More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_0291 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008942  Mlab_0291  hypothetical protein  100 
 
 
408 aa  835    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1926  HI0933-like protein  48.28 
 
 
414 aa  380  1e-104  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1378  hypothetical protein  47.91 
 
 
415 aa  378  1e-103  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.275116 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0927  HI0933 family protein  49.12 
 
 
408 aa  352  8.999999999999999e-96  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.1016 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2387  hypothetical protein  46.37 
 
 
410 aa  348  1e-94  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3399  HI0933 family protein  38.97 
 
 
419 aa  246  4e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000862547  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2209  hypothetical protein  37.59 
 
 
430 aa  242  7e-63  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000224827  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0708  FAD dependent oxidoreductase  38.97 
 
 
409 aa  241  1e-62  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0187  HI0933 family protein  37.8 
 
 
433 aa  238  2e-61  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1150  YhiN family flavoprotein  35.56 
 
 
406 aa  235  1.0000000000000001e-60  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.823305  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1339  hypothetical protein  35.31 
 
 
406 aa  234  2.0000000000000002e-60  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0646456  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2135  hypothetical protein  37.31 
 
 
415 aa  234  2.0000000000000002e-60  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00468248  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1733  HI0933 family protein  38.31 
 
 
408 aa  229  9e-59  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0195  hypothetical protein  37.05 
 
 
435 aa  228  2e-58  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0437859  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0030  HI0933 family protein  37.41 
 
 
412 aa  226  5.0000000000000005e-58  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_183  hypothetical protein  36.32 
 
 
435 aa  226  8e-58  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.277985  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2378  HI0933 family protein  36.97 
 
 
412 aa  220  3e-56  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.270996  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1845  hypothetical protein  35.85 
 
 
422 aa  220  3.9999999999999997e-56  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1810  hypothetical protein  35.85 
 
 
422 aa  220  3.9999999999999997e-56  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.261505  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2050  hypothetical protein  35.86 
 
 
419 aa  219  5e-56  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000118961  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1601  hypothetical protein  36.39 
 
 
406 aa  216  5e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0158  hypothetical protein  34.48 
 
 
435 aa  216  5.9999999999999996e-55  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1437  hypothetical protein  35.75 
 
 
413 aa  213  3.9999999999999995e-54  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0262  flavoprotein  35.51 
 
 
424 aa  213  3.9999999999999995e-54  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000227955  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0861  HI0933 family protein  35.22 
 
 
412 aa  213  4.9999999999999996e-54  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000883164  normal  0.741633 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4539  hypothetical protein  36.78 
 
 
423 aa  212  7e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4843  conserved hypothetical protein TIGR00275  36.45 
 
 
423 aa  211  1e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000266049  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4850  hypothetical protein  36.54 
 
 
423 aa  211  2e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.473198  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4820  conserved hypothetical protein TIGR00275  35.34 
 
 
423 aa  211  3e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0848463  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0416  hypothetical protein TIGR00275  35.25 
 
 
423 aa  211  3e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0139426  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0345  HI0933 family protein  35.31 
 
 
409 aa  209  6e-53  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4440  NAD(FAD)-utilizing dehydrogenase  36.3 
 
 
423 aa  209  7e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0621454  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4458  NAD(FAD)-utilizing dehydrogenase  36.3 
 
 
423 aa  209  7e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00549646  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4604  hypothetical protein  36.3 
 
 
423 aa  209  8e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00629914  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4825  conserved hypothetical protein TIGR00275  36.3 
 
 
423 aa  209  8e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4960  hypothetical protein  36.3 
 
 
423 aa  209  8e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.979568  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1315  hypothetical protein  34.56 
 
 
420 aa  207  3e-52  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.476308  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2451  hypothetical protein  34.36 
 
 
446 aa  206  6e-52  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000138411  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4030  HI0933 family protein  32.81 
 
 
414 aa  206  7e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0791  HI0933 family protein  35.06 
 
 
408 aa  204  2e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.371857 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1122  hypothetical protein  33.09 
 
 
443 aa  203  6e-51  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.138213  normal  0.379331 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1282  HI0933 family protein  33.25 
 
 
457 aa  201  9.999999999999999e-51  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.138775  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0908  HI0933 family protein  37.77 
 
 
426 aa  201  1.9999999999999998e-50  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1052  hypothetical protein  31.7 
 
 
442 aa  200  3e-50  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.843089  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1209  HI0933 family protein  33.77 
 
 
443 aa  199  5e-50  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00892484 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1476  HI0933 family protein  34.55 
 
 
413 aa  200  5e-50  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1430  HI0933 family protein  31.84 
 
 
452 aa  199  7e-50  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.223271  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1022  HI0933 family protein  31.39 
 
 
403 aa  198  1.0000000000000001e-49  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1237  HI0933-like protein  35.61 
 
 
412 aa  197  2.0000000000000003e-49  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1561  hypothetical protein  28.6 
 
 
455 aa  197  3e-49  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3858  hypothetical protein  32.19 
 
 
398 aa  197  3e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00469108  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3962  hypothetical protein  32.19 
 
 
398 aa  197  4.0000000000000005e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.327369  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3371  hypothetical protein  34.29 
 
 
426 aa  196  5.000000000000001e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000385799  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0054  hypothetical protein  33.5 
 
 
396 aa  196  6e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3901  hypothetical protein  32.19 
 
 
398 aa  196  9e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.150346  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5845  HI0933 family protein  33.41 
 
 
408 aa  196  9e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.599184  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3791  hypothetical protein  32.19 
 
 
398 aa  196  9e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3781  hypothetical protein  32.19 
 
 
398 aa  195  1e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2761  HI0933 family protein  32.86 
 
 
427 aa  195  1e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2884  HI0933-like protein  33.73 
 
 
414 aa  194  2e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0672  HI0933 family protein  33.33 
 
 
436 aa  194  3e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1752  hypothetical protein  32.83 
 
 
390 aa  192  6e-48  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00572064  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001943  NAD(FAD)-utilizing dehydrogenase  33.09 
 
 
397 aa  191  1e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1341  hypothetical protein  32.84 
 
 
393 aa  192  1e-47  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0047  hypothetical protein  32.43 
 
 
394 aa  190  2.9999999999999997e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00322221 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0049  hypothetical protein  32.43 
 
 
394 aa  189  5e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000378391 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4953  hypothetical protein  34.52 
 
 
393 aa  189  5.999999999999999e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.683781  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1308  HI0933 family protein  31.54 
 
 
426 aa  189  8e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0313133  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4826  hypothetical protein  34.52 
 
 
393 aa  188  1e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.270305  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0055  hypothetical protein  32.19 
 
 
394 aa  189  1e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000153695 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5002  hypothetical protein  34.26 
 
 
393 aa  189  1e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.32275  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2952  hypothetical protein  31.22 
 
 
415 aa  189  1e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00592847  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1567  hypothetical protein  33.17 
 
 
393 aa  188  2e-46  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0044  hypothetical protein  31.7 
 
 
394 aa  188  2e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2605  hypothetical protein  31.22 
 
 
407 aa  188  2e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00291222  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04960  hypothetical protein  31.85 
 
 
406 aa  188  2e-46  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2635  YhiN family flavoprotein  31.22 
 
 
414 aa  187  2e-46  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.457541  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0627  HI0933 family protein  29.6 
 
 
404 aa  187  3e-46  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000930463  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0512  hypothetical protein  33.5 
 
 
410 aa  187  3e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.246775  normal  0.372207 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0051  hypothetical protein  31.94 
 
 
394 aa  187  3e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  unclonable  0.0000135975 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00536  oxidoreductase  32.35 
 
 
397 aa  186  7e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0047  hypothetical protein  31.45 
 
 
394 aa  185  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0145  hypothetical protein  33.33 
 
 
394 aa  185  2.0000000000000003e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4032  hypothetical protein  31.45 
 
 
398 aa  184  2.0000000000000003e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1396  hypothetical protein  30.68 
 
 
402 aa  184  3e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0123  hypothetical protein  31.37 
 
 
460 aa  183  4.0000000000000006e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.291133  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1530  hypothetical protein  33.42 
 
 
391 aa  183  4.0000000000000006e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4094  hypothetical protein  31.37 
 
 
460 aa  182  9.000000000000001e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3802  hypothetical protein  31.05 
 
 
394 aa  182  1e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0491  hypothetical protein  29.32 
 
 
411 aa  182  1e-44  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1076  HI0933 family protein  32.38 
 
 
407 aa  181  1e-44  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0249257  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1197  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  30.79 
 
 
403 aa  182  1e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00144707  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0051  HI0933 family protein  30.96 
 
 
394 aa  181  2e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.71818 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2502  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein-like  32.48 
 
 
413 aa  181  2e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.472711  normal  0.7121 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1574  HI0933 family protein  31.22 
 
 
409 aa  181  2e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1597  HI0933 family protein  31.47 
 
 
409 aa  181  2e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.168995 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4328  hypothetical protein  31.2 
 
 
394 aa  181  2e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2949  putative FAD dependent oxidoreductase  31.93 
 
 
401 aa  181  2.9999999999999997e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3906  hypothetical protein  31.63 
 
 
397 aa  180  4e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2434  hypothetical protein  31.68 
 
 
398 aa  180  4.999999999999999e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>