More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_1378 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009712  Mboo_1378  hypothetical protein  100 
 
 
415 aa  837    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.275116 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0927  HI0933 family protein  52.58 
 
 
408 aa  408  1.0000000000000001e-112  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.1016 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2387  hypothetical protein  51.04 
 
 
410 aa  395  1e-108  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1926  HI0933-like protein  47.41 
 
 
414 aa  385  1e-106  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0291  hypothetical protein  47.91 
 
 
408 aa  378  1e-103  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1845  hypothetical protein  38.14 
 
 
422 aa  265  8.999999999999999e-70  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1810  hypothetical protein  38.14 
 
 
422 aa  265  8.999999999999999e-70  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.261505  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0708  FAD dependent oxidoreductase  37.81 
 
 
409 aa  265  1e-69  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2135  hypothetical protein  38.08 
 
 
415 aa  253  6e-66  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00468248  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0030  HI0933 family protein  38.75 
 
 
412 aa  249  4e-65  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1315  hypothetical protein  35.78 
 
 
420 aa  244  1.9999999999999999e-63  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.476308  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2050  hypothetical protein  38.48 
 
 
419 aa  240  2.9999999999999997e-62  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000118961  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2209  hypothetical protein  34.96 
 
 
430 aa  236  6e-61  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000224827  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1150  YhiN family flavoprotein  34.07 
 
 
406 aa  233  4.0000000000000004e-60  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.823305  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3399  HI0933 family protein  34.99 
 
 
419 aa  233  6e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000862547  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1601  hypothetical protein  35.09 
 
 
406 aa  231  1e-59  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1339  hypothetical protein  33.83 
 
 
406 aa  232  1e-59  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0646456  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1122  hypothetical protein  37.69 
 
 
443 aa  227  2e-58  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.138213  normal  0.379331 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0672  HI0933 family protein  35.59 
 
 
436 aa  227  3e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2761  HI0933 family protein  34.88 
 
 
427 aa  227  3e-58  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0861  HI0933 family protein  34.98 
 
 
412 aa  226  4e-58  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000883164  normal  0.741633 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1567  hypothetical protein  36.41 
 
 
393 aa  226  6e-58  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1733  HI0933 family protein  34.16 
 
 
408 aa  225  1e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4440  NAD(FAD)-utilizing dehydrogenase  34.67 
 
 
423 aa  224  2e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0621454  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4458  NAD(FAD)-utilizing dehydrogenase  34.67 
 
 
423 aa  224  2e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00549646  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1561  hypothetical protein  35.24 
 
 
455 aa  224  2e-57  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4820  conserved hypothetical protein TIGR00275  34.67 
 
 
423 aa  224  3e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0848463  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0416  hypothetical protein TIGR00275  34.2 
 
 
423 aa  224  3e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0139426  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4604  hypothetical protein  34.67 
 
 
423 aa  223  4e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00629914  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4960  hypothetical protein  34.67 
 
 
423 aa  223  4e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.979568  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4825  conserved hypothetical protein TIGR00275  34.67 
 
 
423 aa  223  4e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0187  HI0933 family protein  35.8 
 
 
433 aa  223  6e-57  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4539  hypothetical protein  34.43 
 
 
423 aa  222  7e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1025  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  31.2 
 
 
403 aa  222  8e-57  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0617168  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4843  conserved hypothetical protein TIGR00275  34.43 
 
 
423 aa  222  9e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000266049  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4850  hypothetical protein  34.43 
 
 
423 aa  222  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.473198  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2378  HI0933 family protein  34.07 
 
 
412 aa  221  9.999999999999999e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.270996  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1437  hypothetical protein  35.62 
 
 
413 aa  221  1.9999999999999999e-56  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1430  HI0933 family protein  36.34 
 
 
452 aa  220  3e-56  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.223271  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1197  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  31.2 
 
 
403 aa  221  3e-56  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00144707  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1282  HI0933 family protein  37.91 
 
 
457 aa  219  5e-56  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.138775  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1752  hypothetical protein  35.41 
 
 
390 aa  218  2e-55  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00572064  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0262  flavoprotein  33.9 
 
 
424 aa  216  5.9999999999999996e-55  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000227955  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1237  HI0933-like protein  32.02 
 
 
412 aa  215  9e-55  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0195  hypothetical protein  34.41 
 
 
435 aa  213  4.9999999999999996e-54  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0437859  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0908  HI0933 family protein  35.53 
 
 
426 aa  213  4.9999999999999996e-54  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3371  hypothetical protein  34.79 
 
 
426 aa  213  5.999999999999999e-54  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000385799  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_183  hypothetical protein  33.42 
 
 
435 aa  211  2e-53  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.277985  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0158  hypothetical protein  32.84 
 
 
435 aa  209  5e-53  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1052  hypothetical protein  32.76 
 
 
442 aa  207  3e-52  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.843089  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1209  HI0933 family protein  36.72 
 
 
443 aa  207  3e-52  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00892484 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1022  HI0933 family protein  32.76 
 
 
403 aa  205  1e-51  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2949  putative FAD dependent oxidoreductase  33.25 
 
 
401 aa  205  1e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3520  HI0933 family protein  33.67 
 
 
408 aa  202  8e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2451  hypothetical protein  30.79 
 
 
446 aa  199  7e-50  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000138411  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4030  HI0933 family protein  32.65 
 
 
414 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2605  hypothetical protein  31.14 
 
 
407 aa  198  2.0000000000000003e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00291222  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3274  hypothetical protein  35.57 
 
 
396 aa  197  2.0000000000000003e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.142928  normal  0.877884 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4032  hypothetical protein  33.58 
 
 
398 aa  196  5.000000000000001e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1476  HI0933 family protein  35.48 
 
 
413 aa  195  1e-48  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1513  hypothetical protein  35.28 
 
 
392 aa  195  1e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.86402  normal  0.0796345 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0825  HI0933 family protein  33.16 
 
 
414 aa  194  3e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.689631 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0123  hypothetical protein  33.33 
 
 
460 aa  194  3e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.291133  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4094  hypothetical protein  33.33 
 
 
460 aa  193  6e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2183  hypothetical protein  33.82 
 
 
396 aa  192  6e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.286863 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1463  hypothetical protein  35.31 
 
 
392 aa  192  7e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.261664  normal  0.428497 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00536  oxidoreductase  31.94 
 
 
397 aa  192  1e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3858  hypothetical protein  31.7 
 
 
398 aa  191  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00469108  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1899  HI0933 family protein  34.07 
 
 
409 aa  191  1e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.279809  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5845  HI0933 family protein  32.04 
 
 
408 aa  192  1e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.599184  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2832  flavoprotein  35.31 
 
 
392 aa  191  2e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.838235  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1349  hypothetical protein  34.07 
 
 
393 aa  191  2e-47  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4118  HI0933 family protein  31.86 
 
 
394 aa  191  2e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2316  hypothetical protein  33.16 
 
 
410 aa  191  2e-47  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3791  hypothetical protein  31.7 
 
 
398 aa  190  2.9999999999999997e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3901  hypothetical protein  31.7 
 
 
398 aa  190  2.9999999999999997e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.150346  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2547  hypothetical protein  33.99 
 
 
394 aa  190  4e-47  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.374165  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001943  NAD(FAD)-utilizing dehydrogenase  31.7 
 
 
397 aa  190  4e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3781  hypothetical protein  31.7 
 
 
398 aa  190  5e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3962  hypothetical protein  31.7 
 
 
398 aa  189  7e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.327369  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1798  hypothetical protein  33.17 
 
 
392 aa  189  8e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1392  hypothetical protein  33.82 
 
 
393 aa  188  1e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.574952  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4688  hypothetical protein  32.33 
 
 
413 aa  189  1e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1707  HI0933-like protein  34.4 
 
 
399 aa  188  1e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.105129 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0156  hypothetical protein  33.9 
 
 
392 aa  186  8e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0303  hypothetical protein  33.42 
 
 
394 aa  186  9e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.918662  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0627  HI0933 family protein  29.03 
 
 
404 aa  185  1.0000000000000001e-45  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000930463  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4204  HI0933 family protein  32.76 
 
 
399 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2364  hypothetical protein  33.98 
 
 
406 aa  185  2.0000000000000003e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.709721  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2623  hypothetical protein  33.01 
 
 
393 aa  184  3e-45  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4953  hypothetical protein  34.44 
 
 
393 aa  183  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.683781  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3931  HI0933 family protein  32.35 
 
 
397 aa  183  6e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3945  hypothetical protein  33.33 
 
 
405 aa  182  8.000000000000001e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4826  hypothetical protein  34.44 
 
 
393 aa  182  9.000000000000001e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.270305  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1308  HI0933 family protein  32.68 
 
 
426 aa  182  1e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0313133  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0791  HI0933 family protein  33.17 
 
 
408 aa  182  1e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.371857 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28030  HI0933-like protein  33.66 
 
 
411 aa  182  1e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3906  hypothetical protein  32.24 
 
 
397 aa  182  1e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0662  hypothetical protein  32.67 
 
 
392 aa  181  2e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0741866  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2067  hypothetical protein  33.17 
 
 
415 aa  181  2e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>