More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_0825 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013216  Dtox_0825  HI0933 family protein  100 
 
 
414 aa  850    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.689631 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1437  hypothetical protein  61.22 
 
 
413 aa  519  1e-146  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4030  HI0933 family protein  62.11 
 
 
414 aa  514  1e-144  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2952  hypothetical protein  43.42 
 
 
415 aa  340  2.9999999999999998e-92  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00592847  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2635  YhiN family flavoprotein  43.18 
 
 
414 aa  337  1.9999999999999998e-91  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.457541  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2605  hypothetical protein  42.79 
 
 
407 aa  329  5.0000000000000004e-89  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00291222  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1076  HI0933 family protein  41.69 
 
 
407 aa  308  1.0000000000000001e-82  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0249257  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0627  HI0933 family protein  38.75 
 
 
404 aa  302  8.000000000000001e-81  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000930463  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1018  HI0933 family protein  37.91 
 
 
404 aa  292  1e-77  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0698  hypothetical protein  37.24 
 
 
409 aa  282  8.000000000000001e-75  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0128  hypothetical protein  40.25 
 
 
394 aa  270  4e-71  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0603016  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0708  FAD dependent oxidoreductase  38.42 
 
 
409 aa  270  4e-71  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_202  hypothetical protein  41.63 
 
 
394 aa  266  5.999999999999999e-70  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0226  hypothetical protein  38.89 
 
 
379 aa  260  3e-68  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2135  hypothetical protein  39.39 
 
 
415 aa  259  7e-68  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00468248  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1339  hypothetical protein  35.94 
 
 
406 aa  251  2e-65  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0646456  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1150  YhiN family flavoprotein  36.43 
 
 
406 aa  251  2e-65  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.823305  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3399  HI0933 family protein  38.21 
 
 
419 aa  247  3e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000862547  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2050  hypothetical protein  36.96 
 
 
419 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000118961  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0754  HI0933-like protein  33.91 
 
 
396 aa  243  5e-63  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.961432  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2378  HI0933 family protein  34.78 
 
 
412 aa  241  2e-62  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.270996  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2209  hypothetical protein  32.23 
 
 
430 aa  239  8e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000224827  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0491  hypothetical protein  32.04 
 
 
411 aa  239  9e-62  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0030  HI0933 family protein  35.94 
 
 
412 aa  236  4e-61  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1601  hypothetical protein  36.21 
 
 
406 aa  234  1.0000000000000001e-60  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1733  HI0933 family protein  35.78 
 
 
408 aa  231  2e-59  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1197  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  33.99 
 
 
403 aa  229  5e-59  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00144707  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1025  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  33.74 
 
 
403 aa  229  7e-59  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0617168  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0672  HI0933 family protein  34.3 
 
 
436 aa  226  8e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1845  hypothetical protein  32.84 
 
 
422 aa  226  8e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1810  hypothetical protein  32.84 
 
 
422 aa  226  8e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.261505  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2761  HI0933 family protein  34.45 
 
 
427 aa  223  4e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2949  putative FAD dependent oxidoreductase  33.09 
 
 
401 aa  223  4e-57  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1349  hypothetical protein  31.76 
 
 
393 aa  223  7e-57  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4843  conserved hypothetical protein TIGR00275  34.93 
 
 
423 aa  222  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000266049  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4604  hypothetical protein  34.93 
 
 
423 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00629914  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4440  NAD(FAD)-utilizing dehydrogenase  34.93 
 
 
423 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0621454  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4458  NAD(FAD)-utilizing dehydrogenase  34.93 
 
 
423 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00549646  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4825  conserved hypothetical protein TIGR00275  34.93 
 
 
423 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4960  hypothetical protein  34.93 
 
 
423 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.979568  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4850  hypothetical protein  34.69 
 
 
423 aa  220  3.9999999999999997e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.473198  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0927  HI0933 family protein  35.19 
 
 
408 aa  220  3.9999999999999997e-56  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.1016 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0262  flavoprotein  32.04 
 
 
424 aa  220  3.9999999999999997e-56  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000227955  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1237  HI0933-like protein  31.79 
 
 
412 aa  218  1e-55  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4820  conserved hypothetical protein TIGR00275  34.78 
 
 
423 aa  218  1e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0848463  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0416  hypothetical protein TIGR00275  34.78 
 
 
423 aa  217  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0139426  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1392  hypothetical protein  31.51 
 
 
393 aa  216  4e-55  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.574952  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4539  hypothetical protein  33.97 
 
 
423 aa  216  5e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3931  HI0933 family protein  33.17 
 
 
397 aa  216  5.9999999999999996e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1505  HI0933 family protein  33.33 
 
 
402 aa  216  7e-55  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000535325  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4032  hypothetical protein  33.66 
 
 
398 aa  216  8e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1315  hypothetical protein  33.58 
 
 
420 aa  215  9e-55  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.476308  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0123  hypothetical protein  33.66 
 
 
460 aa  215  9.999999999999999e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.291133  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3371  hypothetical protein  34.3 
 
 
426 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000385799  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2451  hypothetical protein  32.35 
 
 
446 aa  214  1.9999999999999998e-54  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000138411  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0271  hypothetical protein  32.02 
 
 
401 aa  214  1.9999999999999998e-54  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4094  hypothetical protein  33.66 
 
 
460 aa  214  1.9999999999999998e-54  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4204  HI0933 family protein  31.45 
 
 
399 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0145  hypothetical protein  31.53 
 
 
394 aa  213  3.9999999999999995e-54  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3274  hypothetical protein  31.22 
 
 
396 aa  212  7.999999999999999e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.142928  normal  0.877884 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0156  hypothetical protein  34.24 
 
 
392 aa  212  1e-53  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1707  HI0933-like protein  32.42 
 
 
399 aa  212  1e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.105129 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0187  HI0933 family protein  34.87 
 
 
433 aa  211  2e-53  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1635  hypothetical protein  33.41 
 
 
405 aa  210  3e-53  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2434  hypothetical protein  32.35 
 
 
398 aa  210  4e-53  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0375  HI0933-like protein  32.27 
 
 
393 aa  209  6e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4487  HI0933 family protein  32.6 
 
 
399 aa  208  1e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001943  NAD(FAD)-utilizing dehydrogenase  31.13 
 
 
397 aa  207  2e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00536  oxidoreductase  31.37 
 
 
397 aa  208  2e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4688  hypothetical protein  32.91 
 
 
413 aa  207  2e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3781  hypothetical protein  29.78 
 
 
398 aa  207  3e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3901  hypothetical protein  29.78 
 
 
398 aa  207  3e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.150346  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0861  HI0933 family protein  33.65 
 
 
412 aa  207  3e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000883164  normal  0.741633 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3791  hypothetical protein  29.78 
 
 
398 aa  207  3e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1926  HI0933-like protein  31.36 
 
 
414 aa  207  3e-52  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0908  HI0933 family protein  32.45 
 
 
426 aa  207  3e-52  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3858  hypothetical protein  29.78 
 
 
398 aa  206  4e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00469108  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3962  hypothetical protein  29.78 
 
 
398 aa  207  4e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.327369  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1798  hypothetical protein  30.3 
 
 
392 aa  206  5e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1378  hypothetical protein  33.42 
 
 
415 aa  206  7e-52  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.275116 
 
 
-
 
NC_002936  DET0195  hypothetical protein  33.98 
 
 
435 aa  206  8e-52  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0437859  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1752  hypothetical protein  32.68 
 
 
390 aa  206  8e-52  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00572064  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0051  hypothetical protein  31.2 
 
 
394 aa  206  9e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  unclonable  0.0000135975 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4328  hypothetical protein  31.2 
 
 
394 aa  204  2e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0047  hypothetical protein  30.96 
 
 
394 aa  204  2e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0051  HI0933 family protein  30.96 
 
 
394 aa  203  4e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.71818 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4118  HI0933 family protein  31.93 
 
 
394 aa  202  7e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00166  predicted flavoprotein  31.05 
 
 
393 aa  202  7e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4466  hypothetical protein  31.2 
 
 
394 aa  202  9e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.119173 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0064  hypothetical protein  31.77 
 
 
397 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0044  hypothetical protein  31.2 
 
 
394 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3802  hypothetical protein  32.03 
 
 
394 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4873  hypothetical protein  31.45 
 
 
394 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4838  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  30.89 
 
 
400 aa  201  3e-50  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1567  hypothetical protein  31.96 
 
 
393 aa  199  5e-50  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2555  hypothetical protein  32.17 
 
 
396 aa  200  5e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00730633  hitchhiker  0.0000156467 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0158  hypothetical protein  32.04 
 
 
435 aa  199  5e-50  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07280  hypothetical protein  31.16 
 
 
392 aa  200  5e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0047  hypothetical protein  30.71 
 
 
394 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00322221 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4017  hypothetical protein  31.94 
 
 
393 aa  198  2.0000000000000003e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>