More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_3929 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_3929  HI0933-like protein  100 
 
 
413 aa  847    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00246834 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3520  HI0933 family protein  59.64 
 
 
408 aa  483  1e-135  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1574  HI0933 family protein  59.11 
 
 
409 aa  464  1e-129  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1597  HI0933 family protein  59.11 
 
 
409 aa  464  1e-129  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.168995 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2502  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein-like  59.13 
 
 
413 aa  460  9.999999999999999e-129  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.472711  normal  0.7121 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2316  hypothetical protein  57.33 
 
 
410 aa  444  1e-123  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1396  hypothetical protein  47.54 
 
 
402 aa  404  1e-111  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1503  hypothetical protein  51.26 
 
 
433 aa  399  9.999999999999999e-111  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2067  hypothetical protein  51.03 
 
 
415 aa  390  1e-107  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0791  HI0933 family protein  49.75 
 
 
408 aa  391  1e-107  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.371857 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5032  HI0933 family protein  46.45 
 
 
404 aa  364  2e-99  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0130  hypothetical protein  47.28 
 
 
405 aa  363  3e-99  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.700212  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07621  hypothetical protein  46.53 
 
 
407 aa  359  6e-98  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.0179283 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04960  hypothetical protein  44.17 
 
 
406 aa  357  1.9999999999999998e-97  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0017  hypothetical protein  44.47 
 
 
422 aa  353  2.9999999999999997e-96  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15361  flavoprotein  44.69 
 
 
411 aa  347  3e-94  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0647863  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5845  HI0933 family protein  44.33 
 
 
408 aa  345  6e-94  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.599184  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00161  hypothetical protein  46 
 
 
440 aa  342  5.999999999999999e-93  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1467  hypothetical protein  45.41 
 
 
415 aa  339  4e-92  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.196184  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15731  flavoprotein  44.78 
 
 
410 aa  335  5.999999999999999e-91  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15581  flavoprotein  44.42 
 
 
414 aa  333  2e-90  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.379962  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1282  hypothetical protein  45.32 
 
 
403 aa  333  4e-90  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.488791  normal  0.628895 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0017  hypothetical protein  44.87 
 
 
405 aa  330  4e-89  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0345  HI0933 family protein  43.69 
 
 
409 aa  311  9e-84  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_14937  predicted protein  40.38 
 
 
436 aa  275  1.0000000000000001e-72  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.723308  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2761  HI0933 family protein  33.97 
 
 
427 aa  209  6e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0708  FAD dependent oxidoreductase  33.58 
 
 
409 aa  207  2e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1752  hypothetical protein  34.15 
 
 
390 aa  199  1.0000000000000001e-49  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00572064  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4440  NAD(FAD)-utilizing dehydrogenase  32.93 
 
 
423 aa  196  5.000000000000001e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0621454  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4458  NAD(FAD)-utilizing dehydrogenase  32.93 
 
 
423 aa  196  5.000000000000001e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00549646  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4604  hypothetical protein  32.93 
 
 
423 aa  196  6e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00629914  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0030  HI0933 family protein  34.39 
 
 
412 aa  196  6e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4960  hypothetical protein  32.93 
 
 
423 aa  196  6e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.979568  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4539  hypothetical protein  32.7 
 
 
423 aa  196  6e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4825  conserved hypothetical protein TIGR00275  32.93 
 
 
423 aa  196  6e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4850  hypothetical protein  32.69 
 
 
423 aa  195  1e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.473198  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4843  conserved hypothetical protein TIGR00275  32.69 
 
 
423 aa  195  1e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000266049  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4820  conserved hypothetical protein TIGR00275  32.45 
 
 
423 aa  194  2e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0848463  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1567  hypothetical protein  34.89 
 
 
393 aa  194  2e-48  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0861  HI0933 family protein  31.97 
 
 
412 aa  194  3e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000883164  normal  0.741633 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0416  hypothetical protein TIGR00275  32.45 
 
 
423 aa  193  4e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0139426  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3399  HI0933 family protein  32.82 
 
 
419 aa  193  5e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000862547  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1601  hypothetical protein  33.89 
 
 
406 aa  192  1e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1810  hypothetical protein  31.34 
 
 
422 aa  189  7e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.261505  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1845  hypothetical protein  31.34 
 
 
422 aa  189  7e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1733  HI0933 family protein  32.37 
 
 
408 aa  189  8e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0672  HI0933 family protein  32.05 
 
 
436 aa  189  9e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3371  hypothetical protein  32.29 
 
 
426 aa  188  1e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000385799  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1339  hypothetical protein  31.08 
 
 
406 aa  187  3e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0646456  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1150  YhiN family flavoprotein  31.43 
 
 
406 aa  187  3e-46  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.823305  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2209  hypothetical protein  31.65 
 
 
430 aa  185  1.0000000000000001e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000224827  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2387  hypothetical protein  32.51 
 
 
410 aa  184  3e-45  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0908  HI0933 family protein  30.54 
 
 
426 aa  181  2e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0927  HI0933 family protein  31.96 
 
 
408 aa  179  1e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.1016 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1022  HI0933 family protein  29.16 
 
 
403 aa  177  4e-43  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1315  hypothetical protein  32.39 
 
 
420 aa  175  9.999999999999999e-43  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.476308  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2378  HI0933 family protein  30 
 
 
412 aa  174  2.9999999999999996e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.270996  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3901  hypothetical protein  31.25 
 
 
398 aa  173  5e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.150346  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3791  hypothetical protein  31.25 
 
 
398 aa  173  5e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0262  flavoprotein  31.28 
 
 
424 aa  173  5e-42  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000227955  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2135  hypothetical protein  31.12 
 
 
415 aa  173  5.999999999999999e-42  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00468248  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3781  hypothetical protein  31.01 
 
 
398 aa  172  7.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3962  hypothetical protein  31.01 
 
 
398 aa  172  9e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.327369  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3858  hypothetical protein  31.01 
 
 
398 aa  172  9e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00469108  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1437  hypothetical protein  30.4 
 
 
413 aa  171  3e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1798  hypothetical protein  31.4 
 
 
392 aa  167  4e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1476  HI0933 family protein  31.81 
 
 
413 aa  166  5e-40  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0825  HI0933 family protein  31.3 
 
 
414 aa  166  9e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.689631 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4328  hypothetical protein  32.28 
 
 
394 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0291  hypothetical protein  31.68 
 
 
408 aa  165  2.0000000000000002e-39  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1341  hypothetical protein  30.7 
 
 
393 aa  164  3e-39  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1122  hypothetical protein  31.14 
 
 
443 aa  164  3e-39  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.138213  normal  0.379331 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0044  hypothetical protein  31.71 
 
 
394 aa  164  3e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0051  hypothetical protein  32.28 
 
 
394 aa  164  4.0000000000000004e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  unclonable  0.0000135975 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0047  hypothetical protein  32.04 
 
 
394 aa  163  5.0000000000000005e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0051  HI0933 family protein  32.04 
 
 
394 aa  162  8.000000000000001e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.71818 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1561  hypothetical protein  28.6 
 
 
455 aa  162  9e-39  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1430  HI0933 family protein  31.45 
 
 
452 aa  162  1e-38  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.223271  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1209  HI0933 family protein  31.44 
 
 
443 aa  162  1e-38  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00892484 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4838  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  30.27 
 
 
400 aa  161  2e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0055  hypothetical protein  32.2 
 
 
394 aa  161  2e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000153695 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1378  hypothetical protein  30.83 
 
 
415 aa  161  2e-38  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.275116 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4466  hypothetical protein  29.93 
 
 
394 aa  160  3e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.119173 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0054  hypothetical protein  31.41 
 
 
396 aa  160  3e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3802  hypothetical protein  29.2 
 
 
394 aa  160  3e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4688  hypothetical protein  31.73 
 
 
413 aa  160  3e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4118  HI0933 family protein  30.35 
 
 
394 aa  160  3e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00166  predicted flavoprotein  30.6 
 
 
393 aa  160  3e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3781  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  30.27 
 
 
400 aa  159  6e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1349  hypothetical protein  29.23 
 
 
393 aa  159  6e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0047  hypothetical protein  31.46 
 
 
394 aa  159  6e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00322221 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3830  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  30.77 
 
 
400 aa  160  6e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0145  hypothetical protein  30.22 
 
 
394 aa  159  7e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0049  hypothetical protein  31.95 
 
 
394 aa  159  7e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000378391 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1025  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  27.56 
 
 
403 aa  159  8e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0617168  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0223  HI0933 family protein  30.51 
 
 
400 aa  159  1e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3931  HI0933 family protein  29.83 
 
 
397 aa  158  1e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2949  putative FAD dependent oxidoreductase  29.71 
 
 
401 aa  158  1e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1926  HI0933-like protein  29.95 
 
 
414 aa  158  1e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1197  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  27.56 
 
 
403 aa  159  1e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00144707  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>