292 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_1232 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_1232  hypothetical protein  100 
 
 		 402 aa  793    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0902529  normal  0.743867 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1513  hypothetical protein  59.6 
 
 		 392 aa  449  1e-125  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.86402  normal  0.0796345 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2183  hypothetical protein  58.27 
 
 		 396 aa  451  1e-125  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.286863 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1798  hypothetical protein  56 
 
 		 392 aa  447  1.0000000000000001e-124  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2832  flavoprotein  58.85 
 
 		 392 aa  442  1e-123  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.838235  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1463  hypothetical protein  58.85 
 
 		 392 aa  442  1e-123  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.261664  normal  0.428497 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3274  hypothetical protein  58.84 
 
 		 396 aa  439  9.999999999999999e-123  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.142928  normal  0.877884 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0366  HI0933 family protein  59.2 
 
 		 406 aa  440  9.999999999999999e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.128737 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0398  HI0933 family protein  59.15 
 
 		 406 aa  437  1e-121  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00801709 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1349  hypothetical protein  56.68 
 
 		 393 aa  437  1e-121  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1392  hypothetical protein  56.19 
 
 		 393 aa  432  1e-120  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.574952  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0303  hypothetical protein  56 
 
 		 394 aa  432  1e-120  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.918662  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0801  hypothetical protein  58.51 
 
 		 395 aa  426  1e-118  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1707  HI0933-like protein  54.91 
 
 		 399 aa  412  1e-114  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.105129 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0680  HI0933-like protein  56.27 
 
 		 394 aa  407  1.0000000000000001e-112  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.192167 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2623  hypothetical protein  54.75 
 
 		 393 aa  406  1.0000000000000001e-112  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3931  HI0933 family protein  52.12 
 
 		 397 aa  396  1e-109  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4118  HI0933 family protein  50.62 
 
 		 394 aa  394  1e-108  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3858  hypothetical protein  50 
 
 		 398 aa  385  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00469108  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4204  HI0933 family protein  49.25 
 
 		 399 aa  383  1e-105  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4032  hypothetical protein  48.88 
 
 		 398 aa  382  1e-105  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2680  hypothetical protein  46.52 
 
 		 393 aa  384  1e-105  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2552  hypothetical protein  46.02 
 
 		 393 aa  383  1e-105  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0123  hypothetical protein  48.64 
 
 		 460 aa  381  1e-104  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.291133  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3962  hypothetical protein  49.51 
 
 		 398 aa  379  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.327369  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1831  HI0933-like protein  53.65 
 
 		 402 aa  380  1e-104  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  decreased coverage  0.000611752  normal  0.363311 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0375  HI0933-like protein  47.13 
 
 		 393 aa  379  1e-104  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3791  hypothetical protein  49.75 
 
 		 398 aa  381  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3781  hypothetical protein  49.75 
 
 		 398 aa  381  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4487  HI0933 family protein  49.75 
 
 		 399 aa  379  1e-104  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3901  hypothetical protein  49.75 
 
 		 398 aa  381  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.150346  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2364  hypothetical protein  49.88 
 
 		 406 aa  380  1e-104  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.709721  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4094  hypothetical protein  48.64 
 
 		 460 aa  379  1e-104  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3945  hypothetical protein  50.74 
 
 		 405 aa  376  1e-103  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2335  HI0933 family protein  50.6 
 
 		 413 aa  375  1e-103  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00707215  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2097  hypothetical protein  50.48 
 
 		 419 aa  375  1e-103  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.234168  normal  0.897923 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1238  hypothetical protein  52.88 
 
 		 414 aa  378  1e-103  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2846  hypothetical protein  50.84 
 
 		 413 aa  375  1e-102  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00166  predicted flavoprotein  46.13 
 
 		 393 aa  372  1e-102  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2949  putative FAD dependent oxidoreductase  45.09 
 
 		 401 aa  368  1e-101  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1441  HI0933-like protein  50.25 
 
 		 394 aa  371  1e-101  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2099  hypothetical protein  48.85 
 
 		 396 aa  370  1e-101  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2434  hypothetical protein  47.22 
 
 		 398 aa  371  1e-101  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3802  hypothetical protein  47.76 
 
 		 394 aa  365  1e-100  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0064  hypothetical protein  48.1 
 
 		 397 aa  368  1e-100  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0499  HI0933 family protein  55.05 
 
 		 398 aa  367  1e-100  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0205832 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4688  hypothetical protein  47.84 
 
 		 413 aa  366  1e-100  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0145  hypothetical protein  45.39 
 
 		 394 aa  365  1e-99  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4017  hypothetical protein  47.26 
 
 		 393 aa  363  2e-99  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0044  hypothetical protein  47.76 
 
 		 394 aa  362  5.0000000000000005e-99  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0885  hypothetical protein  53.78 
 
 		 416 aa  362  5.0000000000000005e-99  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0047  hypothetical protein  48.01 
 
 		 394 aa  362  9e-99  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0599  HI0933 family protein  47.88 
 
 		 392 aa  361  1e-98  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.623073 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3800  hypothetical protein  52.78 
 
 		 391 aa  360  2e-98  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.225042  normal  0.0906126 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4328  hypothetical protein  48.01 
 
 		 394 aa  361  2e-98  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5249  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein-like  46.63 
 
 		 392 aa  360  3e-98  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0047  hypothetical protein  47.51 
 
 		 394 aa  360  3e-98  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00322221 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0055  hypothetical protein  47.76 
 
 		 394 aa  360  3e-98  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000153695 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0156  hypothetical protein  48.87 
 
 		 392 aa  359  4e-98  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0051  HI0933 family protein  47.76 
 
 		 394 aa  359  4e-98  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.71818 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2884  HI0933-like protein  47.84 
 
 		 414 aa  359  4e-98  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0051  hypothetical protein  47.76 
 
 		 394 aa  359  5e-98  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000135975 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1400  hypothetical protein  49.03 
 
 		 415 aa  358  9.999999999999999e-98  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.615162  normal  0.401096 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4953  hypothetical protein  48.46 
 
 		 393 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.683781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4466  hypothetical protein  46.52 
 
 		 394 aa  357  1.9999999999999998e-97  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.119173 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0049  hypothetical protein  47.51 
 
 		 394 aa  357  1.9999999999999998e-97  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000378391 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00536  oxidoreductase  45.25 
 
 		 397 aa  357  2.9999999999999997e-97  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5002  hypothetical protein  47.81 
 
 		 393 aa  356  3.9999999999999996e-97  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.32275  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0515  hypothetical protein  46.65 
 
 		 392 aa  356  3.9999999999999996e-97  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001943  NAD(FAD)-utilizing dehydrogenase  45.75 
 
 		 397 aa  356  3.9999999999999996e-97  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4873  hypothetical protein  45.77 
 
 		 394 aa  356  5e-97  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0623  hypothetical protein  42.75 
 
 		 428 aa  356  5e-97  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.228803 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4826  hypothetical protein  47.81 
 
 		 393 aa  355  5e-97  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.270305  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3830  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  47.89 
 
 		 400 aa  355  8.999999999999999e-97  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0223  HI0933 family protein  47.89 
 
 		 400 aa  354  1e-96  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4817  hypothetical protein  52.83 
 
 		 406 aa  355  1e-96  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.571028  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0335  hypothetical protein  53.14 
 
 		 407 aa  354  1e-96  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0368  FAD-dependent oxidoreductase  53.14 
 
 		 407 aa  354  1e-96  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0837  hypothetical protein  53.14 
 
 		 407 aa  354  1e-96  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2388  FAD-dependent oxidoreductase  53.14 
 
 		 407 aa  354  1e-96  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.396449  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1516  hypothetical protein  53.14 
 
 		 407 aa  354  1e-96  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.631373  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3906  hypothetical protein  48.06 
 
 		 397 aa  355  1e-96  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1709  hypothetical protein  53.14 
 
 		 407 aa  354  1e-96  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3781  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  47.64 
 
 		 400 aa  353  2e-96  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28030  HI0933-like protein  48.99 
 
 		 411 aa  354  2e-96  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2530  FAD-dependent oxidoreductase  53.16 
 
 		 407 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4838  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  47.64 
 
 		 400 aa  353  2.9999999999999997e-96  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03341  predicted oxidoreductase with FAD/NAD(P)-binding domain  47.64 
 
 		 400 aa  353  4e-96  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.542782  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0054  hypothetical protein  47.01 
 
 		 396 aa  353  4e-96  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0224  hypothetical protein  47.64 
 
 		 400 aa  353  4e-96  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3283  HI0933-like protein  47.6 
 
 		 416 aa  352  4e-96  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0413  HI0933-like protein  50 
 
 		 392 aa  352  4e-96  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0650019  normal  0.0294705 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3691  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  47.64 
 
 		 400 aa  353  4e-96  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3974  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  47.64 
 
 		 400 aa  353  4e-96  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03294  hypothetical protein  47.64 
 
 		 400 aa  353  4e-96  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.555868  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2208  hypothetical protein  51.05 
 
 		 406 aa  352  8.999999999999999e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0476  hypothetical protein  47.26 
 
 		 394 aa  351  1e-95  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.900431  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2824  HI0933-like protein  49.34 
 
 		 405 aa  350  2e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4483  HI0933-like protein  51.75 
 
 		 406 aa  350  2e-95  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3882  hypothetical protein  51.75 
 
 		 406 aa  350  2e-95  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.151985 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>