More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_1561 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008639  Cpha266_1561  hypothetical protein  100 
 
 
455 aa  924    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1430  HI0933 family protein  57.45 
 
 
452 aa  491  1e-137  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.223271  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1282  HI0933 family protein  57.52 
 
 
457 aa  482  1e-135  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.138775  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1476  HI0933 family protein  51.2 
 
 
413 aa  415  9.999999999999999e-116  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1122  hypothetical protein  52.23 
 
 
443 aa  410  1e-113  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.138213  normal  0.379331 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1052  hypothetical protein  50.5 
 
 
442 aa  407  1.0000000000000001e-112  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.843089  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1209  HI0933 family protein  49.75 
 
 
443 aa  400  9.999999999999999e-111  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00892484 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1601  hypothetical protein  35.24 
 
 
406 aa  248  2e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0708  FAD dependent oxidoreductase  33.18 
 
 
409 aa  247  2e-64  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2135  hypothetical protein  35.91 
 
 
415 aa  246  4e-64  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00468248  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1926  HI0933-like protein  33.79 
 
 
414 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1022  HI0933 family protein  31.35 
 
 
403 aa  231  2e-59  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1733  HI0933 family protein  33.83 
 
 
408 aa  230  5e-59  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2387  hypothetical protein  33.41 
 
 
410 aa  228  2e-58  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2378  HI0933 family protein  34.54 
 
 
412 aa  228  2e-58  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.270996  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3399  HI0933 family protein  33.09 
 
 
419 aa  225  1e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000862547  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0030  HI0933 family protein  34.24 
 
 
412 aa  224  2e-57  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1378  hypothetical protein  35.24 
 
 
415 aa  224  2e-57  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.275116 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2209  hypothetical protein  32.29 
 
 
430 aa  222  9.999999999999999e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000224827  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0927  HI0933 family protein  35.1 
 
 
408 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.1016 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0187  HI0933 family protein  33.58 
 
 
433 aa  216  9e-55  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1025  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  29.52 
 
 
403 aa  215  9.999999999999999e-55  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0617168  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0861  HI0933 family protein  30.14 
 
 
412 aa  214  1.9999999999999998e-54  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000883164  normal  0.741633 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2050  hypothetical protein  35.48 
 
 
419 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000118961  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1197  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  29.26 
 
 
403 aa  212  1e-53  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00144707  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0672  HI0933 family protein  31.36 
 
 
436 aa  211  3e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1315  hypothetical protein  31.51 
 
 
420 aa  210  4e-53  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.476308  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2761  HI0933 family protein  30.47 
 
 
427 aa  207  3e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1810  hypothetical protein  29.98 
 
 
422 aa  205  1e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.261505  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1845  hypothetical protein  29.98 
 
 
422 aa  205  1e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1567  hypothetical protein  32.18 
 
 
393 aa  204  3e-51  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0195  hypothetical protein  32.48 
 
 
435 aa  201  3e-50  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0437859  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1752  hypothetical protein  32.17 
 
 
390 aa  201  3e-50  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00572064  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_183  hypothetical protein  32.32 
 
 
435 aa  199  7.999999999999999e-50  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.277985  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0158  hypothetical protein  31.55 
 
 
435 aa  198  2.0000000000000003e-49  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0291  hypothetical protein  28.6 
 
 
408 aa  197  3e-49  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2605  hypothetical protein  29.13 
 
 
407 aa  197  3e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00291222  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4604  hypothetical protein  28.44 
 
 
423 aa  196  7e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00629914  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4440  NAD(FAD)-utilizing dehydrogenase  28.44 
 
 
423 aa  196  7e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0621454  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4458  NAD(FAD)-utilizing dehydrogenase  28.44 
 
 
423 aa  196  7e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00549646  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4960  hypothetical protein  28.44 
 
 
423 aa  196  7e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.979568  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4825  conserved hypothetical protein TIGR00275  28.44 
 
 
423 aa  196  7e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4820  conserved hypothetical protein TIGR00275  28.67 
 
 
423 aa  196  1e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0848463  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0416  hypothetical protein TIGR00275  28.44 
 
 
423 aa  194  2e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0139426  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4850  hypothetical protein  28.44 
 
 
423 aa  195  2e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.473198  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4843  conserved hypothetical protein TIGR00275  28.44 
 
 
423 aa  195  2e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000266049  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15581  flavoprotein  29.63 
 
 
414 aa  194  2e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.379962  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1339  hypothetical protein  29.61 
 
 
406 aa  194  2e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0646456  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2451  hypothetical protein  28.51 
 
 
446 aa  194  2e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000138411  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1150  YhiN family flavoprotein  29.84 
 
 
406 aa  194  3e-48  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.823305  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0908  HI0933 family protein  30.23 
 
 
426 aa  194  4e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0262  flavoprotein  29.09 
 
 
424 aa  192  8e-48  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000227955  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4539  hypothetical protein  28.44 
 
 
423 aa  191  2.9999999999999997e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15361  flavoprotein  28.05 
 
 
411 aa  191  2.9999999999999997e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0647863  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0017  hypothetical protein  31.83 
 
 
422 aa  189  8e-47  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15731  flavoprotein  28.77 
 
 
410 aa  189  1e-46  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3371  hypothetical protein  27.54 
 
 
426 aa  186  6e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000385799  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1467  hypothetical protein  29 
 
 
415 aa  185  1.0000000000000001e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.196184  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2635  YhiN family flavoprotein  27.73 
 
 
414 aa  185  2.0000000000000003e-45  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.457541  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0627  HI0933 family protein  29.1 
 
 
404 aa  185  2.0000000000000003e-45  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000930463  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1282  hypothetical protein  28.08 
 
 
403 aa  184  3e-45  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.488791  normal  0.628895 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5845  HI0933 family protein  27.54 
 
 
408 aa  181  2e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.599184  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1437  hypothetical protein  26.8 
 
 
413 aa  181  2e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1899  HI0933 family protein  29.17 
 
 
409 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.279809  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2952  hypothetical protein  27.48 
 
 
415 aa  181  2.9999999999999997e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00592847  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07621  hypothetical protein  27.38 
 
 
407 aa  179  1e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.0179283 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1237  HI0933-like protein  28.22 
 
 
412 aa  177  2e-43  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0825  HI0933 family protein  28 
 
 
414 aa  178  2e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.689631 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0130  hypothetical protein  27.36 
 
 
405 aa  176  7e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.700212  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4030  HI0933 family protein  29.18 
 
 
414 aa  175  9.999999999999999e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3274  hypothetical protein  30.59 
 
 
396 aa  173  5e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.142928  normal  0.877884 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2067  hypothetical protein  30.18 
 
 
415 aa  171  2e-41  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3520  HI0933 family protein  27.83 
 
 
408 aa  171  2e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1396  hypothetical protein  27 
 
 
402 aa  169  1e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00402  hypothetical protein  27.73 
 
 
393 aa  167  5e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.96178  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0491  hypothetical protein  27.65 
 
 
411 aa  165  2.0000000000000002e-39  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0413  HI0933-like protein  28.38 
 
 
392 aa  162  8.000000000000001e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0650019  normal  0.0294705 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0303  hypothetical protein  27.52 
 
 
394 aa  162  1e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.918662  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0345  HI0933 family protein  28.86 
 
 
409 aa  162  1e-38  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0791  HI0933 family protein  28.15 
 
 
408 aa  162  1e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.371857 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1574  HI0933 family protein  26.35 
 
 
409 aa  160  4e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0375  HI0933-like protein  29.91 
 
 
393 aa  160  5e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0017  hypothetical protein  30.96 
 
 
405 aa  160  6e-38  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1597  HI0933 family protein  26.11 
 
 
409 aa  159  8e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.168995 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0599  HI0933 family protein  28.93 
 
 
392 aa  159  1e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.623073 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2364  hypothetical protein  25.62 
 
 
406 aa  158  2e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.709721  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3945  hypothetical protein  29.37 
 
 
405 aa  158  2e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1018  HI0933 family protein  27.11 
 
 
404 aa  157  4e-37  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2502  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein-like  28.19 
 
 
413 aa  156  9e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.472711  normal  0.7121 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5032  HI0933 family protein  26.62 
 
 
404 aa  155  1e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1621  HI0933 family protein  27.52 
 
 
394 aa  155  1e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0160754  normal  0.370908 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2316  hypothetical protein  28 
 
 
410 aa  155  1e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2949  putative FAD dependent oxidoreductase  27.15 
 
 
401 aa  155  1e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1707  HI0933-like protein  27.25 
 
 
399 aa  155  2e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.105129 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0623  hypothetical protein  27.33 
 
 
428 aa  155  2e-36  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.228803 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00161  hypothetical protein  30.54 
 
 
440 aa  154  2.9999999999999998e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5249  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein-like  28.73 
 
 
392 aa  154  4e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0476  hypothetical protein  27.83 
 
 
394 aa  154  4e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.900431  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0662  hypothetical protein  28.18 
 
 
392 aa  153  5e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0741866  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0156  hypothetical protein  26.85 
 
 
392 aa  153  5.9999999999999996e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>