More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_5032 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_5032  HI0933 family protein  100 
 
 		 404 aa  832    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0791  HI0933 family protein  61.39 
 
 		 408 aa  518  1e-146  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.371857 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5845  HI0933 family protein  48.63 
 
 		 408 aa  427  1e-118  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.599184  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1282  hypothetical protein  48.01 
 
 		 403 aa  392  1e-108  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.488791  normal  0.628895 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1396  hypothetical protein  46.5 
 
 		 402 aa  374  1e-102  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3520  HI0933 family protein  47.04 
 
 		 408 aa  366  1e-100  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1574  HI0933 family protein  46.06 
 
 		 409 aa  364  1e-99  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2502  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein-like  47.33 
 
 		 413 aa  364  2e-99  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.472711  normal  0.7121 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1597  HI0933 family protein  46.06 
 
 		 409 aa  363  2e-99  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.168995 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2067  hypothetical protein  47.03 
 
 		 415 aa  350  2e-95  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3929  HI0933-like protein  46.37 
 
 		 413 aa  346  5e-94  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00246834 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04960  hypothetical protein  44.89 
 
 		 406 aa  342  5e-93  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2316  hypothetical protein  44.59 
 
 		 410 aa  338  9.999999999999999e-92  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0345  HI0933 family protein  43.77 
 
 		 409 aa  331  1e-89  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0130  hypothetical protein  42.93 
 
 		 405 aa  327  3e-88  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.700212  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1503  hypothetical protein  44.22 
 
 		 433 aa  326  5e-88  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07621  hypothetical protein  42.43 
 
 		 407 aa  322  8e-87  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.0179283 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15731  flavoprotein  42.08 
 
 		 410 aa  306  6e-82  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1467  hypothetical protein  41.58 
 
 		 415 aa  302  6.000000000000001e-81  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.196184  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15361  flavoprotein  40.89 
 
 		 411 aa  300  3e-80  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0647863  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0017  hypothetical protein  39.16 
 
 		 422 aa  300  4e-80  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15581  flavoprotein  41.34 
 
 		 414 aa  297  2e-79  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.379962  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0017  hypothetical protein  38.32 
 
 		 405 aa  287  2e-76  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00161  hypothetical protein  38.62 
 
 		 440 aa  276  4e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_14937  predicted protein  36.73 
 
 		 436 aa  247  3e-64  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.723308  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0861  HI0933 family protein  32.11 
 
 		 412 aa  207  2e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000883164  normal  0.741633 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0672  HI0933 family protein  28.95 
 
 		 436 aa  191  2e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0416  hypothetical protein TIGR00275  30.12 
 
 		 423 aa  189  7e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0139426  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1339  hypothetical protein  32.37 
 
 		 406 aa  189  9e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0646456  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1150  YhiN family flavoprotein  32.37 
 
 		 406 aa  189  9e-47  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.823305  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1810  hypothetical protein  30.24 
 
 		 422 aa  188  1e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.261505  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1845  hypothetical protein  30.24 
 
 		 422 aa  188  1e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4843  conserved hypothetical protein TIGR00275  30.12 
 
 		 423 aa  188  2e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000266049  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4850  hypothetical protein  30.12 
 
 		 423 aa  188  2e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.473198  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4820  conserved hypothetical protein TIGR00275  30.12 
 
 		 423 aa  187  2e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0848463  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2761  HI0933 family protein  29.78 
 
 		 427 aa  187  3e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4440  NAD(FAD)-utilizing dehydrogenase  30.36 
 
 		 423 aa  186  4e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0621454  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4458  NAD(FAD)-utilizing dehydrogenase  30.36 
 
 		 423 aa  186  4e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00549646  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1752  hypothetical protein  32.09 
 
 		 390 aa  186  5e-46  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00572064  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4539  hypothetical protein  29.88 
 
 		 423 aa  186  8e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4604  hypothetical protein  30.12 
 
 		 423 aa  186  9e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00629914  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4825  conserved hypothetical protein TIGR00275  30.12 
 
 		 423 aa  186  9e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4960  hypothetical protein  30.12 
 
 		 423 aa  186  9e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.979568  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0030  HI0933 family protein  31.31 
 
 		 412 aa  184  3e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1437  hypothetical protein  28.79 
 
 		 413 aa  183  5.0000000000000004e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3371  hypothetical protein  28.92 
 
 		 426 aa  183  5.0000000000000004e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000385799  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2135  hypothetical protein  30.03 
 
 		 415 aa  181  2e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00468248  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1349  hypothetical protein  30.39 
 
 		 393 aa  179  5.999999999999999e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2209  hypothetical protein  29.71 
 
 		 430 aa  178  1e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000224827  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1378  hypothetical protein  31.48 
 
 		 415 aa  179  1e-43  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.275116 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1567  hypothetical protein  30.92 
 
 		 393 aa  178  1e-43  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0708  FAD dependent oxidoreductase  29.2 
 
 		 409 aa  178  2e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1197  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  27.34 
 
 		 403 aa  177  2e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00144707  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1315  hypothetical protein  31.23 
 
 		 420 aa  177  3e-43  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.476308  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0908  HI0933 family protein  31.72 
 
 		 426 aa  177  3e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3399  HI0933 family protein  29.52 
 
 		 419 aa  176  6e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000862547  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1798  hypothetical protein  31.62 
 
 		 392 aa  176  8e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0927  HI0933 family protein  31.96 
 
 		 408 aa  175  9.999999999999999e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.1016 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1025  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  27.34 
 
 		 403 aa  175  9.999999999999999e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0617168  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0291  hypothetical protein  31.8 
 
 		 408 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1392  hypothetical protein  29.9 
 
 		 393 aa  173  5e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.574952  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1341  hypothetical protein  29.66 
 
 		 393 aa  172  6.999999999999999e-42  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0262  flavoprotein  28.64 
 
 		 424 aa  172  1e-41  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000227955  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1601  hypothetical protein  29.56 
 
 		 406 aa  171  2e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2451  hypothetical protein  27.03 
 
 		 446 aa  169  9e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000138411  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1430  HI0933 family protein  30.98 
 
 		 452 aa  168  1e-40  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.223271  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0825  HI0933 family protein  27.27 
 
 		 414 aa  168  1e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.689631 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1707  HI0933-like protein  31.87 
 
 		 399 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.105129 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0187  HI0933 family protein  29.85 
 
 		 433 aa  165  1.0000000000000001e-39  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4030  HI0933 family protein  28.39 
 
 		 414 aa  165  1.0000000000000001e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1052  hypothetical protein  28.99 
 
 		 442 aa  164  3e-39  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.843089  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2623  hypothetical protein  30.99 
 
 		 393 aa  162  1e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2605  hypothetical protein  26.96 
 
 		 407 aa  160  4e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00291222  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0047  hypothetical protein  31.18 
 
 		 394 aa  159  8e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00322221 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1018  HI0933 family protein  28.02 
 
 		 404 aa  159  1e-37  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1022  HI0933 family protein  27.52 
 
 		 403 aa  159  1e-37  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0054  hypothetical protein  30.53 
 
 		 396 aa  158  2e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0055  hypothetical protein  30.94 
 
 		 394 aa  157  2e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000153695 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3802  hypothetical protein  29.74 
 
 		 394 aa  158  2e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0049  hypothetical protein  30.94 
 
 		 394 aa  157  3e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000378391 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0303  hypothetical protein  26.94 
 
 		 394 aa  157  4e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.918662  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1926  HI0933-like protein  26.73 
 
 		 414 aa  156  5.0000000000000005e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4466  hypothetical protein  29.5 
 
 		 394 aa  156  5.0000000000000005e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.119173 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4328  hypothetical protein  30.05 
 
 		 394 aa  156  6e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1561  hypothetical protein  26.62 
 
 		 455 aa  155  1e-36  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0044  hypothetical protein  29.81 
 
 		 394 aa  155  1e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2183  hypothetical protein  30.07 
 
 		 396 aa  155  1e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.286863 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1787  hypothetical protein  29.77 
 
 		 406 aa  154  2e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000418833 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0051  HI0933 family protein  29.81 
 
 		 394 aa  154  2e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.71818 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1733  HI0933 family protein  26.82 
 
 		 408 aa  154  2e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3858  hypothetical protein  29.81 
 
 		 398 aa  154  2.9999999999999998e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00469108  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4873  hypothetical protein  29.33 
 
 		 394 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4017  hypothetical protein  28.74 
 
 		 393 aa  154  4e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2378  HI0933 family protein  28.03 
 
 		 412 aa  153  4e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.270996  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1209  HI0933 family protein  28.65 
 
 		 443 aa  153  5e-36  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00892484 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3962  hypothetical protein  29.81 
 
 		 398 aa  152  7e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.327369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0047  hypothetical protein  29.57 
 
 		 394 aa  153  7e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1513  hypothetical protein  30.19 
 
 		 392 aa  152  8.999999999999999e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.86402  normal  0.0796345 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2387  hypothetical protein  28.46 
 
 		 410 aa  152  8.999999999999999e-36  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0754  HI0933-like protein  26.12 
 
 		 396 aa  152  1e-35  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.961432  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>