More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_0801 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_0801  hypothetical protein  100 
 
 		 395 aa  806    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0398  HI0933 family protein  75.13 
 
 		 406 aa  592  1e-168  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00801709 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0366  HI0933 family protein  73.91 
 
 		 406 aa  583  1.0000000000000001e-165  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.128737 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0303  hypothetical protein  67.01 
 
 		 394 aa  550  1e-155  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.918662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1798  hypothetical protein  66.07 
 
 		 392 aa  542  1e-153  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1349  hypothetical protein  66.92 
 
 		 393 aa  539  9.999999999999999e-153  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1392  hypothetical protein  66.41 
 
 		 393 aa  533  1e-150  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.574952  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2623  hypothetical protein  63.71 
 
 		 393 aa  521  1e-146  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2183  hypothetical protein  64.45 
 
 		 396 aa  509  1e-143  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.286863 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3274  hypothetical protein  61.56 
 
 		 396 aa  476  1e-133  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.142928  normal  0.877884 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1707  HI0933-like protein  59.69 
 
 		 399 aa  466  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.105129 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00166  predicted flavoprotein  58.03 
 
 		 393 aa  464  1e-129  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2680  hypothetical protein  55.78 
 
 		 393 aa  460  9.999999999999999e-129  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2552  hypothetical protein  55.53 
 
 		 393 aa  459  9.999999999999999e-129  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2832  flavoprotein  57.95 
 
 		 392 aa  459  9.999999999999999e-129  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.838235  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1513  hypothetical protein  58.21 
 
 		 392 aa  458  1e-127  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.86402  normal  0.0796345 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1463  hypothetical protein  57.69 
 
 		 392 aa  456  1e-127  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.261664  normal  0.428497 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0064  hypothetical protein  55.05 
 
 		 397 aa  442  1e-123  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2099  hypothetical protein  55.58 
 
 		 396 aa  444  1e-123  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0680  HI0933-like protein  59.73 
 
 		 394 aa  442  1e-123  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.192167 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00536  oxidoreductase  54.82 
 
 		 397 aa  442  1e-123  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0623  hypothetical protein  52.51 
 
 		 428 aa  439  9.999999999999999e-123  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.228803 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0375  HI0933-like protein  55.53 
 
 		 393 aa  438  9.999999999999999e-123  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1621  HI0933 family protein  55.81 
 
 		 394 aa  435  1e-121  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0160754  normal  0.370908 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2434  hypothetical protein  54.96 
 
 		 398 aa  436  1e-121  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001943  NAD(FAD)-utilizing dehydrogenase  54.57 
 
 		 397 aa  434  1e-120  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3802  hypothetical protein  54.85 
 
 		 394 aa  432  1e-120  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00402  hypothetical protein  54.71 
 
 		 393 aa  432  1e-120  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.96178  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2547  hypothetical protein  55.64 
 
 		 394 aa  429  1e-119  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.374165  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0599  HI0933 family protein  55.21 
 
 		 392 aa  431  1e-119  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.623073 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4017  hypothetical protein  54.48 
 
 		 393 aa  431  1e-119  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0515  hypothetical protein  53.87 
 
 		 392 aa  427  1e-118  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5249  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein-like  53.21 
 
 		 392 aa  425  1e-118  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3931  HI0933 family protein  55.61 
 
 		 397 aa  425  1e-118  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3800  hypothetical protein  57.29 
 
 		 391 aa  422  1e-117  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.225042  normal  0.0906126 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4688  hypothetical protein  53.77 
 
 		 413 aa  424  1e-117  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0123  hypothetical protein  52.66 
 
 		 460 aa  422  1e-117  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.291133  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0044  hypothetical protein  54.87 
 
 		 394 aa  422  1e-117  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1860  HI0933-like protein  58.22 
 
 		 381 aa  422  1e-117  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.479593  normal  0.0118098 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1232  hypothetical protein  57.22 
 
 		 402 aa  424  1e-117  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0902529  normal  0.743867 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1441  HI0933-like protein  54.2 
 
 		 394 aa  423  1e-117  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4118  HI0933 family protein  53.57 
 
 		 394 aa  422  1e-117  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1725  hypothetical protein  54.81 
 
 		 397 aa  422  1e-117  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.685186 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4487  HI0933 family protein  53.87 
 
 		 399 aa  419  1e-116  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4328  hypothetical protein  54.34 
 
 		 394 aa  418  1e-116  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0145  hypothetical protein  51.15 
 
 		 394 aa  421  1e-116  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4032  hypothetical protein  52.66 
 
 		 398 aa  421  1e-116  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0051  hypothetical protein  54.34 
 
 		 394 aa  418  1e-116  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000135975 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4094  hypothetical protein  52.41 
 
 		 460 aa  419  1e-116  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3858  hypothetical protein  52.05 
 
 		 398 aa  416  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00469108  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3901  hypothetical protein  52.31 
 
 		 398 aa  416  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.150346  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4204  HI0933 family protein  53.55 
 
 		 399 aa  417  9.999999999999999e-116  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0051  HI0933 family protein  54.08 
 
 		 394 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.71818 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2710  hypothetical protein  60.87 
 
 		 401 aa  415  9.999999999999999e-116  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3791  hypothetical protein  52.31 
 
 		 398 aa  416  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0047  hypothetical protein  54.08 
 
 		 394 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3781  hypothetical protein  52.31 
 
 		 398 aa  416  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5002  hypothetical protein  53.85 
 
 		 393 aa  415  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.32275  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0049  hypothetical protein  54.36 
 
 		 394 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000378391 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0047  hypothetical protein  54.36 
 
 		 394 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00322221 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0055  hypothetical protein  54.08 
 
 		 394 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000153695 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07280  hypothetical protein  52.07 
 
 		 392 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4826  hypothetical protein  53.85 
 
 		 393 aa  414  1e-114  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.270305  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4953  hypothetical protein  53.85 
 
 		 393 aa  413  1e-114  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.683781  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5008  conserved hypothetical protein TIGR00275  52 
 
 		 392 aa  414  1e-114  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0662  hypothetical protein  51.81 
 
 		 392 aa  413  1e-114  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0741866  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0512  hypothetical protein  54.38 
 
 		 410 aa  413  1e-114  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.246775  normal  0.372207 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3962  hypothetical protein  51.79 
 
 		 398 aa  412  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.327369  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3945  hypothetical protein  54.43 
 
 		 405 aa  414  1e-114  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4873  hypothetical protein  53.06 
 
 		 394 aa  412  1e-114  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2364  hypothetical protein  52.97 
 
 		 406 aa  411  1e-113  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.709721  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0054  hypothetical protein  53.32 
 
 		 396 aa  409  1e-113  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0335  hypothetical protein  56.03 
 
 		 407 aa  410  1e-113  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2530  FAD-dependent oxidoreductase  56.03 
 
 		 407 aa  410  1e-113  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2949  putative FAD dependent oxidoreductase  50.64 
 
 		 401 aa  409  1e-113  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0476  hypothetical protein  53.09 
 
 		 394 aa  409  1e-113  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.900431  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0837  hypothetical protein  56.03 
 
 		 407 aa  410  1e-113  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0156  hypothetical protein  53.23 
 
 		 392 aa  409  1e-113  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0368  FAD-dependent oxidoreductase  56.03 
 
 		 407 aa  410  1e-113  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2388  FAD-dependent oxidoreductase  56.03 
 
 		 407 aa  410  1e-113  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.396449  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1238  hypothetical protein  53.54 
 
 		 414 aa  409  1e-113  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1709  hypothetical protein  56.03 
 
 		 407 aa  410  1e-113  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0499  HI0933 family protein  56.42 
 
 		 398 aa  409  1e-113  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0205832 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1516  hypothetical protein  56.03 
 
 		 407 aa  410  1e-113  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.631373  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1831  HI0933-like protein  56.04 
 
 		 402 aa  410  1e-113  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  decreased coverage  0.000611752  normal  0.363311 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2218  putative transmembrane protein  56.28 
 
 		 412 aa  407  1.0000000000000001e-112  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1635  hypothetical protein  50.12 
 
 		 405 aa  408  1.0000000000000001e-112  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3115  FAD-dependent oxidoreductase of HI0933-like family protein  53.92 
 
 		 400 aa  408  1.0000000000000001e-112  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28030  HI0933-like protein  51.95 
 
 		 411 aa  401  1e-111  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2030  HI0933 family protein  55.73 
 
 		 407 aa  402  1e-111  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3779  hypothetical protein  56.96 
 
 		 405 aa  402  1e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.28946  normal  0.0295291 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0617  hypothetical protein  56.01 
 
 		 407 aa  403  1e-111  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3253  hypothetical protein  56.7 
 
 		 405 aa  401  1e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0198176 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3781  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  51.41 
 
 		 400 aa  398  9.999999999999999e-111  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2208  hypothetical protein  55.56 
 
 		 406 aa  398  9.999999999999999e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2423  HI0933 family protein  55.98 
 
 		 407 aa  400  9.999999999999999e-111  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3830  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  51.41 
 
 		 400 aa  399  9.999999999999999e-111  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4483  HI0933-like protein  56.56 
 
 		 406 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4838  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  51.41 
 
 		 400 aa  399  9.999999999999999e-111  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3882  hypothetical protein  56.56 
 
 		 406 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.151985 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>