More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DehaBAV1_0158 on replicon NC_009455
Organism: Dehalococcoides sp. BAV1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002936  DET0195  hypothetical protein  92.87 
 
 
435 aa  796    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0437859  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0158  hypothetical protein  100 
 
 
435 aa  877    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_183  hypothetical protein  92.18 
 
 
435 aa  787    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.277985  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0708  FAD dependent oxidoreductase  47.1 
 
 
409 aa  374  1e-102  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2135  hypothetical protein  43 
 
 
415 aa  345  1e-93  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00468248  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2378  HI0933 family protein  42.82 
 
 
412 aa  337  2.9999999999999997e-91  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.270996  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3399  HI0933 family protein  43.55 
 
 
419 aa  334  2e-90  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000862547  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1733  HI0933 family protein  42.76 
 
 
408 aa  332  8e-90  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2050  hypothetical protein  43.61 
 
 
419 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000118961  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1601  hypothetical protein  39.63 
 
 
406 aa  319  6e-86  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2209  hypothetical protein  41.01 
 
 
430 aa  318  1e-85  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000224827  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0030  HI0933 family protein  44.04 
 
 
412 aa  315  9.999999999999999e-85  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1150  YhiN family flavoprotein  41.53 
 
 
406 aa  311  1e-83  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.823305  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1339  hypothetical protein  41.53 
 
 
406 aa  311  2e-83  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0646456  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0187  HI0933 family protein  41.28 
 
 
433 aa  293  6e-78  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2451  hypothetical protein  38.22 
 
 
446 aa  276  4e-73  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000138411  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0262  flavoprotein  35.71 
 
 
424 aa  273  3e-72  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000227955  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0672  HI0933 family protein  37.61 
 
 
436 aa  273  4.0000000000000004e-72  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2761  HI0933 family protein  37.61 
 
 
427 aa  273  5.000000000000001e-72  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1197  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  34.03 
 
 
403 aa  260  4e-68  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00144707  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1025  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  33.8 
 
 
403 aa  259  8e-68  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0617168  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1845  hypothetical protein  35.19 
 
 
422 aa  248  2e-64  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1810  hypothetical protein  35.19 
 
 
422 aa  248  2e-64  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.261505  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0908  HI0933 family protein  36.32 
 
 
426 aa  247  3e-64  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4820  conserved hypothetical protein TIGR00275  35.63 
 
 
423 aa  245  9e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0848463  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4850  hypothetical protein  35.63 
 
 
423 aa  245  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.473198  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4843  conserved hypothetical protein TIGR00275  35.63 
 
 
423 aa  245  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000266049  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0416  hypothetical protein TIGR00275  35.63 
 
 
423 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0139426  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4604  hypothetical protein  35.55 
 
 
423 aa  243  3.9999999999999997e-63  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00629914  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4440  NAD(FAD)-utilizing dehydrogenase  35.55 
 
 
423 aa  243  3.9999999999999997e-63  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0621454  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4458  NAD(FAD)-utilizing dehydrogenase  35.55 
 
 
423 aa  243  3.9999999999999997e-63  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00549646  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4825  conserved hypothetical protein TIGR00275  35.55 
 
 
423 aa  243  3.9999999999999997e-63  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4960  hypothetical protein  35.55 
 
 
423 aa  243  3.9999999999999997e-63  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.979568  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0861  HI0933 family protein  34.01 
 
 
412 aa  242  7.999999999999999e-63  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000883164  normal  0.741633 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3371  hypothetical protein  34.63 
 
 
426 aa  241  2.9999999999999997e-62  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000385799  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4539  hypothetical protein  34.71 
 
 
423 aa  240  4e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1315  hypothetical protein  32.63 
 
 
420 aa  233  4.0000000000000004e-60  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.476308  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1237  HI0933-like protein  33.64 
 
 
412 aa  229  8e-59  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0291  hypothetical protein  34.18 
 
 
408 aa  225  1e-57  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0927  HI0933 family protein  33.33 
 
 
408 aa  225  1e-57  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.1016 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2387  hypothetical protein  33.17 
 
 
410 aa  223  7e-57  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1378  hypothetical protein  32.87 
 
 
415 aa  220  3.9999999999999997e-56  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.275116 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1752  hypothetical protein  31.11 
 
 
390 aa  219  6e-56  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00572064  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1926  HI0933-like protein  31.72 
 
 
414 aa  218  1e-55  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1437  hypothetical protein  33.25 
 
 
413 aa  213  7.999999999999999e-54  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1022  HI0933 family protein  31.63 
 
 
403 aa  208  1e-52  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1430  HI0933 family protein  33.41 
 
 
452 aa  205  1e-51  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.223271  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1567  hypothetical protein  30.39 
 
 
393 aa  204  3e-51  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1561  hypothetical protein  30.82 
 
 
455 aa  202  9e-51  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0627  HI0933 family protein  31.71 
 
 
404 aa  202  9.999999999999999e-51  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000930463  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0825  HI0933 family protein  32.21 
 
 
414 aa  201  1.9999999999999998e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.689631 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4030  HI0933 family protein  32.2 
 
 
414 aa  199  1.0000000000000001e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4017  hypothetical protein  31.19 
 
 
393 aa  192  7e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2952  hypothetical protein  30.91 
 
 
415 aa  190  5e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00592847  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1476  HI0933 family protein  32.69 
 
 
413 aa  189  7e-47  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2635  YhiN family flavoprotein  29.53 
 
 
414 aa  189  1e-46  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.457541  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1052  hypothetical protein  32.1 
 
 
442 aa  186  5e-46  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.843089  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2605  hypothetical protein  29.47 
 
 
407 aa  186  9e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00291222  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3802  hypothetical protein  30.43 
 
 
394 aa  185  2.0000000000000003e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1530  hypothetical protein  32.03 
 
 
391 aa  185  2.0000000000000003e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0128  hypothetical protein  32.05 
 
 
394 aa  184  3e-45  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0603016  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1282  HI0933 family protein  31.65 
 
 
457 aa  183  5.0000000000000004e-45  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.138775  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4873  hypothetical protein  30.21 
 
 
394 aa  182  8.000000000000001e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1209  HI0933 family protein  29.58 
 
 
443 aa  182  1e-44  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00892484 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4466  hypothetical protein  29.82 
 
 
394 aa  182  1e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.119173 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0051  hypothetical protein  29.82 
 
 
394 aa  181  2.9999999999999997e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  unclonable  0.0000135975 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0047  hypothetical protein  29.59 
 
 
394 aa  180  4e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4328  hypothetical protein  29.59 
 
 
394 aa  179  8e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1122  hypothetical protein  30.23 
 
 
443 aa  179  1e-43  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.138213  normal  0.379331 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2555  hypothetical protein  31.78 
 
 
396 aa  178  2e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00730633  hitchhiker  0.0000156467 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1076  HI0933 family protein  31.06 
 
 
407 aa  178  2e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0249257  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3520  HI0933 family protein  29.58 
 
 
408 aa  178  2e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28030  HI0933-like protein  30.96 
 
 
411 aa  177  3e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4118  HI0933 family protein  29.37 
 
 
394 aa  177  4e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0051  HI0933 family protein  29.13 
 
 
394 aa  176  6e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.71818 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_202  hypothetical protein  32.31 
 
 
394 aa  175  9.999999999999999e-43  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0044  hypothetical protein  29.2 
 
 
394 aa  175  9.999999999999999e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4032  hypothetical protein  28.8 
 
 
398 aa  175  9.999999999999999e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0226  hypothetical protein  32.1 
 
 
379 aa  174  1.9999999999999998e-42  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3781  hypothetical protein  29.82 
 
 
398 aa  174  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3791  hypothetical protein  29.91 
 
 
398 aa  174  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3901  hypothetical protein  29.91 
 
 
398 aa  174  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.150346  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0123  hypothetical protein  28.74 
 
 
460 aa  175  1.9999999999999998e-42  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.291133  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0145  hypothetical protein  29.26 
 
 
394 aa  174  2.9999999999999996e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2949  putative FAD dependent oxidoreductase  30.54 
 
 
401 aa  174  2.9999999999999996e-42  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3858  hypothetical protein  29.82 
 
 
398 aa  174  2.9999999999999996e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00469108  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3962  hypothetical protein  29.82 
 
 
398 aa  174  3.9999999999999995e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.327369  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0047  hypothetical protein  29.49 
 
 
394 aa  172  6.999999999999999e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00322221 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0698  hypothetical protein  31.34 
 
 
409 aa  172  7.999999999999999e-42  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1341  hypothetical protein  31.34 
 
 
393 aa  172  1e-41  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2434  hypothetical protein  30.09 
 
 
398 aa  172  1e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4094  hypothetical protein  28.34 
 
 
460 aa  172  1e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4212  hypothetical protein  29.61 
 
 
394 aa  171  2e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1018  HI0933 family protein  28.77 
 
 
404 aa  171  2e-41  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2547  hypothetical protein  31.34 
 
 
394 aa  171  2e-41  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.374165  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00536  oxidoreductase  29.43 
 
 
397 aa  170  4e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0055  hypothetical protein  28.9 
 
 
394 aa  170  5e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000153695 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2502  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein-like  29.9 
 
 
413 aa  170  5e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.472711  normal  0.7121 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1238  hypothetical protein  29.74 
 
 
414 aa  170  5e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4688  hypothetical protein  30.12 
 
 
413 aa  170  5e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>