More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_0017 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_0017  hypothetical protein  100 
 
 		 405 aa  810    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0017  hypothetical protein  76.12 
 
 		 422 aa  631  1e-180  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00161  hypothetical protein  61.79 
 
 		 440 aa  472  1e-132  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07621  hypothetical protein  48.01 
 
 		 407 aa  417  9.999999999999999e-116  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.0179283 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0130  hypothetical protein  48.01 
 
 		 405 aa  416  9.999999999999999e-116  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.700212  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15731  flavoprotein  47.52 
 
 		 410 aa  409  1e-113  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1467  hypothetical protein  46.78 
 
 		 415 aa  408  1.0000000000000001e-112  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.196184  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15361  flavoprotein  45.66 
 
 		 411 aa  404  1e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0647863  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15581  flavoprotein  46.78 
 
 		 414 aa  401  9.999999999999999e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.379962  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1597  HI0933 family protein  43.6 
 
 		 409 aa  335  7.999999999999999e-91  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.168995 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1574  HI0933 family protein  43.35 
 
 		 409 aa  335  9e-91  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2067  hypothetical protein  47.49 
 
 		 415 aa  334  2e-90  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0791  HI0933 family protein  44.33 
 
 		 408 aa  333  5e-90  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.371857 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3520  HI0933 family protein  44.09 
 
 		 408 aa  332  7.000000000000001e-90  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3929  HI0933-like protein  45.29 
 
 		 413 aa  330  3e-89  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00246834 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1396  hypothetical protein  40.55 
 
 		 402 aa  328  8e-89  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2316  hypothetical protein  43.86 
 
 		 410 aa  321  9.999999999999999e-87  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2502  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein-like  43.57 
 
 		 413 aa  313  2.9999999999999996e-84  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.472711  normal  0.7121 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5032  HI0933 family protein  39.41 
 
 		 404 aa  307  2.0000000000000002e-82  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0345  HI0933 family protein  40.19 
 
 		 409 aa  306  3e-82  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5845  HI0933 family protein  40.89 
 
 		 408 aa  302  6.000000000000001e-81  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.599184  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1282  hypothetical protein  40.05 
 
 		 403 aa  299  5e-80  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.488791  normal  0.628895 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1503  hypothetical protein  43.24 
 
 		 433 aa  292  6e-78  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04960  hypothetical protein  37.01 
 
 		 406 aa  286  5e-76  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_14937  predicted protein  39.29 
 
 		 436 aa  272  9e-72  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.723308  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1733  HI0933 family protein  33.41 
 
 		 408 aa  186  9e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0861  HI0933 family protein  30.98 
 
 		 412 aa  185  1.0000000000000001e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000883164  normal  0.741633 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0708  FAD dependent oxidoreductase  32.21 
 
 		 409 aa  182  7e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2209  hypothetical protein  33.25 
 
 		 430 aa  182  7e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000224827  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0927  HI0933 family protein  34.62 
 
 		 408 aa  179  5.999999999999999e-44  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.1016 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1567  hypothetical protein  31.71 
 
 		 393 aa  179  1e-43  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1476  HI0933 family protein  34.55 
 
 		 413 aa  177  4e-43  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1601  hypothetical protein  31.03 
 
 		 406 aa  176  7e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1810  hypothetical protein  30.27 
 
 		 422 aa  176  8e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.261505  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1845  hypothetical protein  30.27 
 
 		 422 aa  176  8e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0030  HI0933 family protein  33.98 
 
 		 412 aa  175  1.9999999999999998e-42  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1926  HI0933-like protein  31.01 
 
 		 414 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0262  flavoprotein  31.06 
 
 		 424 aa  172  7.999999999999999e-42  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000227955  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1437  hypothetical protein  30.43 
 
 		 413 aa  171  3e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1752  hypothetical protein  30.88 
 
 		 390 aa  170  4e-41  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00572064  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1339  hypothetical protein  29.29 
 
 		 406 aa  169  9e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0646456  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2135  hypothetical protein  31.81 
 
 		 415 aa  169  9e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00468248  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1315  hypothetical protein  30.34 
 
 		 420 aa  168  1e-40  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.476308  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1561  hypothetical protein  30.66 
 
 		 455 aa  169  1e-40  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1150  YhiN family flavoprotein  29.05 
 
 		 406 aa  167  2.9999999999999998e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.823305  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0187  HI0933 family protein  34.79 
 
 		 433 aa  167  4e-40  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1122  hypothetical protein  33.25 
 
 		 443 aa  165  1.0000000000000001e-39  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.138213  normal  0.379331 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0908  HI0933 family protein  32.55 
 
 		 426 aa  164  2.0000000000000002e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3399  HI0933 family protein  30.26 
 
 		 419 aa  162  1e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000862547  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2050  hypothetical protein  31.91 
 
 		 419 aa  162  1e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000118961  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4843  conserved hypothetical protein TIGR00275  31.21 
 
 		 423 aa  161  2e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000266049  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2761  HI0933 family protein  31.4 
 
 		 427 aa  161  2e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4850  hypothetical protein  31.76 
 
 		 423 aa  160  3e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.473198  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2387  hypothetical protein  33 
 
 		 410 aa  160  4e-38  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0416  hypothetical protein TIGR00275  31.26 
 
 		 423 aa  160  4e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0139426  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2378  HI0933 family protein  29.55 
 
 		 412 aa  160  5e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.270996  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0672  HI0933 family protein  31.65 
 
 		 436 aa  159  6e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4604  hypothetical protein  31.91 
 
 		 423 aa  159  7e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00629914  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4440  NAD(FAD)-utilizing dehydrogenase  31.91 
 
 		 423 aa  159  7e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0621454  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4458  NAD(FAD)-utilizing dehydrogenase  31.91 
 
 		 423 aa  159  7e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00549646  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4825  conserved hypothetical protein TIGR00275  31.91 
 
 		 423 aa  159  7e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4960  hypothetical protein  31.91 
 
 		 423 aa  159  7e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.979568  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4820  conserved hypothetical protein TIGR00275  31.44 
 
 		 423 aa  159  7e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0848463  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4539  hypothetical protein  31.68 
 
 		 423 aa  159  8e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1209  HI0933 family protein  33.59 
 
 		 443 aa  158  1e-37  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00892484 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2952  hypothetical protein  28.71 
 
 		 415 aa  158  2e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00592847  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2635  YhiN family flavoprotein  28.26 
 
 		 414 aa  158  2e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.457541  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3371  hypothetical protein  31.57 
 
 		 426 aa  157  4e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000385799  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2547  hypothetical protein  32.46 
 
 		 394 aa  155  1e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.374165  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2552  hypothetical protein  28.33 
 
 		 393 aa  154  2e-36  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0825  HI0933 family protein  27.89 
 
 		 414 aa  153  5.9999999999999996e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.689631 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2183  hypothetical protein  32.85 
 
 		 396 aa  153  5.9999999999999996e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.286863 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1197  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  26.78 
 
 		 403 aa  153  5.9999999999999996e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00144707  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1052  hypothetical protein  29.6 
 
 		 442 aa  152  1e-35  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.843089  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1430  HI0933 family protein  31.78 
 
 		 452 aa  152  1e-35  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.223271  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1621  HI0933 family protein  32.69 
 
 		 394 aa  151  2e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0160754  normal  0.370908 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1022  HI0933 family protein  25 
 
 		 403 aa  151  2e-35  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0599  HI0933 family protein  30.31 
 
 		 392 aa  150  3e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.623073 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2680  hypothetical protein  28.61 
 
 		 393 aa  151  3e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1025  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  26.78 
 
 		 403 aa  151  3e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0617168  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1787  hypothetical protein  32.24 
 
 		 406 aa  151  3e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000418833 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1378  hypothetical protein  30.46 
 
 		 415 aa  150  4e-35  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.275116 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2605  hypothetical protein  27.67 
 
 		 407 aa  149  9e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00291222  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0195  hypothetical protein  30.57 
 
 		 435 aa  148  1.0000000000000001e-34  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0437859  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0303  hypothetical protein  31.3 
 
 		 394 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.918662  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_183  hypothetical protein  30.88 
 
 		 435 aa  148  2.0000000000000003e-34  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.277985  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3945  hypothetical protein  30.27 
 
 		 405 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0627  HI0933 family protein  27.58 
 
 		 404 aa  147  3e-34  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000930463  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5249  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein-like  30 
 
 		 392 aa  147  3e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1707  HI0933-like protein  32.85 
 
 		 399 aa  147  3e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.105129 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0158  hypothetical protein  29.57 
 
 		 435 aa  146  5e-34  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1282  HI0933 family protein  32.26 
 
 		 457 aa  146  6e-34  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.138775  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1798  hypothetical protein  30.66 
 
 		 392 aa  145  2e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3018  hypothetical protein  30.33 
 
 		 404 aa  144  2e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0943538  normal  0.733965 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4030  HI0933 family protein  28.75 
 
 		 414 aa  144  3e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3274  hypothetical protein  31.2 
 
 		 396 aa  144  4e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.142928  normal  0.877884 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2451  hypothetical protein  25 
 
 		 446 aa  144  4e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000138411  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00166  predicted flavoprotein  29.74 
 
 		 393 aa  142  8e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2388  FAD-dependent oxidoreductase  30.95 
 
 		 407 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.396449  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1516  hypothetical protein  30.95 
 
 		 407 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.631373  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>