More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_1503 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_1503  hypothetical protein  100 
 
 
433 aa  869    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3520  HI0933 family protein  52.99 
 
 
408 aa  424  1e-117  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1597  HI0933 family protein  49.53 
 
 
409 aa  409  1e-113  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.168995 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1574  HI0933 family protein  49.53 
 
 
409 aa  409  1e-113  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3929  HI0933-like protein  51.26 
 
 
413 aa  410  1e-113  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00246834 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1396  hypothetical protein  48.11 
 
 
402 aa  402  1e-111  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2502  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein-like  49.15 
 
 
413 aa  389  1e-107  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.472711  normal  0.7121 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2067  hypothetical protein  50.35 
 
 
415 aa  374  1e-102  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2316  hypothetical protein  48.3 
 
 
410 aa  373  1e-102  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0791  HI0933 family protein  45.63 
 
 
408 aa  366  1e-100  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.371857 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04960  hypothetical protein  43.46 
 
 
406 aa  366  1e-100  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5845  HI0933 family protein  44.37 
 
 
408 aa  362  9e-99  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.599184  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5032  HI0933 family protein  44.58 
 
 
404 aa  357  1.9999999999999998e-97  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1282  hypothetical protein  44.1 
 
 
403 aa  348  1e-94  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.488791  normal  0.628895 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15731  flavoprotein  42.72 
 
 
410 aa  335  1e-90  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00161  hypothetical protein  45.41 
 
 
440 aa  334  2e-90  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15581  flavoprotein  41.72 
 
 
414 aa  330  2e-89  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.379962  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07621  hypothetical protein  39.68 
 
 
407 aa  330  3e-89  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.0179283 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0130  hypothetical protein  40.14 
 
 
405 aa  328  9e-89  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.700212  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0345  HI0933 family protein  42.03 
 
 
409 aa  327  4.0000000000000003e-88  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15361  flavoprotein  39.63 
 
 
411 aa  324  2e-87  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0647863  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0017  hypothetical protein  43.69 
 
 
422 aa  322  8e-87  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1467  hypothetical protein  40.19 
 
 
415 aa  319  6e-86  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.196184  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0017  hypothetical protein  43.24 
 
 
405 aa  301  2e-80  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_14937  predicted protein  38.76 
 
 
436 aa  259  6e-68  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.723308  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0861  HI0933 family protein  31.8 
 
 
412 aa  202  7e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000883164  normal  0.741633 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0708  FAD dependent oxidoreductase  32.03 
 
 
409 aa  196  5.000000000000001e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2761  HI0933 family protein  32.34 
 
 
427 aa  187  3e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1810  hypothetical protein  31.89 
 
 
422 aa  186  5e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.261505  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1845  hypothetical protein  31.89 
 
 
422 aa  186  5e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1733  HI0933 family protein  30.57 
 
 
408 aa  183  5.0000000000000004e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0672  HI0933 family protein  31.95 
 
 
436 aa  181  2e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0291  hypothetical protein  33.03 
 
 
408 aa  181  2e-44  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1315  hypothetical protein  30.84 
 
 
420 aa  179  7e-44  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.476308  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1567  hypothetical protein  32.34 
 
 
393 aa  179  7e-44  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2209  hypothetical protein  30 
 
 
430 aa  179  8e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000224827  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0908  HI0933 family protein  33.94 
 
 
426 aa  178  1e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0927  HI0933 family protein  33.56 
 
 
408 aa  179  1e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.1016 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2183  hypothetical protein  34.02 
 
 
396 aa  177  3e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.286863 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1752  hypothetical protein  32.05 
 
 
390 aa  177  3e-43  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00572064  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0030  HI0933 family protein  33.49 
 
 
412 aa  177  3e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3399  HI0933 family protein  33.5 
 
 
419 aa  177  5e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000862547  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1150  YhiN family flavoprotein  29.13 
 
 
406 aa  176  6e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.823305  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2832  flavoprotein  35.71 
 
 
392 aa  176  9e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.838235  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1339  hypothetical protein  29.13 
 
 
406 aa  175  9.999999999999999e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0646456  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0262  flavoprotein  31.97 
 
 
424 aa  175  1.9999999999999998e-42  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000227955  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1463  hypothetical protein  35.71 
 
 
392 aa  174  2.9999999999999996e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.261664  normal  0.428497 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1437  hypothetical protein  27.85 
 
 
413 aa  171  2e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1601  hypothetical protein  30.18 
 
 
406 aa  171  3e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2135  hypothetical protein  30.88 
 
 
415 aa  170  4e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00468248  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1378  hypothetical protein  33.33 
 
 
415 aa  170  5e-41  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.275116 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1513  hypothetical protein  34.79 
 
 
392 aa  170  6e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.86402  normal  0.0796345 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1197  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  27.19 
 
 
403 aa  169  6e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00144707  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4440  NAD(FAD)-utilizing dehydrogenase  31.29 
 
 
423 aa  169  1e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0621454  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4458  NAD(FAD)-utilizing dehydrogenase  31.29 
 
 
423 aa  169  1e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00549646  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4825  conserved hypothetical protein TIGR00275  31.29 
 
 
423 aa  168  2e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4850  hypothetical protein  31.29 
 
 
423 aa  168  2e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.473198  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4604  hypothetical protein  31.29 
 
 
423 aa  168  2e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00629914  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3274  hypothetical protein  33.18 
 
 
396 aa  168  2e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.142928  normal  0.877884 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4960  hypothetical protein  31.29 
 
 
423 aa  168  2e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.979568  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4843  conserved hypothetical protein TIGR00275  30.84 
 
 
423 aa  168  2e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000266049  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0416  hypothetical protein TIGR00275  30.84 
 
 
423 aa  167  5e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0139426  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4820  conserved hypothetical protein TIGR00275  30.84 
 
 
423 aa  166  5e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0848463  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1282  HI0933 family protein  31.28 
 
 
457 aa  167  5e-40  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.138775  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1476  HI0933 family protein  31.22 
 
 
413 aa  166  5.9999999999999996e-40  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2949  putative FAD dependent oxidoreductase  30.48 
 
 
401 aa  166  6.9999999999999995e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1025  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  26.96 
 
 
403 aa  166  9e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0617168  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4539  hypothetical protein  30.8 
 
 
423 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2623  hypothetical protein  32.65 
 
 
393 aa  163  5.0000000000000005e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1237  HI0933-like protein  28.33 
 
 
412 aa  163  7e-39  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1926  HI0933-like protein  29.84 
 
 
414 aa  162  1e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1798  hypothetical protein  32.1 
 
 
392 aa  161  2e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1122  hypothetical protein  31.47 
 
 
443 aa  161  2e-38  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.138213  normal  0.379331 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4466  hypothetical protein  31.8 
 
 
394 aa  161  2e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.119173 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1349  hypothetical protein  30.95 
 
 
393 aa  160  3e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3371  hypothetical protein  29.66 
 
 
426 aa  160  4e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000385799  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2605  hypothetical protein  27.25 
 
 
407 aa  159  7e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00291222  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2451  hypothetical protein  27.7 
 
 
446 aa  159  1e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000138411  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1022  HI0933 family protein  26.62 
 
 
403 aa  158  2e-37  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2952  hypothetical protein  27.15 
 
 
415 aa  157  3e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00592847  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2378  HI0933 family protein  28.14 
 
 
412 aa  157  4e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.270996  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0754  HI0933-like protein  28.41 
 
 
396 aa  157  4e-37  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.961432  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0145  hypothetical protein  31.03 
 
 
394 aa  156  5.0000000000000005e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4873  hypothetical protein  30.18 
 
 
394 aa  156  6e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1209  HI0933 family protein  30.54 
 
 
443 aa  156  6e-37  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00892484 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1430  HI0933 family protein  32.24 
 
 
452 aa  156  7e-37  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.223271  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1707  HI0933-like protein  34.17 
 
 
399 aa  156  8e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.105129 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2547  hypothetical protein  31.82 
 
 
394 aa  155  9e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.374165  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2387  hypothetical protein  30.4 
 
 
410 aa  155  1e-36  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1561  hypothetical protein  29.69 
 
 
455 aa  155  1e-36  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0047  hypothetical protein  31.8 
 
 
394 aa  154  2e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1392  hypothetical protein  30.48 
 
 
393 aa  154  2e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.574952  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00166  predicted flavoprotein  30.8 
 
 
393 aa  154  2e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2635  YhiN family flavoprotein  26.98 
 
 
414 aa  154  2e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.457541  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07280  hypothetical protein  33.33 
 
 
392 aa  155  2e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0044  hypothetical protein  32.26 
 
 
394 aa  154  4e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0303  hypothetical protein  30.8 
 
 
394 aa  153  5e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.918662  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4017  hypothetical protein  30.94 
 
 
393 aa  153  5.9999999999999996e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0662  hypothetical protein  33.1 
 
 
392 aa  153  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0741866  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0051  HI0933 family protein  31.57 
 
 
394 aa  153  7e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.71818 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>