e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00291222  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2635  YhiN family flavoprotein  33.09 
 
 
414 aa  221  1.9999999999999999e-56  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.457541  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2952  hypothetical protein  32.85 
 
 
415 aa  220  3.9999999999999997e-56  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00592847  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1018  HI0933 family protein  33.09 
 
 
404 aa  206  7e-52  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0128  hypothetical protein  32.76 
 
 
394 aa  200  3.9999999999999996e-50  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0603016  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0156  hypothetical protein  30.3 
 
 
392 aa  199  1.0000000000000001e-49  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0662  hypothetical protein  28.64 
 
 
392 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0741866  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07280  hypothetical protein  28.64 
 
 
392 aa  197  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_202  hypothetical protein  32.07 
 
 
394 aa  192  9e-48  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2434  hypothetical protein  28.93 
 
 
398 aa  190  4e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0226  hypothetical protein  32.25 
 
 
379 aa  189  7e-47  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1341  hypothetical protein  28.82 
 
 
393 aa  189  1e-46  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2378  HI0933 family protein  34.26 
 
 
412 aa  188  1e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.270996  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28030  HI0933-like protein  29.58 
 
 
411 aa  188  2e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0599  HI0933 family protein  28.92 
 
 
392 aa  188  2e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.623073 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0754  HI0933-like protein  29.8 
 
 
396 aa  186  4e-46  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.961432  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2555  hypothetical protein  31.83 
 
 
396 aa  186  5e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00730633  hitchhiker  0.0000156467 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1463  hypothetical protein  29.38 
 
 
392 aa  186  5e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.261664  normal  0.428497 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2949  putative FAD dependent oxidoreductase  31.19 
 
 
401 aa  186  7e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2832  flavoprotein  29.38 
 
 
392 aa  186  9e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.838235  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001943  NAD(FAD)-utilizing dehydrogenase  30.71 
 
 
397 aa  186  9e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1513  hypothetical protein  28.88 
 
 
392 aa  182  8.000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.86402  normal  0.0796345 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2547  hypothetical protein  30.9 
 
 
394 aa  182  1e-44  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.374165  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00536  oxidoreductase  29.63 
 
 
397 aa  181  2e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2099  hypothetical protein  26.98 
 
 
396 aa  181  2.9999999999999997e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1441  HI0933-like protein  28.29 
 
 
394 aa  181  2.9999999999999997e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0476  hypothetical protein  29.7 
 
 
394 aa  180  4e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.900431  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2623  hypothetical protein  29.66 
 
 
393 aa  180  4e-44  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5249  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein-like  28.43 
 
 
392 aa  179  5.999999999999999e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0064  hypothetical protein  30.3 
 
 
397 aa  178  1e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1601  hypothetical protein  33.82 
 
 
406 aa  179  1e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2761  HI0933 family protein  30.55 
 
 
427 aa  178  2e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0672  HI0933 family protein  29.52 
 
 
436 aa  177  3e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1621  HI0933 family protein  29.93 
 
 
394 aa  177  3e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0160754  normal  0.370908 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0801  hypothetical protein  28.02 
 
 
395 aa  177  4e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3945  hypothetical protein  28.4 
 
 
405 aa  177  4e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1315  hypothetical protein  32.28 
 
 
420 aa  176  5e-43  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.476308  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3858  hypothetical protein  28.57 
 
 
398 aa  176  5e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00469108  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0708  FAD dependent oxidoreductase  30.55 
 
 
409 aa  176  7e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1505  HI0933 family protein  31.02 
 
 
402 aa  176  9e-43  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000535325  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3901  hypothetical protein  28.57 
 
 
398 aa  175  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.150346  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3791  hypothetical protein  28.57 
 
 
398 aa  175  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0627  HI0933 family protein  27.97 
 
 
404 aa  175  9.999999999999999e-43  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000930463  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0271  hypothetical protein  29.98 
 
 
401 aa  176  9.999999999999999e-43  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3781  hypothetical protein  28.33 
 
 
398 aa  174  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3962  hypothetical protein  28.57 
 
 
398 aa  174  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.327369  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1798  hypothetical protein  27.52 
 
 
392 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0375  HI0933-like protein  27.48 
 
 
393 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2209  hypothetical protein  30.29 
 
 
430 aa  174  3.9999999999999995e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000224827  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1025  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  30.96 
 
 
403 aa  173  3.9999999999999995e-42  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0617168  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1197  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  31.14 
 
 
403 aa  173  5e-42  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00144707  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0303  hypothetical protein  26.93 
 
 
394 aa  173  5.999999999999999e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.918662  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2183  hypothetical protein  27.8 
 
 
396 aa  172  7.999999999999999e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.286863 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1810  hypothetical protein  31.22 
 
 
422 aa  172  7.999999999999999e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.261505  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1845  hypothetical protein  31.22 
 
 
422 aa  172  7.999999999999999e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0030  HI0933 family protein  31.63 
 
 
412 aa  172  9e-42  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3274  hypothetical protein  27.23 
 
 
396 aa  172  1e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.142928  normal  0.877884 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1707  HI0933-like protein  27.79 
 
 
399 aa  172  1e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.105129 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1831  HI0933-like protein  28.36 
 
 
402 aa  172  1e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  decreased coverage  0.000611752  normal  0.363311 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1238  hypothetical protein  28.86 
 
 
414 aa  171  2e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1349  hypothetical protein  27.9 
 
 
393 aa  171  2e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00402  hypothetical protein  28.64 
 
 
393 aa  170  4e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.96178  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1725  hypothetical protein  30.22 
 
 
397 aa  170  5e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.685186 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0491  hypothetical protein  28.17 
 
 
411 aa  169  6e-41  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0158  hypothetical protein  31.16 
 
 
435 aa  169  6e-41  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0499  HI0933 family protein  27.58 
 
 
398 aa  169  7e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0205832 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0861  HI0933 family protein  31.46 
 
 
412 aa  169  7e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000883164  normal  0.741633 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2846  hypothetical protein  28.23 
 
 
413 aa  169  7e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2680  hypothetical protein  29.78 
 
 
393 aa  169  8e-41  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4017  hypothetical protein  27.79 
 
 
393 aa  169  9e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0623  hypothetical protein  28.88 
 
 
428 aa  169  1e-40  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.228803 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2552  hypothetical protein  30.27 
 
 
393 aa  169  1e-40  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2135  hypothetical protein  29.16 
 
 
415 aa  168  1e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00468248  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0055  hypothetical protein  28.19 
 
 
394 aa  167  2e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000153695 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0054  hypothetical protein  28.33 
 
 
396 aa  167  2e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2097  hypothetical protein  27.46 
 
 
419 aa  168  2e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.234168  normal  0.897923 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0044  hypothetical protein  28.82 
 
 
394 aa  168  2e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0049  hypothetical protein  29.71 
 
 
394 aa  167  2e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000378391 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4873  hypothetical protein  28.33 
 
 
394 aa  167  2e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0047  hypothetical protein  28.33 
 
 
394 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00322221 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0051  HI0933 family protein  27.83 
 
 
394 aa  167  4e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.71818 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4328  hypothetical protein  28.08 
 
 
394 aa  167  5e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1392  hypothetical protein  27.65 
 
 
393 aa  166  6.9999999999999995e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.574952  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4953  hypothetical protein  26.85 
 
 
393 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.683781  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0927  HI0933 family protein  28.15 
 
 
408 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.1016 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0515  hypothetical protein  28.57 
 
 
392 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1530  hypothetical protein  27.54 
 
 
391 aa  166  1.0000000000000001e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2335  HI0933 family protein  27.51 
 
 
413 aa  165  2.0000000000000002e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00707215  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0908  HI0933 family protein  29.74 
 
 
426 aa  164  2.0000000000000002e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4838  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  28.93 
 
 
400 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5008  conserved hypothetical protein TIGR00275  28.39 
 
 
392 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4826  hypothetical protein  26.85 
 
 
393 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.270305  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4118  HI0933 family protein  29.46 
 
 
394 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2884  HI0933-like protein  27.25 
 
 
414 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0047  hypothetical protein  27.83 
 
 
394 aa  165  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>