More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DehaBAV1_0128 on replicon NC_009455
Organism: Dehalococcoides sp. BAV1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002936  DET0226  hypothetical protein  86.02 
 
 		 379 aa  677    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0128  hypothetical protein  100 
 
 		 394 aa  804    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0603016  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_202  hypothetical protein  86.55 
 
 		 394 aa  686    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4030  HI0933 family protein  40.1 
 
 		 414 aa  274  2.0000000000000002e-72  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1437  hypothetical protein  37.24 
 
 		 413 aa  260  3e-68  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2605  hypothetical protein  37.13 
 
 		 407 aa  254  1.0000000000000001e-66  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00291222  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0627  HI0933 family protein  35.98 
 
 		 404 aa  249  7e-65  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000930463  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0825  HI0933 family protein  39.07 
 
 		 414 aa  247  2e-64  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.689631 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1076  HI0933 family protein  36.9 
 
 		 407 aa  237  3e-61  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0249257  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2952  hypothetical protein  37.5 
 
 		 415 aa  226  7e-58  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00592847  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2635  YhiN family flavoprotein  36.8 
 
 		 414 aa  226  8e-58  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.457541  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1018  HI0933 family protein  32.67 
 
 		 404 aa  213  5.999999999999999e-54  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0708  FAD dependent oxidoreductase  34.44 
 
 		 409 aa  211  2e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0754  HI0933-like protein  33 
 
 		 396 aa  211  3e-53  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.961432  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2209  hypothetical protein  33.9 
 
 		 430 aa  207  4e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000224827  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2050  hypothetical protein  35.08 
 
 		 419 aa  200  3.9999999999999996e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000118961  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1601  hypothetical protein  34.55 
 
 		 406 aa  200  3.9999999999999996e-50  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0030  HI0933 family protein  35.19 
 
 		 412 aa  198  1.0000000000000001e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1733  HI0933 family protein  34.46 
 
 		 408 aa  196  9e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1150  YhiN family flavoprotein  33.25 
 
 		 406 aa  195  1e-48  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.823305  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1339  hypothetical protein  33.25 
 
 		 406 aa  194  2e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0646456  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2761  HI0933 family protein  30.83 
 
 		 427 aa  194  2e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0908  HI0933 family protein  33.09 
 
 		 426 aa  193  4e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0156  hypothetical protein  32.02 
 
 		 392 aa  193  5e-48  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1752  hypothetical protein  33.99 
 
 		 390 aa  189  1e-46  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00572064  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4328  hypothetical protein  33.09 
 
 		 394 aa  188  1e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2135  hypothetical protein  34.69 
 
 		 415 aa  187  2e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00468248  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1567  hypothetical protein  33.93 
 
 		 393 aa  187  3e-46  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0051  HI0933 family protein  32.84 
 
 		 394 aa  186  5e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.71818 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28030  HI0933-like protein  33.01 
 
 		 411 aa  186  6e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00402  hypothetical protein  30.95 
 
 		 393 aa  186  8e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.96178  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5249  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein-like  31.76 
 
 		 392 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0698  hypothetical protein  31.98 
 
 		 409 aa  184  3e-45  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0051  hypothetical protein  32.6 
 
 		 394 aa  184  3e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000135975 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0044  hypothetical protein  32.1 
 
 		 394 aa  184  3e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0047  hypothetical protein  32.35 
 
 		 394 aa  184  3e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1845  hypothetical protein  31.4 
 
 		 422 aa  183  4.0000000000000006e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1810  hypothetical protein  31.4 
 
 		 422 aa  183  4.0000000000000006e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.261505  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3802  hypothetical protein  31.95 
 
 		 394 aa  183  5.0000000000000004e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4017  hypothetical protein  32.18 
 
 		 393 aa  183  5.0000000000000004e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0599  HI0933 family protein  30.79 
 
 		 392 aa  182  7e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.623073 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0049  hypothetical protein  32.35 
 
 		 394 aa  182  7e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000378391 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3371  hypothetical protein  32.12 
 
 		 426 aa  182  8.000000000000001e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000385799  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0047  hypothetical protein  32.35 
 
 		 394 aa  182  9.000000000000001e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00322221 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1349  hypothetical protein  30.27 
 
 		 393 aa  181  1e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0055  hypothetical protein  32.11 
 
 		 394 aa  181  2e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000153695 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0672  HI0933 family protein  31.65 
 
 		 436 aa  180  2.9999999999999997e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1025  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  30.58 
 
 		 403 aa  181  2.9999999999999997e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0617168  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0662  hypothetical protein  31.7 
 
 		 392 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0741866  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0476  hypothetical protein  31.7 
 
 		 394 aa  180  4e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.900431  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2378  HI0933 family protein  33.25 
 
 		 412 aa  180  4e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.270996  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00536  oxidoreductase  32.35 
 
 		 397 aa  180  4e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0861  HI0933 family protein  30.94 
 
 		 412 aa  180  4e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000883164  normal  0.741633 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07280  hypothetical protein  31.45 
 
 		 392 aa  180  4e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4466  hypothetical protein  32.2 
 
 		 394 aa  180  4.999999999999999e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.119173 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4539  hypothetical protein  32.2 
 
 		 423 aa  179  4.999999999999999e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1392  hypothetical protein  30.02 
 
 		 393 aa  179  5.999999999999999e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.574952  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2451  hypothetical protein  32.5 
 
 		 446 aa  179  5.999999999999999e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000138411  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1197  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  30.58 
 
 		 403 aa  179  7e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00144707  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0262  flavoprotein  34.07 
 
 		 424 aa  179  9e-44  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000227955  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0064  hypothetical protein  32.42 
 
 		 397 aa  178  1e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2434  hypothetical protein  30.35 
 
 		 398 aa  179  1e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0491  hypothetical protein  33.25 
 
 		 411 aa  179  1e-43  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0187  HI0933 family protein  33.09 
 
 		 433 aa  177  2e-43  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0623  hypothetical protein  30.22 
 
 		 428 aa  177  2e-43  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.228803 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4604  hypothetical protein  31.48 
 
 		 423 aa  177  3e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00629914  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4440  NAD(FAD)-utilizing dehydrogenase  31.48 
 
 		 423 aa  177  3e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0621454  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4458  NAD(FAD)-utilizing dehydrogenase  31.48 
 
 		 423 aa  177  3e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00549646  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2949  putative FAD dependent oxidoreductase  30.79 
 
 		 401 aa  177  3e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4960  hypothetical protein  31.48 
 
 		 423 aa  177  3e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.979568  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4825  conserved hypothetical protein TIGR00275  31.48 
 
 		 423 aa  177  3e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4850  hypothetical protein  32.2 
 
 		 423 aa  176  4e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.473198  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4820  conserved hypothetical protein TIGR00275  32.12 
 
 		 423 aa  177  4e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0848463  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4843  conserved hypothetical protein TIGR00275  32.2 
 
 		 423 aa  177  4e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000266049  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4873  hypothetical protein  31.45 
 
 		 394 aa  177  4e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0416  hypothetical protein TIGR00275  32.12 
 
 		 423 aa  176  5e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0139426  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001943  NAD(FAD)-utilizing dehydrogenase  32.5 
 
 		 397 aa  176  5e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3962  hypothetical protein  29.73 
 
 		 398 aa  176  7e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.327369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1798  hypothetical protein  30.75 
 
 		 392 aa  176  9e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0054  hypothetical protein  32.01 
 
 		 396 aa  175  9.999999999999999e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0375  HI0933-like protein  31.59 
 
 		 393 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0271  hypothetical protein  31.3 
 
 		 401 aa  175  9.999999999999999e-43  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3399  HI0933 family protein  33.74 
 
 		 419 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000862547  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3858  hypothetical protein  29.48 
 
 		 398 aa  174  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00469108  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5002  hypothetical protein  31.27 
 
 		 393 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.32275  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4688  hypothetical protein  31.47 
 
 		 413 aa  174  1.9999999999999998e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4826  hypothetical protein  31.27 
 
 		 393 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.270305  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3791  hypothetical protein  29.48 
 
 		 398 aa  174  3.9999999999999995e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3901  hypothetical protein  29.48 
 
 		 398 aa  174  3.9999999999999995e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.150346  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00166  predicted flavoprotein  30.27 
 
 		 393 aa  173  5e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3781  hypothetical protein  29.48 
 
 		 398 aa  173  5e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1707  HI0933-like protein  30.15 
 
 		 399 aa  173  5e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.105129 
 
 
-
 
NC_002936  DET0195  hypothetical protein  33.1 
 
 		 435 aa  172  7.999999999999999e-42  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0437859  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_183  hypothetical protein  33.17 
 
 		 435 aa  172  9e-42  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.277985  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1315  hypothetical protein  32.6 
 
 		 420 aa  172  1e-41  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.476308  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0145  hypothetical protein  30.15 
 
 		 394 aa  172  1e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4212  hypothetical protein  32.13 
 
 		 394 aa  171  2e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4953  hypothetical protein  30.77 
 
 		 393 aa  170  3e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.683781  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5008  conserved hypothetical protein TIGR00275  31.3 
 
 		 392 aa  171  3e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0398  HI0933 family protein  31.63 
 
 		 406 aa  170  4e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00801709 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>