More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_2135 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_2135  hypothetical protein  100 
 
 		 415 aa  841    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00468248  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0708  FAD dependent oxidoreductase  55.28 
 
 		 409 aa  450  1e-125  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1733  HI0933 family protein  53.28 
 
 		 408 aa  424  1e-117  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3399  HI0933 family protein  54.24 
 
 		 419 aa  417  9.999999999999999e-116  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000862547  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1339  hypothetical protein  51.33 
 
 		 406 aa  395  1e-109  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0646456  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1150  YhiN family flavoprotein  51.57 
 
 		 406 aa  396  1e-109  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.823305  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2378  HI0933 family protein  47.57 
 
 		 412 aa  384  1e-105  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.270996  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1601  hypothetical protein  48.54 
 
 		 406 aa  375  1e-102  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0158  hypothetical protein  43.22 
 
 		 435 aa  346  5e-94  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0195  hypothetical protein  43.68 
 
 		 435 aa  345  1e-93  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0437859  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_183  hypothetical protein  43.45 
 
 		 435 aa  343  2e-93  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.277985  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2050  hypothetical protein  48.2 
 
 		 419 aa  340  2e-92  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000118961  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0187  HI0933 family protein  47.1 
 
 		 433 aa  338  9.999999999999999e-92  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2451  hypothetical protein  42.75 
 
 		 446 aa  335  5.999999999999999e-91  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000138411  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2209  hypothetical protein  42.03 
 
 		 430 aa  332  1e-89  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000224827  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0030  HI0933 family protein  45.52 
 
 		 412 aa  324  2e-87  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2761  HI0933 family protein  42.55 
 
 		 427 aa  324  2e-87  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0672  HI0933 family protein  41.93 
 
 		 436 aa  321  1.9999999999999998e-86  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0262  flavoprotein  39.42 
 
 		 424 aa  303  4.0000000000000003e-81  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000227955  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0908  HI0933 family protein  40.43 
 
 		 426 aa  301  2e-80  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3371  hypothetical protein  40.48 
 
 		 426 aa  296  4e-79  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000385799  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4850  hypothetical protein  40.48 
 
 		 423 aa  295  1e-78  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.473198  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4539  hypothetical protein  40.48 
 
 		 423 aa  294  2e-78  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4820  conserved hypothetical protein TIGR00275  40 
 
 		 423 aa  293  3e-78  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0848463  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4843  conserved hypothetical protein TIGR00275  40.24 
 
 		 423 aa  293  3e-78  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000266049  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4440  NAD(FAD)-utilizing dehydrogenase  40.24 
 
 		 423 aa  293  4e-78  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0621454  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4458  NAD(FAD)-utilizing dehydrogenase  40.24 
 
 		 423 aa  293  4e-78  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00549646  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4825  conserved hypothetical protein TIGR00275  40.24 
 
 		 423 aa  293  5e-78  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4604  hypothetical protein  40.24 
 
 		 423 aa  293  5e-78  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00629914  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4960  hypothetical protein  40.24 
 
 		 423 aa  293  5e-78  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.979568  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0416  hypothetical protein TIGR00275  39.76 
 
 		 423 aa  291  2e-77  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0139426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1845  hypothetical protein  38.44 
 
 		 422 aa  290  5.0000000000000004e-77  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1810  hypothetical protein  38.44 
 
 		 422 aa  290  5.0000000000000004e-77  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.261505  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1315  hypothetical protein  38.74 
 
 		 420 aa  288  2e-76  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.476308  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0861  HI0933 family protein  37.77 
 
 		 412 aa  283  5.000000000000001e-75  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000883164  normal  0.741633 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1197  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  38.88 
 
 		 403 aa  281  2e-74  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00144707  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1025  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  38.63 
 
 		 403 aa  280  4e-74  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0617168  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1437  hypothetical protein  40.63 
 
 		 413 aa  277  2e-73  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0927  HI0933 family protein  41.93 
 
 		 408 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.1016 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1237  HI0933-like protein  36.39 
 
 		 412 aa  268  1e-70  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2952  hypothetical protein  37.05 
 
 		 415 aa  268  1e-70  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00592847  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2635  YhiN family flavoprotein  36.63 
 
 		 414 aa  267  2.9999999999999995e-70  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.457541  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1378  hypothetical protein  37.75 
 
 		 415 aa  262  6.999999999999999e-69  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.275116 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0825  HI0933 family protein  40.88 
 
 		 414 aa  261  1e-68  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.689631 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4030  HI0933 family protein  37.38 
 
 		 414 aa  258  1e-67  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1561  hypothetical protein  36.14 
 
 		 455 aa  257  3e-67  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1430  HI0933 family protein  37.31 
 
 		 452 aa  254  2.0000000000000002e-66  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.223271  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0627  HI0933 family protein  35.85 
 
 		 404 aa  251  2e-65  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000930463  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1022  HI0933 family protein  34.38 
 
 		 403 aa  247  3e-64  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1926  HI0933-like protein  36.45 
 
 		 414 aa  246  8e-64  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0291  hypothetical protein  37.75 
 
 		 408 aa  245  9.999999999999999e-64  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2605  hypothetical protein  35.22 
 
 		 407 aa  241  2e-62  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00291222  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1052  hypothetical protein  36.54 
 
 		 442 aa  239  9e-62  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.843089  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1282  HI0933 family protein  36.88 
 
 		 457 aa  236  6e-61  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.138775  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2387  hypothetical protein  36.2 
 
 		 410 aa  236  8e-61  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1567  hypothetical protein  34.81 
 
 		 393 aa  235  1.0000000000000001e-60  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1752  hypothetical protein  34.48 
 
 		 390 aa  233  5e-60  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00572064  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1476  HI0933 family protein  35.37 
 
 		 413 aa  220  3e-56  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1209  HI0933 family protein  32.81 
 
 		 443 aa  220  3.9999999999999997e-56  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00892484 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15361  flavoprotein  33.25 
 
 		 411 aa  218  2e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0647863  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1122  hypothetical protein  34.24 
 
 		 443 aa  214  1.9999999999999998e-54  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.138213  normal  0.379331 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15731  flavoprotein  33.42 
 
 		 410 aa  211  2e-53  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15581  flavoprotein  33.01 
 
 		 414 aa  209  5e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.379962  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0128  hypothetical protein  35.51 
 
 		 394 aa  209  9e-53  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0603016  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1467  hypothetical protein  33 
 
 		 415 aa  208  1e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.196184  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07621  hypothetical protein  33.89 
 
 		 407 aa  206  5e-52  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.0179283 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0791  HI0933 family protein  33.33 
 
 		 408 aa  204  2e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.371857 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0130  hypothetical protein  33.26 
 
 		 405 aa  204  2e-51  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.700212  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3520  HI0933 family protein  32.91 
 
 		 408 aa  204  3e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2555  hypothetical protein  31.36 
 
 		 396 aa  203  5e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00730633  hitchhiker  0.0000156467 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28030  HI0933-like protein  32.6 
 
 		 411 aa  202  7e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1574  HI0933 family protein  32.82 
 
 		 409 aa  202  8e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1597  HI0933 family protein  33.07 
 
 		 409 aa  202  8e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.168995 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5032  HI0933 family protein  31.25 
 
 		 404 aa  200  3.9999999999999996e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1076  HI0933 family protein  33.93 
 
 		 407 aa  200  5e-50  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0249257  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4017  hypothetical protein  31.93 
 
 		 393 aa  199  7e-50  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4873  hypothetical protein  30.62 
 
 		 394 aa  197  4.0000000000000005e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1238  hypothetical protein  33.42 
 
 		 414 aa  197  4.0000000000000005e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1396  hypothetical protein  30.17 
 
 		 402 aa  196  7e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5845  HI0933 family protein  30.12 
 
 		 408 aa  196  8.000000000000001e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.599184  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3802  hypothetical protein  30.12 
 
 		 394 aa  196  8.000000000000001e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_202  hypothetical protein  35.35 
 
 		 394 aa  194  2e-48  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2884  HI0933-like protein  33.49 
 
 		 414 aa  194  2e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0049  hypothetical protein  31.78 
 
 		 394 aa  194  2e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000378391 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0047  hypothetical protein  31.78 
 
 		 394 aa  194  2e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00322221 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1282  hypothetical protein  29.16 
 
 		 403 aa  194  3e-48  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.488791  normal  0.628895 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0055  hypothetical protein  31.54 
 
 		 394 aa  193  4e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000153695 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0054  hypothetical protein  31.78 
 
 		 396 aa  193  5e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4328  hypothetical protein  31.54 
 
 		 394 aa  193  5e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0051  hypothetical protein  30.96 
 
 		 394 aa  192  7e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000135975 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0047  hypothetical protein  30.96 
 
 		 394 aa  192  7e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0051  HI0933 family protein  31.3 
 
 		 394 aa  192  1e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.71818 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0044  hypothetical protein  31.05 
 
 		 394 aa  191  2.9999999999999997e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00402  hypothetical protein  33.17 
 
 		 393 aa  190  5e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.96178  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0345  HI0933 family protein  30.62 
 
 		 409 aa  189  5.999999999999999e-47  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2949  putative FAD dependent oxidoreductase  30.07 
 
 		 401 aa  189  5.999999999999999e-47  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0476  hypothetical protein  31.71 
 
 		 394 aa  187  3e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.900431  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2502  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein-like  31.61 
 
 		 413 aa  186  5e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.472711  normal  0.7121 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1018  HI0933 family protein  30.1 
 
 		 404 aa  185  1.0000000000000001e-45  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0017  hypothetical protein  32.54 
 
 		 422 aa  185  1.0000000000000001e-45  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>