More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_2378 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013216  Dtox_2378  HI0933 family protein  100 
 
 
412 aa  843    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.270996  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0708  FAD dependent oxidoreductase  54.88 
 
 
409 aa  469  1.0000000000000001e-131  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1733  HI0933 family protein  56.33 
 
 
408 aa  437  1e-121  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1339  hypothetical protein  52.96 
 
 
406 aa  426  1e-118  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0646456  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1150  YhiN family flavoprotein  52.71 
 
 
406 aa  427  1e-118  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.823305  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2451  hypothetical protein  50.71 
 
 
446 aa  414  1e-114  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000138411  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1601  hypothetical protein  52.35 
 
 
406 aa  410  1e-113  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2135  hypothetical protein  47.57 
 
 
415 aa  384  1e-105  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00468248  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3399  HI0933 family protein  47.3 
 
 
419 aa  377  1e-103  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000862547  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2209  hypothetical protein  45.78 
 
 
430 aa  362  6e-99  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000224827  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0195  hypothetical protein  43.34 
 
 
435 aa  338  8e-92  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0437859  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0030  HI0933 family protein  45.04 
 
 
412 aa  338  9.999999999999999e-92  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_183  hypothetical protein  42.62 
 
 
435 aa  337  1.9999999999999998e-91  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.277985  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0158  hypothetical protein  43.1 
 
 
435 aa  335  7e-91  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0187  HI0933 family protein  46.36 
 
 
433 aa  326  5e-88  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0908  HI0933 family protein  39.95 
 
 
426 aa  320  3e-86  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0861  HI0933 family protein  40.19 
 
 
412 aa  319  6e-86  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000883164  normal  0.741633 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1197  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  42.68 
 
 
403 aa  317  2e-85  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00144707  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1025  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  42.43 
 
 
403 aa  317  4e-85  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0617168  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2761  HI0933 family protein  39.38 
 
 
427 aa  311  1e-83  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0672  HI0933 family protein  39.57 
 
 
436 aa  306  4.0000000000000004e-82  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2050  hypothetical protein  41.39 
 
 
419 aa  301  9e-81  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000118961  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4843  conserved hypothetical protein TIGR00275  39.38 
 
 
423 aa  298  1e-79  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000266049  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4850  hypothetical protein  39.38 
 
 
423 aa  297  2e-79  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.473198  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4604  hypothetical protein  39.38 
 
 
423 aa  298  2e-79  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00629914  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4440  NAD(FAD)-utilizing dehydrogenase  39.38 
 
 
423 aa  298  2e-79  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0621454  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4458  NAD(FAD)-utilizing dehydrogenase  39.38 
 
 
423 aa  298  2e-79  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00549646  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4960  hypothetical protein  39.38 
 
 
423 aa  298  2e-79  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.979568  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4825  conserved hypothetical protein TIGR00275  39.38 
 
 
423 aa  298  2e-79  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4820  conserved hypothetical protein TIGR00275  38.9 
 
 
423 aa  297  3e-79  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0848463  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0416  hypothetical protein TIGR00275  38.9 
 
 
423 aa  295  1e-78  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0139426  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4539  hypothetical protein  39.14 
 
 
423 aa  295  1e-78  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3371  hypothetical protein  39.14 
 
 
426 aa  293  3e-78  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000385799  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1315  hypothetical protein  39.18 
 
 
420 aa  285  1.0000000000000001e-75  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.476308  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0262  flavoprotein  37.44 
 
 
424 aa  275  8e-73  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000227955  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1810  hypothetical protein  38.13 
 
 
422 aa  275  1.0000000000000001e-72  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.261505  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1845  hypothetical protein  38.13 
 
 
422 aa  275  1.0000000000000001e-72  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1752  hypothetical protein  39.26 
 
 
390 aa  267  2.9999999999999995e-70  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00572064  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1437  hypothetical protein  37.92 
 
 
413 aa  263  4.999999999999999e-69  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1567  hypothetical protein  39.07 
 
 
393 aa  254  3e-66  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2952  hypothetical protein  35.28 
 
 
415 aa  249  4e-65  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00592847  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2635  YhiN family flavoprotein  35.28 
 
 
414 aa  248  1e-64  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.457541  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0825  HI0933 family protein  35.03 
 
 
414 aa  243  3e-63  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.689631 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2387  hypothetical protein  35.28 
 
 
410 aa  243  6e-63  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1561  hypothetical protein  33.56 
 
 
455 aa  242  1e-62  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1022  HI0933 family protein  34.92 
 
 
403 aa  241  2e-62  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1378  hypothetical protein  34.07 
 
 
415 aa  240  2.9999999999999997e-62  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.275116 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0291  hypothetical protein  36.97 
 
 
408 aa  239  9e-62  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1430  HI0933 family protein  33.42 
 
 
452 aa  237  3e-61  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.223271  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0927  HI0933 family protein  35.05 
 
 
408 aa  236  4e-61  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.1016 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4030  HI0933 family protein  34.61 
 
 
414 aa  231  1e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1237  HI0933-like protein  34.89 
 
 
412 aa  227  3e-58  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2605  hypothetical protein  32.76 
 
 
407 aa  226  5.0000000000000005e-58  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00291222  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1926  HI0933-like protein  33.66 
 
 
414 aa  223  6e-57  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1476  HI0933 family protein  34.1 
 
 
413 aa  220  3.9999999999999997e-56  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1282  HI0933 family protein  33.41 
 
 
457 aa  220  3.9999999999999997e-56  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.138775  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1467  hypothetical protein  32.69 
 
 
415 aa  219  8.999999999999998e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.196184  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15581  flavoprotein  31.58 
 
 
414 aa  214  1.9999999999999998e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.379962  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4118  HI0933 family protein  34.33 
 
 
394 aa  209  1e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15361  flavoprotein  30.05 
 
 
411 aa  208  1e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0647863  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0130  hypothetical protein  33.25 
 
 
405 aa  207  2e-52  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.700212  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07621  hypothetical protein  33.17 
 
 
407 aa  207  3e-52  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.0179283 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15731  flavoprotein  31.34 
 
 
410 aa  207  3e-52  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1209  HI0933 family protein  30.61 
 
 
443 aa  206  6e-52  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00892484 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1052  hypothetical protein  33.25 
 
 
442 aa  206  9e-52  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.843089  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2949  putative FAD dependent oxidoreductase  33.09 
 
 
401 aa  204  3e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0047  hypothetical protein  32.19 
 
 
394 aa  203  5e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1076  HI0933 family protein  31.12 
 
 
407 aa  203  5e-51  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0249257  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4017  hypothetical protein  33.58 
 
 
393 aa  202  6e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1122  hypothetical protein  31.1 
 
 
443 aa  202  9.999999999999999e-51  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.138213  normal  0.379331 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0051  hypothetical protein  31.94 
 
 
394 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  unclonable  0.0000135975 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0627  HI0933 family protein  32.6 
 
 
404 aa  201  1.9999999999999998e-50  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000930463  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2555  hypothetical protein  33.67 
 
 
396 aa  201  1.9999999999999998e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00730633  hitchhiker  0.0000156467 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001943  NAD(FAD)-utilizing dehydrogenase  32.19 
 
 
397 aa  201  1.9999999999999998e-50  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4328  hypothetical protein  31.94 
 
 
394 aa  200  3e-50  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2884  HI0933-like protein  34.38 
 
 
414 aa  201  3e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4688  hypothetical protein  33.92 
 
 
413 aa  200  3e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1238  hypothetical protein  33.58 
 
 
414 aa  200  3e-50  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0051  HI0933 family protein  31.94 
 
 
394 aa  199  7e-50  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.71818 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00536  oxidoreductase  31.45 
 
 
397 aa  199  7e-50  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_202  hypothetical protein  34.67 
 
 
394 aa  199  7.999999999999999e-50  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2547  hypothetical protein  34.22 
 
 
394 aa  198  1.0000000000000001e-49  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.374165  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3858  hypothetical protein  33.01 
 
 
398 aa  198  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00469108  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0047  hypothetical protein  31.6 
 
 
394 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00322221 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3791  hypothetical protein  32.84 
 
 
398 aa  198  2.0000000000000003e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00402  hypothetical protein  33.58 
 
 
393 aa  197  2.0000000000000003e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.96178  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4204  HI0933 family protein  31.67 
 
 
399 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3901  hypothetical protein  32.84 
 
 
398 aa  198  2.0000000000000003e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.150346  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3274  hypothetical protein  33.66 
 
 
396 aa  197  3e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.142928  normal  0.877884 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3962  hypothetical protein  33.01 
 
 
398 aa  197  3e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.327369  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3781  hypothetical protein  33.01 
 
 
398 aa  197  3e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0128  hypothetical protein  33.5 
 
 
394 aa  196  4.0000000000000005e-49  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0603016  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0226  hypothetical protein  34.41 
 
 
379 aa  196  6e-49  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0044  hypothetical protein  31.36 
 
 
394 aa  196  6e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3802  hypothetical protein  31.13 
 
 
394 aa  196  8.000000000000001e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0055  hypothetical protein  30.96 
 
 
394 aa  195  1e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000153695 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0064  hypothetical protein  32.84 
 
 
397 aa  195  1e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1899  HI0933 family protein  31.58 
 
 
409 aa  195  1e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.279809  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0049  hypothetical protein  31.36 
 
 
394 aa  195  1e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000378391 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2434  hypothetical protein  33.66 
 
 
398 aa  194  2e-48  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>