More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_0791 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_0791  HI0933 family protein  100 
 
 
408 aa  837    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.371857 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5032  HI0933 family protein  61.39 
 
 
404 aa  518  1e-146  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5845  HI0933 family protein  51.36 
 
 
408 aa  441  9.999999999999999e-123  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.599184  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1396  hypothetical protein  49.01 
 
 
402 aa  412  1e-114  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1282  hypothetical protein  50.86 
 
 
403 aa  408  1.0000000000000001e-112  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.488791  normal  0.628895 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3520  HI0933 family protein  51.15 
 
 
408 aa  390  1e-107  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2502  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein-like  47.95 
 
 
413 aa  385  1e-105  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.472711  normal  0.7121 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1597  HI0933 family protein  49.88 
 
 
409 aa  382  1e-105  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.168995 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1574  HI0933 family protein  49.63 
 
 
409 aa  382  1e-105  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3929  HI0933-like protein  48.7 
 
 
413 aa  365  1e-99  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00246834 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04960  hypothetical protein  45.48 
 
 
406 aa  359  5e-98  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0345  HI0933 family protein  46.23 
 
 
409 aa  349  4e-95  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2316  hypothetical protein  48.42 
 
 
410 aa  348  9e-95  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2067  hypothetical protein  47.89 
 
 
415 aa  345  1e-93  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0130  hypothetical protein  43.32 
 
 
405 aa  335  7e-91  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.700212  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07621  hypothetical protein  43.07 
 
 
407 aa  333  3e-90  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.0179283 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1503  hypothetical protein  45.34 
 
 
433 aa  332  6e-90  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0017  hypothetical protein  42.16 
 
 
422 aa  328  2.0000000000000001e-88  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1467  hypothetical protein  40.05 
 
 
415 aa  318  1e-85  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.196184  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15731  flavoprotein  40.88 
 
 
410 aa  315  9.999999999999999e-85  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15361  flavoprotein  39.66 
 
 
411 aa  314  9.999999999999999e-85  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0647863  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0017  hypothetical protein  43.26 
 
 
405 aa  312  5.999999999999999e-84  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15581  flavoprotein  39.42 
 
 
414 aa  310  2.9999999999999997e-83  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.379962  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00161  hypothetical protein  43.38 
 
 
440 aa  305  7e-82  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_14937  predicted protein  39.42 
 
 
436 aa  251  2e-65  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.723308  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0672  HI0933 family protein  32 
 
 
436 aa  209  6e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1845  hypothetical protein  33.41 
 
 
422 aa  209  7e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1810  hypothetical protein  33.41 
 
 
422 aa  209  7e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.261505  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4440  NAD(FAD)-utilizing dehydrogenase  32.94 
 
 
423 aa  206  8e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0621454  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4458  NAD(FAD)-utilizing dehydrogenase  32.94 
 
 
423 aa  206  8e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00549646  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4850  hypothetical protein  32.94 
 
 
423 aa  206  9e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.473198  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4843  conserved hypothetical protein TIGR00275  32.94 
 
 
423 aa  205  9e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000266049  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4604  hypothetical protein  32.94 
 
 
423 aa  205  1e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00629914  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4960  hypothetical protein  32.94 
 
 
423 aa  205  1e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.979568  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4825  conserved hypothetical protein TIGR00275  32.94 
 
 
423 aa  205  1e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4820  conserved hypothetical protein TIGR00275  32.7 
 
 
423 aa  205  1e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0848463  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0416  hypothetical protein TIGR00275  32.7 
 
 
423 aa  204  2e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0139426  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0291  hypothetical protein  35.06 
 
 
408 aa  204  2e-51  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4539  hypothetical protein  32.47 
 
 
423 aa  203  4e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3371  hypothetical protein  31.99 
 
 
426 aa  202  7e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000385799  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2761  HI0933 family protein  31.43 
 
 
427 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0861  HI0933 family protein  31.96 
 
 
412 aa  198  1.0000000000000001e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000883164  normal  0.741633 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0030  HI0933 family protein  33.17 
 
 
412 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1567  hypothetical protein  33.5 
 
 
393 aa  198  2.0000000000000003e-49  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1601  hypothetical protein  32.82 
 
 
406 aa  196  5.000000000000001e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1926  HI0933-like protein  31.48 
 
 
414 aa  188  2e-46  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0927  HI0933 family protein  33.33 
 
 
408 aa  188  2e-46  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.1016 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1752  hypothetical protein  31.13 
 
 
390 aa  187  4e-46  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00572064  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2135  hypothetical protein  32.3 
 
 
415 aa  187  4e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00468248  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0262  flavoprotein  32.06 
 
 
424 aa  186  6e-46  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000227955  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0708  FAD dependent oxidoreductase  31.72 
 
 
409 aa  186  8e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1315  hypothetical protein  31.67 
 
 
420 aa  184  3e-45  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.476308  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1378  hypothetical protein  33.17 
 
 
415 aa  182  1e-44  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.275116 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1437  hypothetical protein  30.75 
 
 
413 aa  179  5.999999999999999e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2209  hypothetical protein  30.68 
 
 
430 aa  177  4e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000224827  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0908  HI0933 family protein  32.52 
 
 
426 aa  176  9e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2387  hypothetical protein  32.37 
 
 
410 aa  173  5e-42  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3399  HI0933 family protein  30.9 
 
 
419 aa  172  1e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000862547  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1025  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  27.54 
 
 
403 aa  171  2e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0617168  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1339  hypothetical protein  29.61 
 
 
406 aa  170  3e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0646456  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1150  YhiN family flavoprotein  29.61 
 
 
406 aa  171  3e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.823305  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1197  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  27.29 
 
 
403 aa  170  5e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00144707  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1052  hypothetical protein  28.57 
 
 
442 aa  168  1e-40  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.843089  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4030  HI0933 family protein  31.63 
 
 
414 aa  169  1e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1430  HI0933 family protein  31.78 
 
 
452 aa  167  2.9999999999999998e-40  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.223271  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1022  HI0933 family protein  28.12 
 
 
403 aa  165  1.0000000000000001e-39  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1798  hypothetical protein  31.96 
 
 
392 aa  165  2.0000000000000002e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0825  HI0933 family protein  29.56 
 
 
414 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.689631 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1733  HI0933 family protein  30.41 
 
 
408 aa  164  2.0000000000000002e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1561  hypothetical protein  28.15 
 
 
455 aa  162  1e-38  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1349  hypothetical protein  30.02 
 
 
393 aa  161  2e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2378  HI0933 family protein  29.06 
 
 
412 aa  160  3e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.270996  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2364  hypothetical protein  32.62 
 
 
406 aa  160  4e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.709721  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2605  hypothetical protein  29.69 
 
 
407 aa  158  1e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00291222  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2451  hypothetical protein  28.74 
 
 
446 aa  158  1e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000138411  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1076  HI0933 family protein  28.17 
 
 
407 aa  157  3e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0249257  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2623  hypothetical protein  31.33 
 
 
393 aa  156  6e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0754  HI0933-like protein  27.01 
 
 
396 aa  155  9e-37  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.961432  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1392  hypothetical protein  29.78 
 
 
393 aa  155  1e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.574952  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0187  HI0933 family protein  31.57 
 
 
433 aa  154  2.9999999999999998e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1282  HI0933 family protein  29.13 
 
 
457 aa  153  4e-36  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.138775  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2547  hypothetical protein  32.54 
 
 
394 aa  153  7e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.374165  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0627  HI0933 family protein  26.85 
 
 
404 aa  151  2e-35  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000930463  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1209  HI0933 family protein  29.72 
 
 
443 aa  150  5e-35  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00892484 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1122  hypothetical protein  29.17 
 
 
443 aa  150  6e-35  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.138213  normal  0.379331 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2335  HI0933 family protein  31.34 
 
 
413 aa  149  7e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00707215  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2846  hypothetical protein  31.65 
 
 
413 aa  149  8e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1476  HI0933 family protein  29.92 
 
 
413 aa  148  2.0000000000000003e-34  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0049  hypothetical protein  29.67 
 
 
394 aa  147  3e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000378391 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0055  hypothetical protein  28.78 
 
 
394 aa  147  4.0000000000000006e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000153695 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0047  hypothetical protein  29.67 
 
 
394 aa  147  4.0000000000000006e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00322221 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0054  hypothetical protein  28.33 
 
 
396 aa  147  5e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1707  HI0933-like protein  30.27 
 
 
399 aa  146  7.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.105129 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1341  hypothetical protein  29.54 
 
 
393 aa  145  9e-34  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2635  YhiN family flavoprotein  26.7 
 
 
414 aa  145  1e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.457541  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0303  hypothetical protein  29.34 
 
 
394 aa  145  2e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.918662  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4466  hypothetical protein  28.3 
 
 
394 aa  144  2e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.119173 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1232  hypothetical protein  31.53 
 
 
402 aa  144  3e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0902529  normal  0.743867 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1237  HI0933-like protein  25.39 
 
 
412 aa  144  3e-33  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0044  hypothetical protein  28.95 
 
 
394 aa  144  3e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>