More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_1209 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011059  Paes_1209  HI0933 family protein  100 
 
 		 443 aa  894    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00892484 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1476  HI0933 family protein  58.87 
 
 		 413 aa  462  1e-129  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1561  hypothetical protein  50.23 
 
 		 455 aa  434  1e-120  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1430  HI0933 family protein  50.8 
 
 		 452 aa  383  1e-105  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.223271  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1282  HI0933 family protein  49.24 
 
 		 457 aa  381  1e-104  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.138775  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1052  hypothetical protein  44.44 
 
 		 442 aa  357  1.9999999999999998e-97  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.843089  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1122  hypothetical protein  44.85 
 
 		 443 aa  356  3.9999999999999996e-97  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.138213  normal  0.379331 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0927  HI0933 family protein  39.1 
 
 		 408 aa  239  9e-62  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.1016 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0030  HI0933 family protein  36.95 
 
 		 412 aa  238  1e-61  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2135  hypothetical protein  33.08 
 
 		 415 aa  227  3e-58  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00468248  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2209  hypothetical protein  33.1 
 
 		 430 aa  218  1e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000224827  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0708  FAD dependent oxidoreductase  32.62 
 
 		 409 aa  217  2.9999999999999998e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2378  HI0933 family protein  31.14 
 
 		 412 aa  215  9.999999999999999e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.270996  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0187  HI0933 family protein  34.35 
 
 		 433 aa  215  9.999999999999999e-55  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1378  hypothetical protein  35.35 
 
 		 415 aa  214  2.9999999999999995e-54  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.275116 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1926  HI0933-like protein  33.41 
 
 		 414 aa  213  7e-54  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0861  HI0933 family protein  31.28 
 
 		 412 aa  213  7.999999999999999e-54  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000883164  normal  0.741633 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0908  HI0933 family protein  32.63 
 
 		 426 aa  212  1e-53  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1197  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  29.36 
 
 		 403 aa  211  3e-53  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00144707  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1601  hypothetical protein  33.81 
 
 		 406 aa  210  5e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0291  hypothetical protein  32.7 
 
 		 408 aa  208  1e-52  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1025  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  29.25 
 
 		 403 aa  209  1e-52  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0617168  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2387  hypothetical protein  34.57 
 
 		 410 aa  206  7e-52  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1733  HI0933 family protein  33.1 
 
 		 408 aa  206  9e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0672  HI0933 family protein  31.67 
 
 		 436 aa  204  3e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1022  HI0933 family protein  28.47 
 
 		 403 aa  204  4e-51  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2761  HI0933 family protein  29.67 
 
 		 427 aa  199  6e-50  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0195  hypothetical protein  31.73 
 
 		 435 aa  198  1.0000000000000001e-49  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0437859  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3399  HI0933 family protein  33.08 
 
 		 419 aa  197  3e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000862547  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1150  YhiN family flavoprotein  30.35 
 
 		 406 aa  195  1e-48  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.823305  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_183  hypothetical protein  31.33 
 
 		 435 aa  194  3e-48  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.277985  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1339  hypothetical protein  30.75 
 
 		 406 aa  193  5e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0646456  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3371  hypothetical protein  30.05 
 
 		 426 aa  192  9e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000385799  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2050  hypothetical protein  31.54 
 
 		 419 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000118961  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1845  hypothetical protein  29.76 
 
 		 422 aa  191  2.9999999999999997e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1810  hypothetical protein  29.76 
 
 		 422 aa  191  2.9999999999999997e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.261505  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0158  hypothetical protein  30.29 
 
 		 435 aa  189  5.999999999999999e-47  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1437  hypothetical protein  31.2 
 
 		 413 aa  189  7e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1315  hypothetical protein  29.86 
 
 		 420 aa  189  9e-47  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.476308  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0262  flavoprotein  29.18 
 
 		 424 aa  188  1e-46  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000227955  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1467  hypothetical protein  29.67 
 
 		 415 aa  189  1e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.196184  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15361  flavoprotein  28.57 
 
 		 411 aa  187  3e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0647863  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15731  flavoprotein  28.95 
 
 		 410 aa  187  4e-46  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4440  NAD(FAD)-utilizing dehydrogenase  28.84 
 
 		 423 aa  187  5e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0621454  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4458  NAD(FAD)-utilizing dehydrogenase  28.84 
 
 		 423 aa  187  5e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00549646  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4843  conserved hypothetical protein TIGR00275  28.84 
 
 		 423 aa  186  5e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000266049  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4604  hypothetical protein  28.84 
 
 		 423 aa  186  6e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00629914  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4960  hypothetical protein  28.84 
 
 		 423 aa  186  6e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.979568  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4825  conserved hypothetical protein TIGR00275  28.84 
 
 		 423 aa  186  6e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15581  flavoprotein  28.44 
 
 		 414 aa  186  9e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.379962  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4850  hypothetical protein  28.6 
 
 		 423 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.473198  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0416  hypothetical protein TIGR00275  28.47 
 
 		 423 aa  185  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0139426  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4820  conserved hypothetical protein TIGR00275  28.6 
 
 		 423 aa  185  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0848463  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1308  HI0933 family protein  32.47 
 
 		 426 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0313133  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4539  hypothetical protein  29.3 
 
 		 423 aa  184  3e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2451  hypothetical protein  27.93 
 
 		 446 aa  184  4.0000000000000006e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000138411  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3520  HI0933 family protein  30.15 
 
 		 408 aa  181  2e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2635  YhiN family flavoprotein  28.2 
 
 		 414 aa  181  2.9999999999999997e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.457541  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1396  hypothetical protein  28.74 
 
 		 402 aa  180  4e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0017  hypothetical protein  32.48 
 
 		 422 aa  180  4.999999999999999e-44  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2952  hypothetical protein  28.2 
 
 		 415 aa  180  4.999999999999999e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00592847  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0130  hypothetical protein  29.83 
 
 		 405 aa  179  9e-44  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.700212  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1752  hypothetical protein  29.76 
 
 		 390 aa  179  1e-43  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00572064  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2067  hypothetical protein  30.41 
 
 		 415 aa  179  1e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4030  HI0933 family protein  30.28 
 
 		 414 aa  177  2e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07621  hypothetical protein  29.52 
 
 		 407 aa  177  3e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.0179283 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2605  hypothetical protein  28.98 
 
 		 407 aa  174  2.9999999999999996e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00291222  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1282  hypothetical protein  30.02 
 
 		 403 aa  173  6.999999999999999e-42  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.488791  normal  0.628895 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1567  hypothetical protein  29.31 
 
 		 393 aa  172  1e-41  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00161  hypothetical protein  33.59 
 
 		 440 aa  171  2e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5032  HI0933 family protein  29.36 
 
 		 404 aa  170  5e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0627  HI0933 family protein  27.95 
 
 		 404 aa  167  2.9999999999999998e-40  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000930463  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0791  HI0933 family protein  30.31 
 
 		 408 aa  167  4e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.371857 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3929  HI0933-like protein  31.63 
 
 		 413 aa  165  2.0000000000000002e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00246834 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0754  HI0933-like protein  27.9 
 
 		 396 aa  164  3e-39  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.961432  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2502  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein-like  30.07 
 
 		 413 aa  164  4.0000000000000004e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.472711  normal  0.7121 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0491  hypothetical protein  28.35 
 
 		 411 aa  163  5.0000000000000005e-39  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0017  hypothetical protein  33.5 
 
 		 405 aa  163  5.0000000000000005e-39  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5845  HI0933 family protein  26.13 
 
 		 408 aa  163  6e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.599184  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0825  HI0933 family protein  28.09 
 
 		 414 aa  162  9e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.689631 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1237  HI0933-like protein  26.42 
 
 		 412 aa  162  1e-38  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2316  hypothetical protein  30.65 
 
 		 410 aa  161  2e-38  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00536  oxidoreductase  27.87 
 
 		 397 aa  162  2e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0183  hypothetical protein  29.39 
 
 		 438 aa  160  3e-38  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.18446 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0345  HI0933 family protein  28 
 
 		 409 aa  160  3e-38  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001943  NAD(FAD)-utilizing dehydrogenase  28.27 
 
 		 397 aa  160  3e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1007  hypothetical protein  30.02 
 
 		 389 aa  159  8e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.775195  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0413  HI0933-like protein  28.81 
 
 		 392 aa  159  9e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0650019  normal  0.0294705 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0476  hypothetical protein  30.05 
 
 		 394 aa  159  1e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.900431  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0202  HI0933-like protein  29.14 
 
 		 433 aa  159  1e-37  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.309698  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3274  hypothetical protein  30.07 
 
 		 396 aa  159  1e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.142928  normal  0.877884 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0512  hypothetical protein  29.16 
 
 		 410 aa  158  2e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.246775  normal  0.372207 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2434  hypothetical protein  28.88 
 
 		 398 aa  158  2e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1574  HI0933 family protein  28.02 
 
 		 409 aa  157  3e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2949  putative FAD dependent oxidoreductase  28.3 
 
 		 401 aa  157  3e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5002  hypothetical protein  29.16 
 
 		 393 aa  157  4e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.32275  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1597  HI0933 family protein  28.09 
 
 		 409 aa  156  6e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.168995 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1503  hypothetical protein  30.83 
 
 		 433 aa  155  2e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4017  hypothetical protein  28.3 
 
 		 393 aa  154  2e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4826  hypothetical protein  28.74 
 
 		 393 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.270305  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>