More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_2605 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_2605  hypothetical protein  100 
 
 		 407 aa  838    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00291222  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1437  hypothetical protein  44.59 
 
 		 413 aa  335  7.999999999999999e-91  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4030  HI0933 family protein  43.93 
 
 		 414 aa  323  4e-87  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2635  YhiN family flavoprotein  42.01 
 
 		 414 aa  317  2e-85  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.457541  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2952  hypothetical protein  41.52 
 
 		 415 aa  316  6e-85  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00592847  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0825  HI0933 family protein  41.86 
 
 		 414 aa  310  4e-83  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.689631 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0627  HI0933 family protein  38.25 
 
 		 404 aa  293  3e-78  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000930463  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1076  HI0933 family protein  40.72 
 
 		 407 aa  270  5e-71  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0249257  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1018  HI0933 family protein  36.39 
 
 		 404 aa  259  6e-68  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0128  hypothetical protein  37.13 
 
 		 394 aa  254  1.0000000000000001e-66  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0603016  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0226  hypothetical protein  36.06 
 
 		 379 aa  234  3e-60  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0708  FAD dependent oxidoreductase  35.35 
 
 		 409 aa  234  3e-60  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_202  hypothetical protein  35.66 
 
 		 394 aa  231  1e-59  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1926  HI0933-like protein  33.33 
 
 		 414 aa  226  6e-58  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1505  HI0933 family protein  32.5 
 
 		 402 aa  225  1e-57  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000535325  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0927  HI0933 family protein  35.31 
 
 		 408 aa  225  1e-57  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.1016 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0754  HI0933-like protein  32.75 
 
 		 396 aa  221  9.999999999999999e-57  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.961432  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2209  hypothetical protein  33.09 
 
 		 430 aa  221  1.9999999999999999e-56  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000224827  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0187  HI0933 family protein  35.22 
 
 		 433 aa  221  1.9999999999999999e-56  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2135  hypothetical protein  34.2 
 
 		 415 aa  219  5e-56  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00468248  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1237  HI0933-like protein  32.27 
 
 		 412 aa  211  2e-53  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0262  flavoprotein  32.7 
 
 		 424 aa  211  2e-53  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000227955  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2761  HI0933 family protein  33.01 
 
 		 427 aa  209  7e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0908  HI0933 family protein  30.92 
 
 		 426 aa  209  7e-53  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1601  hypothetical protein  34 
 
 		 406 aa  208  1e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0662  hypothetical protein  32.36 
 
 		 392 aa  208  1e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0741866  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0698  hypothetical protein  31.71 
 
 		 409 aa  207  3e-52  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2378  HI0933 family protein  32.76 
 
 		 412 aa  206  7e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.270996  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07280  hypothetical protein  31.87 
 
 		 392 aa  205  1e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0672  HI0933 family protein  32.37 
 
 		 436 aa  203  4e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3399  HI0933 family protein  31.96 
 
 		 419 aa  202  6e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000862547  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0030  HI0933 family protein  32.51 
 
 		 412 aa  202  9e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0491  hypothetical protein  30.3 
 
 		 411 aa  202  9.999999999999999e-51  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1733  HI0933 family protein  31.93 
 
 		 408 aa  201  1.9999999999999998e-50  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1150  YhiN family flavoprotein  33.17 
 
 		 406 aa  201  1.9999999999999998e-50  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.823305  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1831  HI0933-like protein  32.03 
 
 		 402 aa  200  3e-50  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  decreased coverage  0.000611752  normal  0.363311 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1339  hypothetical protein  33.17 
 
 		 406 aa  200  3.9999999999999996e-50  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0646456  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1810  hypothetical protein  32.12 
 
 		 422 aa  199  7.999999999999999e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.261505  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1845  hypothetical protein  32.12 
 
 		 422 aa  199  7.999999999999999e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1899  HI0933 family protein  30.83 
 
 		 409 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.279809  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1197  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  32.84 
 
 		 403 aa  198  1.0000000000000001e-49  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00144707  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3274  hypothetical protein  30.15 
 
 		 396 aa  198  2.0000000000000003e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.142928  normal  0.877884 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1378  hypothetical protein  31.14 
 
 		 415 aa  198  2.0000000000000003e-49  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.275116 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1561  hypothetical protein  29.13 
 
 		 455 aa  197  2.0000000000000003e-49  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1025  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  32.84 
 
 		 403 aa  198  2.0000000000000003e-49  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0617168  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1315  hypothetical protein  32.93 
 
 		 420 aa  197  3e-49  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.476308  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1621  HI0933 family protein  31.45 
 
 		 394 aa  196  5.000000000000001e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0160754  normal  0.370908 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0064  hypothetical protein  30.43 
 
 		 397 aa  196  9e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0861  HI0933 family protein  32.22 
 
 		 412 aa  195  2e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000883164  normal  0.741633 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0156  hypothetical protein  30.47 
 
 		 392 aa  193  5e-48  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1349  hypothetical protein  30.79 
 
 		 393 aa  192  7e-48  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1007  hypothetical protein  31.28 
 
 		 389 aa  192  8e-48  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.775195  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00402  hypothetical protein  30.22 
 
 		 393 aa  192  8e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.96178  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1798  hypothetical protein  30.94 
 
 		 392 aa  192  1e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2050  hypothetical protein  34.65 
 
 		 419 aa  191  2e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000118961  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2949  putative FAD dependent oxidoreductase  30.32 
 
 		 401 aa  190  2.9999999999999997e-47  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4017  hypothetical protein  29.88 
 
 		 393 aa  191  2.9999999999999997e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2555  hypothetical protein  29.21 
 
 		 396 aa  190  4e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00730633  hitchhiker  0.0000156467 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4440  NAD(FAD)-utilizing dehydrogenase  32.13 
 
 		 423 aa  190  5e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0621454  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4458  NAD(FAD)-utilizing dehydrogenase  32.13 
 
 		 423 aa  190  5e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00549646  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4825  conserved hypothetical protein TIGR00275  32.13 
 
 		 423 aa  189  5.999999999999999e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4604  hypothetical protein  32.13 
 
 		 423 aa  189  5.999999999999999e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00629914  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4960  hypothetical protein  32.13 
 
 		 423 aa  189  5.999999999999999e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.979568  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4843  conserved hypothetical protein TIGR00275  32.13 
 
 		 423 aa  189  5.999999999999999e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000266049  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2451  hypothetical protein  29.41 
 
 		 446 aa  189  7e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000138411  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4820  conserved hypothetical protein TIGR00275  32.13 
 
 		 423 aa  189  7e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0848463  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1530  hypothetical protein  32.42 
 
 		 391 aa  189  7e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1392  hypothetical protein  30.54 
 
 		 393 aa  189  8e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.574952  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0183  hypothetical protein  29.02 
 
 		 438 aa  189  9e-47  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.18446 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2623  hypothetical protein  30.53 
 
 		 393 aa  189  9e-47  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4850  hypothetical protein  32.13 
 
 		 423 aa  189  1e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.473198  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1567  hypothetical protein  31.7 
 
 		 393 aa  188  1e-46  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3945  hypothetical protein  29.73 
 
 		 405 aa  188  1e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0291  hypothetical protein  31.22 
 
 		 408 aa  188  2e-46  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1282  HI0933 family protein  31.59 
 
 		 457 aa  188  2e-46  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.138775  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2387  hypothetical protein  32.43 
 
 		 410 aa  187  2e-46  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0416  hypothetical protein TIGR00275  32.13 
 
 		 423 aa  188  2e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0139426  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28030  HI0933-like protein  30.99 
 
 		 411 aa  187  2e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3371  hypothetical protein  32.14 
 
 		 426 aa  187  3e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000385799  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0051  hypothetical protein  28.09 
 
 		 394 aa  187  4e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000135975 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1707  HI0933-like protein  30.22 
 
 		 399 aa  187  4e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.105129 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4328  hypothetical protein  28.09 
 
 		 394 aa  186  5e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0145  hypothetical protein  28.71 
 
 		 394 aa  186  6e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0202  HI0933-like protein  27.13 
 
 		 433 aa  186  6e-46  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.309698  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1725  hypothetical protein  29.66 
 
 		 397 aa  186  9e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.685186 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001943  NAD(FAD)-utilizing dehydrogenase  29.47 
 
 		 397 aa  185  1.0000000000000001e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0051  HI0933 family protein  27.85 
 
 		 394 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.71818 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0047  hypothetical protein  27.85 
 
 		 394 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4539  hypothetical protein  31.88 
 
 		 423 aa  185  2.0000000000000003e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2434  hypothetical protein  30.88 
 
 		 398 aa  184  2.0000000000000003e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00536  oxidoreductase  29.34 
 
 		 397 aa  184  2.0000000000000003e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3858  hypothetical protein  29.17 
 
 		 398 aa  184  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00469108  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0413  HI0933-like protein  29.2 
 
 		 392 aa  184  2.0000000000000003e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0650019  normal  0.0294705 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0375  HI0933-like protein  29.98 
 
 		 393 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5249  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein-like  29.78 
 
 		 392 aa  184  3e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3962  hypothetical protein  29.58 
 
 		 398 aa  184  3e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.327369  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00166  predicted flavoprotein  28.85 
 
 		 393 aa  184  3e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0044  hypothetical protein  27.74 
 
 		 394 aa  183  5.0000000000000004e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4032  hypothetical protein  29.44 
 
 		 398 aa  182  6e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3901  hypothetical protein  29.17 
 
 		 398 aa  182  7e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.150346  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>