More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_1476 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_1476  HI0933 family protein  100 
 
 		 413 aa  842    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1209  HI0933 family protein  58.48 
 
 		 443 aa  450  1e-125  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00892484 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1561  hypothetical protein  51.2 
 
 		 455 aa  419  1e-116  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1282  HI0933 family protein  50.48 
 
 		 457 aa  387  1e-106  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.138775  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1430  HI0933 family protein  49.88 
 
 		 452 aa  376  1e-103  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.223271  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1122  hypothetical protein  47.7 
 
 		 443 aa  374  1e-102  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.138213  normal  0.379331 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1052  hypothetical protein  46.62 
 
 		 442 aa  355  1e-96  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.843089  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0708  FAD dependent oxidoreductase  36.08 
 
 		 409 aa  226  5.0000000000000005e-58  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2378  HI0933 family protein  34.1 
 
 		 412 aa  220  3.9999999999999997e-56  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.270996  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0030  HI0933 family protein  35.82 
 
 		 412 aa  219  8.999999999999998e-56  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1601  hypothetical protein  33.94 
 
 		 406 aa  217  2.9999999999999998e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2135  hypothetical protein  35.75 
 
 		 415 aa  217  2.9999999999999998e-55  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00468248  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0187  HI0933 family protein  35.71 
 
 		 433 aa  213  4.9999999999999996e-54  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2050  hypothetical protein  36.29 
 
 		 419 aa  210  3e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000118961  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0927  HI0933 family protein  37.82 
 
 		 408 aa  208  1e-52  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.1016 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3399  HI0933 family protein  35.04 
 
 		 419 aa  207  2e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000862547  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0861  HI0933 family protein  31.49 
 
 		 412 aa  202  9.999999999999999e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000883164  normal  0.741633 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0291  hypothetical protein  34.55 
 
 		 408 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_183  hypothetical protein  34.38 
 
 		 435 aa  199  6e-50  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.277985  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1378  hypothetical protein  35.48 
 
 		 415 aa  199  6e-50  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.275116 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1733  HI0933 family protein  33.59 
 
 		 408 aa  197  2.0000000000000003e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2209  hypothetical protein  32.68 
 
 		 430 aa  196  5.000000000000001e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000224827  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0195  hypothetical protein  33.66 
 
 		 435 aa  196  7e-49  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0437859  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2387  hypothetical protein  35.12 
 
 		 410 aa  195  1e-48  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1022  HI0933 family protein  28.72 
 
 		 403 aa  195  1e-48  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1339  hypothetical protein  31.6 
 
 		 406 aa  195  1e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0646456  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0672  HI0933 family protein  34.32 
 
 		 436 aa  194  4e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1197  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  29.97 
 
 		 403 aa  192  6e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00144707  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1150  YhiN family flavoprotein  31.36 
 
 		 406 aa  192  8e-48  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.823305  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0908  HI0933 family protein  32.66 
 
 		 426 aa  192  1e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1025  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  29.72 
 
 		 403 aa  192  1e-47  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0617168  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2761  HI0933 family protein  31.97 
 
 		 427 aa  188  1e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0158  hypothetical protein  32.69 
 
 		 435 aa  186  5e-46  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1437  hypothetical protein  30.3 
 
 		 413 aa  186  8e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4604  hypothetical protein  30.53 
 
 		 423 aa  182  1e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00629914  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4440  NAD(FAD)-utilizing dehydrogenase  30.53 
 
 		 423 aa  182  1e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0621454  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4458  NAD(FAD)-utilizing dehydrogenase  30.53 
 
 		 423 aa  182  1e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00549646  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4825  conserved hypothetical protein TIGR00275  30.53 
 
 		 423 aa  182  1e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4960  hypothetical protein  30.53 
 
 		 423 aa  182  1e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.979568  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4843  conserved hypothetical protein TIGR00275  30.53 
 
 		 423 aa  182  1e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000266049  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2635  YhiN family flavoprotein  30.36 
 
 		 414 aa  181  1e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.457541  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4850  hypothetical protein  30.53 
 
 		 423 aa  181  2e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.473198  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0825  HI0933 family protein  30.15 
 
 		 414 aa  181  2e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.689631 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4820  conserved hypothetical protein TIGR00275  30.53 
 
 		 423 aa  181  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0848463  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1845  hypothetical protein  31.26 
 
 		 422 aa  180  2.9999999999999997e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15731  flavoprotein  31.22 
 
 		 410 aa  181  2.9999999999999997e-44  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1810  hypothetical protein  31.26 
 
 		 422 aa  180  2.9999999999999997e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.261505  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0416  hypothetical protein TIGR00275  30.53 
 
 		 423 aa  180  4e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0139426  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4539  hypothetical protein  30.53 
 
 		 423 aa  180  4.999999999999999e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4030  HI0933 family protein  30.23 
 
 		 414 aa  179  5.999999999999999e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3371  hypothetical protein  29.52 
 
 		 426 aa  178  1e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000385799  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2952  hypothetical protein  30.2 
 
 		 415 aa  178  2e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00592847  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1315  hypothetical protein  31.14 
 
 		 420 aa  177  3e-43  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.476308  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1467  hypothetical protein  31.2 
 
 		 415 aa  177  3e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.196184  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0262  flavoprotein  31.38 
 
 		 424 aa  177  4e-43  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000227955  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1926  HI0933-like protein  32.55 
 
 		 414 aa  176  8e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0130  hypothetical protein  31.27 
 
 		 405 aa  175  9.999999999999999e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.700212  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2067  hypothetical protein  31.88 
 
 		 415 aa  175  9.999999999999999e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3520  HI0933 family protein  30.15 
 
 		 408 aa  176  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2316  hypothetical protein  31.82 
 
 		 410 aa  175  9.999999999999999e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15581  flavoprotein  30.63 
 
 		 414 aa  174  2.9999999999999996e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.379962  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0017  hypothetical protein  34.78 
 
 		 405 aa  174  2.9999999999999996e-42  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1396  hypothetical protein  29.64 
 
 		 402 aa  173  3.9999999999999995e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07621  hypothetical protein  30.75 
 
 		 407 aa  173  3.9999999999999995e-42  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.0179283 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2451  hypothetical protein  28.84 
 
 		 446 aa  172  6.999999999999999e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000138411  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2502  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein-like  30.96 
 
 		 413 aa  170  5e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.472711  normal  0.7121 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5845  HI0933 family protein  28.57 
 
 		 408 aa  170  5e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.599184  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2605  hypothetical protein  29.66 
 
 		 407 aa  169  1e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00291222  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1237  HI0933-like protein  28.24 
 
 		 412 aa  169  1e-40  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1567  hypothetical protein  32.02 
 
 		 393 aa  169  1e-40  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3929  HI0933-like protein  31.81 
 
 		 413 aa  168  2e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00246834 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0017  hypothetical protein  33.33 
 
 		 422 aa  165  1.0000000000000001e-39  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0627  HI0933 family protein  28.75 
 
 		 404 aa  164  4.0000000000000004e-39  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000930463  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15361  flavoprotein  29.26 
 
 		 411 aa  163  6e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0647863  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00161  hypothetical protein  32.66 
 
 		 440 aa  163  6e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1503  hypothetical protein  31.39 
 
 		 433 aa  160  5e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1574  HI0933 family protein  28.93 
 
 		 409 aa  160  6e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1597  HI0933 family protein  28.93 
 
 		 409 aa  159  7e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.168995 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1752  hypothetical protein  29.13 
 
 		 390 aa  157  2e-37  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00572064  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3274  hypothetical protein  30.86 
 
 		 396 aa  154  2e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.142928  normal  0.877884 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1282  hypothetical protein  29.12 
 
 		 403 aa  155  2e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.488791  normal  0.628895 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0491  hypothetical protein  26.42 
 
 		 411 aa  154  2.9999999999999998e-36  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0413  HI0933-like protein  29.16 
 
 		 392 aa  149  9e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0650019  normal  0.0294705 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04960  hypothetical protein  28.09 
 
 		 406 aa  147  2.0000000000000003e-34  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0791  HI0933 family protein  29.92 
 
 		 408 aa  148  2.0000000000000003e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.371857 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5032  HI0933 family protein  29.34 
 
 		 404 aa  147  3e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1018  HI0933 family protein  26.32 
 
 		 404 aa  147  3e-34  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1899  HI0933 family protein  28.9 
 
 		 409 aa  147  5e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.279809  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0345  HI0933 family protein  27.32 
 
 		 409 aa  145  1e-33  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0754  HI0933-like protein  26.27 
 
 		 396 aa  144  2e-33  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.961432  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1076  HI0933 family protein  26.22 
 
 		 407 aa  142  8e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0249257  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1007  hypothetical protein  31.54 
 
 		 389 aa  139  1e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.775195  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2623  hypothetical protein  29.37 
 
 		 393 aa  138  2e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2555  hypothetical protein  28.05 
 
 		 396 aa  138  2e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00730633  hitchhiker  0.0000156467 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1308  HI0933 family protein  30.85 
 
 		 426 aa  137  3.0000000000000003e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0313133  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_202  hypothetical protein  27.51 
 
 		 394 aa  137  5e-31  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0226  hypothetical protein  27.39 
 
 		 379 aa  136  6.0000000000000005e-31  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0698  hypothetical protein  26.8 
 
 		 409 aa  136  8e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1707  HI0933-like protein  28.29 
 
 		 399 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.105129 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2434  hypothetical protein  28.19 
 
 		 398 aa  134  1.9999999999999998e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>