More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_1150 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_1339  hypothetical protein  99.26 
 
 		 406 aa  807    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0646456  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1150  YhiN family flavoprotein  100 
 
 		 406 aa  810    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.823305  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0708  FAD dependent oxidoreductase  58.72 
 
 		 409 aa  467  9.999999999999999e-131  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1733  HI0933 family protein  54.68 
 
 		 408 aa  420  1e-116  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2378  HI0933 family protein  52.6 
 
 		 412 aa  414  1e-114  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.270996  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3399  HI0933 family protein  49.23 
 
 		 419 aa  389  1e-107  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000862547  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2135  hypothetical protein  51.29 
 
 		 415 aa  386  1e-106  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00468248  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2451  hypothetical protein  48.67 
 
 		 446 aa  379  1e-104  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000138411  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1601  hypothetical protein  53.19 
 
 		 406 aa  375  1e-103  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1197  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  43.56 
 
 		 403 aa  321  9.999999999999999e-87  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00144707  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1025  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  43.07 
 
 		 403 aa  320  3.9999999999999996e-86  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0617168  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0672  HI0933 family protein  42.05 
 
 		 436 aa  319  5e-86  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0861  HI0933 family protein  44.63 
 
 		 412 aa  315  9.999999999999999e-85  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000883164  normal  0.741633 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2209  hypothetical protein  39.66 
 
 		 430 aa  314  1.9999999999999998e-84  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000224827  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0187  HI0933 family protein  42.86 
 
 		 433 aa  313  1.9999999999999998e-84  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0030  HI0933 family protein  45.12 
 
 		 412 aa  311  1e-83  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3371  hypothetical protein  43.31 
 
 		 426 aa  308  8e-83  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000385799  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2761  HI0933 family protein  41.22 
 
 		 427 aa  308  8e-83  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4539  hypothetical protein  42.82 
 
 		 423 aa  306  4.0000000000000004e-82  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4820  conserved hypothetical protein TIGR00275  43.07 
 
 		 423 aa  306  5.0000000000000004e-82  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0848463  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4604  hypothetical protein  42.82 
 
 		 423 aa  305  7e-82  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00629914  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4825  conserved hypothetical protein TIGR00275  42.82 
 
 		 423 aa  305  7e-82  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4960  hypothetical protein  42.82 
 
 		 423 aa  305  7e-82  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.979568  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4850  hypothetical protein  42.58 
 
 		 423 aa  305  9.000000000000001e-82  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.473198  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4440  NAD(FAD)-utilizing dehydrogenase  42.82 
 
 		 423 aa  305  9.000000000000001e-82  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0621454  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4458  NAD(FAD)-utilizing dehydrogenase  42.82 
 
 		 423 aa  305  9.000000000000001e-82  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00549646  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_183  hypothetical protein  41.52 
 
 		 435 aa  305  1.0000000000000001e-81  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.277985  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0908  HI0933 family protein  40.05 
 
 		 426 aa  305  1.0000000000000001e-81  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0158  hypothetical protein  41.18 
 
 		 435 aa  305  1.0000000000000001e-81  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4843  conserved hypothetical protein TIGR00275  42.58 
 
 		 423 aa  304  1.0000000000000001e-81  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000266049  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0416  hypothetical protein TIGR00275  42.82 
 
 		 423 aa  303  3.0000000000000004e-81  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0139426  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0195  hypothetical protein  41.81 
 
 		 435 aa  301  1e-80  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0437859  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2050  hypothetical protein  39.53 
 
 		 419 aa  294  1e-78  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000118961  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1315  hypothetical protein  41.65 
 
 		 420 aa  292  9e-78  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.476308  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1845  hypothetical protein  40.29 
 
 		 422 aa  286  5e-76  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1810  hypothetical protein  40.29 
 
 		 422 aa  286  5e-76  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.261505  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0262  flavoprotein  39.47 
 
 		 424 aa  281  2e-74  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000227955  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1437  hypothetical protein  37.84 
 
 		 413 aa  261  2e-68  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1752  hypothetical protein  39.56 
 
 		 390 aa  260  3e-68  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00572064  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1567  hypothetical protein  37.83 
 
 		 393 aa  253  3e-66  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1022  HI0933 family protein  37.01 
 
 		 403 aa  249  5e-65  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4030  HI0933 family protein  35.95 
 
 		 414 aa  246  6e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0927  HI0933 family protein  34.31 
 
 		 408 aa  243  3e-63  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.1016 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0291  hypothetical protein  35.56 
 
 		 408 aa  242  7.999999999999999e-63  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1378  hypothetical protein  34.07 
 
 		 415 aa  241  1e-62  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.275116 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0825  HI0933 family protein  34.86 
 
 		 414 aa  240  2.9999999999999997e-62  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.689631 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1237  HI0933-like protein  36.04 
 
 		 412 aa  238  2e-61  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2952  hypothetical protein  35.77 
 
 		 415 aa  238  2e-61  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00592847  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2635  YhiN family flavoprotein  35.77 
 
 		 414 aa  238  2e-61  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.457541  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2387  hypothetical protein  32.91 
 
 		 410 aa  226  5.0000000000000005e-58  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1926  HI0933-like protein  33.75 
 
 		 414 aa  225  9e-58  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0627  HI0933 family protein  32.94 
 
 		 404 aa  213  4.9999999999999996e-54  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000930463  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1430  HI0933 family protein  32.52 
 
 		 452 aa  211  2e-53  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.223271  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2605  hypothetical protein  33.17 
 
 		 407 aa  210  3e-53  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00291222  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1561  hypothetical protein  29.84 
 
 		 455 aa  209  9e-53  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4017  hypothetical protein  33.58 
 
 		 393 aa  209  1e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0130  hypothetical protein  33.18 
 
 		 405 aa  207  3e-52  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.700212  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1467  hypothetical protein  34.14 
 
 		 415 aa  206  5e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.196184  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15581  flavoprotein  34.06 
 
 		 414 aa  206  7e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.379962  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5845  HI0933 family protein  33.97 
 
 		 408 aa  205  9e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.599184  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15361  flavoprotein  33.25 
 
 		 411 aa  205  9e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0647863  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2623  hypothetical protein  32.59 
 
 		 393 aa  204  2e-51  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1476  HI0933 family protein  31.36 
 
 		 413 aa  204  3e-51  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1574  HI0933 family protein  35.78 
 
 		 409 aa  204  3e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28030  HI0933-like protein  32.85 
 
 		 411 aa  204  3e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3802  hypothetical protein  31.86 
 
 		 394 aa  203  4e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0051  hypothetical protein  32.6 
 
 		 394 aa  203  4e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000135975 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0047  hypothetical protein  32.36 
 
 		 394 aa  202  6e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15731  flavoprotein  33.98 
 
 		 410 aa  202  7e-51  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1597  HI0933 family protein  35.55 
 
 		 409 aa  201  9.999999999999999e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.168995 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4328  hypothetical protein  32.36 
 
 		 394 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07621  hypothetical protein  33.33 
 
 		 407 aa  201  1.9999999999999998e-50  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.0179283 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1282  HI0933 family protein  31.64 
 
 		 457 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.138775  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0051  HI0933 family protein  32.12 
 
 		 394 aa  200  3.9999999999999996e-50  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.71818 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0055  hypothetical protein  32.6 
 
 		 394 aa  199  5e-50  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000153695 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0064  hypothetical protein  32.6 
 
 		 397 aa  199  6e-50  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0156  hypothetical protein  32.77 
 
 		 392 aa  199  7e-50  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3694  HI0933-like protein  31.63 
 
 		 398 aa  199  7.999999999999999e-50  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0128  hypothetical protein  33.73 
 
 		 394 aa  199  1.0000000000000001e-49  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0603016  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1052  hypothetical protein  28.89 
 
 		 442 aa  197  2.0000000000000003e-49  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.843089  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0049  hypothetical protein  32.36 
 
 		 394 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000378391 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0054  hypothetical protein  32.43 
 
 		 396 aa  197  3e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0047  hypothetical protein  32.36 
 
 		 394 aa  197  3e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00322221 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5032  HI0933 family protein  32.37 
 
 		 404 aa  196  5.000000000000001e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1349  hypothetical protein  32.51 
 
 		 393 aa  195  1e-48  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2555  hypothetical protein  32.09 
 
 		 396 aa  194  2e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00730633  hitchhiker  0.0000156467 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2949  putative FAD dependent oxidoreductase  32.17 
 
 		 401 aa  194  3e-48  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1899  HI0933 family protein  32.21 
 
 		 409 aa  193  4e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.279809  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0044  hypothetical protein  31.87 
 
 		 394 aa  193  4e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0662  hypothetical protein  31.34 
 
 		 392 aa  193  4e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0741866  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5002  hypothetical protein  32.74 
 
 		 393 aa  193  5e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.32275  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3520  HI0933 family protein  32.47 
 
 		 408 aa  192  6e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4688  hypothetical protein  32.07 
 
 		 413 aa  192  8e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00402  hypothetical protein  31.17 
 
 		 393 aa  192  8e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.96178  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07280  hypothetical protein  31.37 
 
 		 392 aa  192  8e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2183  hypothetical protein  32.85 
 
 		 396 aa  192  9e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.286863 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_202  hypothetical protein  34.53 
 
 		 394 aa  191  2e-47  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1392  hypothetical protein  32.43 
 
 		 393 aa  191  2e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.574952  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0303  hypothetical protein  31.13 
 
 		 394 aa  190  2.9999999999999997e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.918662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4466  hypothetical protein  31.36 
 
 		 394 aa  191  2.9999999999999997e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.119173 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>