More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_1437 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_1437  hypothetical protein  100 
 
 		 413 aa  846    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4030  HI0933 family protein  70.18 
 
 		 414 aa  587  1e-167  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0825  HI0933 family protein  61.22 
 
 		 414 aa  514  1.0000000000000001e-145  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.689631 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2952  hypothetical protein  44.25 
 
 		 415 aa  367  1e-100  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00592847  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2635  YhiN family flavoprotein  43.77 
 
 		 414 aa  362  8e-99  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.457541  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2605  hypothetical protein  45.02 
 
 		 407 aa  354  2e-96  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00291222  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0627  HI0933 family protein  39.45 
 
 		 404 aa  323  5e-87  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000930463  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1076  HI0933 family protein  42.71 
 
 		 407 aa  317  3e-85  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0249257  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1018  HI0933 family protein  38.12 
 
 		 404 aa  300  3e-80  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0708  FAD dependent oxidoreductase  39.32 
 
 		 409 aa  281  1e-74  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0128  hypothetical protein  38.02 
 
 		 394 aa  278  1e-73  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0603016  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2135  hypothetical protein  40 
 
 		 415 aa  275  8e-73  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00468248  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_202  hypothetical protein  39.41 
 
 		 394 aa  271  1e-71  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1150  YhiN family flavoprotein  38.69 
 
 		 406 aa  269  8e-71  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.823305  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0226  hypothetical protein  38.27 
 
 		 379 aa  268  1e-70  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1339  hypothetical protein  38.44 
 
 		 406 aa  268  1e-70  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0646456  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0698  hypothetical protein  35.88 
 
 		 409 aa  266  5.999999999999999e-70  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0754  HI0933-like protein  34.72 
 
 		 396 aa  264  2e-69  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.961432  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2378  HI0933 family protein  37.92 
 
 		 412 aa  261  1e-68  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.270996  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3399  HI0933 family protein  39.29 
 
 		 419 aa  261  2e-68  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000862547  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1197  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  37.68 
 
 		 403 aa  261  2e-68  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00144707  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1025  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  37.2 
 
 		 403 aa  258  1e-67  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0617168  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1601  hypothetical protein  38.16 
 
 		 406 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2050  hypothetical protein  37.53 
 
 		 419 aa  253  4.0000000000000004e-66  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000118961  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0672  HI0933 family protein  37.65 
 
 		 436 aa  251  1e-65  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1845  hypothetical protein  37.14 
 
 		 422 aa  251  2e-65  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1810  hypothetical protein  37.14 
 
 		 422 aa  251  2e-65  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.261505  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28030  HI0933-like protein  35.38 
 
 		 411 aa  250  3e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1237  HI0933-like protein  34.95 
 
 		 412 aa  247  3e-64  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0030  HI0933 family protein  36.61 
 
 		 412 aa  246  6e-64  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2949  putative FAD dependent oxidoreductase  33.91 
 
 		 401 aa  243  6e-63  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1733  HI0933 family protein  37.32 
 
 		 408 aa  240  4e-62  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15731  flavoprotein  36.65 
 
 		 410 aa  239  5.999999999999999e-62  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0927  HI0933 family protein  35.78 
 
 		 408 aa  239  5.999999999999999e-62  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.1016 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2209  hypothetical protein  34.95 
 
 		 430 aa  238  1e-61  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000224827  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2761  HI0933 family protein  34.22 
 
 		 427 aa  237  3e-61  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07621  hypothetical protein  36.25 
 
 		 407 aa  236  4e-61  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.0179283 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0130  hypothetical protein  35.51 
 
 		 405 aa  236  6e-61  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.700212  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0262  flavoprotein  33.57 
 
 		 424 aa  236  6e-61  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000227955  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0156  hypothetical protein  36.63 
 
 		 392 aa  236  6e-61  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0908  HI0933 family protein  34.78 
 
 		 426 aa  236  7e-61  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2451  hypothetical protein  34.68 
 
 		 446 aa  236  8e-61  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000138411  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1467  hypothetical protein  36.34 
 
 		 415 aa  234  2.0000000000000002e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.196184  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4843  conserved hypothetical protein TIGR00275  35.75 
 
 		 423 aa  233  4.0000000000000004e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000266049  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15581  flavoprotein  35.45 
 
 		 414 aa  233  5e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.379962  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1378  hypothetical protein  35.96 
 
 		 415 aa  233  6e-60  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.275116 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4850  hypothetical protein  35.51 
 
 		 423 aa  231  1e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.473198  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0051  hypothetical protein  33.58 
 
 		 394 aa  232  1e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000135975 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4204  HI0933 family protein  33.58 
 
 		 399 aa  231  2e-59  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4604  hypothetical protein  35.51 
 
 		 423 aa  231  3e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00629914  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4440  NAD(FAD)-utilizing dehydrogenase  35.51 
 
 		 423 aa  231  3e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0621454  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4458  NAD(FAD)-utilizing dehydrogenase  35.51 
 
 		 423 aa  231  3e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00549646  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4960  hypothetical protein  35.51 
 
 		 423 aa  231  3e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.979568  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0044  hypothetical protein  33.41 
 
 		 394 aa  230  3e-59  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0491  hypothetical protein  31.73 
 
 		 411 aa  230  3e-59  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4825  conserved hypothetical protein TIGR00275  35.51 
 
 		 423 aa  231  3e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4539  hypothetical protein  35.02 
 
 		 423 aa  230  4e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1505  HI0933 family protein  32.75 
 
 		 402 aa  229  6e-59  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000535325  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0047  hypothetical protein  33.09 
 
 		 394 aa  229  6e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4820  conserved hypothetical protein TIGR00275  35.02 
 
 		 423 aa  229  7e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0848463  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0054  hypothetical protein  33.57 
 
 		 396 aa  228  1e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0051  HI0933 family protein  32.85 
 
 		 394 aa  228  1e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.71818 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4328  hypothetical protein  33.09 
 
 		 394 aa  228  1e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3371  hypothetical protein  35.02 
 
 		 426 aa  228  1e-58  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000385799  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1752  hypothetical protein  33.42 
 
 		 390 aa  227  2e-58  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00572064  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0416  hypothetical protein TIGR00275  35.02 
 
 		 423 aa  228  2e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0139426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0476  hypothetical protein  33.42 
 
 		 394 aa  227  3e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.900431  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0055  hypothetical protein  33.09 
 
 		 394 aa  227  4e-58  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000153695 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0047  hypothetical protein  32.93 
 
 		 394 aa  227  4e-58  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00322221 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1349  hypothetical protein  32.2 
 
 		 393 aa  226  5.0000000000000005e-58  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1315  hypothetical protein  34.54 
 
 		 420 aa  226  6e-58  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.476308  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5249  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein-like  32.6 
 
 		 392 aa  226  6e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0049  hypothetical protein  32.93 
 
 		 394 aa  226  8e-58  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000378391 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4032  hypothetical protein  32.92 
 
 		 398 aa  225  9e-58  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3858  hypothetical protein  31.27 
 
 		 398 aa  225  1e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00469108  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0123  hypothetical protein  32.92 
 
 		 460 aa  225  1e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.291133  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0291  hypothetical protein  35.99 
 
 		 408 aa  224  2e-57  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3802  hypothetical protein  33.09 
 
 		 394 aa  224  2e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0271  hypothetical protein  32.35 
 
 		 401 aa  224  2e-57  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4688  hypothetical protein  32.66 
 
 		 413 aa  223  3e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3781  hypothetical protein  31.27 
 
 		 398 aa  223  4e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4094  hypothetical protein  32.67 
 
 		 460 aa  223  4.9999999999999996e-57  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0662  hypothetical protein  32.6 
 
 		 392 aa  223  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0741866  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3901  hypothetical protein  31.02 
 
 		 398 aa  223  6e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.150346  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3962  hypothetical protein  31.27 
 
 		 398 aa  223  6e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.327369  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3791  hypothetical protein  31.02 
 
 		 398 aa  223  6e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4017  hypothetical protein  33.01 
 
 		 393 aa  223  6e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1567  hypothetical protein  33.58 
 
 		 393 aa  222  9e-57  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1707  HI0933-like protein  33.99 
 
 		 399 aa  222  9e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.105129 
 
 
-
 
NC_002936  DET0195  hypothetical protein  35.02 
 
 		 435 aa  221  9.999999999999999e-57  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0437859  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07280  hypothetical protein  32.36 
 
 		 392 aa  222  9.999999999999999e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1392  hypothetical protein  31.95 
 
 		 393 aa  221  1.9999999999999999e-56  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.574952  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0187  HI0933 family protein  34.94 
 
 		 433 aa  221  1.9999999999999999e-56  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_183  hypothetical protein  34.78 
 
 		 435 aa  221  3e-56  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.277985  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3931  HI0933 family protein  32.6 
 
 		 397 aa  219  7e-56  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4487  HI0933 family protein  33.25 
 
 		 399 aa  219  7.999999999999999e-56  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1798  hypothetical protein  32.19 
 
 		 392 aa  219  8.999999999999998e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00536  oxidoreductase  32.6 
 
 		 397 aa  218  1e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0861  HI0933 family protein  34.22 
 
 		 412 aa  218  1e-55  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000883164  normal  0.741633 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4118  HI0933 family protein  33.75 
 
 		 394 aa  218  1e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>