More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smon_1018 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013515  Smon_1018  HI0933 family protein  100 
 
 		 404 aa  804    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1076  HI0933 family protein  49.74 
 
 		 407 aa  377  1e-103  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0249257  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1437  hypothetical protein  37.53 
 
 		 413 aa  283  5.000000000000001e-75  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4030  HI0933 family protein  37.98 
 
 		 414 aa  276  4e-73  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0825  HI0933 family protein  37.21 
 
 		 414 aa  274  3e-72  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.689631 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0627  HI0933 family protein  35.63 
 
 		 404 aa  261  2e-68  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000930463  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2605  hypothetical protein  36.39 
 
 		 407 aa  259  6e-68  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00291222  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2952  hypothetical protein  39.6 
 
 		 415 aa  256  3e-67  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00592847  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2635  YhiN family flavoprotein  39.6 
 
 		 414 aa  254  1.0000000000000001e-66  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.457541  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0128  hypothetical protein  32.67 
 
 		 394 aa  213  5.999999999999999e-54  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0603016  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0708  FAD dependent oxidoreductase  33.73 
 
 		 409 aa  210  3e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0754  HI0933-like protein  31.11 
 
 		 396 aa  202  9.999999999999999e-51  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.961432  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2761  HI0933 family protein  29.98 
 
 		 427 aa  201  9.999999999999999e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0226  hypothetical protein  31.14 
 
 		 379 aa  201  3e-50  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_202  hypothetical protein  31.03 
 
 		 394 aa  197  3e-49  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0672  HI0933 family protein  29.74 
 
 		 436 aa  195  1e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2209  hypothetical protein  29.85 
 
 		 430 aa  191  2.9999999999999997e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000224827  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00402  hypothetical protein  29.9 
 
 		 393 aa  189  9e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.96178  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0698  hypothetical protein  33.09 
 
 		 409 aa  188  1e-46  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1601  hypothetical protein  34.68 
 
 		 406 aa  188  2e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0908  HI0933 family protein  27.52 
 
 		 426 aa  186  6e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2949  putative FAD dependent oxidoreductase  31.53 
 
 		 401 aa  185  1.0000000000000001e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0861  HI0933 family protein  30.12 
 
 		 412 aa  184  2.0000000000000003e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000883164  normal  0.741633 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0262  flavoprotein  30.17 
 
 		 424 aa  184  2.0000000000000003e-45  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000227955  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1810  hypothetical protein  29.93 
 
 		 422 aa  184  3e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.261505  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1845  hypothetical protein  29.93 
 
 		 422 aa  184  3e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3945  hypothetical protein  28.33 
 
 		 405 aa  182  7e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0927  HI0933 family protein  31.13 
 
 		 408 aa  182  1e-44  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.1016 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1341  hypothetical protein  27.23 
 
 		 393 aa  182  1e-44  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00536  oxidoreductase  27.65 
 
 		 397 aa  181  2.9999999999999997e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0156  hypothetical protein  29.34 
 
 		 392 aa  181  2.9999999999999997e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1025  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  30.19 
 
 		 403 aa  180  2.9999999999999997e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0617168  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1530  hypothetical protein  29.58 
 
 		 391 aa  180  4e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2387  hypothetical protein  30.79 
 
 		 410 aa  179  5.999999999999999e-44  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1197  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  30.19 
 
 		 403 aa  179  7e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00144707  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1621  HI0933 family protein  29.1 
 
 		 394 aa  179  8e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0160754  normal  0.370908 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1899  HI0933 family protein  29.8 
 
 		 409 aa  178  1e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.279809  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2378  HI0933 family protein  30.55 
 
 		 412 aa  178  1e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.270996  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0137  hypothetical protein  28.1 
 
 		 405 aa  179  1e-43  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2555  hypothetical protein  28.54 
 
 		 396 aa  179  1e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00730633  hitchhiker  0.0000156467 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0801  hypothetical protein  28.93 
 
 		 395 aa  177  2e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4539  hypothetical protein  28.67 
 
 		 423 aa  176  5e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0303  hypothetical protein  27.34 
 
 		 394 aa  176  5e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.918662  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0187  HI0933 family protein  30.39 
 
 		 433 aa  176  7e-43  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2623  hypothetical protein  27.97 
 
 		 393 aa  176  7e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0416  hypothetical protein TIGR00275  28.67 
 
 		 423 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0139426  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001943  NAD(FAD)-utilizing dehydrogenase  27.45 
 
 		 397 aa  175  9.999999999999999e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3371  hypothetical protein  29.76 
 
 		 426 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000385799  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0145  hypothetical protein  28.82 
 
 		 394 aa  174  2.9999999999999996e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2099  hypothetical protein  27.72 
 
 		 396 aa  174  2.9999999999999996e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1505  HI0933 family protein  30.94 
 
 		 402 aa  174  2.9999999999999996e-42  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000535325  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4850  hypothetical protein  28.92 
 
 		 423 aa  173  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.473198  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4825  conserved hypothetical protein TIGR00275  28.67 
 
 		 423 aa  173  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4604  hypothetical protein  28.67 
 
 		 423 aa  173  3.9999999999999995e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00629914  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4440  NAD(FAD)-utilizing dehydrogenase  28.67 
 
 		 423 aa  173  3.9999999999999995e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0621454  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4458  NAD(FAD)-utilizing dehydrogenase  28.67 
 
 		 423 aa  173  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00549646  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4960  hypothetical protein  28.67 
 
 		 423 aa  173  3.9999999999999995e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.979568  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4843  conserved hypothetical protein TIGR00275  28.67 
 
 		 423 aa  173  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000266049  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1150  YhiN family flavoprotein  31.87 
 
 		 406 aa  174  3.9999999999999995e-42  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.823305  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4820  conserved hypothetical protein TIGR00275  28.67 
 
 		 423 aa  173  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0848463  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1733  HI0933 family protein  30.33 
 
 		 408 aa  173  5e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1339  hypothetical protein  31.63 
 
 		 406 aa  172  6.999999999999999e-42  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0646456  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0291  hypothetical protein  30.49 
 
 		 408 aa  172  7.999999999999999e-42  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1349  hypothetical protein  26.37 
 
 		 393 aa  172  9e-42  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3274  hypothetical protein  27.36 
 
 		 396 aa  171  2e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.142928  normal  0.877884 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1007  hypothetical protein  26.85 
 
 		 389 aa  171  2e-41  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.775195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2434  hypothetical protein  29.38 
 
 		 398 aa  170  3e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1831  HI0933-like protein  29.41 
 
 		 402 aa  171  3e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  decreased coverage  0.000611752  normal  0.363311 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1798  hypothetical protein  27.61 
 
 		 392 aa  170  4e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2547  hypothetical protein  28.57 
 
 		 394 aa  170  4e-41  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.374165  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0830  HI0933 family protein  27.31 
 
 		 419 aa  170  5e-41  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0203262 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1378  hypothetical protein  27.9 
 
 		 415 aa  169  6e-41  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.275116 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0491  hypothetical protein  28.05 
 
 		 411 aa  169  9e-41  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15731  flavoprotein  31.25 
 
 		 410 aa  169  9e-41  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0064  hypothetical protein  29.06 
 
 		 397 aa  168  1e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0366  HI0933 family protein  28.06 
 
 		 406 aa  169  1e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.128737 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0662  hypothetical protein  27.45 
 
 		 392 aa  169  1e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0741866  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07280  hypothetical protein  27.45 
 
 		 392 aa  168  1e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2183  hypothetical protein  27.34 
 
 		 396 aa  167  2e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.286863 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00166  predicted flavoprotein  29.27 
 
 		 393 aa  167  2e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0051  HI0933 family protein  29.1 
 
 		 394 aa  168  2e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.71818 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2135  hypothetical protein  29.7 
 
 		 415 aa  168  2e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00468248  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3399  HI0933 family protein  30.15 
 
 		 419 aa  167  2.9999999999999998e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000862547  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4328  hypothetical protein  29.56 
 
 		 394 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1392  hypothetical protein  26.12 
 
 		 393 aa  167  4e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.574952  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0599  HI0933 family protein  28.85 
 
 		 392 aa  166  5e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.623073 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28030  HI0933-like protein  28.54 
 
 		 411 aa  166  5.9999999999999996e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0398  HI0933 family protein  28.17 
 
 		 406 aa  166  6.9999999999999995e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00801709 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1463  hypothetical protein  26.96 
 
 		 392 aa  166  8e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.261664  normal  0.428497 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15581  flavoprotein  31.14 
 
 		 414 aa  166  8e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.379962  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3800  hypothetical protein  29.41 
 
 		 391 aa  166  9e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.225042  normal  0.0906126 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1567  hypothetical protein  28.43 
 
 		 393 aa  166  9e-40  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0047  hypothetical protein  28.85 
 
 		 394 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6778  HI0933 family protein  27.06 
 
 		 390 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00763254 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0051  hypothetical protein  29.1 
 
 		 394 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000135975 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0623  hypothetical protein  28.43 
 
 		 428 aa  165  1.0000000000000001e-39  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.228803 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2832  flavoprotein  26.72 
 
 		 392 aa  164  3e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.838235  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1237  HI0933-like protein  28.82 
 
 		 412 aa  164  3e-39  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0044  hypothetical protein  28.75 
 
 		 394 aa  163  5.0000000000000005e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0375  HI0933-like protein  27.83 
 
 		 393 aa  163  5.0000000000000005e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>