More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_2451 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_2451  hypothetical protein  100 
 
 		 446 aa  910    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000138411  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2378  HI0933 family protein  50.84 
 
 		 412 aa  415  9.999999999999999e-116  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.270996  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0708  FAD dependent oxidoreductase  49.66 
 
 		 409 aa  415  9.999999999999999e-116  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1733  HI0933 family protein  50.8 
 
 		 408 aa  409  1e-113  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1150  YhiN family flavoprotein  48.63 
 
 		 406 aa  390  1e-107  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.823305  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1339  hypothetical protein  48.63 
 
 		 406 aa  387  1e-106  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0646456  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1601  hypothetical protein  47.7 
 
 		 406 aa  375  1e-103  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3399  HI0933 family protein  44.57 
 
 		 419 aa  353  2.9999999999999997e-96  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000862547  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2135  hypothetical protein  43 
 
 		 415 aa  338  1.9999999999999998e-91  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00468248  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2209  hypothetical protein  39.46 
 
 		 430 aa  305  8.000000000000001e-82  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000224827  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0187  HI0933 family protein  41.04 
 
 		 433 aa  305  1.0000000000000001e-81  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_183  hypothetical protein  39.66 
 
 		 435 aa  298  1e-79  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.277985  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0195  hypothetical protein  39.66 
 
 		 435 aa  295  1e-78  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0437859  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0030  HI0933 family protein  39.37 
 
 		 412 aa  292  9e-78  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0908  HI0933 family protein  37.25 
 
 		 426 aa  291  1e-77  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0158  hypothetical protein  38.94 
 
 		 435 aa  286  4e-76  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2761  HI0933 family protein  36.94 
 
 		 427 aa  286  5e-76  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0861  HI0933 family protein  37.95 
 
 		 412 aa  282  7.000000000000001e-75  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000883164  normal  0.741633 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2050  hypothetical protein  36.23 
 
 		 419 aa  281  2e-74  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000118961  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1197  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  37.3 
 
 		 403 aa  275  1.0000000000000001e-72  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00144707  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1025  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  37.07 
 
 		 403 aa  273  6e-72  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0617168  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4604  hypothetical protein  36.94 
 
 		 423 aa  272  9e-72  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00629914  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4960  hypothetical protein  36.94 
 
 		 423 aa  272  9e-72  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.979568  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4825  conserved hypothetical protein TIGR00275  36.94 
 
 		 423 aa  272  9e-72  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4440  NAD(FAD)-utilizing dehydrogenase  36.94 
 
 		 423 aa  272  1e-71  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0621454  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4458  NAD(FAD)-utilizing dehydrogenase  36.94 
 
 		 423 aa  272  1e-71  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00549646  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0416  hypothetical protein TIGR00275  36.94 
 
 		 423 aa  271  2e-71  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0139426  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4820  conserved hypothetical protein TIGR00275  36.94 
 
 		 423 aa  271  2e-71  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0848463  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4850  hypothetical protein  36.71 
 
 		 423 aa  270  2.9999999999999997e-71  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.473198  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4843  conserved hypothetical protein TIGR00275  36.71 
 
 		 423 aa  271  2.9999999999999997e-71  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000266049  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4539  hypothetical protein  36.26 
 
 		 423 aa  270  2.9999999999999997e-71  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0672  HI0933 family protein  35.16 
 
 		 436 aa  267  4e-70  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3371  hypothetical protein  35.21 
 
 		 426 aa  260  4e-68  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000385799  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0262  flavoprotein  33.26 
 
 		 424 aa  249  8e-65  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000227955  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1437  hypothetical protein  35.12 
 
 		 413 aa  244  3e-63  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1022  HI0933 family protein  33.03 
 
 		 403 aa  240  4e-62  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1237  HI0933-like protein  34.37 
 
 		 412 aa  236  5.0000000000000005e-61  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1315  hypothetical protein  35.14 
 
 		 420 aa  235  1.0000000000000001e-60  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.476308  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1810  hypothetical protein  34.62 
 
 		 422 aa  235  1.0000000000000001e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.261505  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1845  hypothetical protein  34.62 
 
 		 422 aa  235  1.0000000000000001e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1567  hypothetical protein  36.11 
 
 		 393 aa  234  3e-60  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4030  HI0933 family protein  33.72 
 
 		 414 aa  233  5e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2387  hypothetical protein  32.47 
 
 		 410 aa  229  5e-59  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1752  hypothetical protein  34.72 
 
 		 390 aa  226  5.0000000000000005e-58  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00572064  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0291  hypothetical protein  34.45 
 
 		 408 aa  223  4e-57  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0627  HI0933 family protein  30.91 
 
 		 404 aa  223  6e-57  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000930463  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1378  hypothetical protein  31.81 
 
 		 415 aa  217  2.9999999999999998e-55  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.275116 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0825  HI0933 family protein  31.44 
 
 		 414 aa  216  5.9999999999999996e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.689631 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2605  hypothetical protein  31 
 
 		 407 aa  215  1.9999999999999998e-54  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00291222  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1926  HI0933-like protein  30.43 
 
 		 414 aa  214  2.9999999999999995e-54  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0927  HI0933 family protein  30.84 
 
 		 408 aa  211  2e-53  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.1016 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15361  flavoprotein  32.36 
 
 		 411 aa  210  4e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0647863  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1561  hypothetical protein  29 
 
 		 455 aa  209  7e-53  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2952  hypothetical protein  33.03 
 
 		 415 aa  208  1e-52  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00592847  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5845  HI0933 family protein  32.15 
 
 		 408 aa  205  1e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.599184  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2635  YhiN family flavoprotein  33.03 
 
 		 414 aa  206  1e-51  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.457541  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0128  hypothetical protein  32.5 
 
 		 394 aa  204  3e-51  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0603016  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0064  hypothetical protein  32.05 
 
 		 397 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0754  HI0933-like protein  30.7 
 
 		 396 aa  198  2.0000000000000003e-49  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.961432  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0047  hypothetical protein  30.75 
 
 		 394 aa  196  5.000000000000001e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1430  HI0933 family protein  29.09 
 
 		 452 aa  196  8.000000000000001e-49  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.223271  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0051  hypothetical protein  30.14 
 
 		 394 aa  194  3e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000135975 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0051  HI0933 family protein  30.52 
 
 		 394 aa  193  6e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.71818 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3802  hypothetical protein  28.38 
 
 		 394 aa  193  7e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0054  hypothetical protein  30.14 
 
 		 396 aa  191  2e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1467  hypothetical protein  32.2 
 
 		 415 aa  191  2e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.196184  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4328  hypothetical protein  30.52 
 
 		 394 aa  191  2e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_202  hypothetical protein  32.58 
 
 		 394 aa  191  2.9999999999999997e-47  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0055  hypothetical protein  30.07 
 
 		 394 aa  189  5.999999999999999e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000153695 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4118  HI0933 family protein  30.43 
 
 		 394 aa  190  5.999999999999999e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0226  hypothetical protein  31.38 
 
 		 379 aa  189  8e-47  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1076  HI0933 family protein  29.95 
 
 		 407 aa  189  1e-46  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0249257  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15731  flavoprotein  31.75 
 
 		 410 aa  189  1e-46  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3858  hypothetical protein  29.98 
 
 		 398 aa  189  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00469108  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0049  hypothetical protein  29.84 
 
 		 394 aa  188  1e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000378391 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0047  hypothetical protein  29.68 
 
 		 394 aa  189  1e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00322221 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0345  HI0933 family protein  29.55 
 
 		 409 aa  187  2e-46  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4873  hypothetical protein  29.82 
 
 		 394 aa  188  2e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15581  flavoprotein  30.84 
 
 		 414 aa  188  2e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.379962  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0044  hypothetical protein  29.22 
 
 		 394 aa  187  3e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5032  HI0933 family protein  28.57 
 
 		 404 aa  187  4e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3901  hypothetical protein  29.98 
 
 		 398 aa  187  4e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.150346  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3791  hypothetical protein  29.98 
 
 		 398 aa  187  4e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3781  hypothetical protein  29.98 
 
 		 398 aa  186  5e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3962  hypothetical protein  29.98 
 
 		 398 aa  186  5e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.327369  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4017  hypothetical protein  29.68 
 
 		 393 aa  187  5e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3931  HI0933 family protein  29.13 
 
 		 397 aa  186  6e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4688  hypothetical protein  30.54 
 
 		 413 aa  185  1.0000000000000001e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2555  hypothetical protein  31.65 
 
 		 396 aa  185  2.0000000000000003e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00730633  hitchhiker  0.0000156467 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00402  hypothetical protein  31.26 
 
 		 393 aa  185  2.0000000000000003e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.96178  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0017  hypothetical protein  28.64 
 
 		 422 aa  184  3e-45  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3694  HI0933-like protein  28.57 
 
 		 398 aa  184  3e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1018  HI0933 family protein  29.73 
 
 		 404 aa  183  4.0000000000000006e-45  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2067  hypothetical protein  27.94 
 
 		 415 aa  183  6e-45  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1007  hypothetical protein  28.34 
 
 		 389 aa  182  9.000000000000001e-45  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.775195  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2949  putative FAD dependent oxidoreductase  30.28 
 
 		 401 aa  182  1e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4466  hypothetical protein  29.61 
 
 		 394 aa  182  1e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.119173 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2547  hypothetical protein  29.98 
 
 		 394 aa  181  2e-44  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.374165  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1238  hypothetical protein  31.32 
 
 		 414 aa  181  2e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1282  hypothetical protein  30.34 
 
 		 403 aa  181  2e-44  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.488791  normal  0.628895 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>