More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_4030 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_4030  HI0933 family protein  100 
 
 
414 aa  840    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1437  hypothetical protein  70.12 
 
 
413 aa  590  1e-167  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0825  HI0933 family protein  62.11 
 
 
414 aa  514  1e-144  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.689631 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2952  hypothetical protein  44.85 
 
 
415 aa  362  5.0000000000000005e-99  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00592847  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2635  YhiN family flavoprotein  44.85 
 
 
414 aa  362  6e-99  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.457541  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1076  HI0933 family protein  45.78 
 
 
407 aa  345  8e-94  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0249257  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2605  hypothetical protein  44.39 
 
 
407 aa  342  8e-93  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00291222  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0627  HI0933 family protein  38.71 
 
 
404 aa  307  2.0000000000000002e-82  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000930463  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1018  HI0933 family protein  38.02 
 
 
404 aa  296  4e-79  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0128  hypothetical protein  40 
 
 
394 aa  293  5e-78  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0603016  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0698  hypothetical protein  37.35 
 
 
409 aa  278  1e-73  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_202  hypothetical protein  40.36 
 
 
394 aa  276  5e-73  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0754  HI0933-like protein  35.31 
 
 
396 aa  272  7e-72  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.961432  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0226  hypothetical protein  39.75 
 
 
379 aa  272  1e-71  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0708  FAD dependent oxidoreductase  38.63 
 
 
409 aa  265  8.999999999999999e-70  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2135  hypothetical protein  37.59 
 
 
415 aa  258  1e-67  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00468248  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1150  YhiN family flavoprotein  36.74 
 
 
406 aa  247  3e-64  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.823305  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1339  hypothetical protein  36.74 
 
 
406 aa  245  9e-64  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0646456  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0672  HI0933 family protein  36.3 
 
 
436 aa  241  1e-62  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2209  hypothetical protein  35.63 
 
 
430 aa  241  1e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000224827  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2761  HI0933 family protein  34.2 
 
 
427 aa  239  5.999999999999999e-62  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3399  HI0933 family protein  36.13 
 
 
419 aa  238  2e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000862547  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1025  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  34.88 
 
 
403 aa  236  4e-61  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0617168  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1810  hypothetical protein  34.55 
 
 
422 aa  236  5.0000000000000005e-61  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.261505  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1845  hypothetical protein  34.55 
 
 
422 aa  236  5.0000000000000005e-61  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1601  hypothetical protein  36.86 
 
 
406 aa  236  5.0000000000000005e-61  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1197  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  34.8 
 
 
403 aa  236  7e-61  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00144707  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0491  hypothetical protein  34.46 
 
 
411 aa  234  2.0000000000000002e-60  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1733  HI0933 family protein  38.11 
 
 
408 aa  232  9e-60  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1349  hypothetical protein  34.79 
 
 
393 aa  232  1e-59  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2378  HI0933 family protein  34.62 
 
 
412 aa  231  1e-59  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.270996  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2050  hypothetical protein  35.31 
 
 
419 aa  230  4e-59  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000118961  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0030  HI0933 family protein  35.7 
 
 
412 aa  229  1e-58  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2451  hypothetical protein  32.46 
 
 
446 aa  228  2e-58  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000138411  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1392  hypothetical protein  34.55 
 
 
393 aa  227  3e-58  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.574952  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28030  HI0933-like protein  33.09 
 
 
411 aa  227  4e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2949  putative FAD dependent oxidoreductase  32.76 
 
 
401 aa  224  2e-57  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4843  conserved hypothetical protein TIGR00275  34.46 
 
 
423 aa  224  3e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000266049  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0927  HI0933 family protein  36.25 
 
 
408 aa  223  6e-57  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.1016 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4688  hypothetical protein  34.16 
 
 
413 aa  223  7e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3371  hypothetical protein  34.62 
 
 
426 aa  222  8e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000385799  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4850  hypothetical protein  34.22 
 
 
423 aa  222  9e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.473198  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4604  hypothetical protein  34.22 
 
 
423 aa  222  9.999999999999999e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00629914  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4440  NAD(FAD)-utilizing dehydrogenase  34.22 
 
 
423 aa  222  9.999999999999999e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0621454  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4458  NAD(FAD)-utilizing dehydrogenase  34.22 
 
 
423 aa  222  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00549646  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4960  hypothetical protein  34.22 
 
 
423 aa  222  9.999999999999999e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.979568  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4825  conserved hypothetical protein TIGR00275  34.22 
 
 
423 aa  222  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4820  conserved hypothetical protein TIGR00275  33.98 
 
 
423 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0848463  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0262  flavoprotein  31.91 
 
 
424 aa  221  1.9999999999999999e-56  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000227955  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0416  hypothetical protein TIGR00275  33.98 
 
 
423 aa  220  3.9999999999999997e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0139426  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4539  hypothetical protein  34.14 
 
 
423 aa  219  6e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1505  HI0933 family protein  32.1 
 
 
402 aa  219  6e-56  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000535325  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1315  hypothetical protein  34.77 
 
 
420 aa  218  2e-55  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.476308  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15581  flavoprotein  32.63 
 
 
414 aa  218  2e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.379962  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001943  NAD(FAD)-utilizing dehydrogenase  33.41 
 
 
397 aa  217  2e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0861  HI0933 family protein  34.06 
 
 
412 aa  217  2.9999999999999998e-55  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000883164  normal  0.741633 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1022  HI0933 family protein  32.67 
 
 
403 aa  216  5e-55  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1798  hypothetical protein  33.17 
 
 
392 aa  216  5.9999999999999996e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3858  hypothetical protein  30.83 
 
 
398 aa  216  7e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00469108  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2434  hypothetical protein  33.9 
 
 
398 aa  216  8e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0156  hypothetical protein  33.91 
 
 
392 aa  216  9e-55  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00536  oxidoreductase  33.01 
 
 
397 aa  215  9.999999999999999e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4032  hypothetical protein  33.5 
 
 
398 aa  215  9.999999999999999e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0123  hypothetical protein  33.5 
 
 
460 aa  215  9.999999999999999e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.291133  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3791  hypothetical protein  30.83 
 
 
398 aa  214  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0291  hypothetical protein  33.58 
 
 
408 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1707  HI0933-like protein  33.17 
 
 
399 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.105129 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3901  hypothetical protein  30.83 
 
 
398 aa  214  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.150346  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3962  hypothetical protein  30.83 
 
 
398 aa  214  2.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.327369  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3781  hypothetical protein  30.83 
 
 
398 aa  214  2.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1567  hypothetical protein  32.52 
 
 
393 aa  213  3.9999999999999995e-54  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4094  hypothetical protein  33.25 
 
 
460 aa  213  3.9999999999999995e-54  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15731  flavoprotein  32.3 
 
 
410 aa  213  5.999999999999999e-54  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1052  hypothetical protein  33.99 
 
 
442 aa  213  5.999999999999999e-54  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.843089  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0187  HI0933 family protein  35.19 
 
 
433 aa  213  7e-54  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0908  HI0933 family protein  32.85 
 
 
426 aa  212  9e-54  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1237  HI0933-like protein  30.69 
 
 
412 aa  211  1e-53  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0271  hypothetical protein  31.13 
 
 
401 aa  212  1e-53  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07280  hypothetical protein  32.37 
 
 
392 aa  212  1e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1341  hypothetical protein  32.19 
 
 
393 aa  211  2e-53  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3931  HI0933 family protein  33.65 
 
 
397 aa  211  3e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1467  hypothetical protein  32.3 
 
 
415 aa  211  3e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.196184  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1378  hypothetical protein  32.53 
 
 
415 aa  210  4e-53  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.275116 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2832  flavoprotein  33.66 
 
 
392 aa  210  5e-53  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.838235  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5249  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein-like  32.84 
 
 
392 aa  208  2e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0662  hypothetical protein  32.13 
 
 
392 aa  207  2e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0741866  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0195  hypothetical protein  33.9 
 
 
435 aa  206  5e-52  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0437859  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0375  HI0933-like protein  31.71 
 
 
393 aa  206  5e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1463  hypothetical protein  32.92 
 
 
392 aa  206  5e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.261664  normal  0.428497 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0476  hypothetical protein  33.09 
 
 
394 aa  206  6e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.900431  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4204  HI0933 family protein  30.73 
 
 
399 aa  206  8e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1752  hypothetical protein  30.79 
 
 
390 aa  205  1e-51  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00572064  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3274  hypothetical protein  31.48 
 
 
396 aa  205  1e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.142928  normal  0.877884 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0145  hypothetical protein  32.27 
 
 
394 aa  204  2e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00166  predicted flavoprotein  32.03 
 
 
393 aa  204  2e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0044  hypothetical protein  31.86 
 
 
394 aa  204  2e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4328  hypothetical protein  32.03 
 
 
394 aa  203  4e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0049  hypothetical protein  31.62 
 
 
394 aa  203  4e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000378391 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0047  hypothetical protein  31.62 
 
 
394 aa  203  4e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00322221 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0047  hypothetical protein  31.78 
 
 
394 aa  203  5e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>