96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_0963 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013926  Aboo_0963  thiazole biosynthesis enzyme  100 
 
 		 254 aa  512  1e-144  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2426  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  52.94 
 
 		 258 aa  280  1e-74  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00205999  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0277  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  53.36 
 
 		 255 aa  267  1e-70  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.720039 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0421  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  52.94 
 
 		 271 aa  255  4e-67  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000154841  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1609  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  49.6 
 
 		 268 aa  249  3e-65  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000241948  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0859  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  50.2 
 
 		 259 aa  246  3e-64  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.841302  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1358  thiazole biosynthesis enzyme  51.76 
 
 		 264 aa  241  7e-63  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000774298  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2109  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  53.7 
 
 		 258 aa  239  4e-62  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2100  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  52.14 
 
 		 260 aa  228  8e-59  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0142  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  49.21 
 
 		 248 aa  224  8e-58  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0140  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  48.82 
 
 		 248 aa  224  1e-57  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1935  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  50 
 
 		 254 aa  220  9.999999999999999e-57  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1121  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  48.64 
 
 		 286 aa  219  3e-56  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1007  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  49.4 
 
 		 256 aa  218  6e-56  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1590  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  46.25 
 
 		 258 aa  208  6e-53  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00059443  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2251  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  47.66 
 
 		 254 aa  206  3e-52  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1422  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  41.76 
 
 		 277 aa  200  1.9999999999999998e-50  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2221  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  44.02 
 
 		 271 aa  191  7e-48  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000384751 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1555  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  45.14 
 
 		 261 aa  191  8e-48  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1498  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  46.3 
 
 		 275 aa  190  2e-47  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.16629  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1998  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  46.72 
 
 		 273 aa  188  8e-47  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.310517  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1411  thiazole biosynthesis enzyme  43.8 
 
 		 267 aa  187  2e-46  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1052  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  44.53 
 
 		 259 aa  183  3e-45  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.273545  normal  0.78871 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0798  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  49.02 
 
 		 263 aa  181  1e-44  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0725876  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0663  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  44.96 
 
 		 261 aa  179  2.9999999999999997e-44  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.397509  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1420  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  41.92 
 
 		 263 aa  173  2.9999999999999996e-42  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.043335 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0597  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  45.53 
 
 		 262 aa  170  2e-41  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.469921  normal  0.642946 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0226  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  45.53 
 
 		 261 aa  169  3e-41  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1321  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  45.53 
 
 		 261 aa  169  5e-41  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0678  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  37.2 
 
 		 272 aa  154  1e-36  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0002  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  35.48 
 
 		 307 aa  151  1e-35  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.512704 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2980  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  34.8 
 
 		 309 aa  147  2.0000000000000003e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2419  thiazole biosynthesis enzyme  33.7 
 
 		 309 aa  145  7.0000000000000006e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1462  thiazole biosynthesis enzyme  32.97 
 
 		 310 aa  144  2e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_50942  predicted protein  31.1 
 
 		 351 aa  140  1.9999999999999998e-32  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.920544 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03928  Putative thiazole synthaseTHI4_ASPOR Thiazole biosynthetic enzyme, mitochondrial ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q76B84]  32.85 
 
 		 331 aa  138  7e-32  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.514294 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2718  ribulose-1,5-biphosphate synthetase  32.73 
 
 		 308 aa  138  8.999999999999999e-32  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2250  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  36.78 
 
 		 617 aa  52.4  0.000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0682  Putrescine oxidase  46.15 
 
 		 512 aa  49.3  0.00006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.016891  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0413  putative NADPH-dependent glutamate synthase small subunit  35.05 
 
 		 659 aa  48.9  0.00008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.933547  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0455  putative NADPH-dependent glutamate synthase small subunit  44.07 
 
 		 653 aa  48.1  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.374087  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2167  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  47.5 
 
 		 914 aa  47  0.0003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7328  thioredoxin reductase  34.94 
 
 		 348 aa  46.6  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.729107 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25290  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  42.37 
 
 		 612 aa  46.6  0.0004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.126958 
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4840  FAD dependent oxidoreductase  41.79 
 
 		 445 aa  45.8  0.0006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1238  phytoene dehydrogenase and related protein-like protein  27.89 
 
 		 472 aa  45.8  0.0006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.690842  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0344  putative NADPH-dependent glutamate synthase small subunit  40.68 
 
 		 658 aa  45.8  0.0007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0040  putrescine oxidase  53.66 
 
 		 462 aa  45.1  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1077  geranylgeranyl reductase  38.81 
 
 		 399 aa  44.7  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0240225  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1932  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  31.75 
 
 		 895 aa  45.1  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0418716  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2120  dihydrolipoamide dehydrogenase  24.85 
 
 		 581 aa  45.4  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2886  dihydrolipoyl dehydrogenase  29.07 
 
 		 464 aa  44.7  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0945112  normal  0.240271 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0580  putative NADPH-dependent glutamate synthase small subunit  32.65 
 
 		 653 aa  45.1  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000307705  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1564  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  36.51 
 
 		 891 aa  44.7  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2708  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  23.79 
 
 		 554 aa  45.1  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.599219 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1194  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  45.9 
 
 		 1487 aa  44.3  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05771  NAD binding site  47.73 
 
 		 376 aa  44.3  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.161819  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3004  ferredoxin  56.76 
 
 		 493 aa  44.7  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4536  thioredoxin reductase  32.94 
 
 		 348 aa  44.3  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1221  electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase  24.88 
 
 		 541 aa  43.9  0.002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.022805  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0334  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  45.28 
 
 		 466 aa  44.3  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1325  thioredoxin reductase  48 
 
 		 311 aa  43.9  0.002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000005061  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16540  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  32.38 
 
 		 612 aa  43.5  0.003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.0000430303  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1968  FAD dependent oxidoreductase  54.55 
 
 		 485 aa  43.5  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0119583  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1001  FAD dependent oxidoreductase  24.22 
 
 		 471 aa  43.5  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0040  amine oxidase  53.66 
 
 		 463 aa  43.9  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1994  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  23.3 
 
 		 551 aa  43.5  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.345754 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3578  thioredoxin reductase  28.68 
 
 		 309 aa  43.1  0.004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.166603  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0226  FAD dependent oxidoreductase  56.76 
 
 		 518 aa  43.5  0.004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0950  HI0933 family protein  26.38 
 
 		 435 aa  43.5  0.004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00109997  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2656  selenate reductase YgfK  54.55 
 
 		 991 aa  43.5  0.004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03731  hypothetical protein  40 
 
 		 938 aa  43.1  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.968761 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3527  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  23.3 
 
 		 554 aa  43.1  0.004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0789  phytoene dehydrogenase and related protein-like protein  48.98 
 
 		 470 aa  43.1  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.308572 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1266  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  24.88 
 
 		 541 aa  43.1  0.004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.863142  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0418  putative NADPH-dependent glutamate synthase small subunit  36.67 
 
 		 653 aa  42.7  0.006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2382  cyclic nucleotide-regulated FAD- dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  57.5 
 
 		 573 aa  42.7  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.297747  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1852  NAD binding site  45.45 
 
 		 376 aa  42.7  0.006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2581  thioredoxin reductase  50 
 
 		 303 aa  42.7  0.006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.230043  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3431  amine oxidase  46.34 
 
 		 529 aa  42.7  0.006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.478071  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6126  cyclic nucleotide-regulated FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  57.5 
 
 		 575 aa  42.7  0.006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0885  putative oxidoreductase  35.19 
 
 		 612 aa  42.4  0.007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0404  glutamate synthase subunit beta  47.62 
 
 		 472 aa  42.4  0.007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0157845 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0609  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  48.84 
 
 		 492 aa  42.4  0.007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0291397  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_769  hydrogenase subunit  30.58 
 
 		 461 aa  42.4  0.007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0432  thioredoxin-disulfide reductase  46.94 
 
 		 310 aa  42.4  0.007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06362  oxidoreductase  38.78 
 
 		 1412 aa  42  0.008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1892  thioredoxin reductase  37.35 
 
 		 324 aa  42.4  0.008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0767369  hitchhiker  0.00000000000000724203 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1222  putative oxidoreductase  52.5 
 
 		 616 aa  42.4  0.008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0767368  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0146  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  29.13 
 
 		 654 aa  42.4  0.008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0470  thioredoxin reductase  31.71 
 
 		 409 aa  42.4  0.008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0866  hydrogenase subunit, putative  32.23 
 
 		 461 aa  42  0.009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5084  thioredoxin reductase  32.18 
 
 		 325 aa  42  0.009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0006  amine oxidase  35.29 
 
 		 556 aa  42  0.009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2410  hypothetical protein  47.92 
 
 		 436 aa  42  0.009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1249  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  32.71 
 
 		 1073 aa  42  0.01  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0309731 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>