More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_0130 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008819  NATL1_07621  hypothetical protein  97.28 
 
 
407 aa  798    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.0179283 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0130  hypothetical protein  100 
 
 
405 aa  818    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.700212  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15361  flavoprotein  51.62 
 
 
411 aa  437  1e-121  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0647863  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15731  flavoprotein  51.86 
 
 
410 aa  433  1e-120  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1467  hypothetical protein  51.61 
 
 
415 aa  434  1e-120  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.196184  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15581  flavoprotein  51.36 
 
 
414 aa  430  1e-119  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.379962  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0017  hypothetical protein  46.4 
 
 
422 aa  414  1e-114  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0017  hypothetical protein  47.3 
 
 
405 aa  396  1e-109  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00161  hypothetical protein  47.89 
 
 
440 aa  390  1e-107  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1396  hypothetical protein  45.77 
 
 
402 aa  362  7.0000000000000005e-99  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1597  HI0933 family protein  47.9 
 
 
409 aa  357  1.9999999999999998e-97  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.168995 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1574  HI0933 family protein  47.41 
 
 
409 aa  357  1.9999999999999998e-97  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3520  HI0933 family protein  46.23 
 
 
408 aa  346  4e-94  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3929  HI0933-like protein  47.37 
 
 
413 aa  344  1e-93  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00246834 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2067  hypothetical protein  43.9 
 
 
415 aa  338  7e-92  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0791  HI0933 family protein  43.32 
 
 
408 aa  335  7e-91  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.371857 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2502  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein-like  43.78 
 
 
413 aa  331  2e-89  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.472711  normal  0.7121 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5845  HI0933 family protein  41.04 
 
 
408 aa  328  9e-89  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.599184  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0345  HI0933 family protein  42.89 
 
 
409 aa  328  1.0000000000000001e-88  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5032  HI0933 family protein  42.93 
 
 
404 aa  327  3e-88  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2316  hypothetical protein  42.86 
 
 
410 aa  322  7e-87  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1282  hypothetical protein  41.35 
 
 
403 aa  317  2e-85  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.488791  normal  0.628895 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04960  hypothetical protein  41.28 
 
 
406 aa  313  3.9999999999999997e-84  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1503  hypothetical protein  40.05 
 
 
433 aa  304  2.0000000000000002e-81  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_14937  predicted protein  35.73 
 
 
436 aa  240  2.9999999999999997e-62  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.723308  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1437  hypothetical protein  34.96 
 
 
413 aa  218  2e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1150  YhiN family flavoprotein  33.89 
 
 
406 aa  202  7e-51  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.823305  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1339  hypothetical protein  33.18 
 
 
406 aa  201  1.9999999999999998e-50  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0646456  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3399  HI0933 family protein  33.59 
 
 
419 aa  200  3.9999999999999996e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000862547  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1601  hypothetical protein  36.39 
 
 
406 aa  197  4.0000000000000005e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0262  flavoprotein  34.47 
 
 
424 aa  194  2e-48  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000227955  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1733  HI0933 family protein  34.31 
 
 
408 aa  192  8e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0708  FAD dependent oxidoreductase  32.55 
 
 
409 aa  190  4e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0030  HI0933 family protein  33.49 
 
 
412 aa  189  8e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2209  hypothetical protein  33.89 
 
 
430 aa  189  1e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000224827  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2378  HI0933 family protein  33.25 
 
 
412 aa  187  3e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.270996  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2135  hypothetical protein  33.17 
 
 
415 aa  186  4e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00468248  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0927  HI0933 family protein  32.61 
 
 
408 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.1016 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1752  hypothetical protein  33.5 
 
 
390 aa  184  3e-45  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00572064  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1197  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  32.11 
 
 
403 aa  183  4.0000000000000006e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00144707  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1025  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  31.86 
 
 
403 aa  183  6e-45  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0617168  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4030  HI0933 family protein  32.57 
 
 
414 aa  181  2e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1567  hypothetical protein  33.5 
 
 
393 aa  181  2e-44  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0861  HI0933 family protein  32.24 
 
 
412 aa  177  2e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000883164  normal  0.741633 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1810  hypothetical protein  31.63 
 
 
422 aa  178  2e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.261505  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1845  hypothetical protein  31.63 
 
 
422 aa  178  2e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1561  hypothetical protein  27.36 
 
 
455 aa  176  6e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4843  conserved hypothetical protein TIGR00275  34.44 
 
 
423 aa  176  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000266049  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1476  HI0933 family protein  31.27 
 
 
413 aa  175  9.999999999999999e-43  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4850  hypothetical protein  34.2 
 
 
423 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.473198  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4539  hypothetical protein  33.73 
 
 
423 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1315  hypothetical protein  31.73 
 
 
420 aa  174  2.9999999999999996e-42  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.476308  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4604  hypothetical protein  34.2 
 
 
423 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00629914  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4440  NAD(FAD)-utilizing dehydrogenase  34.2 
 
 
423 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0621454  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4458  NAD(FAD)-utilizing dehydrogenase  34.2 
 
 
423 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00549646  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4960  hypothetical protein  34.2 
 
 
423 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.979568  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4825  conserved hypothetical protein TIGR00275  34.2 
 
 
423 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1122  hypothetical protein  29.9 
 
 
443 aa  174  3.9999999999999995e-42  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.138213  normal  0.379331 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2761  HI0933 family protein  31.5 
 
 
427 aa  173  5e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1926  HI0933-like protein  29.74 
 
 
414 aa  173  5e-42  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2605  hypothetical protein  30 
 
 
407 aa  173  5.999999999999999e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00291222  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4820  conserved hypothetical protein TIGR00275  33.49 
 
 
423 aa  172  9e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0848463  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0416  hypothetical protein TIGR00275  33.89 
 
 
423 aa  172  1e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0139426  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0825  HI0933 family protein  31.7 
 
 
414 aa  171  2e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.689631 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1022  HI0933 family protein  30.12 
 
 
403 aa  171  2e-41  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3371  hypothetical protein  33.41 
 
 
426 aa  170  4e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000385799  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0195  hypothetical protein  30.07 
 
 
435 aa  168  1e-40  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0437859  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0291  hypothetical protein  30.75 
 
 
408 aa  169  1e-40  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0187  HI0933 family protein  32.13 
 
 
433 aa  167  2.9999999999999998e-40  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0672  HI0933 family protein  31.49 
 
 
436 aa  167  4e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1430  HI0933 family protein  27.74 
 
 
452 aa  165  1.0000000000000001e-39  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.223271  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2451  hypothetical protein  29.45 
 
 
446 aa  164  2.0000000000000002e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000138411  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2952  hypothetical protein  31.35 
 
 
415 aa  164  2.0000000000000002e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00592847  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_183  hypothetical protein  29.83 
 
 
435 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.277985  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3018  hypothetical protein  30.85 
 
 
404 aa  164  3e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0943538  normal  0.733965 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2050  hypothetical protein  30 
 
 
419 aa  163  5.0000000000000005e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000118961  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0145  hypothetical protein  30.62 
 
 
394 aa  161  2e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1237  HI0933-like protein  31.14 
 
 
412 aa  160  4e-38  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2635  YhiN family flavoprotein  31.19 
 
 
414 aa  160  4e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.457541  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0413  HI0933-like protein  30.77 
 
 
392 aa  159  7e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0650019  normal  0.0294705 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1209  HI0933 family protein  29.13 
 
 
443 aa  159  8e-38  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00892484 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0908  HI0933 family protein  29.69 
 
 
426 aa  158  1e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0202  HI0933-like protein  30.02 
 
 
433 aa  157  2e-37  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.309698  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0128  hypothetical protein  32.76 
 
 
394 aa  157  3e-37  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0603016  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0064  hypothetical protein  31.58 
 
 
397 aa  157  3e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4017  hypothetical protein  29.02 
 
 
393 aa  157  4e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0754  HI0933-like protein  31.85 
 
 
396 aa  156  6e-37  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.961432  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4466  hypothetical protein  29.02 
 
 
394 aa  156  6e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.119173 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1076  HI0933 family protein  32.75 
 
 
407 aa  155  9e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0249257  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00166  predicted flavoprotein  28.57 
 
 
393 aa  155  1e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1052  hypothetical protein  28.22 
 
 
442 aa  155  1e-36  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.843089  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0158  hypothetical protein  28.61 
 
 
435 aa  154  2e-36  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4873  hypothetical protein  30 
 
 
394 aa  155  2e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2547  hypothetical protein  29.98 
 
 
394 aa  154  2.9999999999999998e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.374165  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1378  hypothetical protein  30.17 
 
 
415 aa  153  5.9999999999999996e-36  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.275116 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0627  HI0933 family protein  30.98 
 
 
404 aa  152  8e-36  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000930463  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0055  hypothetical protein  29.27 
 
 
394 aa  152  1e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000153695 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1530  hypothetical protein  29.95 
 
 
391 aa  152  1e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2387  hypothetical protein  29.29 
 
 
410 aa  152  1e-35  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2949  putative FAD dependent oxidoreductase  28.54 
 
 
401 aa  151  2e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>